Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,072,439 |
A→G |
Q960R (CAG→CGG) |
b2000 → |
outer membrane fluffing protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,072,439 | 0 | A | G | 100.0%
| 591.9
/ NA
| 172 | Q960R (CAG→CGG) | b2000 | outer membrane fluffing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (88/84); total (88/84) |
Only 100 of 179 total aligned reads displayed.
CCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTG‑‑CCC‑‑CCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCAC > NC_000913/2072352‑2072528
|
ccTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCC‑‑CCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGcc < 1:331175/93‑1 (MQ=255)
ccTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCC‑‑CCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGcc < 1:4603235/93‑1 (MQ=255)
ccTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCC‑‑CCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGcc < 1:3135293/93‑1 (MQ=255)
cTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCC‑‑CCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCt > 1:1145807/1‑93 (MQ=255)
cTTTGGCGAAGGCACCCCATCCCGTG‑‑CCCCGCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCt < 2:3878814/93‑1 (MQ=255)
tttGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCC‑‑CCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCtt > 2:4797647/1‑93 (MQ=255)
tttGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCC‑‑CCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCtt > 1:216038/1‑93 (MQ=255)
ttGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCC‑‑CCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTc < 2:4386607/93‑1 (MQ=255)
ttGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCC‑‑CCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTc < 2:1783988/93‑1 (MQ=255)
tGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCC‑‑CCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCt < 1:1224940/93‑1 (MQ=255)
ggCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCC‑‑CCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTg < 2:1244484/93‑1 (MQ=255)
gAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCC‑‑CCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTa > 2:2236629/1‑93 (MQ=255)
ggCACCTCATCCCGTGCCCCC‑‑CCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATcc < 1:4842387/93‑1 (MQ=255)
ggCACCTCATCCCGTGCCCCC‑‑CCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATcc > 1:3943431/1‑93 (MQ=255)
gCACCTCATCCCGTGCCCCC‑‑CCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTTAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCg < 2:3234887/93‑1 (MQ=255)
aCCTCATCCCGTGCCCCC‑‑CCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCa > 1:6007972/1‑93 (MQ=255)
aCCTCATCCCGTGCCCCC‑‑CCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCa < 1:5542371/93‑1 (MQ=255)
cTCATCCCGTGCCCCC‑‑CCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCAcc > 1:6343393/1‑93 (MQ=255)
cTCATCCCGTGCCCCC‑‑CCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCAcc > 2:3416304/1‑93 (MQ=255)
cTCATCCCGTGCCCCC‑‑CCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCAcc > 1:181137/1‑93 (MQ=255)
tCATCCCGTGCCCCC‑‑CCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCt > 2:3384571/1‑93 (MQ=255)
tCATCCCGTGCCCCC‑‑CCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCt > 1:1073543/1‑93 (MQ=255)
tCATCCCGTGCCCCC‑‑CCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCt > 2:5326153/1‑93 (MQ=255)
cATCCCGTGCCCCC‑‑CCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCtt > 1:864935/1‑93 (MQ=255)
aTCCCGTGCCCCC‑‑CCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTc < 2:3116588/93‑1 (MQ=255)
aTCCCGTGCCCCC‑‑CCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTc > 2:3643576/1‑93 (MQ=255)
tgccccc‑‑cccTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTcc > 1:3901690/5‑93 (MQ=255)
gccccc‑‑cccTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTccc > 2:3168474/4‑93 (MQ=255)
gccccc‑‑cccTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTccc > 1:2142090/4‑93 (MQ=255)
ccccc‑‑cccTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCg > 1:3707662/3‑93 (MQ=255)
ccccc‑‑cccTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCg < 2:3433478/91‑1 (MQ=255)
cccc‑‑cccTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTccccg > 2:1440437/2‑91 (MQ=255)
cccc‑‑cccTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTccccg > 1:5277314/2‑91 (MQ=255)
cccc‑‑cccTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCgg < 1:4961463/92‑1 (MQ=255)
cccc‑‑cccTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCgg < 1:269163/92‑1 (MQ=255)
cccc‑‑cccTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCgg > 2:2056284/2‑93 (MQ=255)
cccc‑‑cccTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCgg < 1:3245674/92‑1 (MQ=255)
cccc‑‑cccTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCgg < 2:3854782/92‑1 (MQ=255)
ccc‑‑cccTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCggg > 2:5805541/1‑93 (MQ=255)
ccc‑‑cccTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCggg < 1:76782/93‑1 (MQ=255)
c‑‑cccTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGga < 2:5766728/93‑1 (MQ=255)
ccTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGgaga < 1:6220283/93‑1 (MQ=255)
cTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGat > 2:5312678/1‑93 (MQ=255)
cTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGat < 1:4117973/93‑1 (MQ=255)
tGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGata < 1:5930458/93‑1 (MQ=255)
tGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGata < 2:1734576/93‑1 (MQ=255)
tGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGata < 1:6404183/93‑1 (MQ=255)
cgCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAGCTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGata < 2:893115/92‑1 (MQ=255)
cGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATg < 2:183994/93‑1 (MQ=255)
gTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTAGCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCGCCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGc < 2:4857843/93‑1 (MQ=255)
tGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCg > 1:3427922/1‑93 (MQ=255)
tGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCg < 2:6168792/93‑1 (MQ=255)
tGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCg > 2:4428799/1‑93 (MQ=255)
cAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCgtgt < 1:6410881/93‑1 (MQ=255)
cAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCgtgt > 2:1590090/1‑93 (MQ=255)
aGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGtgtg < 1:1638167/93‑1 (MQ=255)
aGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGtgtg < 1:1646368/93‑1 (MQ=255)
aGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGtgtg > 2:6454393/1‑93 (MQ=255)
aGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGtgtg < 2:6216321/93‑1 (MQ=255)
aGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGtgtg > 1:1993320/1‑93 (MQ=255)
gTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTgg < 2:320118/93‑1 (MQ=255)
gCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTgggg > 1:2403127/1‑93 (MQ=255)
gCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTgggg > 1:376945/1‑93 (MQ=255)
cAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGa < 2:5013951/93‑1 (MQ=255)
aaaCACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACt < 2:5087147/93‑1 (MQ=255)
aaCACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACtt > 2:3770385/1‑93 (MQ=255)
cacaGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTcc < 1:4364981/93‑1 (MQ=255)
caGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCAc > 2:189244/1‑93 (MQ=255)
aGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACt > 2:77664/1‑93 (MQ=255)
gtgtGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTg > 1:5961674/1‑93 (MQ=255)
tgtgAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTgc < 1:5784249/93‑1 (MQ=255)
gagtgaATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTgcagg < 1:2861208/93‑1 (MQ=255)
agtgaATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTgcaggc > 2:2766781/1‑93 (MQ=255)
agtgaATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTgcaggc > 1:1271650/1‑93 (MQ=255)
gtgaATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTgcaggca < 1:2342172/93‑1 (MQ=255)
tgaATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTgcaggcag < 2:606811/93‑1 (MQ=255)
tgaATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTgcaggcag < 2:2360361/93‑1 (MQ=255)
tgaATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTgcaggcag < 1:4234731/93‑1 (MQ=255)
gaATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGc > 1:4896963/1‑93 (MQ=255)
gaATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGc > 2:2022693/1‑93 (MQ=255)
aaTTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCg < 2:4216587/93‑1 (MQ=255)
aaTTACCGGTGAACGGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCTCCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCg < 2:1043081/93‑1 (MQ=255)
aTTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCgg < 2:5581572/93‑1 (MQ=255)
tACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGa > 2:3705937/1‑93 (MQ=255)
aCCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGAt > 1:1943327/1‑93 (MQ=255)
aCCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGAt > 2:2477197/1‑93 (MQ=255)
cGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGa > 2:4041035/1‑93 (MQ=255)
cGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGa < 1:5532048/93‑1 (MQ=255)
cGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGa > 2:1299342/1‑93 (MQ=255)
ggTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGAc > 2:4722669/1‑93 (MQ=255)
gTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACg < 1:2444008/93‑1 (MQ=255)
gAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGtt < 1:3407394/93‑1 (MQ=255)
tggtggGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTtctct > 1:4839793/1‑93 (MQ=255)
tggtggGTACGGCCTTCTGTTATCCGAACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTtctct > 2:4167003/1‑93 (MQ=255)
tggGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTccc > 1:2502239/1‑93 (MQ=255)
gggTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCt > 1:2284010/1‑93 (MQ=255)
gTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTca > 2:5683324/1‑93 (MQ=255)
gTACGGCCTACTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCTCTca > 1:6470580/1‑93 (MQ=255)
tACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTcac < 1:2438984/93‑1 (MQ=255)
tACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTcac < 1:3027969/93‑1 (MQ=255)
|
CCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTG‑‑CCC‑‑CCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCAC > NC_000913/2072352‑2072528
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGT‑‑G‑‑CCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAA > NC_000913/2072348‑2072532
|
ATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGT‑‑GCCCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACG > SRR4302537.4254833/1‑94 (MQ=60)
TGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGT‑‑GCCCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGG < SRR4302537.2428147/94‑1 (MQ=60)
CCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGT‑‑GCCCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCT > SRR4302537.1153776/1‑94 (MQ=60)
CCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGT‑‑GCCCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCT < SRR4302537.3157300/94‑1 (MQ=60)
CCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGT‑‑GCCCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCT < SRR4302537.333470/94‑1 (MQ=60)
CCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGT‑‑GCCCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCT < SRR4302537.4635105/94‑1 (MQ=60)
CTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGT‑‑GCCCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTT > SRR4302537.217580/1‑94 (MQ=60)
CTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGT‑‑GCCCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTT > SRR4302537.2795415/1‑94 (MQ=60)
TGGCGAAGGCACCTCATCCCGT‑‑GCCCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTG < SRR4302537.1233453/94‑1 (MQ=60)
GAAGGCACCTCATCCCGT‑‑GCCCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTAT > SRR4302537.3257409/1‑94 (MQ=60)
AGGCACCTCATCCCGT‑‑GCCCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCC > SRR4302537.3971012/1‑94 (MQ=60)
GGCACCTCATCCCGT‑‑GCCCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCG < SRR4302537.4875811/94‑1 (MQ=60)
GGCACCTCATCCCGT‑‑GCCCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCC > SRR4302537.4318960/1‑94 (MQ=60)
CACCTCATCCCGT‑‑GCCCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCA > SRR4302537.6049254/1‑94 (MQ=60)
ACCTCATCCCGT‑‑GCCCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCAC < SRR4302537.5580215/94‑1 (MQ=60)
CCTCATCCCGT‑‑GCCCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACC > SRR4302537.182424/1‑94 (MQ=60)
CCTCATCCCGT‑‑GCCCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACC > SRR4302537.6386727/1‑94 (MQ=60)
CTCATCCCGT‑‑GCCCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCT > SRR4302537.1080938/1‑94 (MQ=60)
TCATCCCGT‑‑GCCCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTT > SRR4302537.870870/1‑94 (MQ=60)
ATCCCGTGCG‑‑CCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTCCCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCA < SRR4302537.6128521/94‑1 (MQ=60)
ATCCCGT‑‑GCCCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTGCGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCA > SRR4302537.5149958/1‑94 (MQ=60)
ATCCCGT‑‑GCCCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCA < SRR4302537.3859837/94‑1 (MQ=60)
ATCCCGT‑‑GCCCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCA < SRR4302537.5705820/94‑1 (MQ=60)
TCCCGT‑‑GCCCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAG < SRR4302537.3982633/94‑1 (MQ=60)
TCCCGT‑‑GCCCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAG < SRR4302537.4278050/94‑1 (MQ=60)
TCCCGT‑‑GCCCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAG < SRR4302537.3206235/94‑1 (MQ=60)
TCCCGT‑‑GCCCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAG < SRR4302537.5488320/94‑1 (MQ=60)
CCCGT‑‑GCCCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGC > SRR4302537.1326156/1‑94 (MQ=60)
CCGT‑‑GCCCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCT < SRR4302537.4306623/94‑1 (MQ=60)
gtgccCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCC > SRR4302537.3928966/6‑94 (MQ=60)
gtgccCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCC > SRR4302537.3949093/6‑94 (MQ=60)
tgccCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCC > SRR4302537.2157164/5‑94 (MQ=60)
gccCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCG > SRR4302537.3733734/4‑94 (MQ=60)
C‑‑CCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGG < SRR4302537.271060/94‑1 (MQ=60)
C‑‑CCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGG < SRR4302537.4995664/94‑1 (MQ=60)
C‑‑CCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGG < SRR4302537.1219010/94‑1 (MQ=60)
C‑‑CCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGG < SRR4302537.3268546/94‑1 (MQ=60)
C‑‑CCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGG < SRR4302537.3418213/94‑1 (MQ=60)
ccCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCCG > SRR4302537.5313626/3‑94 (MQ=60)
CCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGG > SRR4302537.4544954/1‑94 (MQ=60)
CCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGG < SRR4302537.77345/94‑1 (MQ=60)
CCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGA > SRR4302537.4770044/1‑94 (MQ=60)
CCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGA > SRR4302537.6272940/1‑94 (MQ=60)
CCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAG > SRR4302537.2410540/1‑94 (MQ=60)
CCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCTGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGAT < SRR4302537.5092308/94‑1 (MQ=60)
CCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGAT < SRR4302537.6263107/94‑1 (MQ=60)
CTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATA < SRR4302537.4146732/94‑1 (MQ=60)
TGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATAT < SRR4302537.5971148/94‑1 (MQ=60)
TGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATAT < SRR4302537.6447773/94‑1 (MQ=60)
GCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATG < SRR4302537.797777/94‑1 (MQ=60)
GCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATG < SRR4302537.2252732/94‑1 (MQ=60)
CGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGACCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCCGGGGGATATGC > SRR4302537.5404039/1‑94 (MQ=60)
GTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCG > SRR4302537.3452185/1‑94 (MQ=60)
TGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGT > SRR4302537.1239871/1‑94 (MQ=60)
TGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGT > SRR4302537.3780703/1‑94 (MQ=60)
GACAGTGCAAAACGCAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTCGGGCCTTCTGTTACCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTG < SRR4302537.2043660/94‑1 (MQ=60)
GACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTG > SRR4302537.676298/1‑94 (MQ=60)
ACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGT > SRR4302537.6426306/1‑94 (MQ=60)
CAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTG < SRR4302537.6454498/94‑1 (MQ=60)
CAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTG > SRR4302537.2007180/1‑94 (MQ=60)
AGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGG > SRR4302537.3698587/1‑94 (MQ=60)
AGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGG < SRR4302537.1649644/94‑1 (MQ=60)
AGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGG < SRR4302537.1657902/94‑1 (MQ=60)
TGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGG > SRR4302537.379559/1‑94 (MQ=60)
TGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGG > SRR4302537.2420047/1‑94 (MQ=60)
GCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGA > SRR4302537.6130306/1‑94 (MQ=60)
GCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGA > SRR4302537.2319240/1‑94 (MQ=60)
AAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACT > SRR4302537.3328564/1‑94 (MQ=60)
CACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCA < SRR4302537.4395166/94‑1 (MQ=60)
AGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTG > SRR4302537.6002593/1‑94 (MQ=60)
TGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCA < SRR4302537.5823903/94‑1 (MQ=60)
GAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGC > SRR4302537.1280489/1‑94 (MQ=60)
GAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGC < SRR4302537.2881270/94‑1 (MQ=60)
AGTGAATTCCCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCA < SRR4302537.1764298/94‑1 (MQ=60)
AGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCA < SRR4302537.3010113/94‑1 (MQ=60)
GTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAG < SRR4302537.2358677/94‑1 (MQ=60)
TGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGC > SRR4302537.4930769/1‑94 (MQ=60)
TGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGC < SRR4302537.4264196/94‑1 (MQ=60)
GAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCG > SRR4302537.2559150/1‑94 (MQ=60)
GATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGG < SRR4302537.1911932/94‑1 (MQ=60)
AATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGG < SRR4302537.6451003/94‑1 (MQ=60)
ATTACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGG < SRR4302537.4241883/94‑1 (MQ=60)
TACCGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGAT > SRR4302537.1956838/1‑94 (MQ=60)
CGGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGAC < SRR4302537.5569810/94‑1 (MQ=60)
GGTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACG < SRR4302537.5979881/94‑1 (MQ=60)
GTGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGT < SRR4302537.2461208/94‑1 (MQ=60)
TGAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTT > SRR4302537.492520/1‑94 (MQ=60)
GAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTC < SRR4302537.3431532/94‑1 (MQ=60)
GAACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTC > SRR4302537.2517124/1‑94 (MQ=60)
ACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTC > SRR4302537.1374574/1‑94 (MQ=60)
ACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTC > SRR4302537.243457/1‑94 (MQ=60)
ACTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTC > SRR4302537.2152818/1‑94 (MQ=60)
CTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCT > SRR4302537.4982702/1‑94 (MQ=60)
CTGGTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCT > SRR4302537.4873202/1‑94 (MQ=60)
GTGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCC > SRR4302537.2519842/1‑94 (MQ=60)
TGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCT > SRR4302537.2300123/1‑94 (MQ=60)
TGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCT > SRR4302537.5931925/1‑94 (MQ=60)
GGGGTACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCT < SRR4302537.1958562/94‑1 (MQ=60)
GGTACGGCCTACTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCTCTCA > SRR4302537.6514450/1‑94 (MQ=60)
TACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACA < SRR4302537.2456163/94‑1 (MQ=60)
TACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACA > SRR4302537.2525784/1‑94 (MQ=60)
TACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACA < SRR4302537.3049079/94‑1 (MQ=60)
ACGGCCTTCTGTTATCCGCACGTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAG < SRR4302537.2698465/94‑1 (MQ=60)
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ACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAG < SRR4302537.6477120/94‑1 (MQ=60)
ACGGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAG > SRR4302537.3502458/1‑94 (MQ=60)
GGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAA > SRR4302537.3755071/1‑94 (MQ=60)
|
ATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGT‑‑G‑‑CCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAA > NC_000913/2072348‑2072532
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
