Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,183,895 |
(G)7→8 |
intergenic (‑79/‑42) |
yohL ← / → yohM |
hypothetical protein/hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,183,888 | 1 | . | G | 96.2%
| 351.1
/ 5.9
| 104 | intergenic (‑72/‑49) | yohL/yohM | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/4); new base G (92/8); total (92/12) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.08e-04 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.11e-01 |
Only 100 of 163 total aligned reads displayed.
ATCACGGATTGTATGAGACATGGCAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑T‑‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCAAGGAAACGCCT > NC_000913/2183796‑2183976
|
aTCACGGATTGTATGAGACATGGCAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑t > 2:3912268/1‑93 (MQ=255)
aTCACGGATTGTATGAGACATGGCAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑t < 1:4567820/93‑1 (MQ=255)
aTCACGGATTGTATGAGACATGGCAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑t < 1:1604819/93‑1 (MQ=255)
tCACGGATTGTATGAGACATGGCAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑T‑‑g > 1:325250/1‑93 (MQ=255)
tCACGGATTGTATGAGACATGGCAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑T‑‑g < 1:26996/93‑1 (MQ=255)
tCACGGATTGTATGAGACATGGCAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑T‑‑g > 2:762238/1‑93 (MQ=255)
cACGGATTGTATGAGACATGGCAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑T‑‑g‑g < 1:3456462/93‑1 (MQ=255)
aCGGATTGTATGAGACATGGCAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑T‑‑g‑gg < 2:1430728/93‑1 (MQ=255)
cGGATTGTATGAGACATGGCAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑T‑‑g‑gg‑g < 2:5059001/93‑1 (MQ=255)
ggATTGTATGAGAGATGGCAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATGGCACAAGTAATCTGCTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑T‑‑g‑gg‑g‑g < 2:4427658/93‑1 (MQ=255)
ggATTGTATGAGACATGGCAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑T‑‑g‑gg‑g‑g < 2:1682522/93‑1 (MQ=255)
ggATTGTATGAGACATGGCAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑T‑‑g‑gg‑g‑g < 2:6166026/93‑1 (MQ=255)
ggATTGTATGAGACATGGCAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑T‑‑g‑gg‑g‑g < 2:1463209/93‑1 (MQ=255)
gagtGTATGAGACATGGCAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAACTCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑T‑‑g‑gg‑g‑gg < 1:164508/90‑1 (MQ=255)
gATTGTATGAGACATGGCAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑T‑‑g‑gg‑g‑gg > 1:1465219/1‑93 (MQ=255)
aTTGTATTAGACATTGCCACTCCTTTTTAAAAAGAATATGAAAAATCATTGCACTATTAATCTCCTGGGGGGT‑AGTTTCATGTA‑C‑T‑‑g‑gg‑g‑ggt < 2:282199/93‑2 (MQ=255)
aTTGTATGAGACATGGCAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑T‑‑g‑gg‑g‑ggg > 1:852087/1‑93 (MQ=255)
ttGTATGAGACATGGCAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑g‑‑g‑gg‑g‑gggg < 2:4682185/93‑2 (MQ=255)
tGTATGAGACATGGCAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑T‑‑g‑gg‑g‑ggggg > 2:5486571/1‑91 (MQ=255)
gTATGAGACATGGCAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑T‑‑g‑gg‑g‑ggggag > 1:2097673/1‑90 (MQ=255)
tGAGACATGGCAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAg > 2:3626327/1‑93 (MQ=255)
tGAGACATGGCAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAg > 1:2903206/1‑93 (MQ=255)
gagaCATGGCAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGa > 1:4043886/1‑93 (MQ=255)
gaCATGGCAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAAt > 1:2578164/1‑93 (MQ=255)
gaCATGGCAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAAt > 1:3904711/1‑93 (MQ=255)
ctGGAAACAAATGATTAAAAAGAAGATGAAAATTCATTGCAGTATTAATCTGGTGGGGGGG‑AGTATCAGGTA‑CGG‑‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAg < 2:249129/92‑1 (MQ=255)
tGGCAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGa > 1:5176006/1‑93 (MQ=255)
tGGCAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGa > 1:1654558/1‑93 (MQ=255)
ccAACACCTGTTTAAAAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑ATTATCAGGTG‑C‑T‑‑G‑GG‑GTGGG‑AGTAGAATCAGAtt < 2:2003996/92‑1 (MQ=255)
attgggTTATCAAGCATAAGAAACGTCGTAGCACTATTAGTCTGCTGGGGGTT‑ACGATCGGGTA‑C‑T‑‑G‑GG‑G‑GGGTAGTAGAATCAGATTGCCGa < 2:317183/89‑1 (MQ=255)
acCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGa > 1:297822/1‑93 (MQ=255)
acCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGa > 1:2958900/1‑93 (MQ=255)
cTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAAt > 1:7996/1‑93 (MQ=255)
ggTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTa > 1:259246/1‑93 (MQ=255)
gTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTaa > 1:1312981/1‑93 (MQ=255)
gTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTaa > 2:2022461/1‑93 (MQ=255)
tAAAAAAAATAAGAAAAATAATAGCACTATTAATCTACTTGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑GG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATa < 1:3448377/93‑1 (MQ=255)
aaCAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑CGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATAc > 2:5280694/1‑93 (MQ=255)
aCAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACt > 1:5676375/1‑93 (MQ=255)
cAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTa > 2:4668187/1‑93 (MQ=255)
cAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTa > 2:5994555/1‑93 (MQ=255)
cAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGAGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTa > 1:5158935/1‑93 (MQ=255)
aGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑GGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAg > 2:3624045/1‑93 (MQ=255)
aactatGAAAAATCATAGCACTATTAATCTAGTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGa < 2:6028270/90‑1 (MQ=255)
aaaTATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTGCGTGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑CGG‑‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGa < 2:4081793/92‑1 (MQ=255)
aaaTATAACAACTCAGACCACTGTAAGTCTACTGGGGTCT‑AGTCTCCGGTATG‑A‑‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGa < 1:4449227/92‑1 (MQ=255)
aaTATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGaa > 1:587091/1‑93 (MQ=255)
aaTATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGaa > 2:3726636/1‑93 (MQ=255)
atatGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAat < 2:5175795/93‑1 (MQ=255)
atatGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAat > 1:103523/1‑93 (MQ=255)
tatGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAatt > 1:4206281/1‑93 (MQ=255)
atGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAatta > 1:4166125/1‑93 (MQ=255)
gAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAattatt > 2:343222/1‑93 (MQ=255)
aaaaaTCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAAttatta > 2:644885/1‑93 (MQ=255)
aaaaTCCTAACACTATTAAACCGCCGGGGGTT‑AGTATGAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATtattat < 2:4824222/93‑1 (MQ=255)
aaTCATAGTGCTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTACCTGGTC‑C‑T‑‑G‑GG‑GTGGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCa < 1:1201492/93‑1 (MQ=255)
aTCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCAt > 1:3676640/1‑93 (MQ=255)
tCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATg > 1:6469311/1‑93 (MQ=255)
tCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATg > 1:349928/1‑93 (MQ=255)
tCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATg > 2:4189727/1‑93 (MQ=255)
cACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGaa > 1:4047295/1‑93 (MQ=255)
cACTATTAATCTACTGGGGGGG‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGaa > 1:6339877/1‑93 (MQ=255)
aatATTAATCTGCCGGGGGTT‑AGTGACATGTA‑G‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAAt < 2:2881785/91‑1 (MQ=255)
aCTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAAt > 1:1926365/1‑93 (MQ=255)
tATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAAttt > 1:28542/1‑93 (MQ=255)
aTTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTa > 1:5607807/1‑93 (MQ=255)
ttAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TGGG‑GG‑G‑GGG‑GGTAGAATCAAATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTa > 2:3585261/1‑93 (MQ=255)
aaTCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACaa > 1:5448821/1‑93 (MQ=255)
aaTCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATAATAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACaa > 1:4831931/1‑93 (MQ=255)
aTCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAAc > 1:1404602/1‑93 (MQ=255)
tCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAAct > 2:6466982/1‑93 (MQ=255)
cttgtGGGGTGT‑AGGAGCATGTA‑C‑T‑‑G‑GG‑G‑GGGAAGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAActc < 2:2863048/89‑1 (MQ=255)
cTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAActc > 2:1060446/1‑93 (MQ=255)
cTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAActc > 2:4193943/1‑93 (MQ=255)
tACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAActct > 1:3524649/1‑93 (MQ=255)
tgtGGAGGCT‑AGTACGATGTG‑C‑T‑‑G‑GG‑GTGGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACtctt < 1:1210200/91‑1 (MQ=255)
gagggggggTGAGGAGCAGGTG‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAActct < 2:5834922/90‑1 (MQ=255)
aCTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACtctt > 2:3536704/1‑93 (MQ=255)
tGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACtcttct > 1:930533/1‑93 (MQ=255)
ggggggT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTcttctt > 1:1061668/1‑93 (MQ=255)
ggggggT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTcttctt > 2:4216093/1‑93 (MQ=255)
ggT‑AGTATCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGc > 2:4160269/1‑93 (MQ=255)
gt‑agtaTCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCa > 2:3593331/1‑93 (MQ=255)
tgataTCATGTT‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTACAGCaa < 1:4025544/90‑1 (MQ=255)
ggtaTCAGGTG‑C‑T‑‑G‑GG‑GTGGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCAAg < 1:5840335/92‑1 (MQ=255)
agtaTCAGGTG‑C‑T‑‑GAGA‑G‑GTG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCAAg < 2:4324724/93‑1 (MQ=255)
gtaTCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATGCTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCAAgg > 1:4189460/1‑93 (MQ=255)
gtaTCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCAAgg > 2:2302673/1‑93 (MQ=255)
aTCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCAAGGaa > 2:288260/1‑93 (MQ=255)
aTCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCAAGGaa > 2:5459776/1‑93 (MQ=255)
tCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCAAGGaaa > 1:1877240/1‑93 (MQ=255)
tCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCAAGGaaa > 1:6195820/1‑93 (MQ=255)
tCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCAAGGaaa > 2:560972/1‑93 (MQ=255)
tCAGGTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCAAGGaaa > 2:3152237/1‑93 (MQ=255)
ggTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCAAGGAAAcac > 2:5694819/1‑91 (MQ=255)
ggTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCAAGGAAACGc > 2:1786133/1‑93 (MQ=255)
gTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCAAGGAAACGcc > 1:6032336/1‑93 (MQ=255)
gTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCAAGGAAACGcc < 1:888952/93‑1 (MQ=255)
gTA‑C‑TG‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCAAGGAAACGcc < 1:3973656/93‑1 (MQ=255)
tA‑C‑T‑‑G‑GGAG‑AGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCAAGGAAACGCCt < 2:1924199/93‑1 (MQ=255)
|
ATCACGGATTGTATGAGACATGGCAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGT‑AGTATCAGGTA‑C‑T‑‑G‑GG‑G‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCAAGGAAACGCCT > NC_000913/2183796‑2183976
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GATTGTATGAGACATGGCAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑T‑GG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCAAGGAAACGCCTGGTTCTTCATCC > NC_000913/2183802‑2183988
|
GATTGTATGAGACATGGCAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑T‑GG‑GG‑GGG > SRR4302537.857927/1‑94 (MQ=60)
GAGTGTATGAGACATGGCAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAACTCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑T‑GG‑GG‑GGG < SRR4302537.165677/94‑1 (MQ=60)
ATTGTATGAGACATGGCAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑T‑GG‑GG‑GGG‑G > SRR4302537.2978210/1‑94 (MQ=60)
TTGTATGAGACATGGCAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑T‑GG‑GG‑GGGga < SRR4302537.1317267/94‑3 (MQ=60)
TGTATGAGACATGGCAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑T‑GG‑GG‑GGGgag > SRR4302537.2112469/1‑91 (MQ=60)
TATGAGACATGGCAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTA > SRR4302537.3371331/1‑94 (MQ=60)
ATGAGACATGGCAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAG > SRR4302537.2923602/1‑94 (MQ=60)
TGAGACATGGCAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGA > SRR4302537.4072165/1‑94 (MQ=60)
AGACATGGCAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAAT > SRR4302537.3932010/1‑94 (MQ=60)
AGACATGGCAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAAT > SRR4302537.2596210/1‑94 (MQ=60)
CATGGCAACACGTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGTAGTATTAGTCTACGGGGGGGTAGTAGCAGGGGC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAG < SRR4302537.5930747/94‑1 (MQ=46)
ATGGCAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGA > SRR4302537.5211632/1‑94 (MQ=60)
ATGGCAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGA > SRR4302537.1666155/1‑94 (MQ=60)
GCAGCACCTGGAGAAGAAGAATATGAAAGATCGTCGCACTATGAATGTACGGGGGGGGAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTG < SRR4302537.1160167/94‑1 (MQ=25)
CAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGC > SRR4302537.5042336/1‑94 (MQ=60)
aaaaacaGGTTAAAAAGAATATGAAAAATCATAGCTCTATTAATATAGTTGGGGGTTGTATGAGGTCC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCC < SRR4302537.3139469/87‑1 (MQ=34)
AACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCC > SRR4302537.3549402/1‑94 (MQ=60)
AACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAAGCAGATTGCC > SRR4302537.5882243/1‑94 (MQ=60)
ACACCTGGTTAACAATAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCGGCGGGGGGGTAGTATCAGGTAG‑T‑GGTGG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCG < SRR4302537.17418/94‑1 (MQ=60)
CACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGA > SRR4302537.796230/1‑94 (MQ=60)
CACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGA > SRR4302537.2979662/1‑94 (MQ=60)
CACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGA > SRR4302537.299896/1‑94 (MQ=60)
CCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAAT > SRR4302537.8052/1‑94 (MQ=60)
TGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTA > SRR4302537.261079/1‑94 (MQ=60)
GGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAA > SRR4302537.1322121/1‑94 (MQ=60)
GTTAACAAGAATAGGAAAAATCATATCACTATTAGTCTAGTGGGGGTGAGTATCGGCTGC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAAT < SRR4302537.6444594/94‑1 (MQ=36)
TTAATAAGAATACGAAAACTCATAGCACGATTAATCGACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATA < SRR4302537.4107242/94‑1 (MQ=60)
taaagaagaatatgaattgtcataggattagtaatcgtttggggggtattatgagggccggGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATA < SRR4302537.4395065/33‑1 (MQ=60)
TAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATAC > SRR4302537.4487772/1‑94 (MQ=60)
TAAAAAAAATAAGAAAAATAATAGCACTATTAATCTACTTGGGGGTAGTATCAGGTACGG‑GG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATAC < SRR4302537.3472768/94‑1 (MQ=60)
AACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACT > SRR4302537.5715213/1‑94 (MQ=60)
ACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTA > SRR4302537.5633930/1‑94 (MQ=60)
ACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGAGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTA > SRR4302537.5194488/1‑94 (MQ=60)
aagaatatgataaatcagagcagtataaggctgatggagtGTAGTATCAGGTACGG‑GG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAG < SRR4302537.4210845/54‑1 (MQ=60)
aagaatatgaagatgcatcatgttgataagctccagggatgtggtaacaggtcaagGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAG < SRR4302537.2370550/38‑1 (MQ=60)
AGAATATGAAAAATAATAGCACTAGTAATGTGCGGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGA < SRR4302537.2359254/94‑1 (MQ=60)
taataaaaatagtcagaggtaaattgaggTACTGGGGGGTAGTATCAGTGGC‑T‑GG‑GG‑GGGAAGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAA < SRR4302537.5029991/65‑1 (MQ=53)
GAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAA > SRR4302537.591103/1‑94 (MQ=60)
ctgaatgcacacctatagtctgccgagtcttataggaagcaggttaaagaactgcG‑GG‑GGT‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAA < SRR4302537.6015564/39‑1 (MQ=60)
aaatataacaactcagaccactgtaagtctactggggtctagtctccggtatgaGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAA < SRR4302537.4479953/40‑1 (MQ=60)
AATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAAT > SRR4302537.104268/1‑94 (MQ=60)
aatagtaaaaatcatagtattatgagtcgtggggcgtgtagtagcagctgctgGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAAT < SRR4302537.2291372/41‑1 (MQ=60)
ATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATT > SRR4302537.4235634/1‑94 (MQ=60)
TATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTA > SRR4302537.4195223/1‑94 (MQ=60)
TATGAAAAAGCATAGCATTATGAATCTGCTGAGGTGTGGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTA < SRR4302537.4069804/94‑1 (MQ=57)
GAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTA > SRR4302537.1494522/1‑94 (MQ=60)
ataccattgccctattagtatgctggggggttttttcatgtgctgGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCA < SRR4302537.1773290/49‑1 (MQ=60)
aagcaagagtagggacgagggcgtggggggaggtatgggcgacacGG‑GG‑GTG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCA < SRR4302537.4954526/49‑1 (MQ=60)
AATCATAGTGCTATTAATCTACTGGGGGGTAGTACCTGGTCC‑T‑GG‑GGTGGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCAT < SRR4302537.1209845/94‑1 (MQ=60)
AATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCAT > SRR4302537.3702503/1‑94 (MQ=60)
cacagctaaggaccatcaaccaacagggagctggtagcgggccgtggcggaGG‑AGTAGATTCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATC < SRR4302537.3585102/43‑1 (MQ=60)
ATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATG > SRR4302537.6513155/1‑94 (MQ=60)
ATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATG > SRR4302537.352363/1‑94 (MQ=60)
atcgcggaataagtctgcgGGGGGGTAGTATCAGGTGC‑T‑GG‑GG‑GGGTAGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACC < SRR4302537.6284197/75‑1 (MQ=60)
agtagcagtagtgacggacggggatgtggtggtggtggatgGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGAC < SRR4302537.3552357/53‑1 (MQ=60)
ATAGCACGATTGATCTACGGGGGGGTAGTAGCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACC < SRR4302537.6504342/94‑1 (MQ=60)
AGCACTATTAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGA > SRR4302537.3842122/1‑94 (MQ=60)
catccctgctagccgacgacatcgaggtctggggtgagaagcG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCG < SRR4302537.4797356/52‑1 (MQ=60)
GCACTATTAGTCTAGTGGGGAGTAGTCTCAGGTAC‑T‑GG‑GGTGCG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAA < SRR4302537.3071006/94‑1 (MQ=60)
GCACTATTAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAA > SRR4302537.4075598/1‑94 (MQ=60)
GCACTATTAATCTACTGGGGGGGAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAA > SRR4302537.6383199/1‑94 (MQ=60)
ttctgtgcgatggctggggtgtcgtgggaggcAC‑T‑GG‑GG‑GGGAAGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAAT < SRR4302537.5512737/62‑1 (MQ=60)
CACTATTAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAAT > SRR4302537.5353702/1‑94 (MQ=60)
CACTATTAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAAT > SRR4302537.1939733/1‑94 (MQ=60)
CACTATTAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAAT > SRR4302537.3949897/1‑94 (MQ=60)
ACTATGAATATACTGGGGGTTAGTATCAAGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATT < SRR4302537.1950856/94‑1 (MQ=60)
CTATTAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTT > SRR4302537.28771/1‑94 (MQ=60)
TATTAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTA > SRR4302537.5646145/1‑94 (MQ=60)
taactctagcgggtgcaccgctatggcagtgGG‑GG‑GCG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACA < SRR4302537.3508346/63‑1 (MQ=60)
TAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAA > SRR4302537.5485986/1‑94 (MQ=60)
TAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAA > SRR4302537.3521260/1‑94 (MQ=60)
TAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATAATAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAA > SRR4302537.4865298/1‑94 (MQ=60)
AATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAAC > SRR4302537.1414384/1‑94 (MQ=60)
tacctgcgtgcgggttggatgatggagggcgcgtGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAAC < SRR4302537.4027806/60‑1 (MQ=60)
CTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCT > SRR4302537.3549581/1‑94 (MQ=60)
CTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCT > SRR4302537.916245/1‑94 (MQ=60)
atcgaggggggtgttgccgttgggtccgctggccG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACT < SRR4302537.4247650/60‑1 (MQ=60)
CTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCT > SRR4302537.936946/1‑94 (MQ=60)
tctcggggcgtatatcgacgtaaaggggagtG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATGCTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTT < SRR4302537.2556622/63‑1 (MQ=60)
TGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTT > SRR4302537.1068989/1‑94 (MQ=60)
tgtggaggctagtacgatgtgctggggtGGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTC < SRR4302537.1218618/66‑1 (MQ=60)
GGGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTC > SRR4302537.2643454/1‑94 (MQ=60)
GGGGGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCA > SRR4302537.6202670/1‑94 (MQ=60)
gtggatattataacgtacggGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCA < SRR4302537.4738297/74‑1 (MQ=60)
gtgtgcgtaatgaggaattggctgtcG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCA < SRR4302537.1170616/68‑1 (MQ=60)
GGTAGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCA > SRR4302537.3387301/1‑94 (MQ=60)
tgatatcatgttctgGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTACAGCAAG < SRR4302537.4053727/79‑1 (MQ=60)
GGTATCAGGTGC‑T‑GG‑GGTGGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCAAGG < SRR4302537.5880381/94‑1 (MQ=60)
AGTATCAGGTGC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGTATTATTATCATGACAGAATTTACAACTCTTCTTCAGTAAGG > SRR4302537.3355485/1‑94 (MQ=60)
AGTATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATGCTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCAAGG > SRR4302537.4218722/1‑94 (MQ=60)
ATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCAAGGAAA > SRR4302537.6238514/1‑94 (MQ=60)
ATCAGGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCAAGGAAA > SRR4302537.1890297/1‑94 (MQ=60)
gagcgacggaG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCAAGGAAACG < SRR4302537.1510283/84‑1 (MQ=60)
agagataaggggtG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCAAGGAAAC < SRR4302537.673649/81‑1 (MQ=60)
GGTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCAAGGAAACGCC > SRR4302537.6073786/1‑94 (MQ=60)
GTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCAAGGAAACGCCT < SRR4302537.4001475/94‑1 (MQ=60)
GTAC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCAAGGAAACGCCT < SRR4302537.895066/94‑1 (MQ=60)
ttgagGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCAAGGAAACGCCTG < SRR4302537.1455312/89‑1 (MQ=60)
AC‑TGGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCAAGGAAACGCCTGG > SRR4302537.679060/1‑94 (MQ=60)
aatgcG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCAAGGAAACGCCTGG < SRR4302537.2008228/89‑1 (MQ=60)
tgGG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCAAGGAAACGCCTGGTT > SRR4302537.4072955/3‑94 (MQ=60)
G‑GG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCAAGGAAACGCCTGGTTC > SRR4302537.587484/1‑94 (MQ=60)
gacG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCAAGGAAACGCCTGGTTCT < SRR4302537.4204088/91‑1 (MQ=60)
GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTATTACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCAAGGAAACGCCTGGTTCTTC > SRR4302537.835920/1‑94 (MQ=60)
GTG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCAAGGAAACGCCTGGTTCTTCAT < SRR4302537.1485999/94‑1 (MQ=60)
GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCAAGGAAACGCCTGGTTCTTCAT > SRR4302537.2973856/1‑94 (MQ=60)
GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCAAGGAAACGCCTGGTTCTTCAT < SRR4302537.3625133/94‑1 (MQ=60)
GGA‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCAAGGAAACGCCTGGTTCTTCAT < SRR4302537.714918/94‑1 (MQ=60)
G‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCAAGGAAACGCCTGGTTCTTCATCC < SRR4302537.2752158/94‑1 (MQ=60)
|
GATTGTATGAGACATGGCAACACCTGGTTAACAAGAATATGAAAAATCATAGCACTATTAATCTACTGGGGGGTAGTATCAGGTAC‑T‑GG‑GG‑GGG‑AGTAGAATCAGATTGCCGAATTAATACTAAGAATTATTATCATGACCGAATTTACAACTCTTCTTCAGCAAGGAAACGCCTGGTTCTTCATCC > NC_000913/2183802‑2183988
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
