Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,225,969 |
A→G |
S191P (TCA→CCA) |
yohG ← |
putative channel/filament proteins |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,225,969 | 0 | A | G | 100.0%
| 758.5
/ NA
| 216 | S191P (TCA→CCA) | yohG | putative channel/filament proteins |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (92/124); total (92/124) |
Only 100 of 218 total aligned reads displayed.
AATCTGCCCGCCGGGCCAGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGACTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGAGCTGCTGCCGGGTTTTGC > NC_000913/2225879‑2226058
|
aaTCTGCCCGCCGGGCCAGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCt > 2:4943288/1‑93 (MQ=255)
aaTCTGCCCGCCGGGCCAGCAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCt > 2:6239608/1‑93 (MQ=255)
aTCTGCCCGCCGGGCCAGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCtt < 2:3118382/93‑1 (MQ=255)
aTCTGCCCGCCGGGCCAGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCtt > 2:5086342/1‑93 (MQ=255)
aTCTGCCCGCCGCGCCAGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCtt < 1:3053709/93‑1 (MQ=255)
tCTGCCCGCCGGGCCAGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCttt < 2:3594969/93‑1 (MQ=255)
tCTGCCCGCCGGGCCAGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCttt > 2:5263592/1‑93 (MQ=255)
ccgccgGGCCAGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTg > 2:1061347/1‑93 (MQ=255)
ccgccgGGCCAGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTg > 1:972104/1‑93 (MQ=255)
ccgccgGGCCAGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTg > 1:5049061/1‑93 (MQ=255)
ccgGGCCAGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGtt > 1:4111170/1‑93 (MQ=255)
cgGGCCAGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTa < 2:2886654/93‑1 (MQ=255)
gggCCAGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTAt > 1:6329239/1‑93 (MQ=255)
gggCCAGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTAt > 1:4721730/1‑93 (MQ=255)
ggCCAGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTAtt > 1:1099026/1‑93 (MQ=255)
ggCCAGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTAtt < 1:5282481/93‑1 (MQ=255)
gCCAGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTAttt < 1:2496311/93‑1 (MQ=255)
cAGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGt > 2:4382938/1‑93 (MQ=255)
aGTAAGGAGTCCCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTATCTGGTTATTTGTa < 2:1898184/93‑1 (MQ=255)
aGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGCTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTa > 1:5662664/1‑93 (MQ=255)
gTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTaa < 1:934540/93‑1 (MQ=255)
gTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTaa < 2:660682/93‑1 (MQ=255)
gTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTaa < 2:5905311/93‑1 (MQ=255)
tAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAg < 1:2022272/93‑1 (MQ=255)
aaGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGt < 1:5896342/93‑1 (MQ=255)
aaGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGt > 2:3287251/1‑93 (MQ=255)
aGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTgcgc < 1:295569/93‑1 (MQ=255)
gTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCt > 2:2026389/1‑93 (MQ=255)
tACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCtt < 2:1213053/93‑1 (MQ=255)
aCCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTa < 1:4391140/93‑1 (MQ=255)
ccccAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTaa > 2:1632591/1‑93 (MQ=255)
cccAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAAc < 1:1433753/93‑1 (MQ=255)
cccAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAAc < 2:6471232/93‑1 (MQ=255)
cccAGTGCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAAc < 1:3433472/93‑1 (MQ=255)
ccAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAAcc < 1:4762177/93‑1 (MQ=255)
ccAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAAcc > 1:1861161/1‑93 (MQ=255)
tcatcaGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGcc < 2:2816248/93‑1 (MQ=255)
tcaGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCa < 2:2941187/93‑1 (MQ=255)
caGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCaa < 2:5174024/93‑1 (MQ=255)
aGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCaat > 2:5626033/1‑93 (MQ=255)
ggAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCaata > 1:4879953/1‑93 (MQ=255)
ggAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCaata < 2:2455598/93‑1 (MQ=255)
ggAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCaata < 2:1711444/93‑1 (MQ=255)
gAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCaataa > 1:568912/1‑93 (MQ=255)
aaGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCaataat < 2:4462385/93‑1 (MQ=255)
aaGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCaataat < 1:6438798/93‑1 (MQ=255)
aGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAatt < 2:3419131/93‑1 (MQ=255)
aGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTGCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAatt < 1:3087436/93‑1 (MQ=255)
gCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAattt < 1:333898/93‑1 (MQ=255)
gCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAattt > 1:429894/1‑93 (MQ=255)
tGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAattttc < 2:2110048/93‑1 (MQ=255)
tGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAattttc > 2:5010056/1‑93 (MQ=255)
tGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAattttc > 2:3208872/1‑93 (MQ=255)
ggCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAattttca < 2:1314743/93‑1 (MQ=255)
gCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAattttcat > 1:2117228/1‑93 (MQ=255)
gCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAattttcat > 2:2517034/1‑93 (MQ=255)
gCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAattttcat > 1:598329/1‑93 (MQ=255)
cTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAattttcatt < 2:720986/93‑1 (MQ=255)
ttGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAattttccttt > 2:2557152/1‑93 (MQ=255)
ttGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAattttcattt > 1:2818566/1‑93 (MQ=255)
tGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAattttcatttt > 1:1090214/1‑93 (MQ=255)
tGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAattttcatttt < 2:3625748/93‑1 (MQ=255)
tGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAattttcatttt < 1:4200919/93‑1 (MQ=255)
tGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAattttcatttt > 2:3218281/1‑93 (MQ=255)
gCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAattttcattttc < 1:3716003/93‑1 (MQ=255)
ccACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTcc < 2:4159154/93‑1 (MQ=255)
ccACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTcc < 2:5404480/93‑1 (MQ=255)
ccTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTcccc < 1:3294730/92‑1 (MQ=255)
cTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCcg < 1:447735/93‑1 (MQ=255)
tttCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCcgc < 2:2674791/93‑1 (MQ=255)
tCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGa > 2:5543118/1‑93 (MQ=255)
cGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGAc < 1:6393614/93‑1 (MQ=255)
gCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACAt > 1:6169356/1‑93 (MQ=255)
cAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATc < 1:4575000/93‑1 (MQ=255)
aCGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGt > 2:6360139/1‑93 (MQ=255)
aCGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGt > 2:140965/1‑93 (MQ=255)
aCGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGt > 1:5399205/1‑93 (MQ=255)
aCGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGt > 1:841015/1‑93 (MQ=255)
cgcgACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGtt > 1:3900493/1‑93 (MQ=255)
cgcgACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGtt > 2:5752211/1‑93 (MQ=255)
gcgACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTg < 2:3978538/93‑1 (MQ=255)
gcgACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTg < 1:5499470/93‑1 (MQ=255)
cgACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGa > 1:1538944/1‑93 (MQ=255)
aCCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATACTTTTCATTTTCCCCGCGCCATCGTTGAgc > 2:2864982/1‑93 (MQ=255)
aCCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGAgc < 2:1547187/93‑1 (MQ=255)
ccGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGAgct > 2:462867/1‑93 (MQ=255)
ccGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGAgct < 1:1446297/93‑1 (MQ=255)
ccGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGAgct > 2:3224364/1‑93 (MQ=255)
ggTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGAgctgc > 2:3840138/1‑93 (MQ=255)
ggTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGAgctgc < 2:6193779/93‑1 (MQ=255)
gTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGAgctgct > 2:47623/1‑93 (MQ=255)
tAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGAGCTGCTGcc < 2:914383/93‑1 (MQ=255)
aaGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGAGCTGCTGCCg < 1:3959803/93‑1 (MQ=255)
gCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGAGCTGCTGCCggg < 1:5537415/93‑1 (MQ=255)
ttCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGAGCTGCTGCCGGGtt > 1:6347/1‑93 (MQ=255)
ttCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGAGCTGCTGCCGGGtt < 2:2202274/93‑1 (MQ=255)
ttCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGAGCTGCTGCCGGGtt < 1:3638299/93‑1 (MQ=255)
cAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGAGCTGCTGCCGGGtttt < 1:1732022/93‑1 (MQ=255)
aaTGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGAGCTGCTGCCGGGTTTTg > 2:1033257/1‑93 (MQ=255)
aTGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGAGCTGCTGCCGGGTTTTGc > 2:5691500/1‑93 (MQ=255)
|
AATCTGCCCGCCGGGCCAGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGACTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGAGCTGCTGCCGGGTTTTGC > NC_000913/2225879‑2226058
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CAAATCTGCCCGCCGGGCCAGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGACTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGAGCTGCTGCCGGGTTTTGCTGG > NC_000913/2225877‑2226061
|
CAAATCTGCCCGCCGGGCCAGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGC < SRR4302537.6402453/94‑1 (MQ=60)
CAAATCTGCCCGCCGGGCCAGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCCTCAATGGC > SRR4302537.1215907/1‑94 (MQ=60)
AAATCTGCCCGCCGGGCCAGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCT < SRR4302537.1016057/94‑1 (MQ=60)
ATCTGCCCGCCGGGCCAGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTT < SRR4302537.4770273/94‑1 (MQ=60)
ATCTGCCCGCCGCGCCAGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTT < SRR4302537.3074991/94‑1 (MQ=60)
TCTGCCCGCCGGGCCAGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTG < SRR4302537.5725841/94‑1 (MQ=60)
TGCCCGCCGGGCCAGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTC > SRR4302537.6182610/1‑94 (MQ=60)
GCCCGCCGGGCCAGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCT > SRR4302537.3096861/1‑94 (MQ=60)
GCCCGCCGGGCCAGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCT < SRR4302537.3071081/94‑1 (MQ=60)
CCCGCCGGGCCAGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTG > SRR4302537.5083825/1‑94 (MQ=60)
CCCGCCGGGCCAGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTG > SRR4302537.978807/1‑94 (MQ=60)
GCCGGGCCAGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTT > SRR4302537.4139887/1‑94 (MQ=60)
CGGGCCAGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTAT > SRR4302537.4754371/1‑94 (MQ=60)
CGGGCCAGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTAT > SRR4302537.6372521/1‑94 (MQ=60)
GGGCCAGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATT > SRR4302537.1106620/1‑94 (MQ=60)
GGCCAGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTT < SRR4302537.5318814/94‑1 (MQ=60)
GGCCAGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTT < SRR4302537.4135606/94‑1 (MQ=60)
GCCAGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCAGTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTG > SRR4302537.3483532/1‑94 (MQ=60)
GCCAGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTG < SRR4302537.2513884/94‑1 (MQ=60)
CAGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTA > SRR4302537.5561390/1‑94 (MQ=60)
CAGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGCTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTA > SRR4302537.5701410/1‑94 (MQ=60)
AGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAA < SRR4302537.1755819/94‑1 (MQ=60)
GTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAG < SRR4302537.940980/94‑1 (MQ=60)
TAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGT < SRR4302537.2036382/94‑1 (MQ=60)
AAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTG < SRR4302537.5936799/94‑1 (MQ=60)
AGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGC > SRR4302537.4774698/1‑94 (MQ=60)
GGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCG < SRR4302537.3208429/94‑1 (MQ=60)
GAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGC > SRR4302537.3034090/1‑94 (MQ=60)
AGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCT < SRR4302537.297630/94‑1 (MQ=60)
AGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCT < SRR4302537.3351888/94‑1 (MQ=60)
ACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAA < SRR4302537.4421415/94‑1 (MQ=60)
CCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAAC < SRR4302537.4286186/94‑1 (MQ=60)
CCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACC < SRR4302537.1443727/94‑1 (MQ=60)
CCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACC > SRR4302537.1874121/1‑94 (MQ=60)
CCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACC < SRR4302537.4543778/94‑1 (MQ=60)
CCCAGTGCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACC < SRR4302537.3457774/94‑1 (MQ=60)
CCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCG < SRR4302537.5550965/94‑1 (MQ=60)
CCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCG < SRR4302537.4795066/94‑1 (MQ=60)
CAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGT < SRR4302537.395874/94‑1 (MQ=60)
AGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTG < SRR4302537.1839756/94‑1 (MQ=60)
GTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGC < SRR4302537.4891902/94‑1 (MQ=60)
TTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCC > SRR4302537.740387/1‑94 (MQ=60)
TCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCT > SRR4302537.5188453/1‑94 (MQ=60)
ATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCA > SRR4302537.3474283/1‑94 (MQ=60)
CAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAAT < SRR4302537.5960858/94‑1 (MQ=60)
AGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATA < SRR4302537.3686133/94‑1 (MQ=60)
AGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATA > SRR4302537.4913663/1‑94 (MQ=60)
GGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAA > SRR4302537.572823/1‑94 (MQ=60)
GGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAA > SRR4302537.1398492/1‑94 (MQ=60)
GAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAAT < SRR4302537.909744/94‑1 (MQ=60)
AAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATT < SRR4302537.6482507/94‑1 (MQ=60)
AAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATT < SRR4302537.3809841/94‑1 (MQ=60)
AGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTT > SRR4302537.432890/1‑94 (MQ=60)
AGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTGCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTT < SRR4302537.3108974/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTT < SRR4302537.336208/94‑1 (MQ=60)
CTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTC < SRR4302537.5885785/94‑1 (MQ=60)
TGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCA > SRR4302537.4696103/1‑94 (MQ=60)
GGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCAT > SRR4302537.602423/1‑94 (MQ=60)
GGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCAT < SRR4302537.2315264/94‑1 (MQ=60)
GGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCAT > SRR4302537.2132142/1‑94 (MQ=60)
GGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCAT < SRR4302537.6414174/94‑1 (MQ=60)
CTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTT > SRR4302537.2838272/1‑94 (MQ=60)
CTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTT < SRR4302537.27477/94‑1 (MQ=60)
CTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTT < SRR4302537.6159885/94‑1 (MQ=60)
CTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTT > SRR4302537.1576841/1‑94 (MQ=60)
CTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTT > SRR4302537.1101269/1‑94 (MQ=60)
TTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTT > SRR4302537.1097742/1‑94 (MQ=60)
TGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTC < SRR4302537.4230247/94‑1 (MQ=60)
GCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCC < SRR4302537.3742122/94‑1 (MQ=60)
CCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCC < SRR4302537.1458982/94‑1 (MQ=60)
CCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCC > SRR4302537.293370/1‑94 (MQ=60)
CCTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCG < SRR4302537.3318017/94‑1 (MQ=60)
CTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGC < SRR4302537.450837/94‑1 (MQ=60)
CTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGC < SRR4302537.4219488/94‑1 (MQ=60)
CGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACA < SRR4302537.6437162/94‑1 (MQ=60)
GGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACAT > SRR4302537.6211839/1‑94 (MQ=60)
CAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCG < SRR4302537.4497214/94‑1 (MQ=60)
CAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCG > SRR4302537.4259614/1‑94 (MQ=60)
CAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCG < SRR4302537.4606663/94‑1 (MQ=60)
AACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGT > SRR4302537.846775/1‑94 (MQ=60)
AACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGT > SRR4302537.5452357/1‑94 (MQ=60)
AACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGT > SRR4302537.5436060/1‑94 (MQ=60)
ACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTT > SRR4302537.3927763/1‑94 (MQ=60)
ACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTT < SRR4302537.5074692/94‑1 (MQ=60)
CGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTG > SRR4302537.3416652/1‑94 (MQ=60)
GCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGA > SRR4302537.1549686/1‑94 (MQ=60)
GCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGA < SRR4302537.563593/94‑1 (MQ=60)
GCGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGA < SRR4302537.5537024/94‑1 (MQ=60)
CGACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGAG < SRR4302537.4386099/94‑1 (MQ=60)
GACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGAGC > SRR4302537.637433/1‑94 (MQ=60)
ACCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGCGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGAGCT > SRR4302537.1900046/1‑94 (MQ=60)
CCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGAGCTG > SRR4302537.2063172/1‑94 (MQ=60)
CCGGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGAGCTG < SRR4302537.1456374/94‑1 (MQ=60)
GGTTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCACTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGAGCTGCT < SRR4302537.1455043/94‑1 (MQ=60)
GGTGTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGAGCTGCT < SRR4302537.874244/94‑1 (MQ=60)
TTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGAGCTGCTGC < SRR4302537.951347/94‑1 (MQ=60)
TTTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGAGCTGCTGC < SRR4302537.5371127/94‑1 (MQ=60)
TTAAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGAGCTGCTGCC > SRR4302537.644411/1‑94 (MQ=60)
AAGCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGAGCTGCTGCCGG < SRR4302537.3987507/94‑1 (MQ=60)
GCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATATTTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGAGCTGCTGCCGGGT > SRR4302537.6292813/1‑94 (MQ=60)
GCTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGAGCTGCTGCCGGGT < SRR4302537.5575214/94‑1 (MQ=60)
CTTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGAGCTGCTGCCGGGTT > SRR4302537.6395/1‑94 (MQ=60)
TTCAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGAGCTGCTGCCGGGTTT < SRR4302537.3663916/94‑1 (MQ=60)
CAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGAGCTGCTGCCGGGTTTTG < SRR4302537.980586/94‑1 (MQ=60)
CAATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGAGCTGCTGCCGGGTTTTG < SRR4302537.1744108/94‑1 (MQ=60)
ATGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGAGCTGCTGCCGGCTTTTGCT > SRR4302537.5314264/1‑94 (MQ=60)
TGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGAGCTGCTGCCGGGTTTTGCTG > SRR4302537.1983683/1‑94 (MQ=60)
TGGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGAGCTGCTGCCGGGTTTTGCTG < SRR4302537.3094828/94‑1 (MQ=60)
GGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGAGCTGCTGCCGGGTTTTGCTGG < SRR4302537.2608551/94‑1 (MQ=60)
GGCTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGAGCTGCTGCCGGGTTTTGCTGG < SRR4302537.1157825/94‑1 (MQ=60)
|
CAAATCTGCCCGCCGGGCCAGTAAGGAGTACCCCAGTTCATCAGGAAGCTGGCTTGCCACTTTCGGCAACGCGACCGGTTTAAGCTTCAATGACTTTGTCTGGTTATTTGTAAGTGCGCTTAACCGTGCCTCAATAATTTTCATTTTCCCCGCGACATCGTTGAGCTGCTGCCGGGTTTTGCTGG > NC_000913/2225877‑2226061
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
