Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,429,483 |
T→C |
E65E (GAA→GAG) |
dedD ← |
putative lipoprotein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,429,483 | 0 | T | C | 100.0%
| 578.6
/ NA
| 170 | E65E (GAA→GAG) | dedD | putative lipoprotein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (74/96); total (74/96) |
Only 100 of 184 total aligned reads displayed.
GACCGGTGCAGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACTTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCGCTTTCG > NC_000913/2429393‑2429571
|
aCCGGTGCAGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCAcctct < 2:2388772/93‑1 (MQ=255)
cGGTGCAGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACctcttc < 1:4753053/93‑1 (MQ=255)
cGGTGCAGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACctcttc > 2:3105584/1‑93 (MQ=255)
gCAGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCt < 1:3792296/93‑1 (MQ=255)
aGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTgc < 1:3068135/93‑1 (MQ=255)
ggTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTgcg > 2:2276237/1‑93 (MQ=255)
gTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTgcgc > 1:2164964/1‑93 (MQ=255)
tCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCt > 2:3522364/1‑93 (MQ=255)
tCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCt < 2:5339098/93‑1 (MQ=255)
tCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCt < 1:2215827/93‑1 (MQ=255)
ccGGTTCAAACTCGGTTTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCtt < 2:4266542/93‑1 (MQ=255)
ccGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCtt < 1:734835/93‑1 (MQ=255)
ccGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCtt < 2:6205165/93‑1 (MQ=255)
cGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTc > 2:3400822/1‑93 (MQ=255)
cGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCAACTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTc > 1:1319777/1‑93 (MQ=255)
ggTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTcc > 1:5440081/1‑93 (MQ=255)
gTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCcg > 1:2731892/1‑93 (MQ=255)
ttCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCcgg > 2:3337251/1‑93 (MQ=255)
cAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCcggcg < 1:3458547/93‑1 (MQ=255)
cAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCcggcg < 1:4453588/93‑1 (MQ=255)
cAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCcggcg < 2:5742040/93‑1 (MQ=255)
aaaCTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCcggcgg > 1:5817975/1‑93 (MQ=255)
aaCTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCggcggc < 2:2031981/93‑1 (MQ=255)
aaCTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCggcggc > 1:1228889/1‑93 (MQ=255)
aaCTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCggcggc < 1:3594893/93‑1 (MQ=255)
aCTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCt < 2:4079335/93‑1 (MQ=255)
aCTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCt < 2:1069138/93‑1 (MQ=255)
cTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTg < 2:3246860/93‑1 (MQ=255)
gtgtTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTc < 1:2489910/93‑1 (MQ=255)
tgtTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTCCGTCg > 1:1576441/1‑93 (MQ=255)
gtTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGTGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCgg > 1:343706/1‑93 (MQ=255)
ttATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGt > 1:1664439/1‑93 (MQ=255)
ttATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGt < 1:4624977/93‑1 (MQ=255)
ttATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGCCTGCGTCGGt > 1:1979818/1‑93 (MQ=255)
tATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTa > 2:914271/1‑93 (MQ=255)
atgggCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTaa < 2:194837/90‑1 (MQ=255)
aTTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTaa < 2:5798707/93‑1 (MQ=255)
ttGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAAc < 1:907334/93‑1 (MQ=255)
tGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTGCGGCGGCTGCGTCGGTAACg > 1:4301593/1‑93 (MQ=255)
tGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACg > 2:3426244/1‑93 (MQ=255)
gCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGcc < 1:3279670/93‑1 (MQ=255)
gCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGcc > 2:1493938/1‑93 (MQ=255)
gCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGcc < 2:4542671/93‑1 (MQ=255)
cTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCt < 2:6078352/93‑1 (MQ=255)
tGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTg < 2:963792/93‑1 (MQ=255)
tGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTg < 1:4956929/93‑1 (MQ=255)
tGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGAAACGCCTg < 2:6325457/93‑1 (MQ=255)
tGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCAGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTg < 2:2196556/93‑1 (MQ=255)
gCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTgg < 1:3098220/93‑1 (MQ=255)
gCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTgg > 2:6438198/1‑93 (MQ=255)
aaTAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTgggg > 1:2401156/1‑92 (MQ=255)
aaTAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTgggg > 2:4830534/1‑92 (MQ=255)
aTAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTg > 1:5924790/1‑93 (MQ=255)
aGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTggg > 2:5102467/1‑92 (MQ=255)
aGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTggc < 1:166133/93‑1 (MQ=255)
gTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTTGGTggcg > 1:5882645/1‑93 (MQ=255)
ggCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTggcggc > 1:2933997/1‑93 (MQ=255)
gCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCt < 1:4035557/93‑1 (MQ=255)
gCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCt > 2:5447633/1‑93 (MQ=255)
gCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCt < 2:5923189/93‑1 (MQ=255)
ccGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGGGGGTg > 2:3675455/1‑93 (MQ=255)
ccGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTg < 2:3584405/93‑1 (MQ=255)
gATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGca > 1:2110305/1‑93 (MQ=255)
gATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGca < 1:6441374/93‑1 (MQ=255)
aTCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGcat > 2:858081/1‑93 (MQ=255)
tCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGcatc < 2:4142175/93‑1 (MQ=255)
tCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGcatc > 1:5678816/1‑93 (MQ=255)
gAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTCACGCCTGGGTGGCGGCTGGcctcat > 1:2252136/1‑93 (MQ=255)
gAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGcatcat > 2:5651954/1‑93 (MQ=255)
gCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCatat < 1:3681577/93‑1 (MQ=255)
gACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCa < 2:5520038/93‑1 (MQ=255)
gACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCa < 1:450548/93‑1 (MQ=255)
gACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCa < 1:1193826/93‑1 (MQ=255)
ggTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGc > 2:469007/1‑93 (MQ=255)
gTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCt > 1:6097828/1‑93 (MQ=255)
gTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCt > 1:5549822/1‑93 (MQ=255)
gTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCt > 1:2881223/1‑93 (MQ=255)
gTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCt < 2:2033593/93‑1 (MQ=255)
gctgcGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCtca > 1:2920223/1‑93 (MQ=255)
ctgcGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCtcat > 1:537932/1‑93 (MQ=255)
ctgcGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCtcat < 2:2888278/93‑1 (MQ=255)
tgcGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCtcatc < 1:141076/93‑1 (MQ=255)
tgcGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCtcatc < 1:5587921/93‑1 (MQ=255)
gcGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCtcatca > 2:1920601/1‑93 (MQ=255)
cGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCtcatcag < 2:2668054/93‑2 (MQ=255)
cGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCAc > 1:6177716/1‑93 (MQ=255)
cGGCAGCACCTGCCCGCGCCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCAc < 1:5751848/93‑1 (MQ=255)
gCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGGCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGa < 2:2481356/93‑1 (MQ=255)
cATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGAt < 2:2057210/93‑1 (MQ=255)
cATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGAt < 2:6300629/93‑1 (MQ=255)
cATCACCTCCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGAt < 2:4173215/93‑1 (MQ=255)
aTCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAAGCTCATCACGATc > 2:5099776/1‑93 (MQ=255)
ccTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGccc < 1:1009377/93‑1 (MQ=255)
cTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCg > 2:4957320/1‑93 (MQ=255)
tGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCGc < 2:2797352/93‑1 (MQ=255)
ccGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCGCttt < 1:2698582/93‑1 (MQ=255)
ccGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCGCttt < 1:254519/93‑1 (MQ=255)
cGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCGCTTTc < 2:5997638/93‑1 (MQ=255)
cGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCGCTTTc > 2:6383138/1‑93 (MQ=255)
gCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCGCTTTCg > 1:1737106/1‑93 (MQ=255)
|
GACCGGTGCAGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACTTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCGCTTTCG > NC_000913/2429393‑2429571
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GGCGACCGGTGCAGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACTTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCGCTTTCGGCAC > NC_000913/2429390‑2429575
|
GGCGACCGGTGCAGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACC > SRR4302537.2632747/1‑94 (MQ=60)
GGCGACCGGTGCAGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACC > SRR4302537.5295566/1‑94 (MQ=60)
CGACCGGTGCAGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTC < SRR4302537.789876/94‑1 (MQ=60)
GACCGGTGCAGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCT > SRR4302537.5668553/1‑94 (MQ=60)
GACCGGTGCAGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGACGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCT < SRR4302537.4580060/94‑1 (MQ=60)
CCGGTGCAGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTC < SRR4302537.367863/94‑1 (MQ=60)
CGGTGCAGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCC < SRR4302537.1231040/94‑1 (MQ=60)
CGGTGCAGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCC < SRR4302537.4785885/94‑1 (MQ=60)
GCAGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTG < SRR4302537.3818909/94‑1 (MQ=60)
CAGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGC < SRR4302537.1296743/94‑1 (MQ=60)
CAGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGC > SRR4302537.6365774/1‑94 (MQ=60)
AGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCG < SRR4302537.3089511/94‑1 (MQ=60)
GGTTCCGGTTCAAGCTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGC < SRR4302537.4208989/94‑1 (MQ=60)
GGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGC > SRR4302537.5190633/1‑94 (MQ=60)
GGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGC > SRR4302537.2180216/1‑94 (MQ=60)
TCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTT < SRR4302537.2231451/94‑1 (MQ=60)
CCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTC > SRR4302537.1747365/1‑94 (MQ=60)
CCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTC < SRR4302537.739849/94‑1 (MQ=60)
CCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTC < SRR4302537.4716766/94‑1 (MQ=60)
CCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCAACTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTC > SRR4302537.1328976/1‑94 (MQ=60)
CGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCC > SRR4302537.5477189/1‑94 (MQ=60)
GGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCG > SRR4302537.2750959/1‑94 (MQ=60)
GTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGG > SRR4302537.823945/1‑94 (MQ=60)
CAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGG > SRR4302537.5857854/1‑94 (MQ=60)
CAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGG < SRR4302537.3483000/94‑1 (MQ=60)
CAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGG < SRR4302537.4484345/94‑1 (MQ=60)
AAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGC > SRR4302537.1237437/1‑94 (MQ=60)
AAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGC > SRR4302537.6026950/1‑94 (MQ=60)
AACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCT < SRR4302537.3620234/94‑1 (MQ=60)
GTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCG < SRR4302537.2507444/94‑1 (MQ=60)
GTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCG < SRR4302537.6169856/94‑1 (MQ=60)
GTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTCCGTCG > SRR4302537.1587433/1‑94 (MQ=60)
GTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTCCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCG < SRR4302537.1519860/94‑1 (MQ=60)
TGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGTGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGG > SRR4302537.346094/1‑94 (MQ=60)
TGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGG > SRR4302537.2293308/1‑94 (MQ=60)
GTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCTGCGGCTGCGTCGGT < SRR4302537.2423282/94‑1 (MQ=60)
GTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGT > SRR4302537.1676103/1‑94 (MQ=60)
GTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGCCTGCGTCGGT > SRR4302537.1993573/1‑94 (MQ=60)
TTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTA < SRR4302537.4656982/94‑1 (MQ=60)
ATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAAC < SRR4302537.3605111/94‑1 (MQ=60)
TTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTGCGGCGGCTGCGTCGGTAACG > SRR4302537.4331487/1‑94 (MQ=60)
TTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACG < SRR4302537.913605/94‑1 (MQ=60)
GCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCT < SRR4302537.5596823/94‑1 (MQ=60)
GCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCT > SRR4302537.3188773/1‑94 (MQ=60)
GCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCT < SRR4302537.3302822/94‑1 (MQ=60)
CTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCCCCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTG < SRR4302537.1892904/94‑1 (MQ=60)
TGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGG < SRR4302537.4991103/94‑1 (MQ=60)
TGAAATGGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGG < SRR4302537.4524880/94‑1 (MQ=60)
GCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGG < SRR4302537.3119844/94‑1 (MQ=60)
CAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGG > SRR4302537.2418067/1‑94 (MQ=60)
AATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTG > SRR4302537.5965448/1‑94 (MQ=60)
AGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTTGGTGGCG > SRR4302537.5923013/1‑94 (MQ=60)
AGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCG < SRR4302537.167323/94‑1 (MQ=60)
TGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGC > SRR4302537.2954598/1‑94 (MQ=60)
GGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGCCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGTGTGGCGGCT > SRR4302537.2932869/1‑94 (MQ=60)
GCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTG < SRR4302537.4063800/94‑1 (MQ=60)
CCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGG > SRR4302537.1409501/1‑94 (MQ=60)
GGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCA > SRR4302537.2125179/1‑94 (MQ=60)
GATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCAT < SRR4302537.6485086/94‑1 (MQ=60)
GATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCAT < SRR4302537.2525401/94‑1 (MQ=60)
ATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATC > SRR4302537.5717667/1‑94 (MQ=60)
CGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTCACGCCTGGGTGGCGGCTGGCCTCAT > SRR4302537.2268034/1‑94 (MQ=60)
GAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATA > SRR4302537.5945038/1‑94 (MQ=60)
AGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATAT < SRR4302537.3420022/94‑1 (MQ=60)
GCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATC < SRR4302537.2661117/94‑1 (MQ=60)
GCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATC < SRR4302537.3707471/94‑1 (MQ=60)
GACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAG < SRR4302537.453664/94‑1 (MQ=60)
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GACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAG < SRR4302537.1202115/94‑1 (MQ=60)
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GCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCAT > SRR4302537.541622/1‑94 (MQ=60)
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GCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCAC > SRR4302537.6220262/1‑94 (MQ=60)
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CGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCGCTTTCG > SRR4302537.1749223/1‑94 (MQ=60)
CGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCGCTTTCG < SRR4302537.1648810/94‑1 (MQ=60)
CACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCGCTTTCGGC > SRR4302537.613797/1‑94 (MQ=60)
ACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCGCTTTCGGgc > SRR4302537.4467393/1‑92 (MQ=60)
ACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCGCTTTCGGCA < SRR4302537.1013053/94‑1 (MQ=60)
CCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCGCTTTCGGCAC > SRR4302537.2559350/1‑94 (MQ=60)
CCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCGCTTTCGGCAC > SRR4302537.1080005/1‑94 (MQ=60)
|
GGCGACCGGTGCAGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACTTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCGCTTTCGGCAC > NC_000913/2429390‑2429575
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
