Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,550,462 |
A→G |
intergenic (+73/‑8) |
uxuA → / → uxuB |
mannonate hydrolase/D‑mannonate oxidoreductase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,550,462 | 0 | A | G | 100.0%
| 924.1
/ NA
| 261 | intergenic (+73/‑8) | uxuA/uxuB | mannonate hydrolase/D‑mannonate oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (138/123); total (138/123) |
Only 100 of 274 total aligned reads displayed.
GCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCATTGTGCATC > NC_000913/4550372‑4550551
|
gcTTTCTGTAGCCGTTAATCTCCTCCGTCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGt < 1:4059285/93‑1 (MQ=255)
ctttctttAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGtt > 2:664256/1‑93 (MQ=255)
ttctttAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTa < 2:100828/93‑1 (MQ=255)
ttctttAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTa > 2:5931568/1‑93 (MQ=255)
ttctttAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACCGATTCTGGGGTTTa > 1:134593/1‑93 (MQ=255)
ttctttAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCATCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTa < 1:3461513/93‑1 (MQ=255)
tctttAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTAc < 2:5260276/93‑1 (MQ=255)
tctttAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTAc < 1:2421097/93‑1 (MQ=255)
ctttAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACg > 1:3735338/1‑93 (MQ=255)
ttAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGAt > 2:762714/1‑93 (MQ=255)
aGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTTCTTCTTCCTTGCCGTTACTCTTTGAAGAAGGATTCTGGGGTTTACGATGa < 2:5821341/93‑1 (MQ=255)
cGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGacta > 2:2689344/1‑93 (MQ=255)
cGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGacta > 1:592032/1‑93 (MQ=255)
tAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGActacta < 2:2927719/93‑1 (MQ=255)
tAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGActacta < 1:862894/93‑1 (MQ=255)
aaTATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTAt < 2:2227073/93‑1 (MQ=255)
atatCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTAtt > 2:6086297/1‑93 (MQ=255)
atatCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTAtt > 1:1273945/1‑93 (MQ=255)
tatCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTAttg > 1:4253244/1‑93 (MQ=255)
tatCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCAATCTTTGTAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTAttg > 1:5091390/1‑93 (MQ=255)
atCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTAttgt < 2:1382993/93‑1 (MQ=255)
tCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTAttgtt < 1:4571534/93‑1 (MQ=255)
ccACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTAttgttg < 2:4575275/93‑1 (MQ=255)
ccACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTAttgttg > 2:962561/1‑93 (MQ=255)
cACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGa > 2:954519/1‑93 (MQ=255)
cACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGa < 1:4976237/93‑1 (MQ=255)
ccGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTCTTGTTGACa > 2:501020/1‑93 (MQ=255)
ccGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACa > 1:579839/1‑93 (MQ=255)
ccGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACa > 2:4150756/1‑93 (MQ=255)
ccGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACa > 1:6260308/1‑93 (MQ=255)
ccGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACa < 2:3151946/93‑1 (MQ=255)
ccGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACa < 2:5217104/93‑1 (MQ=255)
ccGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACa > 2:6012293/1‑93 (MQ=255)
cGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAg > 1:1944926/1‑93 (MQ=255)
cGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAg > 1:1804170/1‑93 (MQ=255)
ggCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGAGAGc > 2:562433/1‑93 (MQ=255)
gCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCa > 1:2224082/1‑93 (MQ=255)
aTGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAAt > 1:4418936/1‑93 (MQ=255)
aTGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAAt > 1:5172533/1‑93 (MQ=255)
aTGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAAt < 2:2747299/93‑1 (MQ=255)
aTGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAAt > 2:4470077/1‑93 (MQ=255)
tGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATc < 1:3840120/93‑1 (MQ=255)
tGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATc < 2:6427381/93‑1 (MQ=255)
ggCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTGCTATTGTTGACAGCAATCt < 2:6284586/93‑1 (MQ=255)
ggCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCt > 2:3035387/1‑93 (MQ=255)
gCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTg < 2:3256480/93‑1 (MQ=255)
cTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGc < 2:3826685/93‑1 (MQ=255)
cTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGc > 1:1534498/1‑93 (MQ=255)
tGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGcc < 2:1606892/93‑1 (MQ=255)
tGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGcc < 1:318082/93‑1 (MQ=255)
ccGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTgc < 2:5566543/93‑1 (MQ=255)
ccGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTgc > 1:656618/1‑93 (MQ=255)
ccGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAACAATCTGCCGGTTgc < 2:4681959/93‑1 (MQ=255)
cGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTgcc < 1:168470/93‑1 (MQ=255)
tGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTgcccg > 1:2736607/1‑93 (MQ=255)
cGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTgcccgccc > 1:5328645/1‑93 (MQ=255)
ggTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGcccgcccg < 1:3035387/93‑1 (MQ=255)
gTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGt > 2:3493498/1‑93 (MQ=255)
tCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCa < 1:638722/93‑1 (MQ=255)
tCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCa < 2:1814380/93‑1 (MQ=255)
cttcttCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATg > 1:1034916/1‑93 (MQ=255)
cttcttCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATg < 1:909983/93‑1 (MQ=255)
cttcttCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATg > 1:2278058/1‑93 (MQ=255)
tcttcCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATggg > 2:4101778/1‑93 (MQ=255)
tcttcCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATggg > 1:2560973/1‑93 (MQ=255)
cttcCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGa < 1:4875351/93‑1 (MQ=255)
cttcCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGa < 1:3990172/93‑1 (MQ=255)
cttcCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGa < 1:2997698/93‑1 (MQ=255)
ttcCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGAt < 2:2468544/93‑1 (MQ=255)
ttcCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGAt > 1:4701404/1‑93 (MQ=255)
ttcCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGAt < 1:283217/93‑1 (MQ=255)
ttcCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGAt < 1:5977238/93‑1 (MQ=255)
cTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCAt > 1:5946495/1‑93 (MQ=255)
cTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCAt > 2:107508/1‑93 (MQ=255)
ttGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCAtt < 1:5486099/93‑1 (MQ=255)
ccGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATtctc > 1:5777603/1‑93 (MQ=255)
ccGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATtctc > 1:1107469/1‑93 (MQ=255)
tCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTc > 1:2663132/1‑93 (MQ=255)
tCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTc > 2:4364926/1‑93 (MQ=255)
tCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTc < 2:1491729/93‑1 (MQ=255)
ctTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGaa > 1:2304937/1‑93 (MQ=255)
ctTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGaa < 2:3896802/93‑1 (MQ=255)
tGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCa > 1:2001153/1‑93 (MQ=255)
tGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCa < 1:1896091/93‑1 (MQ=255)
gAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCAc < 1:1006277/93‑1 (MQ=255)
gAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCAc > 2:4409512/1‑93 (MQ=255)
gAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCAc > 1:796878/1‑93 (MQ=255)
gAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCAc < 2:2555404/93‑1 (MQ=255)
aaGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACg > 2:481118/1‑93 (MQ=255)
aaGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACg < 2:3940896/93‑1 (MQ=255)
aGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGc < 1:617493/93‑1 (MQ=255)
aCGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCAt > 2:345901/1‑93 (MQ=255)
ggATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCATtg > 1:4143776/1‑93 (MQ=255)
ggATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCATtg < 2:4166361/93‑1 (MQ=255)
gATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGACGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCATtgt < 1:3697810/93‑1 (MQ=255)
aTTCTGGGGTTTACGATGACTGCTATTGTTGACATCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCATtgtg < 1:6441459/93‑1 (MQ=255)
ttCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCATTGTGc > 2:1684898/1‑93 (MQ=255)
tCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCACTCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCATTGTGCa < 2:5053926/93‑1 (MQ=255)
tGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCATTGTGCAtc > 1:5589292/1‑93 (MQ=255)
tGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCATTGTGCAtc > 2:331091/1‑93 (MQ=255)
|
GCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCATTGTGCATC > NC_000913/4550372‑4550551
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCATTGTGCATCTCGG > NC_000913/4550369‑4550555
|
CGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGG > SRR4302537.1976797/1‑94 (MQ=60)
GCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGG > SRR4302537.401024/1‑94 (MQ=60)
GCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGG > SRR4302537.3104678/1‑94 (MQ=60)
CGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGT > SRR4302537.390375/1‑94 (MQ=60)
GCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTT > SRR4302537.2910304/1‑94 (MQ=60)
GCTTTCTGTAGCCGTTAATCTCCTCCGTCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTT < SRR4302537.4087654/94‑1 (MQ=60)
TTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTA > SRR4302537.2254366/1‑94 (MQ=60)
TTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACCGATTCTGGGGTTTA > SRR4302537.135547/1‑94 (MQ=60)
TTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTAC < SRR4302537.4229794/94‑1 (MQ=60)
TTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTAC > SRR4302537.3637875/1‑94 (MQ=60)
TTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTAC < SRR4302537.879533/94‑1 (MQ=60)
TTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCATCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTAC < SRR4302537.3485984/94‑1 (MQ=60)
TCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACG < SRR4302537.2438156/94‑1 (MQ=60)
TCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACG > SRR4302537.3761574/1‑94 (MQ=60)
TCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGCTTACG > SRR4302537.6025884/1‑94 (MQ=60)
TTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGA < SRR4302537.1428022/94‑1 (MQ=60)
CTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGA < SRR4302537.3181777/94‑1 (MQ=60)
TTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGAT < SRR4302537.5480718/94‑1 (MQ=60)
TTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGCTTACGAT > SRR4302537.5078480/1‑94 (MQ=60)
TTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATG < SRR4302537.6479773/94‑1 (MQ=60)
CCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTA > SRR4302537.596078/1‑94 (MQ=60)
CCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTA < SRR4302537.5826289/94‑1 (MQ=60)
CGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTAC < SRR4302537.4407665/94‑1 (MQ=60)
GTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACT < SRR4302537.2371625/94‑1 (MQ=60)
GTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACT > SRR4302537.5473287/1‑94 (MQ=60)
GTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACT < SRR4302537.1019214/94‑1 (MQ=60)
GTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACT > SRR4302537.6281292/1‑94 (MQ=60)
TAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTAT > SRR4302537.378709/1‑94 (MQ=60)
TAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTAT < SRR4302537.868811/94‑1 (MQ=60)
AATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAATACGGATTCTGGGGTTTACGATGAATACTATT > SRR4302537.5659658/1‑94 (MQ=60)
AATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATT > SRR4302537.1282802/1‑94 (MQ=60)
ATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTG > SRR4302537.656817/1‑94 (MQ=60)
ATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTG > SRR4302537.4282808/1‑94 (MQ=60)
ATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTG > SRR4302537.6254545/1‑94 (MQ=60)
ATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCAATCTTTGTAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTG > SRR4302537.5126445/1‑94 (MQ=60)
TATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGT > SRR4302537.4956643/1‑94 (MQ=60)
ATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTT > SRR4302537.5921600/1‑94 (MQ=60)
TCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTG < SRR4302537.4603180/94‑1 (MQ=60)
TCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTG < SRR4302537.2713142/94‑1 (MQ=60)
CACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGAC > SRR4302537.2378420/1‑94 (MQ=60)
CACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGAC < SRR4302537.5010536/94‑1 (MQ=60)
ACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACA > SRR4302537.6303291/1‑94 (MQ=60)
ACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACA > SRR4302537.583805/1‑94 (MQ=60)
CCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAG > SRR4302537.1816762/1‑94 (MQ=60)
CCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAG > SRR4302537.6354557/1‑94 (MQ=60)
CCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAG > SRR4302537.1958445/1‑94 (MQ=60)
GGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCA > SRR4302537.4146016/1‑94 (MQ=60)
GGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCA > SRR4302537.2239748/1‑94 (MQ=60)
CATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAAT > SRR4302537.3034000/1‑94 (MQ=60)
CATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAAT > SRR4302537.4449445/1‑94 (MQ=60)
CATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAAT > SRR4302537.5208140/1‑94 (MQ=60)
CATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAAT > SRR4302537.685740/1‑94 (MQ=60)
ATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGGTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATC > SRR4302537.4695678/1‑94 (MQ=60)
TGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCT < SRR4302537.3867023/94‑1 (MQ=60)
TGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCT < SRR4302537.2505302/94‑1 (MQ=60)
TGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCT > SRR4302537.4150422/1‑94 (MQ=60)
GGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTG < SRR4302537.469474/94‑1 (MQ=60)
GCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGC > SRR4302537.1545218/1‑94 (MQ=60)
TGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCG < SRR4302537.320287/94‑1 (MQ=60)
GCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTT > SRR4302537.3240203/1‑94 (MQ=60)
CGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTG > SRR4302537.4742135/1‑94 (MQ=60)
CGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTG > SRR4302537.4383151/1‑94 (MQ=60)
CGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTG < SRR4302537.3098457/94‑1 (MQ=60)
CGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTG > SRR4302537.1795781/1‑94 (MQ=60)
GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGC > SRR4302537.661093/1‑94 (MQ=60)
GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGC > SRR4302537.5150304/1‑94 (MQ=60)
GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGC > SRR4302537.5150303/1‑94 (MQ=60)
GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGC > SRR4302537.2704762/1‑94 (MQ=60)
CGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCC < SRR4302537.169673/94‑1 (MQ=60)
GTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCG > SRR4302537.2755710/1‑94 (MQ=60)
GTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCG < SRR4302537.4506699/94‑1 (MQ=60)
GTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCG < SRR4302537.5750730/94‑1 (MQ=60)
CCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCC > SRR4302537.5365203/1‑94 (MQ=60)
CCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCC > SRR4302537.5542417/1‑94 (MQ=60)
CGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCG > SRR4302537.919304/1‑94 (MQ=60)
CGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCG < SRR4302537.6103081/94‑1 (MQ=60)
GGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGT < SRR4302537.5323712/94‑1 (MQ=60)
GGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGT < SRR4302537.3056547/94‑1 (MQ=60)
TCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCAT < SRR4302537.643071/94‑1 (MQ=60)
TCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCAT > SRR4302537.967624/1‑94 (MQ=60)
TCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCAT > SRR4302537.2230258/1‑94 (MQ=60)
CCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATG > SRR4302537.1042047/1‑94 (MQ=60)
CCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATG > SRR4302537.2294140/1‑94 (MQ=60)
CCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATG < SRR4302537.2952242/94‑1 (MQ=60)
CTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGG < SRR4302537.916264/94‑1 (MQ=60)
TTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGG < SRR4302537.6015850/94‑1 (MQ=60)
TTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGG > SRR4302537.2578915/1‑94 (MQ=60)
CTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGAT > SRR4302537.4030462/1‑94 (MQ=60)
CTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGAT < SRR4302537.4018110/94‑1 (MQ=60)
CTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGAT < SRR4302537.4909003/94‑1 (MQ=60)
CTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGAT > SRR4302537.4733925/1‑94 (MQ=60)
CTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGAT < SRR4302537.3018597/94‑1 (MQ=60)
TTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATC < SRR4302537.285189/94‑1 (MQ=60)
TTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATC < SRR4302537.659110/94‑1 (MQ=60)
TTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATC < SRR4302537.6018272/94‑1 (MQ=60)
TCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCA > SRR4302537.1076616/1‑94 (MQ=60)
CCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCAT > SRR4302537.5987310/1‑94 (MQ=60)
CTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATT < SRR4302537.5272508/94‑1 (MQ=60)
TTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTC < SRR4302537.5523547/94‑1 (MQ=60)
TGCCGTCACTATTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCT < SRR4302537.2799140/94‑1 (MQ=60)
GCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTC > SRR4302537.5817207/1‑94 (MQ=60)
GCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTC < SRR4302537.893765/94‑1 (MQ=60)
GCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTC > SRR4302537.2636186/1‑94 (MQ=60)
GCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTC > SRR4302537.1115121/1‑94 (MQ=60)
GCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTC > SRR4302537.853953/1‑94 (MQ=60)
CCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCG > SRR4302537.3515238/1‑94 (MQ=60)
CCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCG > SRR4302537.6005230/1‑94 (MQ=60)
CCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCG < SRR4302537.2219417/94‑1 (MQ=60)
CGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGT > SRR4302537.5967588/1‑94 (MQ=60)
CGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGT > SRR4302537.1985183/1‑94 (MQ=60)
CGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGT > SRR4302537.2001282/1‑94 (MQ=60)
GTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTC > SRR4302537.2681735/1‑94 (MQ=60)
GTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTC > SRR4302537.2305635/1‑94 (MQ=60)
GTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTC > SRR4302537.1934766/1‑94 (MQ=60)
TCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCT > SRR4302537.4795479/1‑94 (MQ=60)
CACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTG > SRR4302537.1676469/1‑94 (MQ=60)
CACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTG < SRR4302537.4004398/94‑1 (MQ=60)
CTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGA > SRR4302537.231286/1‑94 (MQ=60)
CTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGA < SRR4302537.1270196/94‑1 (MQ=60)
TCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAA > SRR4302537.2321203/1‑94 (MQ=60)
TCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGAAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAA > SRR4302537.1935708/1‑94 (MQ=60)
CTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAAT < SRR4302537.1260085/94‑1 (MQ=60)
CTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAAT > SRR4302537.5854831/1‑94 (MQ=60)
TTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATC < SRR4302537.1068963/94‑1 (MQ=60)
TTGAAGACGGCTTCTGATGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCA < SRR4302537.2554941/94‑1 (MQ=60)
TTGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCA > SRR4302537.2015068/1‑94 (MQ=60)
TGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCAC > SRR4302537.5829802/1‑94 (MQ=60)
TGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCAC > SRR4302537.802347/1‑94 (MQ=60)
TGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCAC < SRR4302537.374928/94‑1 (MQ=60)
TGAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCAC < SRR4302537.1909267/94‑1 (MQ=60)
GAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACG < SRR4302537.1013224/94‑1 (MQ=60)
GAAGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACG < SRR4302537.1861100/94‑1 (MQ=60)
AGACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCA < SRR4302537.621696/94‑1 (MQ=60)
GACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCAT < SRR4302537.2835357/94‑1 (MQ=60)
ACGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCATT < SRR4302537.1449927/94‑1 (MQ=60)
CGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCATTG > SRR4302537.4172681/1‑94 (MQ=60)
CGGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCATTG > SRR4302537.332134/1‑94 (MQ=60)
GGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCATTGT > SRR4302537.1611034/1‑94 (MQ=60)
GGATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCATTGT > SRR4302537.1353073/1‑94 (MQ=60)
GATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCATTGTG < SRR4302537.4928326/94‑1 (MQ=60)
GATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGACGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCATTGTG < SRR4302537.3723830/94‑1 (MQ=60)
ATTCTGGGGTTTACGATGACTGCTATTGTTGACATCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCATTGTGC < SRR4302537.6485172/94‑1 (MQ=60)
ATTCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCATTGTGC < SRR4302537.668781/94‑1 (MQ=60)
TCTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCATTGTGCAT < SRR4302537.3805846/94‑1 (MQ=60)
CTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCATTGTGCATC > SRR4302537.1702092/1‑94 (MQ=60)
CTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCATTGTGCATC > SRR4302537.5627507/1‑94 (MQ=60)
CTGGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCATTGTGCATC < SRR4302537.4179203/94‑1 (MQ=60)
CTGGGGTTTACGATGACTACTAGTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCATTGTGCATC > SRR4302537.6466690/1‑94 (MQ=60)
GGGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCATTGTGCATCTC > SRR4302537.4365130/1‑94 (MQ=60)
GGGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCATTGTGCATCTCG > SRR4302537.4629227/1‑94 (MQ=60)
GGTTTACGATGACTACTATTGTTGCCAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCATTGTGCATCTCGG > SRR4302537.574501/1‑94 (MQ=60)
|
CGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCATTGTGCATCTCGG > NC_000913/4550369‑4550555
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
