Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1061 |
294.1 |
15065038 |
98.6% |
14854127 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,694,131 |
T→C |
L58P (CTG→CCG) |
yfhD → |
putative periplasmic binding transport protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,694,131 | 0 | T | C | 81.3%
| 534.9
/ 130.6
| 262 | L58P (CTG→CCG) | yfhD | putative periplasmic binding transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (20/29); new base C (103/110); total (123/139) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.28e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.10e-01 |
Only 100 of 272 total aligned reads displayed.
GTTTGCCGATTACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAACTGGTTT > NC_000913/2694039‑2694220
|
ttGCCGATTACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACccgc < 2:2784571/93‑1 (MQ=255)
ttGCCGATTACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACccgc < 2:7530282/93‑1 (MQ=255)
gCCGATTACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACccgctg < 2:5882189/93‑1 (MQ=255)
cGATTACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTggc < 1:744328/93‑1 (MQ=255)
aTTACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTggcgg < 1:4956449/93‑1 (MQ=255)
aTTACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTggcgg < 1:7047766/93‑1 (MQ=255)
ttACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTggcggc > 1:2856002/1‑93 (MQ=255)
ttACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTggcggc > 1:6076380/1‑93 (MQ=255)
ttACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTggcggc > 2:5754826/1‑93 (MQ=255)
ttACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTggcggc > 2:1069128/1‑93 (MQ=255)
tACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCa > 1:2499560/1‑93 (MQ=255)
tACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCa > 2:3847056/1‑93 (MQ=255)
cTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCGGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGa < 1:5652880/93‑1 (MQ=255)
cTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGa < 1:2993916/93‑1 (MQ=255)
tCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGGAc < 2:6491771/93‑1 (MQ=255)
tAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCt > 2:2858064/1‑93 (MQ=255)
aaaaCTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGGACTTGTCta < 1:3782523/93‑1 (MQ=255)
aaaaCTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCta < 1:5979316/93‑1 (MQ=255)
aCTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATaa > 2:5141091/1‑93 (MQ=255)
tGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACa < 1:7032062/93‑1 (MQ=255)
gAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAg > 2:3648399/1‑93 (MQ=255)
aaaGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGt < 2:4646305/93‑1 (MQ=255)
aaaGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGt < 1:3722093/93‑1 (MQ=255)
aaaGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGt < 1:6454573/93‑1 (MQ=255)
aaaGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGt > 1:630605/1‑93 (MQ=255)
aaGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTAACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTg > 2:4897954/1‑93 (MQ=255)
aGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGa < 2:666090/93‑1 (MQ=255)
aGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGa > 1:4342818/1‑93 (MQ=255)
aGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGa < 2:6895952/93‑1 (MQ=255)
aGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGa < 1:2066069/93‑1 (MQ=255)
gTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAg < 2:4297766/93‑1 (MQ=255)
gTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTTGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAg < 2:6421703/93‑1 (MQ=255)
tGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCGGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGc < 1:3436923/93‑1 (MQ=255)
gACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCg < 1:4274575/93‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCgg > 2:3291973/1‑93 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCgg > 2:2158319/1‑93 (MQ=255)
cGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGt < 2:1920565/93‑1 (MQ=255)
gCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTaaa < 2:2363696/93‑1 (MQ=255)
cGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTaaaa < 1:1519411/93‑1 (MQ=255)
ggCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTaaaaa > 2:7421044/1‑93 (MQ=255)
gCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTaaaaaa < 1:5434813/93‑1 (MQ=255)
gCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTaaaaaa < 1:184372/93‑1 (MQ=255)
aGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAAtt > 1:777422/1‑93 (MQ=255)
gAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTa > 2:4846679/1‑93 (MQ=255)
aaTATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTAt < 2:6692850/93‑1 (MQ=255)
atatCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATc < 2:3160138/93‑1 (MQ=255)
atatCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATc < 2:1028845/93‑1 (MQ=255)
atatCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAACATTATc < 2:4724778/93‑1 (MQ=255)
tatCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCa < 1:6095735/93‑1 (MQ=255)
tatCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCa > 1:3509880/1‑93 (MQ=255)
tatCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCa < 2:4032473/93‑1 (MQ=255)
atCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAg < 2:7001826/93‑1 (MQ=255)
tCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGc > 2:6019148/1‑93 (MQ=255)
tCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGc < 1:3410336/93‑1 (MQ=255)
tCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGc < 1:3244995/93‑1 (MQ=255)
cagccagcTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGcc < 2:3369773/93‑1 (MQ=255)
agccagcTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCt < 2:4130632/93‑1 (MQ=255)
agccagcTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCt < 1:305243/93‑1 (MQ=255)
gccagcTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTg > 1:1113691/1‑93 (MQ=255)
gccagcTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTg > 1:6168575/1‑93 (MQ=255)
cagcTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGc > 2:1697266/1‑93 (MQ=255)
cagcTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGc > 2:5456639/1‑93 (MQ=255)
agcTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGcc > 2:6417093/1‑93 (MQ=255)
agcTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGcc < 2:88333/93‑1 (MQ=255)
agcTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGcc > 1:574799/1‑93 (MQ=255)
agcTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGcc > 2:2496684/1‑93 (MQ=255)
gcTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGccc < 2:1358218/93‑1 (MQ=255)
tGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCccta > 2:6287889/1‑93 (MQ=255)
gTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCcctac > 1:2620630/1‑93 (MQ=255)
gTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCcctac > 1:1198270/1‑93 (MQ=255)
tttGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCcctacc > 2:2617160/1‑93 (MQ=255)
ttGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCcctacct < 1:5397343/93‑1 (MQ=255)
tGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCcctaccta < 1:4698822/93‑1 (MQ=255)
acgacCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCtatt < 1:2180331/93‑1 (MQ=255)
acgacCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCtatt > 2:4697857/1‑93 (MQ=255)
cgacCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCtatta < 2:4274883/93‑1 (MQ=255)
gacCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCtattat > 2:5311597/1‑93 (MQ=255)
acCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTattatt > 1:2272687/1‑93 (MQ=255)
acCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTattatt < 1:6898624/93‑1 (MQ=255)
ccTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATTAGCCTGGCCCTACCTATTATTc < 2:3754265/93‑1 (MQ=255)
ccTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTc > 2:5960501/1‑93 (MQ=255)
cTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTcc < 1:1012878/93‑1 (MQ=255)
gATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCgtg < 2:2943918/93‑1 (MQ=255)
gATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCgtg < 1:521523/93‑1 (MQ=255)
gATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCgtg > 2:2692137/1‑93 (MQ=255)
aTAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGTCCTACCTATTATTCCgtgt > 1:4438754/1‑93 (MQ=255)
tAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTc > 2:4811218/1‑93 (MQ=255)
aTGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTcac < 1:4664753/93‑1 (MQ=255)
aaCGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCAcaacaa > 1:6710229/1‑93 (MQ=255)
aCGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACaacaac > 2:2420610/1‑93 (MQ=255)
gCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAACTg > 1:4048433/1‑93 (MQ=255)
gCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAACTg < 1:2391667/93‑1 (MQ=255)
ccGACCTGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAACTgg > 2:2109510/1‑93 (MQ=255)
ccGACCTGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAACTgg > 2:790171/1‑93 (MQ=255)
ccGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAACTgg < 2:1615104/93‑1 (MQ=255)
cGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAACTGGt < 1:1594744/93‑1 (MQ=255)
gACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAACTGGtt > 2:449124/1‑93 (MQ=255)
gACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAACTGGtt < 2:5030883/93‑1 (MQ=255)
aCCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAACTGGttt > 1:4551259/1‑93 (MQ=255)
aCCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAACTGGttt > 2:1480282/1‑93 (MQ=255)
|
GTTTGCCGATTACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAACTGGTTT > NC_000913/2694039‑2694220
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AGTTTGCCGATTACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAACTGGTTTATAA > NC_000913/2694038‑2694224
|
AGTTTGCCGATTACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCC > SRR4302542.4556192/1‑94 (MQ=60)
GTTTGCCGATTACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCG < SRR4302542.5687938/94‑1 (MQ=60)
TTGCCGATTACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCT < SRR4302542.3285770/94‑1 (MQ=60)
TGCCGATTACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTG > SRR4302542.3775647/1‑94 (MQ=60)
GCCGATTACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGG < SRR4302542.3809052/94‑1 (MQ=60)
CCGATTACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGC < SRR4302542.2482765/94‑1 (MQ=60)
CGATTACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCG < SRR4302542.750776/94‑1 (MQ=60)
CGATTACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCG > SRR4302542.6122090/1‑94 (MQ=60)
GATTACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGG > SRR4302542.6033937/1‑94 (MQ=60)
GATTACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGG > SRR4302542.2315021/1‑94 (MQ=60)
ATTACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGC > SRR4302542.2883448/1‑94 (MQ=60)
ATTACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGC < SRR4302542.7116969/94‑1 (MQ=60)
ATTACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGC < SRR4302542.5004600/94‑1 (MQ=60)
ATTACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGC > SRR4302542.6135224/1‑94 (MQ=60)
TTACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCA > SRR4302542.2523796/1‑94 (MQ=60)
ACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGG < SRR4302542.5279174/94‑1 (MQ=60)
ACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGG < SRR4302542.3666560/94‑1 (MQ=60)
ACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGG < SRR4302542.3057257/94‑1 (MQ=60)
ACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGG > SRR4302542.6655393/1‑94 (MQ=60)
CTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCGGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGAC < SRR4302542.5707762/94‑1 (MQ=60)
CTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGAC > SRR4302542.3023565/1‑94 (MQ=60)
CTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGAC < SRR4302542.3022569/94‑1 (MQ=60)
CTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGAC < SRR4302542.4894231/94‑1 (MQ=60)
CTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGAC > SRR4302542.5715257/1‑94 (MQ=60)
TCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGGACT < SRR4302542.4553012/94‑1 (MQ=60)
TCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGGACT < SRR4302542.2456747/94‑1 (MQ=60)
TCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACT < SRR4302542.252144/94‑1 (MQ=60)
CGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTT < SRR4302542.1191378/94‑1 (MQ=60)
GGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTG > SRR4302542.1386855/1‑94 (MQ=60)
GGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTG > SRR4302542.7105721/1‑94 (MQ=60)
GCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGT < SRR4302542.6431902/94‑1 (MQ=60)
CGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTC > SRR4302542.1769633/1‑94 (MQ=60)
GTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCT > SRR4302542.3577394/1‑94 (MQ=60)
TAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTA > SRR4302542.4577175/1‑94 (MQ=60)
AAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGGACTTGTCTAT < SRR4302542.3819942/94‑1 (MQ=60)
AAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTAT < SRR4302542.6037209/94‑1 (MQ=60)
AAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTAT > SRR4302542.1854092/1‑94 (MQ=60)
AACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAA < SRR4302542.5413995/94‑1 (MQ=60)
ACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAAC < SRR4302542.1936834/94‑1 (MQ=60)
CTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACA < SRR4302542.6331667/94‑1 (MQ=60)
TGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAG < SRR4302542.7101156/94‑1 (MQ=60)
TGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAG < SRR4302542.1981702/94‑1 (MQ=60)
TGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAG < SRR4302542.2821395/94‑1 (MQ=60)
GAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGT > SRR4302542.636036/1‑94 (MQ=60)
AAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTG < SRR4302542.4454781/94‑1 (MQ=60)
AAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTG < SRR4302542.1412197/94‑1 (MQ=60)
AAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTG > SRR4302542.3515569/1‑94 (MQ=60)
AAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTG < SRR4302542.6518125/94‑1 (MQ=60)
AAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTG < SRR4302542.3758918/94‑1 (MQ=60)
AAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGA > SRR4302542.6787977/1‑94 (MQ=60)
AAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGA > SRR4302542.4385481/1‑94 (MQ=60)
AGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAG < SRR4302542.2933020/94‑1 (MQ=60)
AGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAG < SRR4302542.2083932/94‑1 (MQ=60)
TGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCGGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCG < SRR4302542.3469098/94‑1 (MQ=60)
GACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGG < SRR4302542.2932812/94‑1 (MQ=60)
GACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGG < SRR4302542.4316627/94‑1 (MQ=60)
GACCGGGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGG > SRR4302542.6158499/1‑94 (MQ=60)
GTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAA < SRR4302542.880799/94‑1 (MQ=60)
GTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAA < SRR4302542.2815059/94‑1 (MQ=60)
GTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAA > SRR4302542.3894362/1‑94 (MQ=60)
CGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAA < SRR4302542.1532535/94‑1 (MQ=60)
GCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAAT < SRR4302542.185936/94‑1 (MQ=60)
GCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAAT < SRR4302542.5487615/94‑1 (MQ=60)
CAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATT > SRR4302542.784141/1‑94 (MQ=60)
CAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATT < SRR4302542.5564467/94‑1 (MQ=60)
AGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTA < SRR4302542.588891/94‑1 (MQ=60)
GAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTAT < SRR4302542.6464555/94‑1 (MQ=60)
ATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCA > SRR4302542.3542694/1‑94 (MQ=60)
ATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCA > SRR4302542.4689946/1‑94 (MQ=60)
ATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCA > SRR4302542.4720127/1‑94 (MQ=60)
TATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAG < SRR4302542.1582133/94‑1 (MQ=60)
TATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAG < SRR4302542.6154732/94‑1 (MQ=60)
ATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGC > SRR4302542.4022949/1‑94 (MQ=60)
ATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGC > SRR4302542.3443421/1‑94 (MQ=60)
TCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCC > SRR4302542.313638/1‑94 (MQ=60)
TCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCC < SRR4302542.3442298/94‑1 (MQ=60)
TCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCC < SRR4302542.3275667/94‑1 (MQ=60)
CAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCT > SRR4302542.7057484/1‑94 (MQ=60)
AGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTG > SRR4302542.1123213/1‑94 (MQ=60)
AGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTG > SRR4302542.6228342/1‑94 (MQ=60)
AGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTG > SRR4302542.6189251/1‑94 (MQ=60)
AGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTG > SRR4302542.2272223/1‑94 (MQ=60)
AGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTG < SRR4302542.307907/94‑1 (MQ=60)
GCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGG < SRR4302542.2193639/94‑1 (MQ=60)
GCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGG > SRR4302542.5461098/1‑94 (MQ=60)
CAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCC > SRR4302542.579735/1‑94 (MQ=60)
CTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTA < SRR4302542.3421560/94‑1 (MQ=60)
TGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTAC > SRR4302542.2645956/1‑94 (MQ=60)
TGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTAC > SRR4302542.1208585/1‑94 (MQ=60)
GTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACC > SRR4302542.4398276/1‑94 (MQ=60)
TTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCT > SRR4302542.7559683/1‑94 (MQ=60)
TTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTA < SRR4302542.5449764/94‑1 (MQ=60)
TGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTAT < SRR4302542.4744692/94‑1 (MQ=60)
TGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTAT > SRR4302542.707393/1‑94 (MQ=60)
TGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTAT < SRR4302542.4345604/94‑1 (MQ=60)
ACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTA < SRR4302542.2199111/94‑1 (MQ=60)
CGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTAT < SRR4302542.5169047/94‑1 (MQ=60)
CGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTAT < SRR4302542.1143723/94‑1 (MQ=60)
CGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTAT < SRR4302542.7603097/94‑1 (MQ=60)
GACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATT < SRR4302542.3460955/94‑1 (MQ=60)
GACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATT > SRR4302542.2292225/1‑94 (MQ=60)
ACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTC < SRR4302542.6966366/94‑1 (MQ=60)
CCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCC > SRR4302542.6364740/1‑94 (MQ=60)
CCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCC < SRR4302542.5641716/94‑1 (MQ=60)
CTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCG > SRR4302542.5455369/1‑94 (MQ=60)
CTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCG < SRR4302542.4385404/94‑1 (MQ=60)
CTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCG < SRR4302542.1021604/94‑1 (MQ=60)
TGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTG > SRR4302542.4255586/1‑94 (MQ=60)
GATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGTCCTACCTATTATTCCGTGT > SRR4302542.4482317/1‑94 (MQ=60)
GATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGT < SRR4302542.7282600/94‑1 (MQ=60)
GATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGT < SRR4302542.526036/94‑1 (MQ=60)
ATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACA > SRR4302542.7430223/1‑94 (MQ=60)
ATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACA < SRR4302542.4710354/94‑1 (MQ=60)
GGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAAC < SRR4302542.2101574/94‑1 (MQ=60)
TAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAA > SRR4302542.6776328/1‑94 (MQ=60)
AACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAAC > SRR4302542.6152486/1‑94 (MQ=60)
AACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAAC < SRR4302542.2343472/94‑1 (MQ=60)
ACGCCGCCCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAACT < SRR4302542.4712353/94‑1 (MQ=60)
ACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAACT < SRR4302542.6110065/94‑1 (MQ=60)
CGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAACTG > SRR4302542.4088370/1‑94 (MQ=60)
GCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAACTGG < SRR4302542.2414384/94‑1 (MQ=60)
CCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAACTGGT > SRR4302542.1090653/1‑94 (MQ=60)
CGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAACTGGTT < SRR4302542.866452/94‑1 (MQ=60)
CGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAACTGGTT < SRR4302542.1608517/94‑1 (MQ=60)
GACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAACTGGTTT > SRR4302542.4899144/1‑94 (MQ=60)
GACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAACTGGTTT > SRR4302542.6957558/1‑94 (MQ=60)
GACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAACTGGTTT > SRR4302542.4595798/1‑94 (MQ=60)
ACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAACTGGTTTA > SRR4302542.4622429/1‑94 (MQ=60)
CCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAACTGGTTTAT > SRR4302542.1608362/1‑94 (MQ=60)
CCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAACTGGTTTATA > SRR4302542.5022684/1‑94 (MQ=60)
CGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAACTGGTTTATAA < SRR4302542.5046986/94‑1 (MQ=60)
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AGTTTGCCGATTACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAACTGGTTTATAA > NC_000913/2694038‑2694224
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
