Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1061 |
294.1 |
15065038 |
98.6% |
14854127 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,238,220 |
T→C |
W213R (TGG→CGG) |
ygjU → |
putative transport protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,238,220 | 0 | T | C | 87.4%
| 678.1
/ 79.8
| 270 | W213R (TGG→CGG) | ygjU | putative transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (15/19); new base C (120/116); total (135/135) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.83e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 274 total aligned reads displayed.
CTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAATTCGT > NC_000913/3238129‑3238312
|
tttATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCgg > 1:3958209/1‑93 (MQ=255)
ttATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCggg > 1:4986019/1‑93 (MQ=255)
tATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCgggg < 1:6929365/93‑1 (MQ=255)
ggTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTa > 2:7286549/1‑93 (MQ=255)
tGAACCTGTTCATTCGCTTCGCCCCGATTGGTATTTTTGGGTTGGTTTCTTTTCCCCGGGCAACCCCCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTAcg < 1:6182285/93‑1 (MQ=255)
tGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTAcg < 2:5903484/93‑1 (MQ=255)
aaCTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACgcgc < 1:3738221/93‑1 (MQ=255)
aaCTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACgcgc > 1:1172684/1‑93 (MQ=255)
cTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCaa > 2:5677417/1‑93 (MQ=255)
tGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTACGCGCAAc < 1:4377326/93‑1 (MQ=255)
ggTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAAct > 2:2544337/1‑93 (MQ=255)
ggTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAAct > 2:4852947/1‑93 (MQ=255)
gTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAActg > 2:1354825/1‑93 (MQ=255)
tCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAActgc < 2:3136631/93‑1 (MQ=255)
tCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAActgc < 1:1798833/93‑1 (MQ=255)
ttcgcttcgcACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTACGCGCAACTGCTgg > 1:5811819/1‑93 (MQ=255)
ttcgcttcgcACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTgg < 2:3253511/93‑1 (MQ=255)
ttcgcttcgcACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTgg < 1:4314086/93‑1 (MQ=255)
ttcgcttcgcACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTgg > 1:1035355/1‑93 (MQ=255)
tcgcttcgcACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGt < 1:6586086/93‑1 (MQ=255)
tcgcttcgcACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGt > 1:1111867/1‑93 (MQ=255)
tcgcttcgcACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGt > 2:5779321/1‑93 (MQ=255)
cgcttcgcACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTc > 2:2228322/1‑93 (MQ=255)
gcttcgcACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCg > 1:5229864/1‑93 (MQ=255)
gcttcgcACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCg > 1:5732824/1‑93 (MQ=255)
cttcgcACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGt > 2:5961210/1‑93 (MQ=255)
cttcgcACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGt > 1:2499103/1‑93 (MQ=255)
tcgcACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGc < 2:5370326/93‑1 (MQ=255)
gcACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTg > 1:6774589/1‑93 (MQ=255)
aCCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGt > 1:4281852/1‑93 (MQ=255)
aCCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGt < 1:2841094/93‑1 (MQ=255)
aCCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGt < 2:2446383/93‑1 (MQ=255)
cGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTg > 2:6159488/1‑93 (MQ=255)
cGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTg > 2:1152583/1‑93 (MQ=255)
gATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTgg > 1:5970561/1‑93 (MQ=255)
aTTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGc < 2:3666046/93‑1 (MQ=255)
aTTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGc > 1:6006941/1‑93 (MQ=255)
tGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTg > 2:1573332/1‑93 (MQ=255)
gTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTa < 1:4742436/93‑1 (MQ=255)
gTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTa < 1:626253/93‑1 (MQ=255)
gTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTa > 1:3930187/1‑93 (MQ=255)
tATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTAt > 1:968650/1‑93 (MQ=255)
tATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTAt < 1:1924354/93‑1 (MQ=255)
tATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTAt < 1:7211590/93‑1 (MQ=255)
tttttGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGt < 2:4580917/93‑1 (MQ=255)
tttttGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGt < 1:1332650/93‑1 (MQ=255)
tttttGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGt < 1:7380810/93‑1 (MQ=255)
ttttGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGtt < 1:6058543/93‑1 (MQ=255)
tttGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTa < 1:3079687/93‑1 (MQ=255)
tGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACt > 2:1754342/1‑93 (MQ=255)
gCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACtggt < 1:7503247/93‑1 (MQ=255)
cTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACtggtg < 2:2934233/93‑1 (MQ=255)
cTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACtggtg > 1:4170569/1‑93 (MQ=255)
tGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACtggtgg < 2:7202871/93‑1 (MQ=255)
ttcttcTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCt > 2:4182476/1‑93 (MQ=255)
ttcttcTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCt > 2:4337545/1‑93 (MQ=255)
ttctACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCtggt > 2:3068778/1‑93 (MQ=255)
tctACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCtggtg > 1:6725593/1‑93 (MQ=255)
tctACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCtggtg > 2:4743789/1‑93 (MQ=255)
tACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTggtggt < 1:3416273/93‑1 (MQ=255)
aCCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGtt < 1:2681712/93‑1 (MQ=255)
ccTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTaa > 2:7399594/1‑93 (MQ=255)
ccTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTaa > 2:3893327/1‑93 (MQ=255)
cTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAAc > 2:2011680/1‑93 (MQ=255)
cTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAAc > 1:1370428/1‑93 (MQ=255)
tGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAAcc < 2:6947868/93‑1 (MQ=255)
tGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAAcc > 1:5611784/1‑93 (MQ=255)
tGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAAcc < 2:3773929/93‑1 (MQ=255)
ggCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAAccc > 2:4722066/1‑93 (MQ=255)
gCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCa > 2:7497968/1‑93 (MQ=255)
gCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCa < 2:143211/93‑1 (MQ=255)
aaCCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCAtt < 2:4009618/93‑1 (MQ=255)
accaccGGTTTCTCGACACTGTGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTg > 2:6444764/1‑93 (MQ=255)
ccaccGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGc < 2:3391102/93‑1 (MQ=255)
ccaccGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGc > 1:3840341/1‑93 (MQ=255)
ccaccGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGc > 2:5098540/1‑93 (MQ=255)
caccGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCt < 2:6622681/93‑1 (MQ=255)
caccGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCt > 1:1875841/1‑93 (MQ=255)
caccGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCt > 1:4056867/1‑93 (MQ=255)
accGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCtg < 1:810258/93‑1 (MQ=255)
accGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCtg > 1:6414120/1‑93 (MQ=255)
ccGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCtgg < 1:4625744/93‑1 (MQ=255)
ggTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCtggtg > 2:6365246/1‑93 (MQ=255)
gTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCtggtgt < 2:183773/93‑1 (MQ=255)
gTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCtggtgt > 2:2705930/1‑93 (MQ=255)
gTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCtggtgt > 1:3682016/1‑93 (MQ=255)
gTTTCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCtggtgt > 2:5042779/1‑93 (MQ=255)
tttCTCCACACTGCGGGGGTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCtggtgtg < 1:1482232/93‑1 (MQ=255)
tttCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCtggtgtg > 2:4462671/1‑93 (MQ=255)
ttCTCCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCtggtgtgg < 1:4434694/93‑1 (MQ=255)
tctcCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCtggtgtggt > 1:5469853/1‑93 (MQ=255)
tcCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGtggtgg > 1:2294159/1‑93 (MQ=255)
tcCACACTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGtggtgg > 1:4762996/1‑93 (MQ=255)
cacaCTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGaa > 2:6237310/1‑93 (MQ=255)
acacTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGaaa > 2:5120608/1‑93 (MQ=255)
acTGTGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAAt < 2:4172413/93‑1 (MQ=255)
acTGTGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAAt < 1:254251/93‑1 (MQ=255)
acTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAAt < 1:2082074/93‑1 (MQ=255)
acTGCGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAAt < 2:5179484/93‑1 (MQ=255)
tgGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAATtcgt < 1:2980206/93‑1 (MQ=255)
|
CTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAATTCGT > NC_000913/3238129‑3238312
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAATTCGTC > NC_000913/3238127‑3238313
|
ACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGT < SRR4302542.3851571/94‑1 (MQ=60)
ACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGC > SRR4302542.932642/1‑94 (MQ=60)
CCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCG < SRR4302542.3487297/94‑1 (MQ=60)
CCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCG < SRR4302542.6977961/94‑1 (MQ=60)
CCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCG > SRR4302542.3090247/1‑94 (MQ=60)
CTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGG < SRR4302542.4218387/94‑1 (MQ=60)
CTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGG < SRR4302542.6960090/94‑1 (MQ=60)
CTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGG > SRR4302542.3997287/1‑94 (MQ=60)
TTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGG < SRR4302542.22868/94‑1 (MQ=60)
TTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGG > SRR4302542.5034400/1‑94 (MQ=60)
TTATGGTGAATCTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTTGTATTTTTGGGCTTTTTTTTTCTGCCCCGGCAACCACCGGGTTCTCCACACTGCGGGG < SRR4302542.7230212/94‑1 (MQ=53)
TTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGG < SRR4302542.874401/94‑1 (MQ=60)
TATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGC < SRR4302542.4465528/94‑1 (MQ=60)
TATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGC < SRR4302542.6997394/94‑1 (MQ=60)
ATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCT > SRR4302542.43992/1‑94 (MQ=60)
ATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCT > SRR4302542.5150368/1‑94 (MQ=60)
ATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCT < SRR4302542.1293047/94‑1 (MQ=60)
TGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTA > SRR4302542.3988853/1‑94 (MQ=60)
GGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTAC < SRR4302542.2501773/94‑1 (MQ=60)
GTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACG < SRR4302542.4650837/94‑1 (MQ=60)
GAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTACG‑C‑G > SRR4302542.60059/1‑94 (MQ=60)
AAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GC > SRR4302542.1182822/1‑94 (MQ=60)
AACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCA < SRR4302542.3775222/94‑1 (MQ=60)
ACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAA > SRR4302542.6104797/1‑94 (MQ=60)
CTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAAC < SRR4302542.5670994/94‑1 (MQ=60)
TGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTACG‑C‑GCAACT < SRR4302542.4420287/94‑1 (MQ=60)
TGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACT < SRR4302542.1841716/94‑1 (MQ=60)
TGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACT > SRR4302542.1427971/1‑94 (MQ=60)
GGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTG > SRR4302542.5828063/1‑94 (MQ=60)
TCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCT < SRR4302542.1814432/94‑1 (MQ=60)
CATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTG > SRR4302542.6568691/1‑94 (MQ=60)
CATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTG > SRR4302542.5759823/1‑94 (MQ=60)
ATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGG > SRR4302542.5868211/1‑94 (MQ=60)
ATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGG > SRR4302542.1044254/1‑94 (MQ=60)
TTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGT < SRR4302542.4356475/94‑1 (MQ=60)
TTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGT < SRR4302542.6412782/94‑1 (MQ=60)
TTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGT > SRR4302542.1121376/1‑94 (MQ=60)
TTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGT < SRR4302542.4911043/94‑1 (MQ=60)
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CTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTG > SRR4302542.7502614/1‑94 (MQ=60)
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ATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCT > SRR4302542.163633/1‑94 (MQ=60)
GGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTA > SRR4302542.3968971/1‑94 (MQ=60)
GTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTAT < SRR4302542.4788671/94‑1 (MQ=60)
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TATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATG < SRR4302542.1940975/94‑1 (MQ=60)
ATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGT < SRR4302542.6667533/94‑1 (MQ=60)
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TACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTT > SRR4302542.6194238/1‑94 (MQ=60)
TACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTT < SRR4302542.1853240/94‑1 (MQ=60)
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CCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAAC > SRR4302542.4507935/1‑94 (MQ=60)
CCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAAC > SRR4302542.1382275/1‑94 (MQ=60)
CTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACC > SRR4302542.5666306/1‑94 (MQ=60)
CTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACC > SRR4302542.6096569/1‑94 (MQ=60)
TGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCC < SRR4302542.2047700/94‑1 (MQ=60)
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CCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCT > SRR4302542.4096876/1‑94 (MQ=60)
CCACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCT > SRR4302542.4046179/1‑94 (MQ=60)
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ACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGG < SRR4302542.4421733/94‑1 (MQ=60)
ACCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGG < SRR4302542.817277/94‑1 (MQ=60)
CCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGT < SRR4302542.5814521/94‑1 (MQ=60)
CCGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGT < SRR4302542.4670938/94‑1 (MQ=60)
CGGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTG > SRR4302542.7292976/1‑94 (MQ=60)
GGTTTCTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGT > SRR4302542.3718101/1‑94 (MQ=60)
GTTTCTCCACACTGTGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTG < SRR4302542.4771086/94‑1 (MQ=60)
GTTTCTCCACACTGTGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTG < SRR4302542.3010918/94‑1 (MQ=60)
GTTTCTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTG > SRR4302542.6301945/1‑94 (MQ=60)
TTTCTCCACACTGCGGGGGTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGG < SRR4302542.1495030/94‑1 (MQ=60)
TTTCTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGG < SRR4302542.7020652/94‑1 (MQ=60)
TTTCTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGG > SRR4302542.4353873/1‑94 (MQ=60)
TTCTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGT > SRR4302542.5522991/1‑94 (MQ=60)
TTCTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGT < SRR4302542.4478226/94‑1 (MQ=60)
TCTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTG < SRR4302542.6819798/94‑1 (MQ=60)
CTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGG > SRR4302542.2581193/1‑94 (MQ=60)
CTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGG > SRR4302542.4229706/1‑94 (MQ=60)
CTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGG > SRR4302542.2313866/1‑94 (MQ=60)
CTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGG > SRR4302542.6130555/1‑94 (MQ=60)
CTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGG < SRR4302542.2367034/94‑1 (MQ=60)
CTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGG > SRR4302542.4809428/1‑94 (MQ=60)
CTCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGG < SRR4302542.5550191/94‑1 (MQ=60)
TCCACACTGTGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGA < SRR4302542.4792134/94‑1 (MQ=60)
TCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGA > SRR4302542.4051143/1‑94 (MQ=60)
TCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGA > SRR4302542.3803003/1‑94 (MQ=60)
TCCACACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGA < SRR4302542.6045387/94‑1 (MQ=60)
GCACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTCCTGGTGGCGGTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGGGGTGGAAAA < SRR4302542.3622185/94‑1 (MQ=60)
ACACTGCGGGGCTACG‑CAGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAA < SRR4302542.3681691/94‑1 (MQ=60)
CACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAAT > SRR4302542.2612933/1‑94 (MQ=60)
CACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAAT < SRR4302542.1166774/94‑1 (MQ=60)
ACTGTGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAATT < SRR4302542.256415/94‑1 (MQ=60)
ACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAATT < SRR4302542.2100058/94‑1 (MQ=60)
ACTGCGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAATT > SRR4302542.2096591/1‑94 (MQ=60)
CTGCGGGGCTACGCC‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAATT < SRR4302542.3758186/94‑1 (MQ=60)
TGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAATTCGTC < SRR4302542.3008740/94‑1 (MQ=60)
CGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAATTCGTC > SRR4302542.3277991/1‑94 (MQ=60)
CGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAATTCGTC < SRR4302542.7159247/94‑1 (MQ=60)
|
ACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTACG‑C‑GCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAATTCGTC > NC_000913/3238127‑3238313
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
