Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1061 |
294.1 |
15065038 |
98.6% |
14854127 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,471,916 |
C→T |
G92S (GGT→AGT) |
rpsL ← |
30S ribosomal subunit protein S12 |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,471,916 | 0 | C | T | 88.3%
| 950.4
/ 71.8
| 318 | G92S (GGT→AGT) | rpsL | 30S ribosomal subunit protein S12 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (8/29); new base T (149/131); total (158/160) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.57e-04 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.22e-02 |
Only 100 of 319 total aligned reads displayed.
GGACGCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACCCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCA‑GGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTCACTTC > NC_000913/3471825‑3472006
|
ggACGCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACAccc > 2:6926335/1‑93 (MQ=255)
aCGCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACCCgg < 1:1124188/93‑1 (MQ=255)
gCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGa < 1:1406907/93‑1 (MQ=255)
ttCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAgg > 1:5896353/1‑93 (MQ=255)
ttCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAgg < 1:5008814/93‑1 (MQ=255)
ttCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAgg > 1:3790338/1‑93 (MQ=255)
cACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTc < 2:586386/93‑1 (MQ=255)
cACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACCCGGGAGGTc < 1:262713/93‑1 (MQ=255)
gCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCttt < 2:2968636/93‑1 (MQ=255)
aTACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAac < 2:2798311/93‑1 (MQ=255)
tACTTGGAACGAGTCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAaca > 2:5819882/1‑93 (MQ=255)
tACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAaca < 1:460848/93‑1 (MQ=255)
tACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAaca < 2:1874159/93‑1 (MQ=255)
tACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAaca < 1:4475826/93‑1 (MQ=255)
tACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAaca < 1:3895859/93‑1 (MQ=255)
tACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACCCGGGAGGTCTTTAaca < 1:820621/93‑1 (MQ=255)
ttGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGa > 1:2053113/1‑93 (MQ=255)
ttGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGa < 2:3504935/93‑1 (MQ=255)
tGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGAc < 2:5668286/93‑1 (MQ=255)
tGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGAc < 1:7013478/93‑1 (MQ=255)
tGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGAc > 1:6020104/1‑93 (MQ=255)
tGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGAc < 1:5354311/93‑1 (MQ=255)
tGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACCCGGGAGGTCTTTAACACGAc < 2:6311581/93‑1 (MQ=255)
ggAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGAcc < 1:292953/93‑1 (MQ=255)
aaCGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGc < 2:1128721/93‑1 (MQ=255)
aCGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGcc > 1:626016/1‑93 (MQ=255)
gAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCAc < 1:4931696/93‑1 (MQ=255)
aGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACg > 1:3235229/1‑93 (MQ=255)
aGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACg > 2:6352223/1‑93 (MQ=255)
aGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACg > 1:210170/1‑93 (MQ=255)
gCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACgg > 2:2304644/1‑93 (MQ=255)
ccTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACgga < 2:6023616/93‑1 (MQ=255)
tGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACggatc > 2:2696883/1‑93 (MQ=255)
tGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACggatc > 1:3597043/1‑93 (MQ=255)
tGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACggatc > 2:117266/1‑93 (MQ=255)
tGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACggatc < 2:683793/93‑1 (MQ=255)
tGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACCCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACggatc < 2:4603706/93‑1 (MQ=255)
gCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACggatca < 2:7013788/93‑1 (MQ=255)
gCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACggatca > 1:6857699/1‑93 (MQ=255)
gCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACggatca < 2:1784358/93‑1 (MQ=255)
cTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACggatcag > 2:4303583/1‑93 (MQ=255)
cTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACggatcag > 2:5415403/1‑93 (MQ=255)
tACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACggatcagga > 2:2020383/1‑93 (MQ=255)
tACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACggatcagga < 2:3604883/93‑1 (MQ=255)
cGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACggatcaggatc > 2:5313361/1‑93 (MQ=255)
cGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACggatcaggatc > 1:1040413/1‑93 (MQ=255)
gTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCAc < 2:3651872/93‑1 (MQ=255)
tCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACg < 2:942029/93‑1 (MQ=255)
tCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACg > 1:5657316/1‑93 (MQ=255)
cTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACgg > 1:1165067/1‑93 (MQ=255)
tttAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGa > 1:5263898/1‑93 (MQ=255)
ttAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAg < 2:7389348/93‑1 (MQ=255)
ttAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAg < 2:7164687/93‑1 (MQ=255)
tAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACCCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGt < 2:434731/93‑1 (MQ=255)
aCGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGc < 1:7367696/93‑1 (MQ=255)
ccGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTcc < 2:1401545/93‑1 (MQ=255)
ccGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTcc > 2:327355/1‑93 (MQ=255)
cGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCt > 1:915837/1‑93 (MQ=255)
cGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACCCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCt < 2:7332065/93‑1 (MQ=255)
ggAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTg > 2:4797315/1‑93 (MQ=255)
gAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGc > 2:5549976/1‑93 (MQ=255)
gTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCA‑GGtt > 1:7500304/1‑93 (MQ=255)
gTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCA‑GGtt < 2:6514530/93‑1 (MQ=255)
tCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCA‑GGTtg < 1:655791/93‑1 (MQ=255)
cAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCA‑GGTtgt < 1:3974509/93‑1 (MQ=255)
cAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCA‑GGTtgt < 2:2175309/93‑1 (MQ=255)
cAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCA‑GGTtgt < 2:6099944/93‑1 (MQ=255)
gcgcACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCA‑GGTTGTGAc < 1:1209220/93‑1 (MQ=255)
gcACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCA‑GGTTGTGACCt > 2:4121628/1‑93 (MQ=255)
accacGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCA‑GGTTGTGACCTTc > 1:5622302/1‑93 (MQ=255)
cacGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCA‑GGTTGTGACCTTcac > 1:7422717/1‑93 (MQ=255)
cacGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCA‑GGTTGTGACCTTcac > 1:223126/1‑93 (MQ=255)
acGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCA‑GGTTGTGACCTTcacc > 2:523716/1‑93 (MQ=255)
cGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCA‑GGTTGTGACCTTcacca > 2:208050/1‑93 (MQ=255)
gTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCA‑GGTTGTGACCTTcaccac < 1:3526157/93‑1 (MQ=255)
tACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGGTTGTGACTTTaacaac > 1:2357280/1‑93 (MQ=255)
tACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCA‑GGTTGTGACCTTCaccacc > 1:1676797/1‑93 (MQ=255)
tACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCA‑GGTTGTGACCTTCaccacc < 1:3159295/93‑1 (MQ=255)
tACGGTGTGGTAACGAACACCCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCA‑GGTTGTGACCTTCaccacc < 2:39847/93‑1 (MQ=255)
tACGGTGTGGTAACGAACACCCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCA‑GGTTGTGACCTTCaccacc < 2:4921785/93‑1 (MQ=255)
cGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCA‑GGTTGTGACCTTCACCACCGa > 1:2462211/1‑93 (MQ=255)
ggTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCA‑GGTTGTGACCTTCACCACCGAt < 2:3855371/93‑1 (MQ=255)
ggTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCA‑GGTTGTGACCTTCACCACCGAt < 1:5847175/93‑1 (MQ=255)
tgtgGTAACGAACACCCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCA‑GGTTGTGACCTTCACCACCGATgc < 2:680867/93‑2 (MQ=255)
tgtgGTAACGAACACCCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCA‑GGTTGTGACCTTCACCACCGATgc < 1:690375/93‑2 (MQ=255)
gtgGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCA‑GGTTGTGACCTTCACCACCGATGTa < 2:2413555/93‑1 (MQ=255)
tgGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCA‑GGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAg < 2:3127960/93‑1 (MQ=255)
gTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCA‑GGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGa > 1:1953073/1‑93 (MQ=255)
gTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCA‑GGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGa < 1:5595771/93‑1 (MQ=255)
tAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCA‑GGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGaa > 2:2543083/1‑93 (MQ=255)
aaCGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCA‑GGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAg < 1:6666747/93‑1 (MQ=255)
aCGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCA‑GGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGt < 2:1556795/93‑1 (MQ=255)
aCGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCA‑GGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGt > 2:6004723/1‑93 (MQ=255)
aCGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCA‑GGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGt < 2:1470190/93‑1 (MQ=255)
cGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCA‑GGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTc < 1:1531237/93‑1 (MQ=255)
cGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCA‑GGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTc > 2:4721481/1‑93 (MQ=255)
cGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCA‑GGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTc > 1:7127778/1‑93 (MQ=255)
aaCACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCA‑GGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTCAc > 2:910536/1‑93 (MQ=255)
acacTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCA‑GGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTCACt < 1:6314822/93‑1 (MQ=255)
acCCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCA‑GGTTGTGACCTTCACCACCGATGCAGGAAGTCACTTc < 1:4124353/93‑1 (MQ=255)
|
GGACGCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACCCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCA‑GGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTCACTTC > NC_000913/3471825‑3472006
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TAGGACGCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACCCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTCACTTCG > NC_000913/3471823‑3472007
|
TAGGACGCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACT > SRR4302542.1401195/1‑94 (MQ=60)
AGGACGCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTC < SRR4302542.4448598/94‑1 (MQ=60)
GGACGCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCG < SRR4302542.4904390/94‑1 (MQ=60)
GACGCTTCACGCCATACTTTGAACGAGCCTGCTTACGGGCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGGGTGGTAACGAACACTCGG > SRR4302542.3700023/1‑94 (MQ=60)
GACGCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGG < SRR4302542.987925/94‑1 (MQ=60)
GACGCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGG > SRR4302542.5269226/1‑94 (MQ=60)
GACGCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGG > SRR4302542.2522654/1‑94 (MQ=60)
ACGCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACCCGGG < SRR4302542.3998521/94‑1 (MQ=60)
ACGCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACCCGGG < SRR4302542.1133791/94‑1 (MQ=60)
CGCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGA > SRR4302542.5610190/1‑94 (MQ=60)
CGCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGA > SRR4302542.4002083/1‑94 (MQ=60)
GCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAG < SRR4302542.7320109/94‑1 (MQ=60)
GCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAG < SRR4302542.1419071/94‑1 (MQ=60)
GCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAG < SRR4302542.142118/94‑1 (MQ=60)
GCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAG < SRR4302542.207400/94‑1 (MQ=60)
GCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAG < SRR4302542.1080721/94‑1 (MQ=60)
GCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAG < SRR4302542.5006663/94‑1 (MQ=60)
CTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGG > SRR4302542.5953495/1‑94 (MQ=60)
CTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGG > SRR4302542.5953494/1‑94 (MQ=60)
CTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGG > SRR4302542.3827814/1‑94 (MQ=60)
TTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGT < SRR4302542.5057463/94‑1 (MQ=60)
TTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGT > SRR4302542.5373321/1‑94 (MQ=60)
TTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGT > SRR4302542.5486889/1‑94 (MQ=60)
CACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACCCGGGAGGTCT < SRR4302542.264955/94‑1 (MQ=60)
ACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTT > SRR4302542.2814633/1‑94 (MQ=60)
CGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTT > SRR4302542.5363831/1‑94 (MQ=60)
CGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTT < SRR4302542.3870036/94‑1 (MQ=60)
GCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTA < SRR4302542.1991925/94‑1 (MQ=60)
GCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTA > SRR4302542.4048360/1‑94 (MQ=60)
GCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTA > SRR4302542.2464894/1‑94 (MQ=60)
CCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAA < SRR4302542.5690049/94‑1 (MQ=60)
CCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAA < SRR4302542.7530963/94‑1 (MQ=60)
ATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACCCGGGAGGTCTTTAACA > SRR4302542.1775085/1‑94 (MQ=60)
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TACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACAC < SRR4302542.464839/94‑1 (MQ=60)
TACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACAC < SRR4302542.3934323/94‑1 (MQ=60)
TACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACAC < SRR4302542.6551574/94‑1 (MQ=60)
TACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACCCGGGAGGTCTTTAACAC < SRR4302542.4071302/94‑1 (MQ=60)
TACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACCCGGGAGGTCTTTAACAC < SRR4302542.827710/94‑1 (MQ=60)
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CTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGA > SRR4302542.2070855/1‑94 (MQ=60)
TTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGAC > SRR4302542.6078408/1‑94 (MQ=60)
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TGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACC < SRR4302542.1683512/94‑1 (MQ=60)
TGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACC < SRR4302542.5406345/94‑1 (MQ=60)
GGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCG < SRR4302542.1686557/94‑1 (MQ=60)
GGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCG < SRR4302542.295507/94‑1 (MQ=60)
AACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCC > SRR4302542.631404/1‑94 (MQ=60)
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GAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACG > SRR4302542.211982/1‑94 (MQ=60)
GAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACCCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACG < SRR4302542.628346/94‑1 (MQ=60)
AGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGG > SRR4302542.1354290/1‑94 (MQ=60)
CCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGAT > SRR4302542.6069160/1‑94 (MQ=60)
CCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGAT < SRR4302542.1626997/94‑1 (MQ=60)
CTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATC > SRR4302542.5981477/1‑94 (MQ=60)
CTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATC > SRR4302542.3630582/1‑94 (MQ=60)
CTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACCCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATC < SRR4302542.210928/94‑1 (MQ=60)
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TGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCA > SRR4302542.5163600/1‑94 (MQ=60)
GCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAG > SRR4302542.3798666/1‑94 (MQ=60)
GCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAG < SRR4302542.2267755/94‑1 (MQ=60)
CTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGG > SRR4302542.2426925/1‑94 (MQ=60)
CTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGG < SRR4302542.4958829/94‑1 (MQ=60)
CTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGG > SRR4302542.7488844/1‑94 (MQ=60)
TTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGA > SRR4302542.566697/1‑94 (MQ=60)
ACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATC > SRR4302542.1049348/1‑94 (MQ=60)
CGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCA < SRR4302542.2268065/94‑1 (MQ=60)
CGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCA > SRR4302542.6964506/1‑94 (MQ=60)
CGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGAGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCA > SRR4302542.7588041/1‑94 (MQ=60)
GGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCAC > SRR4302542.955479/1‑94 (MQ=60)
GGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACCCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCAC < SRR4302542.7015510/94‑1 (MQ=60)
GTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACG < SRR4302542.5920585/94‑1 (MQ=60)
GTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACG > SRR4302542.5712280/1‑94 (MQ=60)
TCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGG > SRR4302542.1175093/1‑94 (MQ=60)
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CTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGA > SRR4302542.5315046/1‑94 (MQ=60)
CTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGA > SRR4302542.4680374/1‑94 (MQ=60)
TTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAG < SRR4302542.3234419/94‑1 (MQ=60)
TTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAG > SRR4302542.7022185/1‑94 (MQ=60)
TAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACCCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTG < SRR4302542.2143842/94‑1 (MQ=60)
AACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGC > SRR4302542.5015122/1‑94 (MQ=60)
AACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGC < SRR4302542.6616866/94‑1 (MQ=60)
ACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCT < SRR4302542.7439850/94‑1 (MQ=60)
CCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCT < SRR4302542.3322771/94‑1 (MQ=60)
CCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCT > SRR4302542.923734/1‑94 (MQ=60)
GGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACCCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGC > SRR4302542.777242/1‑94 (MQ=60)
GAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCA > SRR4302542.6342975/1‑94 (MQ=60)
AGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAG < SRR4302542.1519306/94‑1 (MQ=60)
AGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTT > SRR4302542.7574072/1‑94 (MQ=60)
AGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTT > SRR4302542.5832137/1‑94 (MQ=60)
AGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTT < SRR4302542.5824293/94‑1 (MQ=60)
AGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACCCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTT < SRR4302542.1067318/94‑1 (MQ=60)
GTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTG < SRR4302542.3583009/94‑1 (MQ=60)
TCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGT < SRR4302542.661449/94‑1 (MQ=60)
CAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTG < SRR4302542.4013724/94‑1 (MQ=60)
GCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACC < SRR4302542.665474/94‑1 (MQ=60)
GCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACC < SRR4302542.1219608/94‑1 (MQ=60)
CGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCT < SRR4302542.5697524/94‑1 (MQ=60)
GCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTT < SRR4302542.1390873/94‑1 (MQ=60)
CACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTC > SRR4302542.5676912/1‑94 (MQ=60)
CACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTC < SRR4302542.6813393/94‑1 (MQ=60)
CACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTC > SRR4302542.3245299/1‑94 (MQ=60)
ACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCA > SRR4302542.7493573/1‑94 (MQ=60)
CCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCAC > SRR4302542.6337515/1‑94 (MQ=60)
CCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCAC < SRR4302542.5667234/94‑1 (MQ=60)
CCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCAC > SRR4302542.7495349/1‑94 (MQ=60)
CCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCAC > SRR4302542.225060/1‑94 (MQ=60)
CACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACC > SRR4302542.2210868/1‑94 (MQ=60)
ACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCA < SRR4302542.4153967/94‑1 (MQ=60)
GTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGgttgtgactttaacaac > SRR4302542.2377543/1‑77 (MQ=60)
GTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACC > SRR4302542.2676399/1‑94 (MQ=60)
GTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACC < SRR4302542.3559111/94‑1 (MQ=60)
GTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACC > SRR4302542.1691288/1‑94 (MQ=60)
TACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCG < SRR4302542.3189284/94‑1 (MQ=60)
TACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCG > SRR4302542.4631710/1‑94 (MQ=60)
ACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGA > SRR4302542.2486126/1‑94 (MQ=60)
ACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGA > SRR4302542.1163704/1‑94 (MQ=60)
GGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATG < SRR4302542.5903882/94‑1 (MQ=60)
GGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATG < SRR4302542.6811094/94‑1 (MQ=60)
GTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGT > SRR4302542.5893547/1‑94 (MQ=60)
GTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGT > SRR4302542.3571576/1‑94 (MQ=60)
TGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTA > SRR4302542.4427275/1‑94 (MQ=60)
TGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTA > SRR4302542.1849228/1‑94 (MQ=60)
TGTGGTAACGAACACCCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGCA < SRR4302542.696340/94‑1 (MQ=60)
GTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAG > SRR4302542.886384/1‑94 (MQ=60)
TGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGG < SRR4302542.6221085/94‑1 (MQ=60)
TGGTAACGAACACCCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGCAGG > SRR4302542.7181401/1‑94 (MQ=60)
GGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGA > SRR4302542.1969966/1‑94 (MQ=60)
GGTAACGAACACCCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGCAGGA < SRR4302542.4456705/94‑1 (MQ=60)
GTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAA < SRR4302542.5650143/94‑1 (MQ=60)
GTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAA > SRR4302542.3222185/1‑94 (MQ=60)
GTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAA < SRR4302542.254311/94‑1 (MQ=60)
TAACGAACACTCGGGAGGACTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGGGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAG > SRR4302542.732828/1‑94 (MQ=60)
AACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGT < SRR4302542.1194902/94‑1 (MQ=60)
AACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGT < SRR4302542.6732428/94‑1 (MQ=60)
AACGAACACCCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGCAGGAAGT > SRR4302542.392864/1‑94 (MQ=60)
ACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTC > SRR4302542.7197734/1‑94 (MQ=60)
ACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTC < SRR4302542.861430/94‑1 (MQ=60)
CGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTCA < SRR4302542.1544458/94‑1 (MQ=60)
CGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTCA < SRR4302542.3525719/94‑1 (MQ=60)
CGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTCA < SRR4302542.6938652/94‑1 (MQ=60)
CGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTCA > SRR4302542.460558/1‑94 (MQ=60)
GAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTCAC > SRR4302542.2331455/1‑94 (MQ=60)
ACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTCACTT < SRR4302542.6377068/94‑1 (MQ=60)
ACACCCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGCAGGAAGTCACTT < SRR4302542.6671825/94‑1 (MQ=60)
CACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTCACTTC > SRR4302542.5564881/1‑94 (MQ=60)
CACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTCACTTC < SRR4302542.7251573/94‑1 (MQ=60)
ACCCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGCAGGAAGTCACTTCG < SRR4302542.4164981/94‑1 (MQ=60)
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TAGGACGCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACCCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTCACTTCG > NC_000913/3471823‑3472007
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
