Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1061 |
294.1 |
15065038 |
98.6% |
14854127 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,494,555 |
T→C |
intergenic (+41/‑85) |
nirD → / → nirC |
nitrite reductase (NAD(P)H) subunit/Nitrite transporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,494,555 | 0 | T | C | 86.0%
| 667.3
/ 94.3
| 278 | intergenic (+41/‑85) | nirD/nirC | nitrite reductase (NAD(P)H) subunit/Nitrite transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (8/31); new base C (41/198); total (49/229) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.51e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.22e-01 |
Only 100 of 281 total aligned reads displayed.
AACATTACGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGTCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTAAAGGATAATCAAATGTT > NC_000913/3494465‑3494644
|
aaCATTACGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGccc < 2:3045452/93‑1 (MQ=255)
cATTACGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTg < 1:2088708/93‑1 (MQ=255)
tACGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGtaa < 2:6384491/93‑1 (MQ=255)
tACGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGtaa > 2:6034159/1‑93 (MQ=255)
aCGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGtaat < 2:814252/93‑1 (MQ=255)
cGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGtaata < 1:4741535/93‑1 (MQ=255)
cGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGtaata < 1:23993/93‑1 (MQ=255)
gAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGtaataa < 1:4354558/93‑1 (MQ=255)
aGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATc < 1:3390790/93‑1 (MQ=255)
aGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATc > 1:4296355/1‑93 (MQ=255)
gcgAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTc < 2:625291/93‑1 (MQ=255)
gcgAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTc < 2:5083680/93‑1 (MQ=255)
gcgAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTc < 2:5704478/93‑1 (MQ=255)
gcgAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTc > 2:1629760/1‑93 (MQ=255)
gcgAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTc < 2:7463530/93‑1 (MQ=255)
cgAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCg < 2:4127584/93‑1 (MQ=255)
gAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCgg < 2:2440797/93‑1 (MQ=255)
aGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGt > 2:2309876/1‑93 (MQ=255)
gAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGtata < 1:5648123/93‑1 (MQ=255)
gAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGtata < 2:4542702/93‑1 (MQ=255)
gAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGtata < 1:161231/93‑1 (MQ=255)
aaaGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTatat < 2:4691344/93‑1 (MQ=255)
aaaGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTatat < 1:5433643/93‑1 (MQ=255)
aaGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGTCCTGTAATAATCTTCGGTATAtt < 2:6875843/93‑1 (MQ=255)
aaGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATAtt < 1:3210532/93‑1 (MQ=255)
aaGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATAtt < 2:1423128/93‑1 (MQ=255)
aaGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATAtt < 2:6956586/93‑1 (MQ=255)
aGACGGTGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGTCCTGTAATAATCTTCGGTATATTg < 1:251906/93‑1 (MQ=255)
aGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGTCCTGTAATAATCTTCGGTATATTg < 2:6170209/93‑1 (MQ=255)
aGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTg < 2:35817/93‑1 (MQ=255)
aCGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCa < 2:2343922/93‑1 (MQ=255)
ggCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAgg < 1:1979656/93‑1 (MQ=255)
gCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGa < 1:3859861/93‑1 (MQ=255)
gtggtgCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACa < 2:2806706/93‑1 (MQ=255)
gtggtgCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACa < 1:6386401/93‑1 (MQ=255)
gtggtgCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACa > 1:5936038/1‑93 (MQ=255)
gtggtgCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACa < 1:5889520/93‑1 (MQ=255)
gtggtgCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACa < 1:1072610/93‑1 (MQ=255)
tggtgCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACAt < 2:7297017/93‑1 (MQ=255)
tggtgCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACAt < 1:2711036/93‑1 (MQ=255)
gtgCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACAttt < 1:2971113/93‑1 (MQ=255)
tgCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGTCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACAtttt < 2:368033/93‑1 (MQ=255)
cTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTaaa < 1:3905705/93‑1 (MQ=255)
cTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTaaa < 2:1498846/93‑1 (MQ=255)
cTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTaaa < 2:6296266/93‑1 (MQ=255)
tGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAAc < 2:3163543/93‑1 (MQ=255)
tGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAAc < 2:4387507/93‑1 (MQ=255)
gcgcGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACt > 1:2221733/1‑93 (MQ=255)
gcgGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGTCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACttt < 2:3432611/93‑1 (MQ=255)
gcgGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACttt < 2:340035/93‑1 (MQ=255)
gcgGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACttt < 1:448829/93‑1 (MQ=255)
gcgGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACttt < 1:2474457/93‑1 (MQ=255)
gcgGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACttt < 1:4577355/93‑1 (MQ=255)
cgGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGTCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACtttt < 1:654844/93‑1 (MQ=255)
cgGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACtttt > 1:4813941/1‑93 (MQ=255)
ggTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACttttt < 1:1677062/93‑1 (MQ=255)
gTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGTCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTg < 1:1231436/93‑1 (MQ=255)
gTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTg > 2:4297536/1‑93 (MQ=255)
gTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTg < 1:6178192/93‑1 (MQ=255)
ttAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGt < 1:5120091/93‑1 (MQ=255)
tAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGtt < 2:7259876/93‑1 (MQ=255)
tAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGtt < 2:1018426/93‑1 (MQ=255)
aaTGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGTCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGttt < 1:7468307/93‑1 (MQ=255)
aaTGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGttt < 2:1284482/93‑1 (MQ=255)
aTGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGtttt < 1:517028/93‑1 (MQ=255)
aTGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGtttt > 2:2998029/1‑93 (MQ=255)
aTGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGtttt > 2:2538069/1‑93 (MQ=255)
tGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTa < 1:4957117/93‑1 (MQ=255)
tGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTa < 1:4027310/93‑1 (MQ=255)
gTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTGCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTAt < 2:4785764/93‑1 (MQ=255)
ttttAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGTCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTAtt < 1:1031180/93‑1 (MQ=255)
ttttAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTAtt < 2:913921/93‑1 (MQ=255)
ttttAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTAtt < 2:3344593/93‑1 (MQ=255)
ttttAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTAtt < 2:1261358/93‑1 (MQ=255)
ttttAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTAtt < 2:2131237/93‑1 (MQ=255)
ttttAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTAtt < 2:5783381/93‑1 (MQ=255)
tttAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTAttt < 2:7398699/93‑1 (MQ=255)
accGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTAtttttt < 1:3709237/91‑1 (MQ=255)
aaCGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTAtttttt < 1:2878208/93‑1 (MQ=255)
aaCGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTAtttttt < 1:5519374/93‑1 (MQ=255)
gggAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGTCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGtt < 1:3669168/93‑1 (MQ=255)
gggAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGtt > 1:6684862/1‑93 (MQ=255)
gggAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGtt < 2:648143/93‑1 (MQ=255)
ggAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGttt < 2:5920435/93‑1 (MQ=255)
ggAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGttt < 2:1724985/93‑1 (MQ=255)
aGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGttttt < 2:1897974/93‑1 (MQ=255)
aGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGttttt < 2:6536467/93‑1 (MQ=255)
aGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGttttt < 2:1324361/93‑1 (MQ=255)
aGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGttttt < 1:3570955/93‑1 (MQ=255)
gcgcAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTAt < 2:1992163/93‑1 (MQ=255)
cAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTAtttt < 1:6982586/93‑1 (MQ=255)
cAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTAtttt < 2:3906077/93‑1 (MQ=255)
ccTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTaaa > 1:5040589/1‑93 (MQ=255)
ccTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTaaa < 2:3007700/93‑1 (MQ=255)
tCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTAAAgg < 2:2726261/93‑1 (MQ=255)
cccTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTAAAGGAt > 1:1831628/1‑93 (MQ=255)
cccTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTAAAGGAt < 1:1486141/93‑1 (MQ=255)
ccTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTAAAGGATa > 2:4205372/1‑93 (MQ=255)
ccTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTAAAGGATa < 1:4184658/93‑1 (MQ=255)
tGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTAAAGGATAATCAAATGtt < 2:3989925/93‑1 (MQ=255)
|
AACATTACGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGTCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTAAAGGATAATCAAATGTT > NC_000913/3494465‑3494644
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CAAACATTACGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGTCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTAAAGGATAATCAAATGTTTACA > NC_000913/3494463‑3494648
|
CAAACATTACGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCC < SRR4302542.2165862/94‑1 (MQ=60)
CATTACGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGT < SRR4302542.2106738/94‑1 (MQ=60)
ATTACGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTA < SRR4302542.167787/94‑1 (MQ=60)
TTACGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAA > SRR4302542.1396658/1‑94 (MQ=60)
TACGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGTCCTGTAAT < SRR4302542.2080461/94‑1 (MQ=60)
CGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAA < SRR4302542.1053258/94‑1 (MQ=60)
CGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAA < SRR4302542.24198/94‑1 (MQ=60)
CGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAA < SRR4302542.4787764/94‑1 (MQ=60)
GAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGTCCTGTAATAAT < SRR4302542.6464866/94‑1 (MQ=60)
GAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAAT < SRR4302542.4397338/94‑1 (MQ=60)
AAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATC < SRR4302542.4676711/94‑1 (MQ=60)
AAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATC > SRR4302542.4338615/1‑94 (MQ=60)
AGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCT < SRR4302542.5138089/94‑1 (MQ=60)
AGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCT < SRR4302542.3422609/94‑1 (MQ=60)
GCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCG < SRR4302542.5564080/94‑1 (MQ=60)
GCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCG < SRR4302542.1111392/94‑1 (MQ=60)
GCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCG < SRR4302542.1716753/94‑1 (MQ=60)
CGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGG < SRR4302542.1539717/94‑1 (MQ=60)
GAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGT < SRR4302542.5568216/94‑1 (MQ=60)
GAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGT < SRR4302542.764409/94‑1 (MQ=60)
GTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTAT < SRR4302542.6201047/94‑1 (MQ=60)
GAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGTCCTGTAATAATCTTCGGTATAT > SRR4302542.3675591/1‑94 (MQ=60)
GAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATAT < SRR4302542.5702971/94‑1 (MQ=60)
GAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATAT < SRR4302542.162598/94‑1 (MQ=60)
AAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATT < SRR4302542.5486439/94‑1 (MQ=60)
AAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATT < SRR4302542.6133889/94‑1 (MQ=60)
AAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGTCCTGTAATAATCTTCGGTATATTG > SRR4302542.2540431/1‑94 (MQ=60)
AAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTG < SRR4302542.3240927/94‑1 (MQ=60)
AGACGGTGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGTCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGC < SRR4302542.254059/94‑1 (MQ=60)
AGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGTCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGC < SRR4302542.3242908/94‑1 (MQ=60)
AGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGC < SRR4302542.1567602/94‑1 (MQ=60)
AGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGC < SRR4302542.2652132/94‑1 (MQ=60)
ACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAG < SRR4302542.7415731/94‑1 (MQ=60)
CGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGG < SRR4302542.4367211/94‑1 (MQ=60)
CGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGG < SRR4302542.6575737/94‑1 (MQ=60)
CGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGG < SRR4302542.2913811/94‑1 (MQ=60)
GGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGA < SRR4302542.1996750/94‑1 (MQ=60)
GCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGAC < SRR4302542.3897983/94‑1 (MQ=60)
CGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACA > SRR4302542.5993545/1‑94 (MQ=60)
GTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGTCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACAT < SRR4302542.6434806/94‑1 (MQ=60)
GTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACAT < SRR4302542.6449283/94‑1 (MQ=60)
GTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACAT < SRR4302542.5946596/94‑1 (MQ=60)
GTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACAT < SRR4302542.1081827/94‑1 (MQ=60)
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TGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATT < SRR4302542.4560109/94‑1 (MQ=60)
TGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATT < SRR4302542.3739970/94‑1 (MQ=60)
TGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATT < SRR4302542.2737181/94‑1 (MQ=60)
GGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGTCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTT < SRR4302542.3639685/94‑1 (MQ=60)
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GGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTGGTAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTT < SRR4302542.2472753/94‑1 (MQ=60)
GGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTT < SRR4302542.4231021/94‑1 (MQ=60)
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GTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTT < SRR4302542.2999569/94‑1 (MQ=60)
TGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTT < SRR4302542.2338948/94‑1 (MQ=60)
TGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTT < SRR4302542.2543979/94‑1 (MQ=60)
TGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTT < SRR4302542.3877759/94‑1 (MQ=60)
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TGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACT > SRR4302542.2240844/1‑94 (MQ=60)
TGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACT < SRR4302542.1883927/94‑1 (MQ=60)
TGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACT < SRR4302542.1497888/94‑1 (MQ=60)
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CGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTT < SRR4302542.453964/94‑1 (MQ=60)
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GCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTT < SRR4302542.2498465/94‑1 (MQ=60)
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GCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTT < SRR4302542.4622136/94‑1 (MQ=60)
GCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTT < SRR4302542.452710/94‑1 (MQ=60)
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CGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTT < SRR4302542.3820978/94‑1 (MQ=60)
CGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTT > SRR4302542.5818100/1‑94 (MQ=60)
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GTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGT > SRR4302542.6411430/1‑94 (MQ=60)
GTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGT < SRR4302542.6238090/94‑1 (MQ=60)
GTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGT < SRR4302542.4917289/94‑1 (MQ=60)
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AATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGTCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTT < SRR4302542.7541481/94‑1 (MQ=60)
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ATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTA < SRR4302542.521508/94‑1 (MQ=60)
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AACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTG > SRR4302542.5217211/1‑94 (MQ=60)
AACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTG < SRR4302542.5277891/94‑1 (MQ=60)
AACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTG < SRR4302542.2905860/94‑1 (MQ=60)
AACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTG < SRR4302542.5573012/94‑1 (MQ=60)
ACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGT > SRR4302542.4246579/1‑94 (MQ=60)
CGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTT < SRR4302542.399944/94‑1 (MQ=60)
CGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTT > SRR4302542.6750703/1‑94 (MQ=60)
GGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGTCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTT < SRR4302542.3704336/94‑1 (MQ=60)
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GCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTAAA > SRR4302542.5089521/1‑94 (MQ=60)
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CCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTAAAG < SRR4302542.2224753/94‑1 (MQ=60)
CCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTAAAG < SRR4302542.2837613/94‑1 (MQ=60)
CTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTAAAGG > SRR4302542.2387154/1‑94 (MQ=60)
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TCCCCTTTTTGCATGGTCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTAAAGGA > SRR4302542.4846175/1‑94 (MQ=60)
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TTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTAAAGGATAATCAAA < SRR4302542.4455418/94‑1 (MQ=60)
GCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTAAAGGATAATCAAATG > SRR4302542.1234335/1‑94 (MQ=60)
ATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTAAAGGATAATCAAATGTT > SRR4302542.4137442/1‑94 (MQ=60)
TCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTAAAGGATAATCAAATGTTTACA > SRR4302542.6148406/1‑94 (MQ=60)
CCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTAAAGGATAATCAAATGTTTACA < SRR4302542.6438614/94‑1 (MQ=60)
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CAAACATTACGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGTCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTAAAGGATAATCAAATGTTTACA > NC_000913/3494463‑3494648
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
