Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1061 |
294.1 |
15065038 |
98.6% |
14854127 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,766,847 |
T→C |
intergenic (+582/‑125) |
yibG → / → b4549 |
hypothetical protein/hypothetical protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,766,847 | 0 | T | C | 86.8%
| 717.4
/ 95.1
| 287 | intergenic (+582/‑125) | yibG/b4549 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (22/16); new base C (127/122); total (149/138) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.88e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.71e-01 |
Only 100 of 302 total aligned reads displayed.
TTTTGGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTGCAG > NC_000913/3766757‑3766939
|
ttttGGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATtctc > 2:5116556/1‑93 (MQ=255)
ttttGGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATtctc > 2:3326384/1‑93 (MQ=255)
tttGGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCa < 1:5310314/93‑1 (MQ=255)
gTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGc > 1:756612/1‑93 (MQ=255)
ccGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAGAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCa < 2:543422/93‑1 (MQ=255)
ccGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCa < 2:275686/93‑1 (MQ=255)
ccGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCa > 2:6746421/1‑93 (MQ=255)
cGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAg > 1:5800913/1‑93 (MQ=255)
gTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGa > 1:3379944/1‑93 (MQ=255)
tCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGAt > 1:4524462/1‑93 (MQ=255)
cTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATGACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATa < 1:2663736/93‑1 (MQ=255)
cTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATa < 2:5484892/93‑1 (MQ=255)
tAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGca > 1:1020899/1‑93 (MQ=255)
ggACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGcaca > 1:5909653/1‑93 (MQ=255)
ggACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGcaca > 1:2009348/1‑93 (MQ=255)
ggACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGcaca < 1:5575788/93‑1 (MQ=255)
gACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACAt > 1:7408381/1‑93 (MQ=255)
cTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTaa > 1:4555785/1‑93 (MQ=255)
cTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTaa > 1:7449163/1‑93 (MQ=255)
tCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAAc > 1:6278612/1‑93 (MQ=255)
tCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAAc < 2:4545183/93‑1 (MQ=255)
cGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACa < 1:1411521/93‑1 (MQ=255)
gATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAg < 1:3642878/93‑1 (MQ=255)
aTTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGt > 1:46701/1‑93 (MQ=255)
ttCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACGTGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGtt > 1:6214884/1‑93 (MQ=255)
ttCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGtt > 2:1578772/1‑93 (MQ=255)
ttCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGtt < 1:4741271/93‑1 (MQ=255)
tCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTa > 1:2527338/1‑93 (MQ=255)
cTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTAc < 2:6915907/93‑1 (MQ=255)
tGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACg < 1:6433643/93‑1 (MQ=255)
ttCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGa < 1:127257/93‑1 (MQ=255)
tCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGAc < 2:5848737/93‑1 (MQ=255)
gggTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTaaaa > 2:4375216/1‑93 (MQ=255)
gggTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTaaaa > 1:3290762/1‑93 (MQ=255)
gTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAatat > 2:4160832/1‑93 (MQ=255)
tataACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATg < 1:5700345/93‑1 (MQ=255)
aaCTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCa > 1:851242/1‑93 (MQ=255)
aCTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCaa < 1:1772245/93‑1 (MQ=255)
aCTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCaa > 1:6041608/1‑93 (MQ=255)
aCTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCaa < 1:2101562/93‑1 (MQ=255)
aCTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCaa < 2:4087266/93‑1 (MQ=255)
cTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAg > 1:4902569/1‑93 (MQ=255)
cTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAg < 2:4439507/93‑1 (MQ=255)
cTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAg > 1:51220/1‑93 (MQ=255)
tGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAgg > 2:2944459/1‑93 (MQ=255)
tGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAgg < 1:6914305/93‑1 (MQ=255)
ggTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGt > 1:3120594/1‑93 (MQ=255)
ggTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGt < 2:3941628/93‑1 (MQ=255)
ggTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCGCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGt < 2:7253829/93‑1 (MQ=255)
ttATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGttat < 2:6157532/93‑1 (MQ=255)
ttATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGttat > 1:2789239/1‑93 (MQ=255)
ttATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGttat > 2:3743807/1‑93 (MQ=255)
tATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGttatt < 1:4283822/93‑1 (MQ=255)
tATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGttatt > 1:2440097/1‑93 (MQ=255)
tCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTaa > 2:1664171/1‑93 (MQ=255)
tCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTaa > 2:7062382/1‑93 (MQ=255)
tCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTaa > 2:2379034/1‑93 (MQ=255)
tAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACa > 2:1875806/1‑93 (MQ=255)
aaTGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACaa > 1:4590601/1‑93 (MQ=255)
gACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTg > 1:5417649/1‑93 (MQ=255)
aCATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGt > 1:4026469/1‑93 (MQ=255)
cATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTa > 1:5682466/1‑93 (MQ=255)
tGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTAtt > 2:3539832/1‑93 (MQ=255)
tGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTAtt > 2:7450738/1‑93 (MQ=255)
tGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTAtt > 2:5753476/1‑93 (MQ=255)
tGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTAtt > 1:6941729/1‑93 (MQ=255)
gCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTAttt < 1:719293/93‑1 (MQ=255)
gCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTAttt > 1:3230609/1‑93 (MQ=255)
cAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTAtttt < 2:3222330/93‑1 (MQ=255)
cAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTAtttt > 2:1353282/1‑93 (MQ=255)
cAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTAtttt > 2:6460750/1‑93 (MQ=255)
aaaaaTTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTAttttt > 1:182804/1‑93 (MQ=255)
aaaaTTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTAtttttt < 2:1527421/93‑1 (MQ=255)
aaaTTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTAttttttt < 2:1394160/93‑1 (MQ=255)
aaaTTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTAttttttt > 2:1078108/1‑93 (MQ=255)
aaTTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTtc < 2:2014261/93‑1 (MQ=255)
aTTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTtct > 1:3894789/1‑93 (MQ=255)
ttAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTtctc < 1:4498407/93‑1 (MQ=255)
ttAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTtctc < 1:7000944/93‑1 (MQ=255)
tAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTctct > 1:5245096/1‑93 (MQ=255)
tAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTctct < 2:4484288/93‑1 (MQ=255)
tAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTctct > 1:5458346/1‑93 (MQ=255)
aaaTGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTa < 1:165889/93‑1 (MQ=255)
aaaTGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTa > 1:3560020/1‑93 (MQ=255)
aTGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTAtt > 2:2845335/1‑93 (MQ=255)
tGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTAttt > 2:2342594/1‑93 (MQ=255)
tGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTAttt > 2:6873412/1‑93 (MQ=255)
gAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTc < 1:1604006/93‑1 (MQ=255)
gAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTc > 1:283477/1‑93 (MQ=255)
gTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTg < 1:4405473/93‑1 (MQ=255)
ttAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGc < 1:2342730/93‑1 (MQ=255)
aaTATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGa < 1:1504192/93‑1 (MQ=255)
aaTATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGa > 2:4649438/1‑93 (MQ=255)
atatTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAg > 1:5529675/1‑93 (MQ=255)
tatTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGt > 1:6506570/1‑93 (MQ=255)
tatTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGt > 2:2549261/1‑93 (MQ=255)
tatTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGt > 1:6749751/1‑93 (MQ=255)
atTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTg > 2:1011751/1‑93 (MQ=255)
atTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTg > 2:6068130/1‑93 (MQ=255)
ttttCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTGc > 1:6584815/1‑93 (MQ=255)
|
TTTTGGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTGCAG > NC_000913/3766757‑3766939
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGCTTTTGGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTGCAGT > NC_000913/3766754‑3766940
|
CGCTTTTGGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTC > SRR4302542.1306673/1‑94 (MQ=60)
GCTTTTGGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCT > SRR4302542.4248001/1‑94 (MQ=60)
GCTTTTGGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCT > SRR4302542.4581664/1‑94 (MQ=60)
CTTTTGGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTATTAACATGAAAAATTTAATTAAGTTAATATCTTC > SRR4302542.578214/1‑94 (MQ=60)
CTTTTGGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTC > SRR4302542.6339894/1‑94 (MQ=60)
CTTTTGGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTC > SRR4302542.7543286/1‑94 (MQ=60)
CTTTTGGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTC > SRR4302542.242700/1‑94 (MQ=60)
CTTTTGGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTC > SRR4302542.6930361/1‑94 (MQ=60)
TTTGGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAG < SRR4302542.5361907/94‑1 (MQ=60)
GGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGC > SRR4302542.763171/1‑94 (MQ=60)
TCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCA > SRR4302542.4085495/1‑94 (MQ=60)
CCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAG < SRR4302542.6117258/94‑1 (MQ=60)
CCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAG > SRR4302542.5857209/1‑94 (MQ=60)
CGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGA > SRR4302542.3411700/1‑94 (MQ=60)
CGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGA < SRR4302542.3624617/94‑1 (MQ=60)
GTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGAT > SRR4302542.2486277/1‑94 (MQ=60)
GTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGAT > SRR4302542.4568783/1‑94 (MQ=60)
GTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGAT > SRR4302542.7420431/1‑94 (MQ=60)
CTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATGACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAG < SRR4302542.2689445/94‑1 (MQ=60)
CTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAG < SRR4302542.2192349/94‑1 (MQ=60)
CTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAG < SRR4302542.5918261/94‑1 (MQ=60)
CTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAG > SRR4302542.6918843/1‑94 (MQ=60)
CTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAG > SRR4302542.467067/1‑94 (MQ=60)
CTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAG < SRR4302542.6711974/94‑1 (MQ=60)
CTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAG > SRR4302542.1274093/1‑94 (MQ=60)
CTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAG < SRR4302542.3281508/94‑1 (MQ=60)
TTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCA < SRR4302542.833747/94‑1 (MQ=60)
TTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCA < SRR4302542.250495/94‑1 (MQ=60)
TTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCA > SRR4302542.1029691/1‑94 (MQ=60)
TTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCA < SRR4302542.6402526/94‑1 (MQ=60)
AGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACA > SRR4302542.5966927/1‑94 (MQ=60)
AGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACA < SRR4302542.6617818/94‑1 (MQ=60)
AGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACA > SRR4302542.6568071/1‑94 (MQ=60)
AGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACA > SRR4302542.5980366/1‑94 (MQ=60)
AGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACA > SRR4302542.2026701/1‑94 (MQ=60)
GGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACAT < SRR4302542.5629950/94‑1 (MQ=60)
GGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACAT > SRR4302542.7480890/1‑94 (MQ=60)
GACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATT > SRR4302542.5328990/1‑94 (MQ=60)
ACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTA < SRR4302542.1620664/94‑1 (MQ=60)
CCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAA > SRR4302542.7522097/1‑94 (MQ=60)
CCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAA > SRR4302542.4600357/1‑94 (MQ=60)
CCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAA > SRR4302542.5958867/1‑94 (MQ=60)
CTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAAC < SRR4302542.7004014/94‑1 (MQ=60)
CTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAAC > SRR4302542.1826476/1‑94 (MQ=60)
CTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAAC > SRR4302542.6340488/1‑94 (MQ=60)
TCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACA < SRR4302542.5421673/94‑1 (MQ=60)
TCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACA > SRR4302542.3391052/1‑94 (MQ=60)
CGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAG < SRR4302542.698863/94‑1 (MQ=60)
CGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAG < SRR4302542.1423721/94‑1 (MQ=60)
GATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGT > SRR4302542.47089/1‑94 (MQ=60)
GATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGT > SRR4302542.1744270/1‑94 (MQ=60)
GATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGT > SRR4302542.5538347/1‑94 (MQ=60)
GATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGT < SRR4302542.3676866/94‑1 (MQ=60)
ATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACGTGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTT > SRR4302542.6276109/1‑94 (MQ=60)
ATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTT < SRR4302542.883663/94‑1 (MQ=60)
TTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTA < SRR4302542.4787498/94‑1 (MQ=60)
TTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTA > SRR4302542.2551849/1‑94 (MQ=60)
TTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTA > SRR4302542.3890626/1‑94 (MQ=60)
TCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTAC < SRR4302542.7246785/94‑1 (MQ=60)
CTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACG < SRR4302542.1291268/94‑1 (MQ=60)
TGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGG < SRR4302542.6497028/94‑1 (MQ=60)
TGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGG < SRR4302542.6149756/94‑1 (MQ=60)
TTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGAC < SRR4302542.128296/94‑1 (MQ=60)
TTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGAC < SRR4302542.1792440/94‑1 (MQ=60)
CGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAA > SRR4302542.2606693/1‑94 (MQ=60)
GAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAA < SRR4302542.2697183/94‑1 (MQ=60)
GAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAA < SRR4302542.1186074/94‑1 (MQ=60)
AGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAA > SRR4302542.3321826/1‑94 (MQ=60)
GGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAA > SRR4302542.4561778/1‑94 (MQ=60)
GGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAA > SRR4302542.7063678/1‑94 (MQ=60)
GTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAAT > SRR4302542.4597378/1‑94 (MQ=60)
TTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATA < SRR4302542.4036531/94‑1 (MQ=60)
TGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATAT > SRR4302542.2045223/1‑94 (MQ=60)
GTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATG > SRR4302542.820139/1‑94 (MQ=60)
GTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATG < SRR4302542.6590857/94‑1 (MQ=60)
GTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATG < SRR4302542.2849705/94‑1 (MQ=60)
GTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATG > SRR4302542.5487228/1‑94 (MQ=60)
TATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGG < SRR4302542.5755672/94‑1 (MQ=60)
TAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCA > SRR4302542.5416840/1‑94 (MQ=60)
TAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCA > SRR4302542.858582/1‑94 (MQ=60)
TAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCA > SRR4302542.4522818/1‑94 (MQ=60)
TAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCA < SRR4302542.4734618/94‑1 (MQ=60)
TAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCA > SRR4302542.4706427/1‑94 (MQ=60)
AACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAA > SRR4302542.6100092/1‑94 (MQ=60)
AACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAA > SRR4302542.1683769/1‑94 (MQ=60)
ACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAG < SRR4302542.1787608/94‑1 (MQ=60)
ACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAG > SRR4302542.51633/1‑94 (MQ=60)
ACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAG < SRR4302542.7510807/94‑1 (MQ=60)
ACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAG > SRR4302542.4950262/1‑94 (MQ=60)
ACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAG < SRR4302542.2119698/94‑1 (MQ=60)
CTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGG < SRR4302542.860530/94‑1 (MQ=60)
TGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGT < SRR4302542.6982182/94‑1 (MQ=60)
TGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGT < SRR4302542.7382090/94‑1 (MQ=60)
TGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGT > SRR4302542.3150278/1‑94 (MQ=60)
TGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGT < SRR4302542.6423467/94‑1 (MQ=60)
GGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTT < SRR4302542.3318911/94‑1 (MQ=60)
GGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTT > SRR4302542.3631297/1‑94 (MQ=60)
GGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTT > SRR4302542.4788691/1‑94 (MQ=60)
GTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTA > SRR4302542.4609721/1‑94 (MQ=60)
GTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTA < SRR4302542.4288196/94‑1 (MQ=60)
GTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTA < SRR4302542.4816410/94‑1 (MQ=60)
GTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTA < SRR4302542.2120943/94‑1 (MQ=60)
TTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTAT > SRR4302542.2816094/1‑94 (MQ=60)
TTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATT > SRR4302542.2463843/1‑94 (MQ=60)
TTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATT < SRR4302542.3065011/94‑1 (MQ=60)
TATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTA < SRR4302542.6512552/94‑1 (MQ=60)
TATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTA < SRR4302542.4325957/94‑1 (MQ=60)
TATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTA > SRR4302542.4612427/1‑94 (MQ=60)
ATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAA < SRR4302542.244131/94‑1 (MQ=60)
TCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAAC < SRR4302542.3539790/94‑1 (MQ=60)
TCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAAC > SRR4302542.3529163/1‑94 (MQ=60)
CTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTAAGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACA > SRR4302542.5514000/1‑94 (MQ=60)
CTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACA > SRR4302542.370097/1‑94 (MQ=60)
CTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACA < SRR4302542.6312039/94‑1 (MQ=60)
CTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACA > SRR4302542.5680857/1‑94 (MQ=60)
CTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACA > SRR4302542.5182/1‑94 (MQ=60)
TAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAA > SRR4302542.4635497/1‑94 (MQ=60)
AATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAAT > SRR4302542.4393404/1‑94 (MQ=60)
AATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAAT > SRR4302542.1525606/1‑94 (MQ=60)
ATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATT > SRR4302542.5106235/1‑94 (MQ=60)
TGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTG > SRR4302542.5470253/1‑94 (MQ=60)
TGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTG > SRR4302542.711397/1‑94 (MQ=60)
TGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTG > SRR4302542.5324651/1‑94 (MQ=60)
TGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTG > SRR4302542.4486669/1‑94 (MQ=60)
GACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGT < SRR4302542.5615060/94‑1 (MQ=60)
GACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGT > SRR4302542.4066190/1‑94 (MQ=60)
ACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTA > SRR4302542.5734966/1‑94 (MQ=60)
ACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTA > SRR4302542.5737643/1‑94 (MQ=60)
ACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTA > SRR4302542.3259777/1‑94 (MQ=60)
CATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTAT > SRR4302542.2693319/1‑94 (MQ=60)
ATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATT > SRR4302542.7009934/1‑94 (MQ=60)
TGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTT > SRR4302542.3261169/1‑94 (MQ=60)
GCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTT < SRR4302542.725492/94‑1 (MQ=60)
CAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTT > SRR4302542.184352/1‑94 (MQ=60)
AAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTT < SRR4302542.5744139/94‑1 (MQ=60)
AAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTC > SRR4302542.3247301/1‑94 (MQ=60)
AAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTC < SRR4302542.5472800/94‑1 (MQ=60)
AAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTC < SRR4302542.5739280/94‑1 (MQ=60)
AATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCT < SRR4302542.1988147/94‑1 (MQ=60)
AATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCT > SRR4302542.3933242/1‑94 (MQ=60)
AATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCT > SRR4302542.1847978/1‑94 (MQ=60)
AATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCT < SRR4302542.4061369/94‑1 (MQ=60)
ATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTC > SRR4302542.6053539/1‑94 (MQ=60)
ATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTC > SRR4302542.6742685/1‑94 (MQ=60)
TTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCT < SRR4302542.4542529/94‑1 (MQ=60)
TTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCT < SRR4302542.7069716/94‑1 (MQ=60)
TTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCT < SRR4302542.3020573/94‑1 (MQ=60)
TTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCT > SRR4302542.5511375/1‑94 (MQ=60)
TTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCT < SRR4302542.4585023/94‑1 (MQ=60)
TTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCT > SRR4302542.5296078/1‑94 (MQ=60)
TAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTA > SRR4302542.3593261/1‑94 (MQ=60)
AAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTAT < SRR4302542.167295/94‑1 (MQ=60)
AATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATT < SRR4302542.507885/94‑1 (MQ=60)
ATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTT < SRR4302542.1544248/94‑1 (MQ=60)
ATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTT > SRR4302542.340224/1‑94 (MQ=60)
TGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTC > SRR4302542.285948/1‑94 (MQ=60)
TGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTC > SRR4302542.6713013/1‑94 (MQ=60)
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GAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCT > SRR4302542.75222/1‑94 (MQ=60)
GAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCT < SRR4302542.7019044/94‑1 (MQ=60)
GAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCT < SRR4302542.1628716/94‑1 (MQ=60)
GAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCT < SRR4302542.1617859/94‑1 (MQ=60)
AGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTG < SRR4302542.7514666/94‑1 (MQ=60)
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TTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCG < SRR4302542.2362793/94‑1 (MQ=60)
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TAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGA > SRR4302542.5800300/1‑94 (MQ=60)
AATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAG < SRR4302542.5240429/94‑1 (MQ=60)
AATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAG < SRR4302542.1517203/94‑1 (MQ=60)
AATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAG > SRR4302542.5583418/1‑94 (MQ=60)
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ATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGT > SRR4302542.2853140/1‑94 (MQ=60)
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TATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTG > SRR4302542.439420/1‑94 (MQ=60)
ATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTGC > SRR4302542.455391/1‑94 (MQ=60)
ATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTGC > SRR4302542.6649688/1‑94 (MQ=60)
ATTCTCGGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTGC > SRR4302542.1134429/1‑94 (MQ=60)
ATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTGC > SRR4302542.7104516/1‑94 (MQ=60)
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TTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTGCA > SRR4302542.6429216/1‑94 (MQ=60)
TTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTGCA < SRR4302542.4218858/94‑1 (MQ=60)
TTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTGCA > SRR4302542.3212015/1‑94 (MQ=60)
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TTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTGCAG < SRR4302542.2603123/94‑1 (MQ=60)
TCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTGCAG < SRR4302542.7016214/94‑1 (MQ=60)
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CTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTGCAGT < SRR4302542.7073766/94‑1 (MQ=60)
|
CGCTTTTGGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTGCAGT > NC_000913/3766754‑3766940
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |