Sample Resequencing Stats

Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate Predicted Mutations Mean Coverage Total Reads Percent Mapped Mapped Reads Average Read Length
A1 F1 I1 R1 1061 294.1 15065038 98.6% 14854127 93.0

Breseq alignment

BRESEQ :: Evidence
Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA NC_000913 3,766,847 T→C intergenic (+582/‑125) yibG → / → b4549 hypothetical protein/hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*NC_0009133,766,8470TC86.8% 717.4 / 95.1 287intergenic (+582/‑125)yibG/b4549hypothetical protein/hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (22/16);  new base C (127/122);  total (149/138)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.88e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.71e-01

Only 100 of 302 total aligned reads displayed.

TTTTGGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTGCAG  >  NC_000913/3766757‑3766939
                                                                                          |                                                                                            
ttttGGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATtctc                                                                                            >  2:5116556/1‑93 (MQ=255)
ttttGGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATtctc                                                                                            >  2:3326384/1‑93 (MQ=255)
 tttGGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCa                                                                                           <  1:5310314/93‑1 (MQ=255)
     gTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGc                                                                                       >  1:756612/1‑93 (MQ=255)
       ccGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAGAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCa                                                                                     <  2:543422/93‑1 (MQ=255)
       ccGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCa                                                                                     <  2:275686/93‑1 (MQ=255)
       ccGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCa                                                                                     >  2:6746421/1‑93 (MQ=255)
        cGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAg                                                                                    >  1:5800913/1‑93 (MQ=255)
         gTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGa                                                                                   >  1:3379944/1‑93 (MQ=255)
          tCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGAt                                                                                  >  1:4524462/1‑93 (MQ=255)
           cTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATGACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATa                                                                                 <  1:2663736/93‑1 (MQ=255)
           cTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATa                                                                                 <  2:5484892/93‑1 (MQ=255)
              tAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGca                                                                              >  1:1020899/1‑93 (MQ=255)
                ggACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGcaca                                                                            >  1:5909653/1‑93 (MQ=255)
                ggACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGcaca                                                                            >  1:2009348/1‑93 (MQ=255)
                ggACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGcaca                                                                            <  1:5575788/93‑1 (MQ=255)
                 gACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACAt                                                                           >  1:7408381/1‑93 (MQ=255)
                    cTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTaa                                                                        >  1:4555785/1‑93 (MQ=255)
                    cTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTaa                                                                        >  1:7449163/1‑93 (MQ=255)
                     tCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAAc                                                                       >  1:6278612/1‑93 (MQ=255)
                     tCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAAc                                                                       <  2:4545183/93‑1 (MQ=255)
                      cGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACa                                                                      <  1:1411521/93‑1 (MQ=255)
                       gATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAg                                                                     <  1:3642878/93‑1 (MQ=255)
                        aTTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGt                                                                    >  1:46701/1‑93 (MQ=255)
                         ttCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACGTGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGtt                                                                   >  1:6214884/1‑93 (MQ=255)
                         ttCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGtt                                                                   >  2:1578772/1‑93 (MQ=255)
                         ttCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGtt                                                                   <  1:4741271/93‑1 (MQ=255)
                          tCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTa                                                                  >  1:2527338/1‑93 (MQ=255)
                           cTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTAc                                                                 <  2:6915907/93‑1 (MQ=255)
                            tGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACg                                                                <  1:6433643/93‑1 (MQ=255)
                              ttCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGa                                                              <  1:127257/93‑1 (MQ=255)
                               tCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGAc                                                             <  2:5848737/93‑1 (MQ=255)
                                    gggTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTaaaa                                                        >  2:4375216/1‑93 (MQ=255)
                                    gggTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTaaaa                                                        >  1:3290762/1‑93 (MQ=255)
                                         gTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAatat                                                   >  2:4160832/1‑93 (MQ=255)
                                          tataACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATg                                                  <  1:5700345/93‑1 (MQ=255)
                                             aaCTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCa                                               >  1:851242/1‑93 (MQ=255)
                                              aCTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCaa                                              <  1:1772245/93‑1 (MQ=255)
                                              aCTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCaa                                              >  1:6041608/1‑93 (MQ=255)
                                              aCTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCaa                                              <  1:2101562/93‑1 (MQ=255)
                                              aCTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCaa                                              <  2:4087266/93‑1 (MQ=255)
                                               cTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAg                                             >  1:4902569/1‑93 (MQ=255)
                                               cTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAg                                             <  2:4439507/93‑1 (MQ=255)
                                               cTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAg                                             >  1:51220/1‑93 (MQ=255)
                                                tGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAgg                                            >  2:2944459/1‑93 (MQ=255)
                                                tGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAgg                                            <  1:6914305/93‑1 (MQ=255)
                                                 ggTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGt                                           >  1:3120594/1‑93 (MQ=255)
                                                 ggTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGt                                           <  2:3941628/93‑1 (MQ=255)
                                                 ggTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCGCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGt                                           <  2:7253829/93‑1 (MQ=255)
                                                    ttATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGttat                                        <  2:6157532/93‑1 (MQ=255)
                                                    ttATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGttat                                        >  1:2789239/1‑93 (MQ=255)
                                                    ttATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGttat                                        >  2:3743807/1‑93 (MQ=255)
                                                     tATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGttatt                                       <  1:4283822/93‑1 (MQ=255)
                                                     tATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGttatt                                       >  1:2440097/1‑93 (MQ=255)
                                                       tCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTaa                                     >  2:1664171/1‑93 (MQ=255)
                                                       tCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTaa                                     >  2:7062382/1‑93 (MQ=255)
                                                       tCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTaa                                     >  2:2379034/1‑93 (MQ=255)
                                                         tAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACa                                   >  2:1875806/1‑93 (MQ=255)
                                                          aaTGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACaa                                  >  1:4590601/1‑93 (MQ=255)
                                                             gACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTg                               >  1:5417649/1‑93 (MQ=255)
                                                              aCATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGt                              >  1:4026469/1‑93 (MQ=255)
                                                               cATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTa                             >  1:5682466/1‑93 (MQ=255)
                                                                 tGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTAtt                           >  2:3539832/1‑93 (MQ=255)
                                                                 tGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTAtt                           >  2:7450738/1‑93 (MQ=255)
                                                                 tGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTAtt                           >  2:5753476/1‑93 (MQ=255)
                                                                 tGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTAtt                           >  1:6941729/1‑93 (MQ=255)
                                                                  gCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTAttt                          <  1:719293/93‑1 (MQ=255)
                                                                  gCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTAttt                          >  1:3230609/1‑93 (MQ=255)
                                                                   cAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTAtttt                         <  2:3222330/93‑1 (MQ=255)
                                                                   cAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTAtttt                         >  2:1353282/1‑93 (MQ=255)
                                                                   cAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTAtttt                         >  2:6460750/1‑93 (MQ=255)
                                                                    aaaaaTTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTAttttt                        >  1:182804/1‑93 (MQ=255)
                                                                     aaaaTTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTAtttttt                       <  2:1527421/93‑1 (MQ=255)
                                                                      aaaTTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTAttttttt                      <  2:1394160/93‑1 (MQ=255)
                                                                      aaaTTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTAttttttt                      >  2:1078108/1‑93 (MQ=255)
                                                                       aaTTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTtc                     <  2:2014261/93‑1 (MQ=255)
                                                                        aTTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTtct                    >  1:3894789/1‑93 (MQ=255)
                                                                         ttAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTtctc                   <  1:4498407/93‑1 (MQ=255)
                                                                         ttAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTtctc                   <  1:7000944/93‑1 (MQ=255)
                                                                          tAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTctct                  >  1:5245096/1‑93 (MQ=255)
                                                                          tAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTctct                  <  2:4484288/93‑1 (MQ=255)
                                                                          tAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTctct                  >  1:5458346/1‑93 (MQ=255)
                                                                           aaaTGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTa                 <  1:165889/93‑1 (MQ=255)
                                                                           aaaTGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTa                 >  1:3560020/1‑93 (MQ=255)
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                                                                                          |                                                                                            
TTTTGGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTGCAG  >  NC_000913/3766757‑3766939

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: 

GATK/CNVnator alignment

BRESEQ :: bam2aln output
CGCTTTTGGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTGCAGT  >  NC_000913/3766754‑3766940
                                                                                             |                                                                                             
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                                 TTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGAC                                                              <  SRR4302542.1792440/94‑1 (MQ=60)
                                    CGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAA                                                           >  SRR4302542.2606693/1‑94 (MQ=60)
                                     GAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAA                                                          <  SRR4302542.2697183/94‑1 (MQ=60)
                                     GAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAA                                                          <  SRR4302542.1186074/94‑1 (MQ=60)
                                      AGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAA                                                         >  SRR4302542.3321826/1‑94 (MQ=60)
                                        GGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAA                                                       >  SRR4302542.4561778/1‑94 (MQ=60)
                                        GGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAA                                                       >  SRR4302542.7063678/1‑94 (MQ=60)
                                         GTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAAT                                                      >  SRR4302542.4597378/1‑94 (MQ=60)
                                          TTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATA                                                     <  SRR4302542.4036531/94‑1 (MQ=60)
                                           TGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATAT                                                    >  SRR4302542.2045223/1‑94 (MQ=60)
                                            GTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATG                                                   >  SRR4302542.820139/1‑94 (MQ=60)
                                            GTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATG                                                   <  SRR4302542.6590857/94‑1 (MQ=60)
                                            GTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATG                                                   <  SRR4302542.2849705/94‑1 (MQ=60)
                                            GTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATG                                                   >  SRR4302542.5487228/1‑94 (MQ=60)
                                             TATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGG                                                  <  SRR4302542.5755672/94‑1 (MQ=60)
                                               TAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCA                                                >  SRR4302542.5416840/1‑94 (MQ=60)
                                               TAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCA                                                >  SRR4302542.858582/1‑94 (MQ=60)
                                               TAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCA                                                >  SRR4302542.4522818/1‑94 (MQ=60)
                                               TAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCA                                                <  SRR4302542.4734618/94‑1 (MQ=60)
                                               TAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCA                                                >  SRR4302542.4706427/1‑94 (MQ=60)
                                                AACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAA                                               >  SRR4302542.6100092/1‑94 (MQ=60)
                                                AACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAA                                               >  SRR4302542.1683769/1‑94 (MQ=60)
                                                 ACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAG                                              <  SRR4302542.1787608/94‑1 (MQ=60)
                                                 ACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAG                                              >  SRR4302542.51633/1‑94 (MQ=60)
                                                 ACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAG                                              <  SRR4302542.7510807/94‑1 (MQ=60)
                                                 ACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAG                                              >  SRR4302542.4950262/1‑94 (MQ=60)
                                                 ACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAG                                              <  SRR4302542.2119698/94‑1 (MQ=60)
                                                  CTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGG                                             <  SRR4302542.860530/94‑1 (MQ=60)
                                                   TGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGT                                            <  SRR4302542.6982182/94‑1 (MQ=60)
                                                   TGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGT                                            <  SRR4302542.7382090/94‑1 (MQ=60)
                                                   TGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGT                                            >  SRR4302542.3150278/1‑94 (MQ=60)
                                                   TGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGT                                            <  SRR4302542.6423467/94‑1 (MQ=60)
                                                    GGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTT                                           <  SRR4302542.3318911/94‑1 (MQ=60)
                                                    GGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTT                                           >  SRR4302542.3631297/1‑94 (MQ=60)
                                                    GGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTT                                           >  SRR4302542.4788691/1‑94 (MQ=60)
                                                     GTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTA                                          >  SRR4302542.4609721/1‑94 (MQ=60)
                                                     GTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTA                                          <  SRR4302542.4288196/94‑1 (MQ=60)
                                                     GTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTA                                          <  SRR4302542.4816410/94‑1 (MQ=60)
                                                     GTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTA                                          <  SRR4302542.2120943/94‑1 (MQ=60)
                                                      TTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTAT                                         >  SRR4302542.2816094/1‑94 (MQ=60)
                                                       TTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATT                                        >  SRR4302542.2463843/1‑94 (MQ=60)
                                                       TTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATT                                        <  SRR4302542.3065011/94‑1 (MQ=60)
                                                        TATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTA                                       <  SRR4302542.6512552/94‑1 (MQ=60)
                                                        TATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTA                                       <  SRR4302542.4325957/94‑1 (MQ=60)
                                                        TATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTA                                       >  SRR4302542.4612427/1‑94 (MQ=60)
                                                         ATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAA                                      <  SRR4302542.244131/94‑1 (MQ=60)
                                                          TCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAAC                                     <  SRR4302542.3539790/94‑1 (MQ=60)
                                                          TCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAAC                                     >  SRR4302542.3529163/1‑94 (MQ=60)
                                                           CTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTAAGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACA                                    >  SRR4302542.5514000/1‑94 (MQ=60)
                                                           CTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACA                                    >  SRR4302542.370097/1‑94 (MQ=60)
                                                           CTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACA                                    <  SRR4302542.6312039/94‑1 (MQ=60)
                                                           CTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACA                                    >  SRR4302542.5680857/1‑94 (MQ=60)
                                                           CTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACA                                    >  SRR4302542.5182/1‑94 (MQ=60)
                                                            TAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAA                                   >  SRR4302542.4635497/1‑94 (MQ=60)
                                                             AATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAAT                                  >  SRR4302542.4393404/1‑94 (MQ=60)
                                                             AATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAAT                                  >  SRR4302542.1525606/1‑94 (MQ=60)
                                                              ATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATT                                 >  SRR4302542.5106235/1‑94 (MQ=60)
                                                               TGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTG                                >  SRR4302542.5470253/1‑94 (MQ=60)
                                                               TGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTG                                >  SRR4302542.711397/1‑94 (MQ=60)
                                                               TGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTG                                >  SRR4302542.5324651/1‑94 (MQ=60)
                                                               TGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTG                                >  SRR4302542.4486669/1‑94 (MQ=60)
                                                                GACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGT                               <  SRR4302542.5615060/94‑1 (MQ=60)
                                                                GACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGT                               >  SRR4302542.4066190/1‑94 (MQ=60)
                                                                 ACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTA                              >  SRR4302542.5734966/1‑94 (MQ=60)
                                                                 ACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTA                              >  SRR4302542.5737643/1‑94 (MQ=60)
                                                                 ACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTA                              >  SRR4302542.3259777/1‑94 (MQ=60)
                                                                  CATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTAT                             >  SRR4302542.2693319/1‑94 (MQ=60)
                                                                   ATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATT                            >  SRR4302542.7009934/1‑94 (MQ=60)
                                                                    TGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTT                           >  SRR4302542.3261169/1‑94 (MQ=60)
                                                                     GCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTT                          <  SRR4302542.725492/94‑1 (MQ=60)
                                                                      CAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTT                         >  SRR4302542.184352/1‑94 (MQ=60)
                                                                       AAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTT                        <  SRR4302542.5744139/94‑1 (MQ=60)
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                                                                         AAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTC                      <  SRR4302542.5472800/94‑1 (MQ=60)
                                                                         AAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTC                      <  SRR4302542.5739280/94‑1 (MQ=60)
                                                                          AATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCT                     <  SRR4302542.1988147/94‑1 (MQ=60)
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                                                                          AATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCT                     >  SRR4302542.1847978/1‑94 (MQ=60)
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                                                                           ATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTC                    >  SRR4302542.6053539/1‑94 (MQ=60)
                                                                           ATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTC                    >  SRR4302542.6742685/1‑94 (MQ=60)
                                                                            TTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCT                   <  SRR4302542.4542529/94‑1 (MQ=60)
                                                                            TTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCT                   <  SRR4302542.7069716/94‑1 (MQ=60)
                                                                            TTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCT                   <  SRR4302542.3020573/94‑1 (MQ=60)
                                                                            TTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCT                   >  SRR4302542.5511375/1‑94 (MQ=60)
                                                                            TTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCT                   <  SRR4302542.4585023/94‑1 (MQ=60)
                                                                            TTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCT                   >  SRR4302542.5296078/1‑94 (MQ=60)
                                                                             TAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTA                  >  SRR4302542.3593261/1‑94 (MQ=60)
                                                                              AAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTAT                 <  SRR4302542.167295/94‑1 (MQ=60)
                                                                               AATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATT                <  SRR4302542.507885/94‑1 (MQ=60)
                                                                                ATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTT               <  SRR4302542.1544248/94‑1 (MQ=60)
                                                                                ATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTT               >  SRR4302542.340224/1‑94 (MQ=60)
                                                                                 TGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTC              >  SRR4302542.285948/1‑94 (MQ=60)
                                                                                 TGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTC              >  SRR4302542.6713013/1‑94 (MQ=60)
                                                                                 TGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTC              >  SRR4302542.1287656/1‑94 (MQ=60)
                                                                                  GAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCT             >  SRR4302542.75222/1‑94 (MQ=60)
                                                                                  GAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCT             <  SRR4302542.7019044/94‑1 (MQ=60)
                                                                                  GAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCT             <  SRR4302542.1628716/94‑1 (MQ=60)
                                                                                  GAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCT             <  SRR4302542.1617859/94‑1 (MQ=60)
                                                                                   AGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTG            <  SRR4302542.7514666/94‑1 (MQ=60)
                                                                                    GTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGC           <  SRR4302542.4448739/94‑1 (MQ=60)
                                                                                     TTGATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCG          <  SRR4302542.1426116/94‑1 (MQ=60)
                                                                                     TTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCG          <  SRR4302542.2362793/94‑1 (MQ=60)
                                                                                      TAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGA         >  SRR4302542.1480723/1‑94 (MQ=60)
                                                                                      TAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGA         >  SRR4302542.5800300/1‑94 (MQ=60)
                                                                                       AATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAG        <  SRR4302542.5240429/94‑1 (MQ=60)
                                                                                       AATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAG        <  SRR4302542.1517203/94‑1 (MQ=60)
                                                                                       AATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAG        >  SRR4302542.5583418/1‑94 (MQ=60)
                                                                                       AATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAG        <  SRR4302542.2038145/94‑1 (MQ=60)
                                                                                        ATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGT       >  SRR4302542.6570709/1‑94 (MQ=60)
                                                                                        ATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGT       >  SRR4302542.6816162/1‑94 (MQ=60)
                                                                                        ATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGT       >  SRR4302542.2853140/1‑94 (MQ=60)
                                                                                        ATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGT       <  SRR4302542.4727834/94‑1 (MQ=60)
                                                                                         TATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTG      >  SRR4302542.439420/1‑94 (MQ=60)
                                                                                          ATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTGC     >  SRR4302542.455391/1‑94 (MQ=60)
                                                                                          ATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTGC     >  SRR4302542.6649688/1‑94 (MQ=60)
                                                                                          ATTCTCGGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTGC     >  SRR4302542.1134429/1‑94 (MQ=60)
                                                                                          ATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTGC     >  SRR4302542.7104516/1‑94 (MQ=60)
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                                                                                            TCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTGCAG   <  SRR4302542.7016214/94‑1 (MQ=60)
                                                                                            TCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTGCAG   <  SRR4302542.179696/94‑1 (MQ=60)
                                                                                             CTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTGCAGT  <  SRR4302542.7073766/94‑1 (MQ=60)
                                                                                             |                                                                                             
CGCTTTTGGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTGCAGT  >  NC_000913/3766754‑3766940

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: