Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
744 |
338.8 |
17650688 |
97.8% |
17262372 |
93.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CAGTACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTG > NC_000913/1741573‑1741758
|
cgaTACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGC < SRR4302541.5054955/91‑1 (MQ=60)
cgaTACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCAC > SRR4302541.800841/4‑94 (MQ=60)
cgaTACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCAC < SRR4302541.6672124/91‑1 (MQ=60)
cgaTACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCAC > SRR4302541.7759721/4‑94 (MQ=60)
gaTACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCG > SRR4302541.5817802/3‑94 (MQ=60)
ACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGAC < SRR4302541.4752376/94‑1 (MQ=60)
CCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACT < SRR4302541.919665/94‑1 (MQ=60)
CCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACT > SRR4302541.2893536/1‑94 (MQ=60)
CCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACT > SRR4302541.4766880/1‑94 (MQ=60)
CCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACT < SRR4302541.7701266/94‑1 (MQ=60)
CCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACT < SRR4302541.3512118/94‑1 (MQ=60)
CCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACT < SRR4302541.3512119/94‑1 (MQ=60)
CGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTG < SRR4302541.8016599/94‑1 (MQ=60)
CGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTG < SRR4302541.3353244/94‑1 (MQ=60)
GTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGC > SRR4302541.7538898/1‑94 (MQ=60)
TGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCT < SRR4302541.700229/94‑1 (MQ=60)
GATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTG < SRR4302541.7722756/94‑1 (MQ=60)
GATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTG > SRR4302541.8171946/1‑94 (MQ=60)
TGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTTGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCT > SRR4302541.7941998/1‑94 (MQ=60)
TGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCT < SRR4302541.2460051/94‑1 (MQ=60)
TGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCT < SRR4302541.4692125/94‑1 (MQ=60)
TGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCT > SRR4302541.1634251/1‑94 (MQ=60)
TGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCT < SRR4302541.714944/94‑1 (MQ=60)
GGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGGGGCGGGCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGGTCCTCTTTTGTCGCGGACTGCTGCTG > SRR4302541.5087486/1‑94 (MQ=60)
GGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTG < SRR4302541.2559411/94‑1 (MQ=60)
CGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGC > SRR4302541.4932120/1‑94 (MQ=60)
GGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCA < SRR4302541.1040339/94‑1 (MQ=60)
GGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCA > SRR4302541.3180233/1‑94 (MQ=60)
CGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTA > SRR4302541.3187391/1‑94 (MQ=60)
GGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAA < SRR4302541.6401004/94‑1 (MQ=60)
GCTATAGTGCCCCCGACATGTCTGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTACC < SRR4302541.6656998/94‑1 (MQ=60)
GCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAAC < SRR4302541.3742529/94‑1 (MQ=60)
CTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACG > SRR4302541.5519921/1‑94 (MQ=60)
CTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACG > SRR4302541.4561211/1‑94 (MQ=60)
CTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACG > SRR4302541.5519920/1‑94 (MQ=60)
CTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACG > SRR4302541.2833162/1‑94 (MQ=60)
CTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGCCATTAACG > SRR4302541.4872759/1‑94 (MQ=60)
CTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCCATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACG < SRR4302541.3909959/94‑1 (MQ=60)
TATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGC < SRR4302541.481007/94‑1 (MQ=60)
TATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGC > SRR4302541.2680811/1‑94 (MQ=60)
TATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGC < SRR4302541.3620351/94‑1 (MQ=60)
TAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCG > SRR4302541.6542701/1‑94 (MQ=60)
TAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCG < SRR4302541.6110478/94‑1 (MQ=60)
AGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGG < SRR4302541.1274840/94‑1 (MQ=60)
GTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGT < SRR4302541.7384359/94‑1 (MQ=60)
CCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTAT > SRR4302541.6615607/1‑94 (MQ=60)
CACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATC > SRR4302541.229050/1‑94 (MQ=60)
CACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATC > SRR4302541.7952139/1‑94 (MQ=60)
CCCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCG < SRR4302541.7738358/94‑1 (MQ=60)
ACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCG > SRR4302541.3054805/1‑94 (MQ=60)
CCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGC > SRR4302541.2891723/1‑94 (MQ=60)
CGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCG > SRR4302541.4730621/1‑94 (MQ=60)
CGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCG < SRR4302541.7958088/94‑1 (MQ=60)
GACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGC > SRR4302541.5724954/1‑94 (MQ=60)
GACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGC > SRR4302541.4649734/1‑94 (MQ=60)
ACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCA < SRR4302541.3875739/94‑1 (MQ=60)
CATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCCA > SRR4302541.8077426/1‑94 (MQ=60)
CATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAA > SRR4302541.5447158/1‑94 (MQ=60)
TGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATT < SRR4302541.3309554/94‑1 (MQ=60)
TGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATT < SRR4302541.3127639/94‑1 (MQ=60)
TGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATT < SRR4302541.5913105/94‑1 (MQ=60)
TGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATT < SRR4302541.4662375/94‑1 (MQ=60)
CGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAA > SRR4302541.489876/1‑94 (MQ=60)
GGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAAT > SRR4302541.2074715/1‑94 (MQ=60)
GCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATG < SRR4302541.7834503/94‑1 (MQ=60)
GCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATG < SRR4302541.1518097/94‑1 (MQ=60)
GCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATG > SRR4302541.961263/1‑94 (MQ=60)
CGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGG > SRR4302541.4961033/1‑94 (MQ=60)
GGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGT < SRR4302541.4670494/94‑1 (MQ=60)
GTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTT < SRR4302541.2673872/94‑1 (MQ=60)
GTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTT < SRR4302541.8539216/94‑1 (MQ=60)
TCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTC < SRR4302541.8015584/94‑1 (MQ=60)
TCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTC > SRR4302541.2956504/1‑94 (MQ=60)
CGCTATCGGTACTTCTATCTGTCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCC < SRR4302541.8129238/94‑1 (MQ=60)
CGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCC < SRR4302541.7369177/94‑1 (MQ=60)
GCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCG > SRR4302541.6283603/1‑94 (MQ=60)
GCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCG < SRR4302541.8554279/94‑1 (MQ=60)
CCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCG < SRR4302541.1696101/94‑1 (MQ=60)
CTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGG > SRR4302541.6620446/1‑94 (MQ=60)
CTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGG < SRR4302541.4496694/94‑1 (MQ=60)
CTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGG < SRR4302541.5306169/94‑1 (MQ=60)
CTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGG > SRR4302541.3270620/1‑94 (MQ=60)
TATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGT > SRR4302541.3509610/1‑94 (MQ=60)
TATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGC > SRR4302541.544058/1‑94 (MQ=60)
ATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTC < SRR4302541.2218874/94‑1 (MQ=60)
TCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCG < SRR4302541.5496523/94‑1 (MQ=60)
TCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCG < SRR4302541.6867736/94‑1 (MQ=60)
TCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCG > SRR4302541.8328760/1‑94 (MQ=60)
TCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCG < SRR4302541.1518732/94‑1 (MQ=60)
CGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGA > SRR4302541.2467081/1‑94 (MQ=60)
GGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGAC > SRR4302541.3284809/1‑94 (MQ=60)
GGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGAC > SRR4302541.3424278/1‑94 (MQ=60)
GGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGAC > SRR4302541.2974922/1‑94 (MQ=60)
GGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGAC < SRR4302541.6746660/94‑1 (MQ=60)
GGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGCTCCGGTCGcg > SRR4302541.3424277/1‑92 (MQ=60)
GTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACG > SRR4302541.8121396/1‑94 (MQ=60)
GTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACG > SRR4302541.481907/1‑94 (MQ=60)
GTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACG < SRR4302541.4792913/94‑1 (MQ=60)
ACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTG > SRR4302541.820048/1‑94 (MQ=60)
CTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGA > SRR4302541.2728142/1‑94 (MQ=60)
TTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAG < SRR4302541.7346254/94‑1 (MQ=60)
TTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAG < SRR4302541.1628918/94‑1 (MQ=60)
TTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAG > SRR4302541.7655858/1‑94 (MQ=60)
TTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAG > SRR4302541.4183093/1‑94 (MQ=60)
TTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAG < SRR4302541.7282306/94‑1 (MQ=60)
TTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAG > SRR4302541.725839/1‑94 (MQ=60)
TTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAG < SRR4302541.3875626/94‑1 (MQ=60)
TTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAG < SRR4302541.741968/94‑1 (MQ=60)
TCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGC < SRR4302541.7781092/94‑1 (MQ=60)
TCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGC < SRR4302541.3535835/94‑1 (MQ=60)
TCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTTAATGGTTCCGGTCGACGTGAGC > SRR4302541.7925812/1‑94 (MQ=60)
CTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCG > SRR4302541.3296105/1‑94 (MQ=60)
TATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGC > SRR4302541.5847534/1‑94 (MQ=60)
TATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGCCGTGAGCGC > SRR4302541.3773594/1‑94 (MQ=60)
ATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCA > SRR4302541.232314/1‑94 (MQ=60)
ATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCA > SRR4302541.1350920/1‑94 (MQ=60)
ATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCA > SRR4302541.3050547/1‑94 (MQ=60)
TCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCAT > SRR4302541.3207150/1‑94 (MQ=60)
CTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATAGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATT > SRR4302541.6145018/1‑94 (MQ=60)
GGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGC < SRR4302541.4125129/94‑1 (MQ=60)
GCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCG < SRR4302541.6770532/94‑1 (MQ=60)
GCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCG > SRR4302541.5964129/1‑94 (MQ=60)
GCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCG < SRR4302541.767703/94‑1 (MQ=60)
GCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCG < SRR4302541.4007165/94‑1 (MQ=60)
TCCGGCGATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCAT > SRR4302541.5520976/1‑94 (MQ=60)
GGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTAGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAG < SRR4302541.3139840/94‑1 (MQ=60)
GCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGG < SRR4302541.3448948/94‑1 (MQ=60)
GATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTG > SRR4302541.7081729/1‑94 (MQ=60)
GATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTG > SRR4302541.2936147/1‑94 (MQ=60)
GATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTG < SRR4302541.5459317/94‑1 (MQ=60)
GATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTG > SRR4302541.2578244/1‑94 (MQ=60)
GATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTG > SRR4302541.2470271/1‑94 (MQ=60)
GATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGGG > SRR4302541.6908261/1‑94 (MQ=60)
ATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGC < SRR4302541.3694516/94‑1 (MQ=60)
ATCCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGC < SRR4302541.5932504/94‑1 (MQ=60)
ATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGC < SRR4302541.7792312/94‑1 (MQ=60)
ATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGC < SRR4302541.7326010/94‑1 (MQ=60)
ATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGC < SRR4302541.464983/94‑1 (MQ=60)
TCCTCGTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCG < SRR4302541.8144305/94‑1 (MQ=60)
TCTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGA < SRR4302541.7009237/94‑1 (MQ=60)
CTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGAC > SRR4302541.2286603/1‑94 (MQ=60)
CTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGAC > SRR4302541.972388/1‑94 (MQ=60)
CTCTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGAC > SRR4302541.115997/1‑94 (MQ=60)
CTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGAC > SRR4302541.2319096/1‑94 (MQ=60)
CTTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAA > SRR4302541.700350/1‑94 (MQ=60)
CTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAA > SRR4302541.332218/1‑94 (MQ=60)
TTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAG < SRR4302541.4912838/94‑1 (MQ=60)
TTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAG < SRR4302541.6467484/94‑1 (MQ=60)
TTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAG < SRR4302541.6277483/94‑1 (MQ=60)
TTTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAG < SRR4302541.2980270/94‑1 (MQ=60)
TTGGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGG > SRR4302541.237099/1‑94 (MQ=60)
GGTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTT < SRR4302541.2191788/94‑1 (MQ=60)
GTCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGGCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTT > SRR4302541.1570707/1‑94 (MQ=60)
TCGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTC < SRR4302541.980066/94‑1 (MQ=60)
CGCGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCT > SRR4302541.845269/1‑94 (MQ=60)
ACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTG < SRR4302541.8579555/94‑1 (MQ=60)
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CAGTACCGTGATGGCGGGCGGCTATAGTGCCACCGACATGGCGGCGGTCGCTATCGGTACTTCTATCTGGCTTCCGGCGATCCTCTTTGGTCACGGACTGCTGCTGGCATTAACGCCGGTTATCGCGCAATTAAATGGTTCCGGTCGACGTGAGCGCATTGCGCATCAGGTGCGACAAGGTTTCTG > NC_000913/1741573‑1741758
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
