Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
884 |
257.2 |
12958910 |
96.9% |
12557183 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
831,133 |
T→C |
S347P (TCG→CCG) |
rhlE → |
putative ATP‑dependent RNA helicase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 831,133 | 0 | T | C | 100.0%
| 858.8
/ NA
| 250 | S347P (TCG→CCG) | rhlE | putative ATP‑dependent RNA helicase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (114/136); total (114/136) |
Only 100 of 261 total aligned reads displayed.
GTCGTCAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGTCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCGGGCTAT > NC_000913/831043‑831222
|
tcgtcAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGc < 2:1166518/93‑1 (MQ=255)
cgtcAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCt < 1:771682/93‑1 (MQ=255)
cgtcAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCt < 2:2203371/93‑1 (MQ=255)
cgtcAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCt > 2:2022947/1‑93 (MQ=255)
gtcAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTg > 1:1262337/1‑93 (MQ=255)
gtcAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTg < 2:6036075/93‑1 (MQ=255)
gtcAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTg < 2:574845/93‑1 (MQ=255)
gtcAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTg < 2:132586/93‑1 (MQ=255)
tcAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTgg > 1:5617482/1‑93 (MQ=255)
aaCTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGgtg < 1:4900669/93‑1 (MQ=255)
aaCTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGgtg < 2:2682454/93‑1 (MQ=255)
aCTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGgtgg > 2:1957811/1‑92 (MQ=255)
cTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGgtgtg < 2:6352044/93‑1 (MQ=255)
cTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGgtgtg < 2:4475771/93‑1 (MQ=255)
tATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGgtgtgt < 2:231549/93‑1 (MQ=255)
tATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGgtgtgt > 2:5889875/1‑93 (MQ=255)
tATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGgtgtgt < 2:4172244/93‑1 (MQ=255)
aTGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGgtgtgtg > 1:5476237/1‑93 (MQ=255)
tGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGgtgtgtgt < 1:2456104/93‑1 (MQ=255)
tGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGgtgtgtgt < 2:1410236/93‑1 (MQ=255)
tGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCATGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGgtgtgtgt < 2:4651546/93‑1 (MQ=255)
gAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGtt < 2:2851031/93‑1 (MQ=255)
gAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGtt < 2:4989574/93‑1 (MQ=255)
aCTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTtga < 2:349328/93‑1 (MQ=255)
cTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTtgat > 1:602290/1‑93 (MQ=255)
cTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTtgat < 1:2166514/93‑1 (MQ=255)
gCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTtgatga < 2:2288031/93‑1 (MQ=255)
cAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAac < 1:3285457/93‑1 (MQ=255)
aCGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAAcaca > 1:1013174/1‑93 (MQ=255)
ctACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACaaa < 1:3653177/92‑1 (MQ=255)
tACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAAc < 2:246642/93‑1 (MQ=255)
tACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGGGTGTTGATGAACACAAAc > 1:346648/1‑93 (MQ=255)
aCCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACCAAct > 1:4152435/1‑93 (MQ=255)
aCCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAAct > 1:5700001/1‑93 (MQ=255)
cTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAActgc > 2:3261306/1‑93 (MQ=255)
cTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAActgc > 1:1645894/1‑93 (MQ=255)
tGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAActgct > 2:4837106/1‑93 (MQ=255)
tGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAActgct > 2:5118801/1‑93 (MQ=255)
tGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAActgct > 2:15875/1‑93 (MQ=255)
tGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAActgct > 2:5350039/1‑93 (MQ=255)
tGAAGATTATGTCCACAGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAActgct > 1:1683616/1‑93 (MQ=255)
aaGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACtgctgc < 2:3847142/93‑1 (MQ=255)
aaGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACtgctgc < 2:1882072/93‑1 (MQ=255)
gATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGt < 1:5373270/93‑1 (MQ=255)
aTTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTg > 1:1058896/1‑93 (MQ=255)
ttATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGa < 1:2287161/93‑1 (MQ=255)
tATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGat < 1:4494981/93‑1 (MQ=255)
aTGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGata < 1:3574055/93‑1 (MQ=255)
tGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGatat > 1:4796034/1‑93 (MQ=255)
gTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATc < 1:648820/93‑1 (MQ=255)
gTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATc > 2:5515353/1‑93 (MQ=255)
gTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATc > 2:5251241/1‑93 (MQ=255)
gTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATc < 1:3334642/93‑1 (MQ=255)
gTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGCCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATc < 2:5931090/93‑1 (MQ=255)
gTCCACCGTATCGAGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGATGCCTCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATc < 1:1364365/93‑1 (MQ=255)
tCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCg > 2:5702105/1‑93 (MQ=255)
ccACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGa > 1:4854778/1‑93 (MQ=255)
aCCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGcaa > 2:2777801/1‑93 (MQ=255)
aCCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGaaa > 1:6385535/1‑93 (MQ=255)
aCCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGaaa > 2:1607555/1‑93 (MQ=255)
ccGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGaaaa > 2:351489/1‑93 (MQ=255)
cGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGaaaaa > 2:1221999/1‑93 (MQ=255)
cGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGaaaaa > 1:4599402/1‑93 (MQ=255)
cGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGaaaaa < 2:44160/93‑1 (MQ=255)
cGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGaaaaa > 1:2308124/1‑93 (MQ=255)
gTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTAGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAAc > 2:3442200/1‑93 (MQ=255)
ggCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGa > 2:2400904/1‑93 (MQ=255)
gCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGaa > 2:3670707/1‑93 (MQ=255)
gCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGaa > 1:6262946/1‑93 (MQ=255)
cGTACCGGTCGTGCGTCTGCTTCCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATTAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGaaa < 1:520955/93‑1 (MQ=255)
cGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGaaa < 2:916150/93‑1 (MQ=255)
cGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGaaa > 1:1498217/1‑93 (MQ=255)
cGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGaaa < 1:528098/93‑1 (MQ=255)
tACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGaaaaa < 1:1282908/93‑1 (MQ=255)
tACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGaaaaa > 1:1480968/1‑93 (MQ=255)
tACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGaaaaa > 2:174202/1‑93 (MQ=255)
cGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAaga < 2:5593528/93‑1 (MQ=255)
cGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAaga > 1:6070239/1‑93 (MQ=255)
cGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAaga < 1:2697005/93‑1 (MQ=255)
cGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAaga < 1:287234/93‑1 (MQ=255)
ggTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAagag > 2:310350/1‑93 (MQ=255)
ggTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAagag > 1:3231707/1‑93 (MQ=255)
ggTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAagag > 2:3862541/1‑93 (MQ=255)
gTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAgaga > 1:2554778/1‑93 (MQ=255)
gTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAgaga < 2:3815330/93‑1 (MQ=255)
tCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGAt > 2:2557764/1‑93 (MQ=255)
cGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATc < 1:284166/93‑1 (MQ=255)
gCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCcg > 2:4272735/1‑93 (MQ=255)
gCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCcg < 1:5143442/93‑1 (MQ=255)
gctgctACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCgcgc > 2:2906891/1‑93 (MQ=255)
tgctACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCAt < 2:5202889/93‑1 (MQ=255)
tgctACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCAt < 1:906010/93‑1 (MQ=255)
tACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGc < 2:3932601/93‑1 (MQ=255)
tACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGc < 2:1262337/93‑1 (MQ=255)
tACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGc < 2:2197121/93‑1 (MQ=255)
aaGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCgg < 2:5275494/93‑1 (MQ=255)
aaGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCgg < 2:4841770/93‑1 (MQ=255)
aGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCggg < 2:776946/93‑1 (MQ=255)
aGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCggg < 1:3976614/93‑1 (MQ=255)
ttGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCGGGCTAt < 1:5917574/93‑1 (MQ=255)
|
GTCGTCAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGTCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCGGGCTAT > NC_000913/831043‑831222
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CACGTCGTCAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGTCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCGGGCTATGAG > NC_000913/831040‑831225
|
CACGTCGTCAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGC > SRR4302534.5225436/1‑94 (MQ=60)
CACGTCGTCAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGC > SRR4302534.5224481/1‑94 (MQ=60)
ACGTCGTCAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCC > SRR4302534.6007384/1‑94 (MQ=60)
ACGTCGTCAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCC < SRR4302534.105837/94‑1 (MQ=60)
GTCGTCAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGC < SRR4302534.5199072/94‑1 (MQ=60)
TCGTCAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCT > SRR4302534.4862619/1‑94 (MQ=60)
TCGTCAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCT < SRR4302534.2298121/94‑1 (MQ=60)
CGTCAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTG > SRR4302534.1295597/1‑94 (MQ=60)
CGTCAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTG < SRR4302534.790892/94‑1 (MQ=60)
GTCAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGG > SRR4302534.5769484/1‑94 (MQ=60)
GTCAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGG < SRR4302534.1964921/94‑1 (MQ=60)
GTCAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGG < SRR4302534.3978364/94‑1 (MQ=60)
AACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGT > SRR4302534.5556853/1‑94 (MQ=60)
AACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGT < SRR4302534.5033532/94‑1 (MQ=60)
TATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTG > SRR4302534.5623904/1‑94 (MQ=60)
TATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCCGGCGGCTGCTACCGGGGAAACGGTGTCGCTGGTGGGTG > SRR4302534.4130859/1‑94 (MQ=60)
TGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTT < SRR4302534.2521358/94‑1 (MQ=60)
GAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTG > SRR4302534.6100543/1‑94 (MQ=60)
ACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGAT > SRR4302534.616966/1‑94 (MQ=60)
CTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATG > SRR4302534.142108/1‑94 (MQ=60)
CTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATG < SRR4302534.2563287/94‑1 (MQ=60)
CTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATA < SRR4302534.2223737/94‑1 (MQ=60)
CAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACA < SRR4302534.1023370/94‑1 (MQ=60)
CAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACA < SRR4302534.3373044/94‑1 (MQ=60)
TAACGTACCAGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACAC > SRR4302534.6460350/1‑94 (MQ=60)
AAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACAC < SRR4302534.1337510/94‑1 (MQ=60)
AACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGGCGCTGGAGTGTGGTGGTGAACACA > SRR4302534.2508452/1‑94 (MQ=60)
AACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACA > SRR4302534.1159331/1‑94 (MQ=60)
AACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACA > SRR4302534.1039246/1‑94 (MQ=60)
ACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGGCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAA > SRR4302534.1012741/1‑94 (MQ=60)
GTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAAC < SRR4302534.3659782/94‑1 (MQ=60)
GTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGGGTGTTGATGAACACAAAC > SRR4302534.355546/1‑94 (MQ=60)
CTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAAC < SRR4302534.3751345/94‑1 (MQ=60)
TACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACCAACT > SRR4302534.4264532/1‑94 (MQ=60)
TACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACT > SRR4302534.4965012/1‑94 (MQ=60)
TACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACT > SRR4302534.5854409/1‑94 (MQ=60)
ACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTG < SRR4302534.2925361/94‑1 (MQ=60)
ACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTG < SRR4302534.5488478/94‑1 (MQ=60)
ACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGCTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAAATG > SRR4302534.5087385/1‑94 (MQ=60)
CCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGC > SRR4302534.1688793/1‑94 (MQ=60)
CTGAAGATTATGTCCACAGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCT > SRR4302534.1727406/1‑94 (MQ=60)
TGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTG < SRR4302534.3894959/94‑1 (MQ=60)
TGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTG > SRR4302534.3267054/1‑94 (MQ=60)
AAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCG > SRR4302534.247508/1‑94 (MQ=60)
AAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCG > SRR4302534.1532037/1‑94 (MQ=60)
AAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCG < SRR4302534.225161/94‑1 (MQ=60)
AAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCG > SRR4302534.5453493/1‑94 (MQ=60)
GATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTG < SRR4302534.5518065/94‑1 (MQ=60)
GATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTG > SRR4302534.1086330/1‑94 (MQ=60)
ATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGA < SRR4302534.3538996/94‑1 (MQ=60)
TTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGAT < SRR4302534.5821690/94‑1 (MQ=60)
TTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGAT < SRR4302534.2347856/94‑1 (MQ=60)
TATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATA > SRR4302534.6544272/1‑94 (MQ=60)
TATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATA < SRR4302534.4616637/94‑1 (MQ=60)
TATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATA > SRR4302534.145283/1‑94 (MQ=60)
ATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATAT > SRR4302534.4926259/1‑94 (MQ=60)
ATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATAT < SRR4302534.3670187/94‑1 (MQ=60)
TGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATC < SRR4302534.1297028/94‑1 (MQ=60)
TGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATC > SRR4302534.562270/1‑94 (MQ=60)
TGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATC < SRR4302534.3464276/94‑1 (MQ=60)
TGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATC < SRR4302534.3709989/94‑1 (MQ=60)
TGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATC < SRR4302534.4987379/94‑1 (MQ=60)
GTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTGCCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCG < SRR4302534.538996/94‑1 (MQ=60)
GTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCG < SRR4302534.664554/94‑1 (MQ=60)
GTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCG < SRR4302534.3423854/94‑1 (MQ=60)
GTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCG < SRR4302534.1703592/94‑1 (MQ=60)
GTCCACCGTATCGAGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGATGCCTCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCG < SRR4302534.1400307/94‑1 (MQ=60)
TCCACCGTATGGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCGGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGA < SRR4302534.684080/94‑1 (MQ=60)
TCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGA < SRR4302534.2754553/94‑1 (MQ=60)
TCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGA > SRR4302534.4986491/1‑94 (MQ=60)
CCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTCAAGCCTTGCCGCTTGCGTGTGTTGATGCACACAAACTCCTGCGTGATACCGAA > SRR4302534.2016479/1‑94 (MQ=60)
CACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAA > SRR4302534.6558033/1‑94 (MQ=60)
ACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAA > SRR4302534.4396757/1‑94 (MQ=60)
CCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAA > SRR4302534.4724233/1‑94 (MQ=60)
CCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAA > SRR4302534.2369389/1‑94 (MQ=60)
CGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTTCTACCGGGGAAGAGGTGCCGCTGGTCTGTGTTGATGAACTCAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGgta > SRR4302534.4164659/1‑91 (MQ=60)
CGGGCGTACCGGGCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACCCAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTG < SRR4302534.1192674/94‑1 (MQ=60)
GGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAA > SRR4302534.6432584/1‑94 (MQ=60)
GCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAA > SRR4302534.1537650/1‑94 (MQ=60)
CGTACCGGTCGTGCGTCTGCTTCCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATTAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAA < SRR4302534.533906/94‑1 (MQ=60)
CGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAA > SRR4302534.6105352/1‑94 (MQ=60)
CGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAA > SRR4302534.1793870/1‑94 (MQ=60)
CGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAA < SRR4302534.541203/94‑1 (MQ=60)
GTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGTAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGGTGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAA > SRR4302534.1205262/1‑94 (MQ=60)
GTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAA > SRR4302534.1519913/1‑94 (MQ=60)
TACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAA < SRR4302534.1316687/94‑1 (MQ=60)
CCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGA > SRR4302534.6235276/1‑94 (MQ=60)
CGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAG < SRR4302534.6356259/94‑1 (MQ=60)
CGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAG > SRR4302534.3317603/1‑94 (MQ=60)
CGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAG < SRR4302534.294659/94‑1 (MQ=60)
CGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAG < SRR4302534.2768259/94‑1 (MQ=60)
CGGTCGTGCGCCCGCTACCGGTGCAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAACCTGATGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAG < SRR4302534.2429266/94‑1 (MQ=60)
GGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGA > SRR4302534.2622498/1‑94 (MQ=60)
CGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCC < SRR4302534.53484/94‑1 (MQ=60)
CGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCC < SRR4302534.291513/94‑1 (MQ=60)
GTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCC < SRR4302534.4807952/94‑1 (MQ=60)
TGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCG < SRR4302534.1551851/94‑1 (MQ=60)
TGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCG < SRR4302534.4950550/94‑1 (MQ=60)
TGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCG < SRR4302534.786406/94‑1 (MQ=60)
TACGGCTGCTACCGGTGATGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCG < SRR4302534.3414840/94‑1 (MQ=60)
GCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGC < SRR4302534.5282240/94‑1 (MQ=60)
GCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGC < SRR4302534.5643219/94‑1 (MQ=60)
GGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGC > SRR4302534.2351132/1‑94 (MQ=60)
CTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCAT > SRR4302534.4690345/1‑94 (MQ=60)
TGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATT < SRR4302534.929027/94‑1 (MQ=60)
TGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATT < SRR4302534.4427377/94‑1 (MQ=60)
GCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTG < SRR4302534.1357315/94‑1 (MQ=60)
GCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTG < SRR4302534.6346986/94‑1 (MQ=60)
CTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGC > SRR4302534.1073993/1‑94 (MQ=60)
TACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCG < SRR4302534.2769855/94‑1 (MQ=60)
TACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCG > SRR4302534.2889000/1‑94 (MQ=60)
TACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCG < SRR4302534.3332788/94‑1 (MQ=60)
ACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGA > SRR4302534.3381801/1‑94 (MQ=60)
GGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTC < SRR4302534.82864/94‑1 (MQ=60)
GGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTC > SRR4302534.421540/1‑94 (MQ=60)
GGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTC < SRR4302534.6204706/94‑1 (MQ=60)
TGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCG < SRR4302534.2764951/94‑1 (MQ=60)
GAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCGG < SRR4302534.3089486/94‑1 (MQ=60)
GAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCACGCGCATTGCGATTCCGG > SRR4302534.54224/1‑94 (MQ=60)
AAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCGGG < SRR4302534.3732012/94‑1 (MQ=60)
AAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCGGG < SRR4302534.661861/94‑1 (MQ=60)
AAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCGGG > SRR4302534.6011734/1‑94 (MQ=60)
AGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCGGGC > SRR4302534.5944209/1‑94 (MQ=60)
AGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCGGGC < SRR4302534.4083028/94‑1 (MQ=60)
AGCGTTGCCGCTGGTGTGTGGTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCGGGC > SRR4302534.1640111/1‑94 (MQ=60)
TTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCGGGCTATG < SRR4302534.6078253/94‑1 (MQ=60)
GCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCGGGCTATGAG > SRR4302534.3865815/1‑94 (MQ=60)
GCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCGGGCTATGAG < SRR4302534.1384128/94‑1 (MQ=60)
GCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCGGGCTATGAG > SRR4302534.468865/1‑94 (MQ=60)
GCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCGGGCTATGAG < SRR4302534.4300157/94‑1 (MQ=60)
|
CACGTCGTCAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGTCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCGGGCTATGAG > NC_000913/831040‑831225
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
