Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
744 |
338.8 |
17650688 |
97.8% |
17262372 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
831,133 |
T→C |
S347P (TCG→CCG) |
rhlE → |
putative ATP‑dependent RNA helicase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 831,133 | 0 | T | C | 99.0%
| 1014.0
/ ‑2.7
| 303 | S347P (TCG→CCG) | rhlE | putative ATP‑dependent RNA helicase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/1); new base C (113/187); total (115/188) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.60e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 |
Only 100 of 331 total aligned reads displayed.
GTCGTCAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGTCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCGGGCTAT > NC_000913/831043‑831222
|
gtcgtcAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCg > 1:3707105/1‑93 (MQ=255)
gtcAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTg < 1:6352504/93‑1 (MQ=255)
gtcAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTg > 2:3985697/1‑93 (MQ=255)
tcAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGGGTTGCCGCTgg > 2:7310560/1‑93 (MQ=255)
tcAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTgg > 2:6622297/1‑93 (MQ=255)
aaCTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGgtg > 1:1016364/1‑93 (MQ=255)
aaCTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGgtg > 1:4046606/1‑93 (MQ=255)
aCTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGgtgt > 2:2255325/1‑93 (MQ=255)
aCTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGgtgg > 2:1881189/1‑92 (MQ=255)
cTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGgtgtg > 2:5526046/1‑93 (MQ=255)
cTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGgtggg > 1:1391513/1‑91 (MQ=255)
cTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGCGAAGCGTTGTCGCTGgtgtg > 2:5824591/1‑93 (MQ=255)
tATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGgtgtgt > 1:4993521/1‑93 (MQ=255)
aTGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGgtgtgtg < 2:826995/93‑1 (MQ=255)
tGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGgtgtgtgt < 1:5164758/93‑1 (MQ=255)
aCTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTtga > 2:7014097/1‑93 (MQ=255)
aCTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTtga < 1:8718369/93‑1 (MQ=255)
cTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTtgat < 1:6074666/93‑1 (MQ=255)
tGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGGGGGTGTtgatg > 1:2546069/1‑93 (MQ=255)
gCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTtgatga > 1:5643075/1‑93 (MQ=255)
ccAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGaa < 1:7940132/93‑1 (MQ=255)
cAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAac < 2:8773759/93‑1 (MQ=255)
aaaCGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAaca < 1:786402/93‑1 (MQ=255)
aaCGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAacac < 1:4208519/93‑1 (MQ=255)
aaCGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAacac < 1:6751729/93‑1 (MQ=255)
aCGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAAcaca > 2:6383511/1‑93 (MQ=255)
gTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACaaa < 1:4288101/93‑1 (MQ=255)
tACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAAc < 1:921209/93‑1 (MQ=255)
tACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAAc < 2:2210167/93‑1 (MQ=255)
tACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAAc < 1:5774242/93‑1 (MQ=255)
tACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGGGTGTTGATGAACACAAAc > 1:1647440/1‑93 (MQ=255)
aCCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAAct < 2:17731/93‑1 (MQ=255)
aCCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAAct < 1:6486984/93‑1 (MQ=255)
ccTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAActg < 1:3947100/93‑1 (MQ=255)
cTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAActgc > 1:223007/1‑93 (MQ=255)
cTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAActgc > 2:3005960/1‑93 (MQ=255)
gAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAActgctg > 2:7498016/1‑93 (MQ=255)
aaGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACtgctgc < 1:7032470/93‑1 (MQ=255)
aGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCg > 2:3948472/1‑93 (MQ=255)
gATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGt < 1:5120753/93‑1 (MQ=255)
ttATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGa > 1:2687237/1‑93 (MQ=255)
tATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGat > 2:1096613/1‑93 (MQ=255)
tATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGat < 1:2890579/93‑1 (MQ=255)
aTGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGata > 1:5908876/1‑93 (MQ=255)
tGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGatat > 1:3762709/1‑93 (MQ=255)
tGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGatat > 2:1212764/1‑93 (MQ=255)
ttcctccGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATc < 2:7335553/92‑1 (MQ=255)
tCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCg < 2:5782828/93‑1 (MQ=255)
tCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCg > 1:2492508/1‑93 (MQ=255)
ccgccGTATCGGGCGTACCGTTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCTCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGa < 2:7633596/90‑1 (MQ=255)
cACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGGTGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGaa > 2:4680571/1‑93 (MQ=255)
cACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGaa > 1:8339519/1‑93 (MQ=255)
cGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGaaaaa < 1:726547/93‑1 (MQ=255)
gTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAAc < 2:3074218/93‑1 (MQ=255)
gTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAAc > 2:1966558/1‑93 (MQ=255)
aTCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGGCGCTGGGGTGTGTTGATGGACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAActg > 2:2699482/1‑93 (MQ=255)
aTCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAActg > 2:3427913/1‑93 (MQ=255)
aTCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAActg < 2:5011480/93‑1 (MQ=255)
tCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAActgc < 1:7631425/93‑1 (MQ=255)
tCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGAGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAActgc < 2:8649251/93‑1 (MQ=255)
cGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAActgct > 1:4888498/1‑93 (MQ=255)
gggCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAActgctg < 2:5141884/93‑1 (MQ=255)
gggCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAActgctg > 2:6738198/1‑93 (MQ=255)
ggCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGa < 1:8210255/93‑1 (MQ=255)
gCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGaa < 2:5955012/93‑1 (MQ=255)
gTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGaaaa < 1:1202437/93‑1 (MQ=255)
gTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGaaaa < 1:2772442/93‑1 (MQ=255)
tACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGaaaaa > 2:1346157/1‑93 (MQ=255)
aCCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGaaaaaa < 1:3316291/93‑1 (MQ=255)
ccGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAag < 1:1513515/93‑1 (MQ=255)
ccGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAag < 1:3082443/93‑1 (MQ=255)
ccGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCCCTGGGGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTACTCaaaaaaa > 2:7251997/1‑92 (MQ=255)
cGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAaga < 2:6230807/93‑1 (MQ=255)
ggTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAagag > 2:7131127/1‑93 (MQ=255)
gTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAgaga < 1:8527276/93‑1 (MQ=255)
cGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATc < 2:6538323/93‑1 (MQ=255)
gcgCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGTCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAATTGCTGCGTGATAACGAAAAACTGCTGAAATTAGAGATcc > 2:7821108/3‑93 (MQ=255)
gTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGAGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAAATcc > 1:4794007/1‑93 (MQ=255)
tGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATccc < 2:3644964/93‑1 (MQ=255)
cGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATCAACCCAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCcgc < 1:4481044/93‑1 (MQ=255)
ggCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCcgcg < 1:1138274/93‑1 (MQ=255)
ggCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCcgcg > 2:2937276/1‑93 (MQ=255)
ggCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCcgcg < 2:1666984/93‑1 (MQ=255)
tgctACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCAt < 2:8443387/93‑1 (MQ=255)
gctACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCAtt < 2:448273/93‑1 (MQ=255)
ctACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTg < 1:4925863/93‑1 (MQ=255)
tACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGc < 1:5357056/93‑1 (MQ=255)
tACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGc > 2:3510721/1‑93 (MQ=255)
tACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGc > 2:6795081/1‑93 (MQ=255)
aCCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCg > 1:3171514/1‑93 (MQ=255)
cGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGAt > 2:5208619/1‑93 (MQ=255)
cGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGAt > 1:7441143/1‑93 (MQ=255)
cGGGGAAGCTGTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGAt < 1:2381635/93‑1 (MQ=255)
ggTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGAtt > 1:6873262/1‑93 (MQ=255)
ggTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGAtt < 2:2660354/93‑1 (MQ=255)
gTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTc < 1:6327862/93‑1 (MQ=255)
gAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCg < 1:1827043/93‑1 (MQ=255)
gAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCg < 1:2090463/93‑1 (MQ=255)
aGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCggg > 2:2542712/1‑93 (MQ=255)
gCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCGGGc > 2:2465896/1‑93 (MQ=255)
|
GTCGTCAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGTCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCGGGCTAT > NC_000913/831043‑831222
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CACGTCGTCAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGTCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCGGGCTATGAG > NC_000913/831040‑831225
|
CACGTCGTCAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGC > SRR4302541.118349/1‑94 (MQ=60)
CCGTCGTCAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCC < SRR4302541.6561094/94‑1 (MQ=60)
ACGTCGTCAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCC < SRR4302541.1976897/94‑1 (MQ=60)
ACGTCGTCAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCC < SRR4302541.2390246/94‑1 (MQ=60)
ACGTCGTCAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCC < SRR4302541.3980641/94‑1 (MQ=60)
CGTCGTCAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCG > SRR4302541.3744531/1‑94 (MQ=60)
TCGTCAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCT > SRR4302541.5818821/1‑94 (MQ=60)
CGTCAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTG > SRR4302541.1986031/1‑94 (MQ=60)
CGTCAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTG < SRR4302541.5820193/94‑1 (MQ=60)
GTCAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGG < SRR4302541.8521/94‑1 (MQ=60)
GTCAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGG < SRR4302541.6417436/94‑1 (MQ=60)
TCAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGT < SRR4302541.3271439/94‑1 (MQ=60)
CAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTG < SRR4302541.3953833/94‑1 (MQ=60)
CAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTG > SRR4302541.4086543/1‑94 (MQ=60)
CAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTG > SRR4302541.1025763/1‑94 (MQ=60)
CAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGCTG > SRR4302541.2900098/1‑94 (MQ=60)
ACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGGG > SRR4302541.1405155/1‑94 (MQ=60)
CTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTCCCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGT > SRR4302541.5346976/1‑94 (MQ=60)
CTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGT > SRR4302541.6413956/1‑94 (MQ=60)
CTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGT > SRR4302541.5044792/1‑94 (MQ=60)
CTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGT < SRR4302541.5209485/94‑1 (MQ=60)
ATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGT > SRR4302541.6647804/1‑94 (MQ=60)
TGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTT < SRR4302541.375846/94‑1 (MQ=60)
TGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTT < SRR4302541.5217902/94‑1 (MQ=60)
TGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTT < SRR4302541.5217897/94‑1 (MQ=60)
GAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTG < SRR4302541.1528268/94‑1 (MQ=60)
GAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTG < SRR4302541.7900975/94‑1 (MQ=60)
GAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTG < SRR4302541.8850872/94‑1 (MQ=60)
GAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTG > SRR4302541.2494495/1‑94 (MQ=60)
AACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGA > SRR4302541.4359890/1‑94 (MQ=60)
AACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGA > SRR4302541.7963066/1‑94 (MQ=60)
ACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGAT < SRR4302541.4950544/94‑1 (MQ=60)
ACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGAT < SRR4302541.4950543/94‑1 (MQ=60)
ACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGAT < SRR4302541.8811611/94‑1 (MQ=60)
CTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATG < SRR4302541.6136678/94‑1 (MQ=60)
CTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATG < SRR4302541.2557352/94‑1 (MQ=60)
CTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGGGGGTGTTGATG > SRR4302541.2571612/1‑94 (MQ=60)
TGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGA > SRR4302541.940649/1‑94 (MQ=60)
TGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGA < SRR4302541.8548167/94‑1 (MQ=60)
TGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGA > SRR4302541.5700752/1‑94 (MQ=60)
CCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAAC < SRR4302541.8027584/94‑1 (MQ=60)
CCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAAC < SRR4302541.4925963/94‑1 (MQ=60)
CCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAAC < SRR4302541.1053681/94‑1 (MQ=60)
CCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCAGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGCAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGGTGATGAAC > SRR4302541.5409778/1‑94 (MQ=60)
CAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACA < SRR4302541.8788932/94‑1 (MQ=60)
AAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACAC < SRR4302541.793700/94‑1 (MQ=60)
AACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACA < SRR4302541.5720529/94‑1 (MQ=60)
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AACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACA < SRR4302541.4250369/94‑1 (MQ=60)
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ACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAA > SRR4302541.308030/1‑94 (MQ=60)
CGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAA < SRR4302541.2448654/94‑1 (MQ=60)
GTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAAC < SRR4302541.4330944/94‑1 (MQ=60)
GTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAAC < SRR4302541.5849465/94‑1 (MQ=60)
GTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAAC > SRR4302541.2565810/1‑94 (MQ=60)
GTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGGGTGTTGATGAACACAAAC > SRR4302541.1663718/1‑94 (MQ=60)
CTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAAC < SRR4302541.2468806/94‑1 (MQ=60)
TACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACT < SRR4302541.5832971/94‑1 (MQ=60)
TACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACT < SRR4302541.929836/94‑1 (MQ=60)
TACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACT < SRR4302541.7210536/94‑1 (MQ=60)
ACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTG > SRR4302541.3295570/1‑94 (MQ=60)
ACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTG < SRR4302541.49783/94‑1 (MQ=60)
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AAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCG < SRR4302541.7509536/94‑1 (MQ=60)
GATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTG < SRR4302541.5173370/94‑1 (MQ=60)
GATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTG < SRR4302541.6165389/94‑1 (MQ=60)
AATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTG < SRR4302541.1859067/94‑1 (MQ=60)
ATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGA > SRR4302541.2713927/1‑94 (MQ=60)
TTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGAT < SRR4302541.6468166/94‑1 (MQ=60)
TATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATA < SRR4302541.2919628/94‑1 (MQ=60)
TATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATA > SRR4302541.5969020/1‑94 (MQ=60)
TATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATA < SRR4302541.4505615/94‑1 (MQ=60)
TATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATA < SRR4302541.3874660/94‑1 (MQ=60)
TATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATA > SRR4302541.2729356/1‑94 (MQ=60)
ATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATAT > SRR4302541.839316/1‑94 (MQ=60)
ATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATAT > SRR4302541.3800504/1‑94 (MQ=60)
ATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATAT < SRR4302541.7606831/94‑1 (MQ=60)
TGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATC > SRR4302541.6821159/1‑94 (MQ=60)
GTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCG > SRR4302541.6140996/1‑94 (MQ=60)
GTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCG > SRR4302541.2517629/1‑94 (MQ=60)
TCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGA < SRR4302541.1157903/94‑1 (MQ=60)
TCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGA < SRR4302541.6565084/94‑1 (MQ=60)
TCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGA > SRR4302541.507772/1‑94 (MQ=60)
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CCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAA > SRR4302541.8430065/1‑94 (MQ=60)
CCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTACGGGTTATCGAA > SRR4302541.6419241/1‑94 (MQ=60)
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CGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAAC > SRR4302541.8014656/1‑94 (MQ=60)
GTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAGACTGCTGCGTGATATCGAAAAACT < SRR4302541.3014045/94‑1 (MQ=60)
ATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGC < SRR4302541.8100513/94‑1 (MQ=60)
ATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGC > SRR4302541.7761147/1‑94 (MQ=60)
TCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCT < SRR4302541.7712846/94‑1 (MQ=60)
TCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCT > SRR4302541.4938378/1‑94 (MQ=60)
CGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTG < SRR4302541.1760440/94‑1 (MQ=60)
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GCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAA > SRR4302541.4255421/1‑94 (MQ=60)
CGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAA > SRR4302541.8410837/1‑94 (MQ=60)
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ACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAG < SRR4302541.3349567/94‑1 (MQ=60)
CCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGA < SRR4302541.3113722/94‑1 (MQ=60)
CCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGA < SRR4302541.1528587/94‑1 (MQ=60)
CGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAG < SRR4302541.8101927/94‑1 (MQ=60)
CGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAG > SRR4302541.1203500/1‑94 (MQ=60)
CGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAG < SRR4302541.311484/94‑1 (MQ=60)
CGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAG < SRR4302541.1060803/94‑1 (MQ=60)
GGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGA < SRR4302541.7103017/94‑1 (MQ=60)
GGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGA < SRR4302541.3786711/94‑1 (MQ=60)
GTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGAT < SRR4302541.8619021/94‑1 (MQ=60)
GTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGAT > SRR4302541.939805/1‑94 (MQ=60)
TCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATC < SRR4302541.6060004/94‑1 (MQ=60)
TCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATC < SRR4302541.285933/94‑1 (MQ=60)
TCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATC > SRR4302541.27178/1‑94 (MQ=60)
CGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGCACACAAACTGCTGTGTGGTATCGAAAAACTGCAGAAAAAAGAGATCC > SRR4302541.6161119/1‑94 (MQ=60)
CGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCC < SRR4302541.7127184/94‑1 (MQ=60)
CGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCC < SRR4302541.510132/94‑1 (MQ=60)
CGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGAGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAAATCC > SRR4302541.4842918/1‑94 (MQ=60)
GTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCC > SRR4302541.1432927/1‑94 (MQ=60)
GTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCC > SRR4302541.2149723/1‑94 (MQ=60)
TGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGGGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCG > SRR4302541.2683627/1‑94 (MQ=60)
TGAGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCG < SRR4302541.4029543/94‑1 (MQ=60)
GCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAGCACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGC > SRR4302541.2066342/1‑94 (MQ=60)
CGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCG < SRR4302541.3731245/94‑1 (MQ=60)
CGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATCAACCCAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCG < SRR4302541.4526200/94‑1 (MQ=60)
GGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGC < SRR4302541.3693884/94‑1 (MQ=60)
GGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGC < SRR4302541.1149080/94‑1 (MQ=60)
CTGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCAT < SRR4302541.1431867/94‑1 (MQ=60)
TGCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATT > SRR4302541.4570317/1‑94 (MQ=60)
GCTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTG > SRR4302541.6214186/1‑94 (MQ=60)
CTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGC < SRR4302541.4976115/94‑1 (MQ=60)
CTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGC > SRR4302541.1342837/1‑94 (MQ=60)
CTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGC < SRR4302541.747509/94‑1 (MQ=60)
CTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGC < SRR4302541.1568708/94‑1 (MQ=60)
CTACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGC < SRR4302541.1706354/94‑1 (MQ=60)
TACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCG < SRR4302541.5412089/94‑1 (MQ=60)
TACCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCG > SRR4302541.3203560/1‑94 (MQ=60)
CCGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGAT > SRR4302541.7520660/1‑94 (MQ=60)
CCGGTGAAGCGTTGCCGCTAGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGAT < SRR4302541.4267140/94‑1 (MQ=60)
CGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATT > SRR4302541.6946669/1‑94 (MQ=60)
CGGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATT < SRR4302541.4184422/94‑1 (MQ=60)
GGTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTC > SRR4302541.6406791/1‑94 (MQ=60)
GTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCC < SRR4302541.6392558/94‑1 (MQ=60)
GTGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCC < SRR4302541.8505314/94‑1 (MQ=60)
TGAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGGAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCG > SRR4302541.4742241/1‑94 (MQ=60)
GAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCGG < SRR4302541.410167/94‑1 (MQ=60)
GAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCGG < SRR4302541.2110716/94‑1 (MQ=60)
GAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCGG < SRR4302541.2239304/94‑1 (MQ=60)
GAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCGG < SRR4302541.3149460/94‑1 (MQ=60)
GAAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCGG < SRR4302541.1844764/94‑1 (MQ=60)
AAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCGGG < SRR4302541.1276899/94‑1 (MQ=60)
AAGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCGGG < SRR4302541.5928142/94‑1 (MQ=60)
AGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCGGGC > SRR4302541.7668375/1‑94 (MQ=60)
AGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCGGGC < SRR4302541.2746950/94‑1 (MQ=60)
AGCGTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCGGGC > SRR4302541.257944/1‑94 (MQ=60)
GTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCGGGCTAT > SRR4302541.5685763/1‑94 (MQ=60)
GTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCGGGCTAT < SRR4302541.684121/94‑1 (MQ=60)
GTTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCGGGCTAT > SRR4302541.4326128/1‑94 (MQ=60)
TTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCGGGTTATG > SRR4302541.2441521/1‑94 (MQ=60)
TTGCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCGGGCTATG < SRR4302541.5195966/94‑1 (MQ=60)
TGCCGCTGGTGTGTGTTGATGACCGCAATCTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCGGGCTATGA < SRR4302541.7888851/94‑1 (MQ=60)
GCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCGGGCTATGAG < SRR4302541.2280948/94‑1 (MQ=60)
GCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCGGGCTATGAG < SRR4302541.6446436/94‑1 (MQ=60)
GCCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCGGGCTATGAG > SRR4302541.6052295/1‑94 (MQ=60)
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CACGTCGTCAACTATGAACTGCCAAACGTACCTGAAGATTATGTCCACCGTATCGGGCGTACCGGTCGTGCGGCTGCTACCGGTGAAGCGTTGTCGCTGGTGTGTGTTGATGAACACAAACTGCTGCGTGATATCGAAAAACTGCTGAAAAAAGAGATCCCGCGCATTGCGATTCCGGGCTATGAG > NC_000913/831040‑831225
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
