Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
884 |
257.2 |
12958910 |
96.9% |
12557183 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,015,850 |
T→C |
Q558R (CAG→CGG) |
b0955 ← |
putative ATP‑dependent protease |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,015,850 | 0 | T | C | 100.0%
| 891.5
/ NA
| 252 | Q558R (CAG→CGG) | b0955 | putative ATP‑dependent protease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (130/122); total (130/122) |
Only 100 of 254 total aligned reads displayed.
GATCAGTTCGGAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCTGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCGTCAGTCACATCGTCTACTGCC > NC_000913/1015760‑1015939
|
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gATCAGTTCGGAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCgg > 2:3207502/1‑93 (MQ=255)
gATCAGTTCGGAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCgg > 1:1949523/1‑93 (MQ=255)
gATCAGTTCGGAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCgg > 2:4383439/1‑93 (MQ=255)
gATCAGTTCGGAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCgg > 2:419232/1‑93 (MQ=255)
aTCAGTTCGGAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGa > 1:6356437/1‑93 (MQ=255)
aTCAGTTCGGAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGa > 1:5521737/1‑93 (MQ=255)
tCAGTTCGGAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGAt > 1:881920/1‑93 (MQ=255)
aGTTCGGAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATgg > 2:4060110/1‑93 (MQ=255)
gTTCGGAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGt > 2:3629976/1‑93 (MQ=255)
gTTCGGAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGt > 1:6094853/1‑93 (MQ=255)
gTTCGGAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGt > 2:1632810/1‑93 (MQ=255)
ttCGGAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGtt > 1:1594466/1‑93 (MQ=255)
ttCGGAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGtt < 1:919729/93‑1 (MQ=255)
tCGGAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGttt > 2:5215241/1‑93 (MQ=255)
tCGGAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGttt > 2:2559767/1‑93 (MQ=255)
gAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCa > 2:274779/1‑93 (MQ=255)
gAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCa > 1:489651/1‑93 (MQ=255)
aTAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATc > 1:5399067/1‑93 (MQ=255)
tAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCa > 2:564148/1‑93 (MQ=255)
tAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCa > 2:291242/1‑93 (MQ=255)
tAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCa > 2:1795211/1‑93 (MQ=255)
aaaCCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAg < 1:308833/93‑1 (MQ=255)
aaaCCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAg > 1:1235079/1‑93 (MQ=255)
aaCCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGc < 2:3153602/93‑1 (MQ=255)
aaCCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTCGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGc < 1:4136609/93‑1 (MQ=255)
ccAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGcgt < 2:1679110/93‑1 (MQ=255)
ccAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGcgt < 1:4602773/93‑1 (MQ=255)
ccAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGcgt < 2:5949480/93‑1 (MQ=255)
gTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGcgtcgt > 2:834449/1‑93 (MQ=255)
ttCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGtt > 1:748408/1‑93 (MQ=255)
tCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGttt < 1:4923914/93‑1 (MQ=255)
tCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGttt < 1:2524744/93‑1 (MQ=255)
aGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTgg < 2:6313280/93‑1 (MQ=255)
ccAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGcc < 1:5259500/93‑1 (MQ=255)
ccAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGcc < 2:1074857/93‑1 (MQ=255)
ccAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGcc < 2:755629/93‑1 (MQ=255)
aaCGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCtt < 2:5324604/93‑1 (MQ=255)
aaCGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCtt < 1:3597186/93‑1 (MQ=255)
aCGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTc < 2:2063002/93‑1 (MQ=255)
cGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCg < 1:5731323/93‑1 (MQ=255)
aaTGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCa > 1:1373624/1‑93 (MQ=255)
aaTGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCa < 2:4528171/93‑1 (MQ=255)
aTGCCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCAt < 2:6348849/93‑1 (MQ=255)
ggCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATcc < 2:1932759/93‑1 (MQ=255)
gCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATccc < 2:6081922/93‑1 (MQ=255)
cATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCcac > 1:4746901/1‑93 (MQ=255)
aTGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCcaca > 1:37173/1‑93 (MQ=255)
aTGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCcaca > 2:176600/1‑93 (MQ=255)
tGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCacac > 2:4728503/1‑93 (MQ=255)
tGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCacac < 1:5863232/93‑1 (MQ=255)
ggAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACAcc < 1:2657946/93‑1 (MQ=255)
ggAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACAcc > 1:5946510/1‑93 (MQ=255)
gAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCa < 1:3128974/93‑1 (MQ=255)
aaaaCGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAg > 1:953006/1‑93 (MQ=255)
aaaCGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGTATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACGCCAGa < 1:2105044/93‑1 (MQ=255)
aaaCGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGa < 1:1470293/93‑1 (MQ=255)
aaaCGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGa < 2:2255493/93‑1 (MQ=255)
agcGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGAt < 1:724387/91‑1 (MQ=255)
aaCGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGAt > 1:4066097/1‑93 (MQ=255)
aaCGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGAt > 1:179417/1‑93 (MQ=255)
ggTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTta > 2:4340231/1‑93 (MQ=255)
ggTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTta > 1:2965751/1‑93 (MQ=255)
gTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTAGCCATCCCACACCAGATTtaa < 1:5309120/93‑1 (MQ=255)
aCGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTtaataa < 2:2391612/93‑1 (MQ=255)
aCGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCAATCCCACACCAGATTtaataa > 1:4383760/1‑93 (MQ=255)
gTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTtaataata > 2:4610558/1‑93 (MQ=255)
tccttcctGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTtaataataa > 2:2813864/1‑93 (MQ=255)
tccttcctGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTtaataataa < 2:3817502/93‑1 (MQ=255)
tccttcctGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTtaataataa > 2:5574533/1‑93 (MQ=255)
tccttcctGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTtaataataa > 2:5715988/1‑93 (MQ=255)
tccttcctGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTCTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTtaataataa < 2:5120903/93‑1 (MQ=255)
ccttcctGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAAc < 2:3482233/93‑1 (MQ=255)
ccttcctGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAAc < 1:2391228/93‑1 (MQ=255)
cttcctGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACg < 2:3078241/93‑1 (MQ=255)
cttcctGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACg > 1:5228525/1‑93 (MQ=255)
ttcctGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACgg > 2:5062731/1‑93 (MQ=255)
ttcctGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACgg < 2:3741000/93‑1 (MQ=255)
tcctGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATTATAACGGc < 1:6299361/93‑1 (MQ=255)
cctGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCa < 2:1201455/93‑1 (MQ=255)
tGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGt > 1:1018416/1‑93 (MQ=255)
gTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTg > 2:4583617/1‑93 (MQ=255)
gTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTg > 1:3522311/1‑93 (MQ=255)
ttGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGc < 1:2884975/93‑1 (MQ=255)
tGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCg < 2:3378460/93‑1 (MQ=255)
gATACTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGAGCgtca > 1:3260213/1‑93 (MQ=255)
gCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCgtcagtc < 2:2618499/93‑1 (MQ=255)
tGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCGTCAGTcaca > 1:1283053/1‑93 (MQ=255)
gcgcGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCGTCAGTCACAt < 2:68508/93‑1 (MQ=255)
cgcgATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCGTCAGTCACATc > 1:1833404/1‑93 (MQ=255)
cgATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCGTCAGTCACATCGt < 2:4660120/93‑1 (MQ=255)
cgATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCGTCAGTCACATCGt < 2:1325397/93‑1 (MQ=255)
gATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCGTCAGTCACATCGTc > 2:1317263/1‑93 (MQ=255)
gATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCGTCAGTCACATCGTc < 1:3808097/93‑1 (MQ=255)
aTACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCGTCAGTCACATCGTCt < 1:564148/93‑1 (MQ=255)
aCGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCGTCAGTCACATCGTCTAc < 2:5424331/93‑1 (MQ=255)
aCGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCGTCAGTCACATCGTCTAc < 2:5397938/93‑1 (MQ=255)
aCGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCGTCAGTCACATCGTCTAc < 1:6172041/93‑1 (MQ=255)
ttCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCGTCAGTCACATCGTCTACTGc < 2:326681/93‑1 (MQ=255)
tCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCGTCAGTCACATCGTCTACTGcc > 1:3906890/1‑93 (MQ=255)
|
GATCAGTTCGGAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCTGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCGTCAGTCACATCGTCTACTGCC > NC_000913/1015760‑1015939
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TCCGATCAGTTCGGAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCTGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCGTCAGTCACATCGTCTACTGCCCAGA > NC_000913/1015757‑1015943
|
TCCGATCAGTTCGGAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCC < SRR4302534.6263088/94‑1 (MQ=60)
TCCGATCAGTTCGGAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCC < SRR4302534.934245/94‑1 (MQ=60)
CCGATCAGTTCGGAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCG > SRR4302534.2261402/1‑94 (MQ=60)
CCGATCAGTTCGGAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCG > SRR4302534.5046943/1‑94 (MQ=60)
CCGATCAGTCCGGAAGAAACCGGTTCAGCCGACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGGGATGCTTGCGCGATACGTTCCCG < SRR4302534.6205746/94‑1 (MQ=60)
CGATCAGTTCGGAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGG > SRR4302534.4547123/1‑94 (MQ=60)
CGATCAGTTCGGAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGG > SRR4302534.2000545/1‑94 (MQ=60)
GATCAGTTCGGAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGA > SRR4302534.5670732/1‑94 (MQ=60)
GATCAGTTCGGAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGA > SRR4302534.6528104/1‑94 (MQ=60)
ATCAGTTCGGAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGAT > SRR4302534.904223/1‑94 (MQ=60)
ATCAGTTCGGAATAAACCAGTGCAGCCGACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGAT < SRR4302534.6100496/94‑1 (MQ=60)
TCAGTTCGGAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATG < SRR4302534.1754323/94‑1 (MQ=60)
CAGTTCGGAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGG > SRR4302534.362114/1‑94 (MQ=60)
AGTTCGGAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGT > SRR4302534.4221330/1‑94 (MQ=60)
AGTTCGGAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGT > SRR4302534.6260596/1‑94 (MQ=60)
AGTTCGGAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGT > SRR4302534.5584319/1‑94 (MQ=60)
AGTTCGGAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGT > SRR4302534.954111/1‑94 (MQ=60)
gttgggataaaaccatttaAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGCCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCCCGAAACGTTCCCGGAGGGTT > SRR4302534.577433/20‑94 (MQ=60)
GTTCGGAATAAACCAGTTCAGCGAACGTAATGGCGATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTT < SRR4302534.2809102/94‑1 (MQ=60)
GTTCGGAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTT > SRR4302534.1636147/1‑94 (MQ=60)
TTCGGAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTT < SRR4302534.943153/94‑1 (MQ=60)
TGGAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGC > SRR4302534.272042/1‑94 (MQ=60)
CGGAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGC > SRR4302534.3254030/1‑94 (MQ=60)
GGAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCA > SRR4302534.501887/1‑94 (MQ=60)
GAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGATGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCAT < SRR4302534.308323/94‑1 (MQ=60)
GAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCAT > SRR4302534.1117760/1‑94 (MQ=60)
AATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATC > SRR4302534.5544416/1‑94 (MQ=60)
TAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAG > SRR4302534.3889808/1‑94 (MQ=60)
TAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAG < SRR4302534.5035838/94‑1 (MQ=60)
TAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAG > SRR4302534.1393213/1‑94 (MQ=60)
TAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAG > SRR4302534.1267631/1‑94 (MQ=60)
TAAACCAGTACAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAG < SRR4302534.4996879/94‑1 (MQ=60)
AAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGC < SRR4302534.316812/94‑1 (MQ=60)
AAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGC > SRR4302534.3033760/1‑94 (MQ=60)
AACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTCGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCG < SRR4302534.4248233/94‑1 (MQ=60)
CCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTC < SRR4302534.4727689/94‑1 (MQ=60)
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CAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCG < SRR4302534.3964626/94‑1 (MQ=60)
CAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCG > SRR4302534.6379071/1‑94 (MQ=60)
CAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCG < SRR4302534.6245448/94‑1 (MQ=60)
GTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTT > SRR4302534.766954/1‑94 (MQ=60)
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CAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGG > SRR4302534.4067482/1‑94 (MQ=60)
CAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGGCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGG < SRR4302534.2874570/94‑1 (MQ=60)
GCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCC > SRR4302534.1481020/1‑94 (MQ=60)
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TAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCA > SRR4302534.1409815/1‑94 (MQ=60)
TAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCA > SRR4302534.5751433/1‑94 (MQ=60)
ATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATC < SRR4302534.2504885/94‑1 (MQ=60)
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GCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCA < SRR4302534.1426388/94‑1 (MQ=60)
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CCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCAC < SRR4302534.5447003/94‑1 (MQ=60)
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GTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTAGCCATCCCACACCAGATTTAAT < SRR4302534.5452370/94‑1 (MQ=60)
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ACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAAT < SRR4302534.1520156/94‑1 (MQ=60)
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CCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACG < SRR4302534.5863495/94‑1 (MQ=60)
CCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACG < SRR4302534.2454778/94‑1 (MQ=60)
CCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACG > SRR4302534.5369681/1‑94 (MQ=60)
CTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGG > SRR4302534.1286890/1‑94 (MQ=60)
TTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGC < SRR4302534.6338194/94‑1 (MQ=60)
TCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATTATAACGGCA < SRR4302534.6469725/94‑1 (MQ=60)
CCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAG < SRR4302534.262480/94‑1 (MQ=60)
CTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGT > SRR4302534.1044637/1‑94 (MQ=60)
CTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGT < SRR4302534.5939850/94‑1 (MQ=60)
CTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGT < SRR4302534.743837/94‑1 (MQ=60)
TGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGGCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTG > SRR4302534.3252424/1‑94 (MQ=60)
TGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTG < SRR4302534.4464550/94‑1 (MQ=60)
TGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTG > SRR4302534.3617050/1‑94 (MQ=60)
GTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGC > SRR4302534.5516924/1‑94 (MQ=60)
TTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCG < SRR4302534.2960696/94‑1 (MQ=60)
TGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCGT > SRR4302534.4985590/1‑94 (MQ=60)
CGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCGTCA < SRR4302534.2405755/94‑1 (MQ=60)
CGATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCGTCA > SRR4302534.3644529/1‑94 (MQ=60)
CGATACTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGAGCGTCA > SRR4302534.3347026/1‑94 (MQ=60)
GATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCGTCAG > SRR4302534.100796/1‑94 (MQ=60)
GATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCGTCAG < SRR4302534.2450186/94‑1 (MQ=60)
ATGCTTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCGTCAGT > SRR4302534.4403560/1‑94 (MQ=60)
TTGCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCGTCAGTCACA > SRR4302534.1316839/1‑94 (MQ=60)
GCGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCGTCAGTCACATC > SRR4302534.1881074/1‑94 (MQ=60)
CGCGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCGTCAGTCACATCG > SRR4302534.5393770/1‑94 (MQ=60)
CGATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCGTCAGTCACATCGTC > SRR4302534.6626896/1‑94 (MQ=60)
GATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCGTCAGTCACATCGTCT < SRR4302534.6501966/94‑1 (MQ=60)
GATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCGTCAGTCACATCGTCT < SRR4302534.3910343/94‑1 (MQ=60)
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ATACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCGTCAGTCACATCGTCTA < SRR4302534.578019/94‑1 (MQ=60)
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TACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCGTCAGTCACATCGTCTAC > SRR4302534.1300940/1‑94 (MQ=60)
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ACGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCGTCAGTCACATCGTCTACT < SRR4302534.6339942/94‑1 (MQ=60)
CGTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCGTCAGTCACATCGTCTACTG > SRR4302534.970984/1‑94 (MQ=60)
GTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCGTCAGTCACATCGTCTACTGC < SRR4302534.861828/94‑1 (MQ=60)
GTTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCGTCAGTCACATCGTCTACTGC > SRR4302534.936720/1‑94 (MQ=60)
TTCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCGTCAGTCACATCGTCTACTGCC > SRR4302534.4011669/1‑94 (MQ=60)
TCCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCGTCAGTCACATCGTCTACTGCCC < SRR4302534.5229224/94‑1 (MQ=60)
CCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCGTCAGTCACATCGTCTACTGCCCA > SRR4302534.5425319/1‑94 (MQ=60)
CCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCGTCAGTCACATCGTCTACTGCCCA < SRR4302534.411098/94‑1 (MQ=60)
CCCGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCGTCAGTCACATCGTCTACTGCCCA < SRR4302534.3634483/94‑1 (MQ=60)
CGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCGTCAGTCACATCGTCTACTGCCCAGA > SRR4302534.3249687/1‑94 (MQ=60)
|
TCCGATCAGTTCGGAATAAACCAGTTCAGCCAACGTAATGGCCATGGAAAACGGTGACGTCCTTCCTGTTGCGATGCTTGCGCGATACGTTCCTGGATGGTTTGCATCAGCGTCGTTTGGCCTTCGCCATCCCACACCAGATTTAATAATAACGGCAGTGCGTCAGTCACATCGTCTACTGCCCAGA > NC_000913/1015757‑1015943
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
