Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
884 |
257.2 |
12958910 |
96.9% |
12557183 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,049,079 |
T→C |
intergenic (‑94/‑25) |
ymcD ← / → b4514 |
hypothetical protein/hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,049,079 | 0 | T | C | 99.3%
| 359.7
/ ‑4.7
| 145 | intergenic (‑94/‑25) | ymcD/b4514 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (67/77); total (67/78) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.33e-01 |
Only 100 of 157 total aligned reads displayed.
ATGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGC > NC_000913/1048989‑1049142
|
aTGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGccc > 2:1066812/1‑93 (MQ=255)
aTGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGccc < 2:1687098/93‑1 (MQ=255)
aTGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGccc < 2:2490140/93‑1 (MQ=255)
tGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGcccc > 2:1208917/1‑93 (MQ=255)
tGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGcccc > 2:5231258/1‑93 (MQ=255)
tGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGcccc > 2:2474539/1‑93 (MQ=255)
ggACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCcct < 1:6009911/93‑1 (MQ=255)
ggACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCcct < 2:2835245/93‑1 (MQ=255)
gACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCcctc < 2:3024616/93‑1 (MQ=255)
gcAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCcctcc < 1:2012322/92‑1 (MQ=255)
aCAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCcctcc < 2:459049/93‑1 (MQ=255)
aCAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCcctcc < 2:3343322/93‑1 (MQ=255)
aCAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCcctcc < 2:3127260/93‑1 (MQ=255)
cAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCcctcct < 2:3929690/93‑1 (MQ=255)
aaTACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTg > 1:2229709/1‑93 (MQ=255)
aaTACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTg > 2:1665726/1‑93 (MQ=255)
aTACGGGTGATGCTGCCAGCTTCCTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGt < 1:6190877/93‑1 (MQ=255)
aTACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGt > 2:5160180/1‑93 (MQ=255)
tACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGtt < 1:1488817/93‑1 (MQ=255)
cGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCa < 1:3834882/93‑1 (MQ=25)
cGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCa < 1:107749/93‑1 (MQ=21)
gggAGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTATTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAg > 1:2515084/1‑93 (MQ=255)
ggTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGc < 1:6213005/93‑1 (MQ=18)
ggTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGc > 1:4714654/1‑93 (MQ=18)
gTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCt > 1:5932353/1‑93 (MQ=18)
gTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCt > 1:2988998/1‑93 (MQ=18)
gATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTAc > 1:365886/1‑93 (MQ=18)
gATGCTGCCAAATTACTGATTTCGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATTAGCTGCGCCTTCTGTTCAGCTAc > 1:365887/1‑93 (MQ=11)
aTGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACt > 1:5844838/1‑93 (MQ=18)
aTGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACt > 1:2554093/1‑93 (MQ=18)
tgctgcCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTg < 1:37988/93‑1 (MQ=18)
tgctgcCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTg < 2:5898250/93‑1 (MQ=18)
gctgcCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGa > 1:1809428/1‑93 (MQ=18)
gctgcCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGa > 1:6255175/1‑93 (MQ=18)
tgcCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACg < 2:5089542/93‑1 (MQ=18)
tgcCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGCTCTCCAGTGGCTTATGTTTCTATCAGCTGCACCTCCTGTTCAGCTCCTGACg > 1:6454924/1‑93 (MQ=11)
gcCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACgg > 1:765624/1‑93 (MQ=18)
gcCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACgg < 2:4097250/93‑1 (MQ=18)
ccAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACggg < 2:4101237/93‑1 (MQ=18)
cANCTTNCTGATTTAGTGTATNNTGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACgggg < 2:2798332/93‑1 (MQ=255)
cAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACgggg < 1:5391466/93‑1 (MQ=18)
aaCTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACcgggg > 1:5931023/1‑92 (MQ=255)
aaCTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGggt > 1:6284273/1‑93 (MQ=18)
aaCTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGggt < 2:5490742/93‑1 (MQ=18)
aaCTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGggt < 2:3344458/93‑1 (MQ=18)
aaCTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGggt < 2:6286981/93‑1 (MQ=18)
aaCTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGggt > 2:363926/1‑93 (MQ=18)
aCTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGggtg > 1:3209757/1‑93 (MQ=18)
aCTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGggtg > 1:1298404/1‑93 (MQ=18)
cTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGggtgg < 1:2220226/93‑1 (MQ=18)
ttACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGggtggt < 1:2300858/93‑1 (MQ=18)
tcaCTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGggtggt < 2:5239760/91‑1 (MQ=16)
tACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGgtggtg < 1:1208339/93‑1 (MQ=18)
tACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCACCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGgtggtg > 1:907722/1‑93 (MQ=16)
tGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGGGCGt > 1:4486129/1‑93 (MQ=255)
gATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTa > 2:917966/1‑93 (MQ=21)
tttAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAAc < 1:2783032/93‑1 (MQ=18)
ttAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACg < 2:5601839/93‑1 (MQ=18)
tAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACgg > 1:613081/1‑93 (MQ=18)
tAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACgg > 2:1328690/1‑93 (MQ=21)
tAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACgg < 2:4632657/93‑1 (MQ=18)
tAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGATGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACgg > 1:1536556/1‑93 (MQ=16)
aGTGTATGATGGTTTTTTTGAGTTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGc < 2:5328335/93‑1 (MQ=255)
gtgtATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCa > 2:4784994/1‑93 (MQ=18)
gtATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCaaa < 1:5820482/93‑1 (MQ=18)
gtATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCaaa > 1:2651817/1‑93 (MQ=18)
tATGATGGTGTTTTTGAGTTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCaaaa < 2:2986424/93‑1 (MQ=16)
tATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCaaaa < 1:3407254/93‑1 (MQ=18)
tgatgGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGc < 1:4136198/93‑1 (MQ=18)
atgGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCAc > 1:2859941/1‑93 (MQ=18)
atgGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCAc > 1:5175189/1‑93 (MQ=18)
atgGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGGAACGGCAAAAGCAc > 2:4410822/1‑93 (MQ=255)
atgGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCGTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCAc < 2:1926332/93‑1 (MQ=16)
tgGTTTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCAcc < 1:4321716/93‑2 (MQ=17)
tgGTTTTTGTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCAcc < 1:4578745/93‑2 (MQ=11)
tgGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCCGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACt > 2:1979564/1‑93 (MQ=16)
tgGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACt > 1:4955162/1‑93 (MQ=18)
tgGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACt > 1:1499644/1‑93 (MQ=18)
tgGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACt < 2:798518/93‑1 (MQ=18)
ggTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATTAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGctgtg > 1:5532822/1‑89 (MQ=11)
gtgtTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGc > 1:2723521/1‑93 (MQ=18)
gtgtTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGc < 1:109714/93‑1 (MQ=18)
gtgtTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGc < 2:3666209/93‑1 (MQ=18)
gtgtTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGc > 2:4462572/1‑93 (MQ=18)
tgtTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGcc < 1:779911/93‑1 (MQ=18)
tgtTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGcc < 2:6139153/93‑1 (MQ=18)
tgtTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGcc < 1:4622045/93‑1 (MQ=18)
tttttGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCgg < 2:6287964/93‑1 (MQ=18)
ttttGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGa < 2:2283522/93‑1 (MQ=18)
tGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACAt > 1:5640177/1‑93 (MQ=21)
gAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACTGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATc > 1:3006029/1‑93 (MQ=16)
gAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTCACGGCAAAAGCACTGCCGGAAATc > 2:686904/1‑93 (MQ=255)
gAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATc > 1:4530596/1‑93 (MQ=18)
gAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATc < 1:5511987/93‑1 (MQ=18)
gAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATc < 1:4288264/93‑1 (MQ=18)
gAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATc < 1:3437491/93‑1 (MQ=18)
aGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCa > 1:1485851/1‑93 (MQ=18)
ggTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAg < 1:2054317/93‑1 (MQ=18)
ggTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAg < 2:100245/93‑1 (MQ=18)
tctcCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAgcgc < 1:5338901/93‑1 (MQ=14)
|
ATGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGC > NC_000913/1048989‑1049142
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGCATGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGG > NC_000913/1048986‑1049172
|
CGCATGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGC > SRR4302534.4897245/1‑94 (MQ=49)
CGCATGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGC > SRR4302534.493859/1‑94 (MQ=49)
TGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCT < SRR4302534.6344262/94‑1 (MQ=38)
GGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTC < SRR4302534.6173203/94‑1 (MQ=35)
GGACAATACGGGTGACGCTCCCATCTTACTGATTTAGTGTAGGATGGTGTTTTGGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTC < SRR4302534.2340823/94‑1 (MQ=28)
GCAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCT < SRR4302534.2064968/94‑1 (MQ=27)
ACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTGCT > SRR4302534.4536321/1‑94 (MQ=29)
CAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTG > SRR4302534.2288769/1‑94 (MQ=28)
ATACGGGTGATGCTGCCAGCTTCCTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTT < SRR4302534.6359340/94‑1 (MQ=21)
TACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTC < SRR4302534.1527972/94‑1 (MQ=20)
CGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAG < SRR4302534.110629/94‑1 (MQ=7)
CGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAG < SRR4302534.3937864/94‑1 (MQ=7)
CGGGAGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTATTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAG > SRR4302534.2581866/1‑94 (MQ=4)
GGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGC > SRR4302534.4842684/1‑94 (MQ=10)
GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCT < SRR4302534.6381835/94‑1 (MQ=5)
GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCT > SRR4302534.3067149/1‑94 (MQ=5)
GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCT > SRR4302534.6093449/1‑94 (MQ=5)
TGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTAC > SRR4302534.375223/1‑94 (MQ=5)
TGATGCTGCCAAATTACTGATTTCGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATTAGCTGCGCCTTCTGTTCAGCTAC > SRR4302534.375224/1‑94 (MQ=60)
GATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACT > SRR4302534.2621793/1‑94 (MQ=5)
GATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACT > SRR4302534.6003518/1‑94 (MQ=5)
TGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA > SRR4302534.4917925/1‑94 (MQ=5)
TGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA > SRR4302534.1856415/1‑94 (MQ=5)
TGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA < SRR4302534.39002/94‑1 (MQ=5)
TGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA > SRR4302534.6424713/1‑94 (MQ=5)
GCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑C > SRR4302534.3291961/1‑94 (MQ=5)
CTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGCTCTCCAGTGGCTTATGTTTCTATCAGCTGCACCTCCTGTTCAGCTCCTGA‑CG > SRR4302534.6628849/1‑94 (MQ=3)
TGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGG > SRR4302534.784644/1‑94 (MQ=5)
TGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTAATGA‑CGG > SRR4302534.862308/1‑94 (MQ=4)
GCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGG > SRR4302534.695037/1‑94 (MQ=5)
CCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGG > SRR4302534.2799207/1‑94 (MQ=5)
CAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACCGGGG > SRR4302534.6092089/1‑94 (MQ=4)
CAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGT < SRR4302534.2651744/94‑1 (MQ=5)
CAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGT < SRR4302534.5536650/94‑1 (MQ=5)
CAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGT > SRR4302534.6454307/1‑94 (MQ=5)
AACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTTA‑CGGGGTG > SRR4302534.1220475/1‑94 (MQ=4)
AACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTG > SRR4302534.1332629/1‑94 (MQ=5)
AACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTG > SRR4302534.3294929/1‑94 (MQ=5)
AACTTACTGATTGAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTG < SRR4302534.5477237/94‑1 (MQ=4)
CTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGT < SRR4302534.2279037/94‑1 (MQ=5)
TTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTG > SRR4302534.5552785/1‑94 (MQ=5)
TTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTG < SRR4302534.2361928/94‑1 (MQ=5)
TTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCACCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTG > SRR4302534.930786/1‑94 (MQ=4)
TACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGC < SRR4302534.1240135/94‑1 (MQ=5)
CTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGGGCGT > SRR4302534.4607513/1‑94 (MQ=4)
TGTTTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCGGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTA < SRR4302534.5705385/94‑1 (MQ=4)
TTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACG < SRR4302534.2856230/94‑1 (MQ=5)
TTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGG > SRR4302534.627977/1‑94 (MQ=5)
TTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGATGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGG > SRR4302534.1576852/1‑94 (MQ=4)
AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCA < SRR4302534.5931600/94‑1 (MQ=5)
AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCA > SRR4302534.6373055/1‑94 (MQ=5)
TGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAA > SRR4302534.2721949/1‑94 (MQ=5)
GTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAA < SRR4302534.5978468/94‑1 (MQ=5)
TATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAG < SRR4302534.3498757/94‑1 (MQ=5)
TATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAG < SRR4302534.6168095/94‑1 (MQ=5)
ATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGC < SRR4302534.5735700/94‑1 (MQ=5)
TGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCA < SRR4302534.4247809/94‑1 (MQ=5)
GATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCAC > SRR4302534.482004/1‑94 (MQ=5)
GATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCAC > SRR4302534.2935064/1‑94 (MQ=5)
GATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCAC > SRR4302534.5314648/1‑94 (MQ=5)
ATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACT > SRR4302534.1539108/1‑94 (MQ=5)
ATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACT > SRR4302534.5089356/1‑94 (MQ=5)
TGGTTTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCG < SRR4302534.4438679/94‑1 (MQ=0)
TGGTTTTTGTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCG < SRR4302534.4702933/94‑1 (MQ=0)
TGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATTAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCtgtg > SRR4302534.5682153/1‑90 (MQ=4)
TGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTG > SRR4302534.3716409/1‑94 (MQ=5)
GGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGC < SRR4302534.2590898/94‑1 (MQ=8)
GGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGC > SRR4302534.2795380/1‑94 (MQ=8)
GTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCC > SRR4302534.2203951/1‑94 (MQ=8)
GTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCC < SRR4302534.4387319/94‑1 (MQ=8)
GTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCC < SRR4302534.112641/94‑1 (MQ=8)
GTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCC < SRR4302534.1906340/94‑1 (MQ=8)
TGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCG < SRR4302534.3054929/94‑1 (MQ=8)
TGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCG < SRR4302534.4747462/94‑1 (MQ=8)
TGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCG < SRR4302534.3879159/94‑1 (MQ=8)
TGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCG < SRR4302534.799355/94‑1 (MQ=8)
GTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGG > SRR4302534.1528980/1‑94 (MQ=8)
TTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGAC < SRR4302534.6089839/94‑1 (MQ=8)
TTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACAT > SRR4302534.5792834/1‑94 (MQ=8)
TGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CTGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATC > SRR4302534.3084669/1‑94 (MQ=7)
TGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATC > SRR4302534.4653362/1‑94 (MQ=8)
GAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCA < SRR4302534.6453518/94‑1 (MQ=8)
GAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCA < SRR4302534.5660682/94‑1 (MQ=8)
GAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCA < SRR4302534.3529870/94‑1 (MQ=8)
GAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCA > SRR4302534.1524941/1‑94 (MQ=8)
GAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCA < SRR4302534.4404442/94‑1 (MQ=8)
AGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAG > SRR4302534.4675531/1‑94 (MQ=8)
AGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAG > SRR4302534.1016578/1‑94 (MQ=8)
GGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGC < SRR4302534.2107998/94‑1 (MQ=5)
GGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGC > SRR4302534.1584060/1‑94 (MQ=5)
GGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGC > SRR4302534.1470927/1‑94 (MQ=5)
TTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGC > SRR4302534.335983/1‑94 (MQ=0)
TCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCT < SRR4302534.4166408/94‑1 (MQ=0)
TCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCT < SRR4302534.5482847/94‑1 (MQ=0)
TCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTAT > SRR4302534.2266212/1‑94 (MQ=0)
TCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTAT > SRR4302534.2178914/1‑94 (MQ=0)
CCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATC < SRR4302534.6129479/94‑1 (MQ=0)
CCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATC < SRR4302534.5539956/94‑1 (MQ=0)
CAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATCT > SRR4302534.4011849/1‑94 (MQ=0)
AGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATCTC > SRR4302534.4078364/1‑94 (MQ=0)
AGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATCTC > SRR4302534.4338694/1‑94 (MQ=0)
AGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATCTC > SRR4302534.1650817/1‑94 (MQ=0)
GTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATCTCT < SRR4302534.226083/94‑1 (MQ=0)
GTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATCTCT < SRR4302534.2146350/94‑1 (MQ=0)
GTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATCTCT < SRR4302534.1208519/94‑1 (MQ=0)
TGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATCTCTG < SRR4302534.4220219/94‑1 (MQ=0)
TGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATCTCTG < SRR4302534.2909203/94‑1 (MQ=0)
GGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGC < SRR4302534.4533492/94‑1 (MQ=0)
GCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCT < SRR4302534.4358822/94‑1 (MQ=0)
CTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTC > SRR4302534.4824525/1‑94 (MQ=0)
TTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCT < SRR4302534.834034/94‑1 (MQ=0)
TCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTC < SRR4302534.1742735/94‑1 (MQ=0)
CTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCA < SRR4302534.4444074/94‑1 (MQ=0)
GTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACT < SRR4302534.2487882/94‑1 (MQ=0)
TTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTG < SRR4302534.1362738/94‑1 (MQ=0)
TTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTG < SRR4302534.3457746/94‑1 (MQ=0)
TTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTA < SRR4302534.6635331/94‑1 (MQ=0)
TTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGC < SRR4302534.3053881/94‑1 (MQ=0)
TCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCC < SRR4302534.6399652/94‑1 (MQ=0)
CTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCG > SRR4302534.3084512/1‑94 (MQ=0)
CTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCG < SRR4302534.2432442/94‑1 (MQ=0)
CTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCG < SRR4302534.5252928/94‑1 (MQ=0)
TATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGT > SRR4302534.6201177/1‑94 (MQ=0)
ATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATCTCTTCTCTCACTGCCGTA > SRR4302534.3511630/1‑94 (MQ=0)
AGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAGCGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTTTCTGCCGTAAAA > SRR4302534.5710557/1‑94 (MQ=0)
GCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAAC > SRR4302534.4805933/1‑94 (MQ=0)
CTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACA > SRR4302534.4941427/1‑94 (MQ=0)
CTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACA < SRR4302534.4502381/94‑1 (MQ=0)
GCCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATG > SRR4302534.94294/1‑94 (MQ=0)
GCCCCTCATGTCCAGCTGCTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATG < SRR4302534.5971363/94‑1 (MQ=0)
TCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGG > SRR4302534.3478339/1‑94 (MQ=0)
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CGCATGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGA‑CGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGG > NC_000913/1048986‑1049172
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
