Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
884 |
257.2 |
12958910 |
96.9% |
12557183 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,202,176 |
T→C |
V78A (GTA→GCA) |
b1146 → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,202,176 | 0 | T | C | 100.0%
| 744.7
/ NA
| 212 | V78A (GTA→GCA) | b1146 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (98/114); total (98/114) |
Only 100 of 216 total aligned reads displayed.
GAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACT > NC_000913/1202086‑1202265
|
gaagaaTTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACACTTGCAc > 2:1881033/1‑93 (MQ=255)
agaaTTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGAGCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAATGAAATTAAAACCCTTGCACCg > 2:5839446/1‑93 (MQ=255)
agaaTTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCg < 1:2554999/93‑1 (MQ=255)
gaaTTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGt > 1:2352923/1‑93 (MQ=255)
aaTTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGtt < 2:4336884/93‑1 (MQ=255)
tCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAg < 2:2857110/93‑1 (MQ=255)
tCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAg > 1:3204457/1‑93 (MQ=255)
ccGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGt < 1:4758040/93‑1 (MQ=255)
ccGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGt < 1:238061/93‑1 (MQ=255)
cGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTa > 1:5309474/1‑93 (MQ=255)
ccAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACa < 2:1644206/93‑1 (MQ=255)
cAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACaa > 2:1192658/1‑93 (MQ=255)
cAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACaa > 1:5072881/1‑93 (MQ=255)
aaCACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAg > 1:3557680/1‑93 (MQ=255)
cacCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTa > 2:212303/1‑93 (MQ=255)
cacCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTa < 1:4459494/93‑1 (MQ=255)
ccATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATc > 2:1833319/1‑93 (MQ=255)
cATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCt < 2:6432511/93‑1 (MQ=255)
cATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCt < 1:6211618/93‑1 (MQ=255)
cATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCt < 2:5447085/93‑1 (MQ=255)
tctctcAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTg > 2:6010127/1‑93 (MQ=255)
ctctcAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGa > 1:4114420/1‑93 (MQ=255)
tctcAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGaa > 2:1565977/1‑93 (MQ=255)
tcAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAGGGTACAAGTATCTTGAAgg < 1:6316730/93‑1 (MQ=255)
tcAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAgg < 2:3404962/93‑1 (MQ=255)
cAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGt < 2:6056332/93‑1 (MQ=255)
gTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTc < 1:1362851/93‑1 (MQ=255)
gTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTc < 1:335097/93‑1 (MQ=255)
ttttCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCa > 2:3820602/1‑93 (MQ=255)
ggCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCaa < 2:5155980/93‑1 (MQ=255)
ggCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCaa > 2:4582104/1‑93 (MQ=255)
ggCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCaa < 2:2325318/93‑1 (MQ=255)
ggCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCaa < 2:5374155/93‑1 (MQ=255)
ggCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCaa > 2:4757143/1‑93 (MQ=255)
gCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAAt < 1:308413/93‑1 (MQ=255)
cGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATc < 1:2061555/93‑1 (MQ=255)
ttAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCAt > 2:5628697/1‑93 (MQ=255)
ttAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCAt > 2:4078968/1‑93 (MQ=255)
aGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGt < 1:123936/93‑1 (MQ=255)
gACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTa < 2:2721939/93‑1 (MQ=255)
gACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTa > 1:974629/1‑93 (MQ=255)
aCCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTaa < 1:3453454/93‑1 (MQ=255)
cgccgGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAata < 2:5413756/93‑1 (MQ=255)
cgGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGt < 1:5012353/93‑1 (MQ=255)
ggATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTa > 1:5178907/1‑93 (MQ=255)
ggATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTa < 1:5826031/93‑1 (MQ=255)
ggATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTa < 2:4953147/93‑1 (MQ=255)
gATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTac < 1:1738095/93‑1 (MQ=255)
aTGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTaca < 2:2352346/93‑1 (MQ=255)
aTGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTaca < 1:4522299/93‑1 (MQ=255)
tGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTacac < 2:6162829/93‑1 (MQ=255)
gTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACAcc > 1:2819363/1‑93 (MQ=255)
taTGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCgg < 2:173740/92‑1 (MQ=255)
cATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCgg < 1:5294435/93‑1 (MQ=255)
tGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAg < 1:305673/93‑1 (MQ=255)
tGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAg < 1:856377/93‑1 (MQ=255)
tGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAg < 1:1398578/93‑1 (MQ=255)
gATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGt > 1:2205281/1‑93 (MQ=255)
gATTGTTTGCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGt > 1:6280174/1‑93 (MQ=255)
aTTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTa < 2:1413460/93‑1 (MQ=255)
ttGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTAc > 1:4566750/1‑93 (MQ=255)
tGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACa < 1:5837017/93‑1 (MQ=255)
tGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACa < 1:684426/93‑1 (MQ=255)
ttttCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACata > 1:5927598/1‑93 (MQ=255)
ttttCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACata > 2:4029705/1‑93 (MQ=255)
ttttCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACata < 1:5263900/93‑1 (MQ=255)
tttCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACatat < 1:4204077/93‑1 (MQ=255)
tttCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACatat < 2:3562875/93‑1 (MQ=255)
ttCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATAtt < 2:5279681/93‑1 (MQ=255)
tCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTg > 1:3854452/1‑93 (MQ=255)
cATAACGAAATTAAATCCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGt < 1:5521806/93‑1 (MQ=255)
cATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGt < 2:193699/93‑1 (MQ=255)
cATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGt < 1:5170854/93‑1 (MQ=255)
aTAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTa > 1:1005177/1‑93 (MQ=255)
aTAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTa > 2:3478498/1‑93 (MQ=255)
tAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTAt < 1:4903794/93‑1 (MQ=255)
tAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTAt < 1:1074694/93‑1 (MQ=255)
tAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGGACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTAt > 2:312524/1‑93 (MQ=255)
aaCGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATg < 2:3283970/93‑1 (MQ=255)
aaCGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATg > 2:6235702/1‑93 (MQ=255)
aCGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGa > 1:1060279/1‑93 (MQ=255)
gAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGaaa < 2:4259440/93‑1 (MQ=255)
gAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGaaa < 1:3763894/93‑1 (MQ=255)
gAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGaaa < 1:5113439/93‑1 (MQ=255)
aaTTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGc < 1:4805651/93‑1 (MQ=255)
aTTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCg < 2:8457/93‑1 (MQ=255)
ttAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGt > 2:5143693/1‑93 (MQ=255)
tAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTa > 2:703064/1‑93 (MQ=255)
aaaaCCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTAt > 2:2469561/1‑93 (MQ=255)
aaaaCCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTAt < 2:3249231/93‑1 (MQ=255)
aaaCCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTAtt < 1:5450414/93‑1 (MQ=255)
aaaCCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTAtt < 1:1158103/93‑1 (MQ=255)
aaCCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTg < 1:359585/93‑1 (MQ=255)
cccTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTggg > 2:3749142/1‑93 (MQ=255)
ccTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTgggc > 1:2746905/1‑92 (MQ=255)
ccTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGa > 2:1245615/1‑93 (MQ=255)
ccTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGa > 1:6126391/1‑93 (MQ=255)
ccTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGa < 1:5466101/93‑1 (MQ=255)
cTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGAc > 1:2644692/1‑93 (MQ=255)
ttGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGAct > 2:4516984/1‑93 (MQ=255)
|
GAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACT > NC_000913/1202086‑1202265
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTT > NC_000913/1202084‑1202269
|
AGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCA < SRR4302534.3804099/94‑1 (MQ=60)
AGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCA < SRR4302534.2080300/94‑1 (MQ=60)
AGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCA < SRR4302534.6113802/94‑1 (MQ=60)
GGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCAC > SRR4302534.5179216/1‑94 (MQ=60)
GAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACC < SRR4302534.5311126/94‑1 (MQ=60)
AGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGT < SRR4302534.2622728/94‑1 (MQ=60)
AGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGT > SRR4302534.2415367/1‑94 (MQ=60)
GAATCCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTT < SRR4302534.6629189/94‑1 (MQ=60)
TTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAG > SRR4302534.3289429/1‑94 (MQ=60)
CCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTA < SRR4302534.244288/94‑1 (MQ=60)
CCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTA > SRR4302534.5452732/1‑94 (MQ=60)
CCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTA < SRR4302534.4887243/94‑1 (MQ=60)
CCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTA > SRR4302534.4583979/1‑94 (MQ=60)
CCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAA < SRR4302534.2358235/94‑1 (MQ=60)
CCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAA < SRR4302534.3562670/94‑1 (MQ=60)
CCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAA > SRR4302534.5209832/1‑94 (MQ=60)
CCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAA > SRR4302534.3686282/1‑94 (MQ=60)
CAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAG > SRR4302534.3653402/1‑94 (MQ=60)
CACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTAT < SRR4302534.3013629/94‑1 (MQ=60)
CACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTAT < SRR4302534.4580065/94‑1 (MQ=60)
CACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTAT < SRR4302534.2651761/94‑1 (MQ=60)
ACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATC > SRR4302534.1243621/1‑94 (MQ=60)
ACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGGTAGACCGCAGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACACTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATC > SRR4302534.1058531/1‑94 (MQ=60)
CCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCT < SRR4302534.1301642/94‑1 (MQ=60)
CATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTT < SRR4302534.147760/94‑1 (MQ=60)
CATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTT > SRR4302534.1096196/1‑94 (MQ=60)
CATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTT > SRR4302534.4678912/1‑94 (MQ=60)
CATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTT < SRR4302534.6380425/94‑1 (MQ=60)
CTCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACTAGTATCTTG < SRR4302534.6459436/94‑1 (MQ=60)
ATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTG < SRR4302534.2418801/94‑1 (MQ=60)
TCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGA > SRR4302534.4225112/1‑94 (MQ=60)
TCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAG < SRR4302534.4331193/94‑1 (MQ=60)
CTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGG > SRR4302534.2647239/1‑94 (MQ=60)
CTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGG < SRR4302534.5691582/94‑1 (MQ=60)
TCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAGGGTACAAGTATCTTGAAGGT < SRR4302534.6487455/94‑1 (MQ=60)
TCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGT < SRR4302534.6208197/94‑1 (MQ=60)
GTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCA < SRR4302534.1398762/94‑1 (MQ=60)
GTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCA < SRR4302534.343684/94‑1 (MQ=60)
TTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCAT < SRR4302534.4194698/94‑1 (MQ=60)
TTTCTGTCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATT < SRR4302534.3332631/94‑1 (MQ=60)
TTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATT > SRR4302534.3893512/1‑94 (MQ=60)
TTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTT > SRR4302534.1594715/1‑94 (MQ=60)
TCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAATGTTCATTTC < SRR4302534.6484738/94‑1 (MQ=60)
GCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATC < SRR4302534.316381/94‑1 (MQ=60)
CGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCA < SRR4302534.2115462/94‑1 (MQ=60)
CGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGCACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCA > SRR4302534.2528652/1‑94 (MQ=60)
GTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCAT > SRR4302534.5420355/1‑94 (MQ=60)
TTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATG > SRR4302534.4766293/1‑94 (MQ=60)
AGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTA > SRR4302534.5303973/1‑94 (MQ=60)
AGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTA > SRR4302534.999476/1‑94 (MQ=60)
AGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTA < SRR4302534.127210/94‑1 (MQ=60)
GACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAA < SRR4302534.5665869/94‑1 (MQ=60)
ACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAAT < SRR4302534.3546286/94‑1 (MQ=60)
CCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATA < SRR4302534.2256438/94‑1 (MQ=60)
CGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATAT < SRR4302534.3406273/94‑1 (MQ=60)
CGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTA > SRR4302534.5318436/1‑94 (MQ=60)
CGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTA < SRR4302534.5147825/94‑1 (MQ=60)
GGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTAC > SRR4302534.427803/1‑94 (MQ=60)
GGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTAC < SRR4302534.6334303/94‑1 (MQ=60)
GGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTAC < SRR4302534.5984171/94‑1 (MQ=60)
GGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTAC > SRR4302534.936277/1‑94 (MQ=60)
GATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACA < SRR4302534.1783221/94‑1 (MQ=60)
GATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACA > SRR4302534.5215259/1‑94 (MQ=60)
ATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACAC < SRR4302534.4644806/94‑1 (MQ=60)
TGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACC > SRR4302534.2893506/1‑94 (MQ=60)
GTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCG < SRR4302534.5987787/94‑1 (MQ=60)
TCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGG > SRR4302534.4925963/1‑94 (MQ=60)
TCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGG > SRR4302534.2797418/1‑94 (MQ=60)
CATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTGAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATCTGTACACCGGA > SRR4302534.6038455/1‑94 (MQ=60)
CATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGA < SRR4302534.5437336/94‑1 (MQ=60)
TGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGG < SRR4302534.313553/94‑1 (MQ=60)
TGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGG < SRR4302534.877990/94‑1 (MQ=60)
TGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGG < SRR4302534.1435374/94‑1 (MQ=60)
GGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGT > SRR4302534.2263642/1‑94 (MQ=60)
GGATTGTTTGCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGT > SRR4302534.6450141/1‑94 (MQ=60)
GATTGTTTTCATAACGAAATTAAATCCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTA < SRR4302534.5389144/94‑1 (MQ=60)
GATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTA < SRR4302534.2853857/94‑1 (MQ=60)
ATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTAC > SRR4302534.4690555/1‑94 (MQ=60)
ATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTAC < SRR4302534.534938/94‑1 (MQ=60)
TTGTTTTCATAACGAAATTAAACCCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACA < SRR4302534.5599311/94‑1 (MQ=60)
TGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACAT < SRR4302534.701135/94‑1 (MQ=60)
TGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACAT < SRR4302534.5995475/94‑1 (MQ=60)
GTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATA > SRR4302534.6088566/1‑94 (MQ=60)
TTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATAT < SRR4302534.5406102/94‑1 (MQ=60)
TTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATAT < SRR4302534.702635/94‑1 (MQ=60)
TTTCATAACGAAATTAAACCCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATT < SRR4302534.3245600/94‑1 (MQ=60)
TTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATT < SRR4302534.4317576/94‑1 (MQ=60)
TTCATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTG > SRR4302534.3957938/1‑94 (MQ=60)
TTCATAACGAAATTAAAACCCTGGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTG < SRR4302534.2064694/94‑1 (MQ=60)
CATAACGAAATTAAATCCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTA < SRR4302534.5670802/94‑1 (MQ=60)
CATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTA > SRR4302534.1030958/1‑94 (MQ=60)
CATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTA > SRR4302534.4997736/1‑94 (MQ=60)
CATAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTA < SRR4302534.5310228/94‑1 (MQ=60)
TAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATG < SRR4302534.1102597/94‑1 (MQ=60)
TAACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATG < SRR4302534.5036738/94‑1 (MQ=60)
AACGAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGA > SRR4302534.1087761/1‑94 (MQ=60)
GAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAG < SRR4302534.3864941/94‑1 (MQ=60)
GAAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAG < SRR4302534.5251436/94‑1 (MQ=60)
AAATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGC < SRR4302534.4044294/94‑1 (MQ=60)
AATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCG < SRR4302534.4936125/94‑1 (MQ=60)
AATTAAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCG > SRR4302534.5544645/1‑94 (MQ=60)
AAAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATT > SRR4302534.5444883/1‑94 (MQ=60)
ACACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTG < SRR4302534.3798922/94‑1 (MQ=60)
AAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTG < SRR4302534.1188487/94‑1 (MQ=60)
AAACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTG < SRR4302534.5597270/94‑1 (MQ=60)
AACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGG > SRR4302534.6422337/1‑94 (MQ=60)
AACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGG < SRR4302534.368758/94‑1 (MQ=60)
ACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGG > SRR4302534.1430404/1‑94 (MQ=60)
ACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGG < SRR4302534.5781695/94‑1 (MQ=60)
ACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGG > SRR4302534.506589/1‑94 (MQ=60)
ACCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGG > SRR4302534.3456715/1‑94 (MQ=60)
CCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGC > SRR4302534.2819276/1‑94 (MQ=60)
CCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGA > SRR4302534.6293024/1‑94 (MQ=60)
CCCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGA < SRR4302534.3146546/94‑1 (MQ=60)
CCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGAC > SRR4302534.2714621/1‑94 (MQ=60)
CCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGAC < SRR4302534.1118367/94‑1 (MQ=60)
CCTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGAC < SRR4302534.5613441/94‑1 (MQ=60)
CTTGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACT > SRR4302534.5018841/1‑94 (MQ=60)
TGCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCT > SRR4302534.2176066/1‑94 (MQ=60)
GCACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTT < SRR4302534.3226199/94‑1 (MQ=60)
CACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTT < SRR4302534.1422863/94‑1 (MQ=60)
CACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTT > SRR4302534.6413912/1‑94 (MQ=60)
CACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTT > SRR4302534.1496038/1‑94 (MQ=60)
|
AGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTT > NC_000913/1202084‑1202269
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
