Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
884 |
257.2 |
12958910 |
96.9% |
12557183 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,457,617 |
T→C |
P180P (CCT→CCC) |
ydbU → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,457,617 | 0 | T | C | 99.6%
| 773.8
/ NA
| 223 | P180P (CCT→CCC) | ydbU | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (101/121); minor base A (1/0); total (102/121) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.57e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 230 total aligned reads displayed.
GAAGTTGGTGGAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCTGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCAGGT > NC_000913/1457527‑1457706
|
gaAGTTGGTGGAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCcgt < 2:3626533/93‑1 (MQ=255)
aGTTGGTGGAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTgc < 1:2112391/93‑1 (MQ=255)
gTTGGTGGAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTgcg < 1:4916258/93‑1 (MQ=255)
ttGGTGGAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTgcgc < 1:4492670/93‑1 (MQ=255)
ggtggAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTg < 1:4065119/93‑1 (MQ=255)
tggAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTc > 2:6341746/1‑93 (MQ=255)
aGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCTGTGCGCTGTCAtt > 1:1499127/1‑93 (MQ=255)
aGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCAtt < 2:5340731/93‑1 (MQ=255)
ggtggtCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTc > 2:5480540/1‑93 (MQ=255)
gtggtCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCg > 2:2646168/1‑93 (MQ=255)
ggtCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGAc > 1:5329547/1‑93 (MQ=255)
cAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTcc > 1:3526378/1‑93 (MQ=255)
cAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTcc < 2:4926196/93‑1 (MQ=255)
aGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCt < 1:324786/93‑1 (MQ=255)
aGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCt > 2:3651426/1‑93 (MQ=255)
aGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCt < 2:4070739/93‑1 (MQ=255)
gTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAGCGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTg > 1:6029035/1‑93 (MQ=255)
gTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTg > 2:1671823/1‑93 (MQ=255)
gTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTg > 2:4859773/1‑93 (MQ=255)
tGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTgg < 2:2507847/93‑1 (MQ=255)
tGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTgg < 2:82081/93‑1 (MQ=255)
gCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCATCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGAtt < 2:6383557/93‑1 (MQ=255)
cTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGAttt < 2:876782/93‑1 (MQ=255)
cTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGAttt < 1:2712132/93‑1 (MQ=255)
tGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTa > 2:1521588/1‑93 (MQ=255)
ggCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCAGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGCTTTAt > 2:5811734/1‑93 (MQ=255)
gCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATc < 2:3854392/93‑1 (MQ=255)
gCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATc < 2:5855792/93‑1 (MQ=255)
cAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCg < 1:2893175/93‑1 (MQ=255)
aCGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGtt < 2:2247586/93‑1 (MQ=255)
aCGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGtt > 2:5707630/1‑93 (MQ=255)
cggcggcggAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTa > 2:1378192/1‑93 (MQ=255)
ggcggcggAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTaa > 2:5240437/1‑93 (MQ=255)
ggcggcggAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTaa > 1:2468324/1‑93 (MQ=255)
gcggcggAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAAc > 1:5810153/1‑93 (MQ=255)
gcggcggAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAAc < 1:1412755/93‑1 (MQ=255)
gcggcggAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAAc > 1:487828/1‑93 (MQ=255)
gcggcggAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAAc < 2:1991281/93‑1 (MQ=255)
ggAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCgtgt < 1:6330629/93‑1 (MQ=255)
ggAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCgtgt > 1:1043651/1‑93 (MQ=255)
ggAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCgtgt < 2:5152884/93‑1 (MQ=255)
gAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCATCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGtt < 2:1702894/93‑1 (MQ=255)
gAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGtt > 2:5728327/1‑93 (MQ=255)
aaGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCATCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTg < 2:6174185/93‑1 (MQ=255)
aGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTgc > 2:4588590/1‑93 (MQ=255)
aGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTgc < 2:648662/93‑1 (MQ=255)
aGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTgc > 2:5012498/1‑93 (MQ=255)
ttgttgAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTgcgc < 2:2051009/93‑1 (MQ=255)
gttgAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGt > 2:1482370/1‑93 (MQ=255)
ttgAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGCTTTAt > 1:389797/1‑73 (MQ=255)
ttgAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTAt < 2:389797/73‑1 (MQ=255)
ttgAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGATGCGCGTc > 1:3946370/1‑93 (MQ=255)
tgAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGGCTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTcc < 1:1307747/93‑1 (MQ=255)
tgAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTcc < 1:396231/93‑1 (MQ=255)
tgAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTcc < 1:3674410/93‑1 (MQ=255)
gAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCt > 1:5077636/1‑93 (MQ=255)
gAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCt < 2:1308195/93‑1 (MQ=255)
gAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCt > 2:3301050/1‑93 (MQ=255)
gAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCt > 1:362135/1‑93 (MQ=255)
aGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCtt < 1:4125419/93‑1 (MQ=255)
gCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCtta < 2:1741828/93‑1 (MQ=255)
aGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCttatt > 1:2375877/1‑93 (MQ=255)
ttGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTtattat < 2:4448236/93‑1 (MQ=255)
tgtgtgAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTattatt < 1:2596741/93‑1 (MQ=255)
tgtgtgAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTattatt > 1:4405515/1‑93 (MQ=255)
gtgtgAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTc < 2:4575832/93‑1 (MQ=255)
gtgAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCg > 2:354417/1‑93 (MQ=255)
tgAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGa < 1:5461931/93‑1 (MQ=255)
tgAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGa < 1:1020560/93‑1 (MQ=255)
gAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAg > 2:4270585/1‑93 (MQ=255)
gAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAg > 1:3130860/1‑93 (MQ=255)
aaCTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAgg > 1:931268/1‑93 (MQ=255)
cTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGcc < 2:3133621/93‑1 (MQ=255)
cTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGcc < 2:2796256/93‑1 (MQ=255)
cTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGcc > 1:2503142/1‑93 (MQ=255)
tAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCt < 1:2919906/93‑1 (MQ=255)
tAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCt > 1:5637801/1‑93 (MQ=255)
aaCGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTg < 2:958261/93‑1 (MQ=255)
aaCGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCAAGGCCTg > 1:557228/1‑93 (MQ=255)
aCGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTgg < 2:4052018/93‑1 (MQ=255)
aCGTTGAGGTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTgg > 1:6313088/1‑93 (MQ=255)
gTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCg < 1:5775651/93‑1 (MQ=255)
gTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCg > 1:1373271/1‑93 (MQ=255)
ttGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCgg < 1:2231587/93‑1 (MQ=255)
tGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCggg < 2:2418329/93‑1 (MQ=255)
tGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCggg < 1:6232978/93‑1 (MQ=255)
gAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGc > 2:2863468/1‑93 (MQ=255)
ttGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACt < 2:4743865/93‑1 (MQ=255)
tGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTg < 1:1138196/93‑1 (MQ=255)
gTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAag > 1:1899947/1‑93 (MQ=255)
aaGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAagag < 1:3640467/93‑1 (MQ=255)
aaGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAagag > 2:2970135/1‑93 (MQ=255)
agcagcCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGc < 2:1187918/93‑1 (MQ=255)
agcagcCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGc > 2:6111793/1‑93 (MQ=255)
agcagcCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGc < 1:4594926/93‑1 (MQ=255)
gcagcCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCa < 1:4613554/93‑1 (MQ=255)
agcCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCAgg > 2:3388737/1‑93 (MQ=255)
agcCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCAgg > 1:4234649/1‑93 (MQ=255)
gcCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCAGGt > 2:1400050/1‑93 (MQ=255)
gcCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCAGGt > 1:31096/1‑93 (MQ=255)
|
GAAGTTGGTGGAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCTGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCAGGT > NC_000913/1457527‑1457706
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GATGAAGTTGGTGGAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCTGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCAGGTTGCT > NC_000913/1457524‑1457710
|
GATGAAGTTGGTGGAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCC < SRR4302534.1639843/94‑1 (MQ=60)
GATGAAGTTGGTGGAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCC < SRR4302534.1164852/94‑1 (MQ=60)
GATGAAGTTGGTGGAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCC < SRR4302534.3782179/94‑1 (MQ=60)
ATGAAGTTGGTGGAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCG < SRR4302534.6165651/94‑1 (MQ=60)
ATGAAGTTGGTGGAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGGAAGAAGCCCG > SRR4302534.1456657/1‑94 (MQ=60)
ATGAAGTTGGTGGAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGGTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCG > SRR4302534.1166656/1‑94 (MQ=60)
GAAGTTGGTGGAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTG < SRR4302534.1598587/94‑1 (MQ=60)
GAAGTGGGTGGAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTG < SRR4302534.5849117/94‑1 (MQ=60)
AGTTGGTGGAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCG > SRR4302534.3551967/1‑94 (MQ=60)
AGTTGGTGGAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCG < SRR4302534.4725887/94‑1 (MQ=60)
AGTTGGTGGAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCG < SRR4302534.2167944/94‑1 (MQ=60)
GTTGGTGGAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGC < SRR4302534.5049508/94‑1 (MQ=60)
TTGGTGGAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCT < SRR4302534.4614241/94‑1 (MQ=60)
TTGGTGGAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCT < SRR4302534.3764172/94‑1 (MQ=60)
GGTGGAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGT < SRR4302534.4174182/94‑1 (MQ=60)
GAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCTGTGCGCTGTCATT > SRR4302534.1538583/1‑94 (MQ=60)
GGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCG < SRR4302534.20007/94‑1 (MQ=60)
GGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCG < SRR4302534.2299523/94‑1 (MQ=60)
GTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGA > SRR4302534.2715862/1‑94 (MQ=60)
TGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGAC > SRR4302534.5473285/1‑94 (MQ=60)
GGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACC > SRR4302534.4437643/1‑94 (MQ=60)
TCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCC < SRR4302534.3945933/94‑1 (MQ=60)
TCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCC > SRR4302534.3621231/1‑94 (MQ=60)
TCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGGTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCC > SRR4302534.2343715/1‑94 (MQ=60)
AGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAGCGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTG > SRR4302534.6192862/1‑94 (MQ=60)
AGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTG < SRR4302534.333131/94‑1 (MQ=60)
AGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTG > SRR4302534.1278052/1‑94 (MQ=60)
GGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATT < SRR4302534.6453908/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCAACTGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTT < SRR4302534.3719974/94‑1 (MQ=60)
CTGTCAACGGCGGCGGCAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTACCGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGTTGTCATTCGACTCCTGGATTTA < SRR4302534.3107944/94‑1 (MQ=60)
CTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTA < SRR4302534.2783732/94‑1 (MQ=60)
CAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGT < SRR4302534.2969112/94‑1 (MQ=60)
CAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGT > SRR4302534.3896207/1‑94 (MQ=60)
AACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTT < SRR4302534.1632552/94‑1 (MQ=60)
CGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAA > SRR4302534.6247322/1‑94 (MQ=60)
CGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAA > SRR4302534.2533935/1‑94 (MQ=60)
GGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAAC > SRR4302534.500029/1‑94 (MQ=60)
GGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAAC > SRR4302534.5967843/1‑94 (MQ=60)
GCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACC < SRR4302534.2466883/94‑1 (MQ=60)
GCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACC < SRR4302534.1449919/94‑1 (MQ=60)
GCGGAAGTTGATGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTG < SRR4302534.794664/94‑1 (MQ=60)
CGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGT > SRR4302534.1070600/1‑94 (MQ=60)
GGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTT > SRR4302534.2751983/1‑94 (MQ=60)
GGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTT < SRR4302534.6501668/94‑1 (MQ=60)
GGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTT < SRR4302534.2574635/94‑1 (MQ=60)
GAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTG < SRR4302534.5945674/94‑1 (MQ=60)
GAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTG > SRR4302534.1051096/1‑94 (MQ=60)
GAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTG > SRR4302534.3187265/1‑94 (MQ=60)
AAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGC > SRR4302534.4570429/1‑94 (MQ=60)
AAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGC > SRR4302534.5479685/1‑94 (MQ=60)
AGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCG > SRR4302534.5695614/1‑94 (MQ=60)
GTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGC < SRR4302534.4029967/94‑1 (MQ=60)
GTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGGGTTGCGG > SRR4302534.2542304/1‑94 (MQ=60)
GTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGCTTTATCaatctatagatcggaagag > SRR4302534.399760/1‑75 (MQ=60)
GTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGGTGCGCGTC > SRR4302534.4052037/1‑94 (MQ=60)
GTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGATGCGCGTC > SRR4302534.4052036/1‑94 (MQ=60)
TTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCC > SRR4302534.5761253/1‑94 (MQ=60)
TGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGGCTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCT < SRR4302534.1342251/94‑1 (MQ=60)
TGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCT > SRR4302534.5100270/1‑94 (MQ=60)
TGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCT < SRR4302534.406371/94‑1 (MQ=60)
TGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCT > SRR4302534.5214706/1‑94 (MQ=60)
TGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCT < SRR4302534.3773182/94‑1 (MQ=60)
TGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCT > SRR4302534.5327134/1‑94 (MQ=60)
TGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCT > SRR4302534.371368/1‑94 (MQ=60)
GAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTT < SRR4302534.1451667/94‑1 (MQ=60)
AGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTA < SRR4302534.4236471/94‑1 (MQ=60)
CAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATT < SRR4302534.2972892/94‑1 (MQ=60)
CAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATT > SRR4302534.2438968/1‑94 (MQ=60)
AGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTA > SRR4302534.5040635/1‑94 (MQ=60)
TTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATT > SRR4302534.4524402/1‑94 (MQ=60)
TGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTC < SRR4302534.2665462/94‑1 (MQ=60)
TGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCG < SRR4302534.4117396/94‑1 (MQ=60)
TGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAG > SRR4302534.3213160/1‑94 (MQ=60)
TGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAG < SRR4302534.5609135/94‑1 (MQ=60)
TGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAG < SRR4302534.6340040/94‑1 (MQ=60)
TGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAG < SRR4302534.1046832/94‑1 (MQ=60)
GAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCGTTATTATTCCGAGG > SRR4302534.1116641/1‑94 (MQ=60)
GAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGG > SRR4302534.954954/1‑94 (MQ=60)
ACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCC > SRR4302534.2569608/1‑94 (MQ=60)
CTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCT > SRR4302534.5790389/1‑94 (MQ=60)
CTAACGTTGAGTTGGGCTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCT < SRR4302534.4698125/94‑1 (MQ=60)
TAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTG < SRR4302534.3705984/94‑1 (MQ=60)
TAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTG < SRR4302534.2996525/94‑1 (MQ=60)
TAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTG > SRR4302534.2889849/1‑94 (MQ=60)
TAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCAAGGCCTG > SRR4302534.570965/1‑94 (MQ=60)
AACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGG < SRR4302534.1365496/94‑1 (MQ=60)
AACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGG > SRR4302534.4155095/1‑94 (MQ=60)
AACGTTGAGGTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGG > SRR4302534.6483745/1‑94 (MQ=60)
CGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCG > SRR4302534.4874032/1‑94 (MQ=60)
CGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCG > SRR4302534.1427445/1‑94 (MQ=60)
CGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCG > SRR4302534.1409458/1‑94 (MQ=60)
GTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGG < SRR4302534.5932325/94‑1 (MQ=60)
GTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGG < SRR4302534.6071091/94‑1 (MQ=60)
TTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGG < SRR4302534.2290693/94‑1 (MQ=60)
TTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGG < SRR4302534.943409/94‑1 (MQ=60)
TGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGC < SRR4302534.6402161/94‑1 (MQ=60)
AGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCAC > SRR4302534.4802886/1‑94 (MQ=60)
GTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACT < SRR4302534.6498530/94‑1 (MQ=60)
TGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGG > SRR4302534.3359345/1‑94 (MQ=60)
TGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGG < SRR4302534.5772246/94‑1 (MQ=60)
TGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGG < SRR4302534.1167970/94‑1 (MQ=60)
GGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAA < SRR4302534.52157/94‑1 (MQ=60)
GGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAA < SRR4302534.4200001/94‑1 (MQ=60)
GGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAG > SRR4302534.1949504/1‑94 (MQ=60)
TAAGCAGCCCGTGCTCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAG < SRR4302534.2269557/94‑1 (MQ=60)
AAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGC < SRR4302534.3738309/94‑1 (MQ=60)
AGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCA > SRR4302534.3211153/1‑94 (MQ=60)
AGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCA < SRR4302534.4719636/94‑1 (MQ=60)
GCTGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCAG < SRR4302534.4408121/94‑1 (MQ=60)
GCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGTCTGGCGGGCGCTGGAAGAGCAG < SRR4302534.3269614/94‑1 (MQ=60)
GCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCAG < SRR4302534.4738763/94‑1 (MQ=60)
CAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCAGG > SRR4302534.4348795/1‑94 (MQ=60)
AGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCAGGT > SRR4302534.1390338/1‑94 (MQ=60)
AGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCAGGT > SRR4302534.4307467/1‑94 (MQ=60)
AGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCAGGT > SRR4302534.31918/1‑94 (MQ=60)
AGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCAGGT > SRR4302534.3327937/1‑94 (MQ=60)
GCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCAGGTT > SRR4302534.5647199/1‑94 (MQ=60)
GCC‑GTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCAGGTTG > SRR4302534.2127751/1‑94 (MQ=60)
CCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCAGGTTG > SRR4302534.5650893/1‑94 (MQ=60)
CCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCAGGTTG < SRR4302534.6573493/94‑1 (MQ=60)
CGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCAGGTTGCT > SRR4302534.4715997/1‑94 (MQ=60)
CGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCAGGTTGCT > SRR4302534.2946380/1‑94 (MQ=60)
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GATGAAGTTGGTGGAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCTGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCAGGTTGCT > NC_000913/1457524‑1457710
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
