Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
744 |
338.8 |
17650688 |
97.8% |
17262372 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,457,617 |
T→C |
P180P (CCT→CCC) |
ydbU → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,457,617 | 0 | T | C | 99.6%
| 812.4
/ ‑5.6
| 241 | P180P (CCT→CCC) | ydbU | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (95/144); total (97/144) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.00e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 |
Only 100 of 259 total aligned reads displayed.
ATGAAGTTGGTGGAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCTGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCAGGT > NC_000913/1457525‑1457706
|
aaGTTGGTGGAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCcgtg < 1:3555294/93‑1 (MQ=255)
tggtggAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCt < 2:3344412/93‑1 (MQ=255)
tggtggAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCt < 1:2534627/93‑1 (MQ=255)
gtggAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGt > 1:289080/1‑93 (MQ=255)
tggAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGGGTTGGGGTACGCAGCCCGTGCGCTGTc > 1:5102320/1‑93 (MQ=255)
ggAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCa > 2:3702784/1‑93 (MQ=255)
gAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCAt < 2:7890518/93‑1 (MQ=255)
gAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCAt > 2:7377681/1‑93 (MQ=255)
gtggtCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCg > 2:1749412/1‑93 (MQ=255)
tggtCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGa < 2:1103078/93‑1 (MQ=255)
ggtCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGAc < 1:115031/93‑1 (MQ=255)
ggtCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGAc < 2:500932/93‑1 (MQ=255)
tCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTc > 2:3128310/1‑93 (MQ=255)
tCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTc > 1:4891028/1‑93 (MQ=255)
cAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTcc < 2:1992567/93‑1 (MQ=255)
aGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCt > 2:3403232/1‑93 (MQ=255)
aGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCt > 1:2142869/1‑93 (MQ=255)
aGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCt < 2:2707542/93‑1 (MQ=255)
gTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCGCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTg > 1:4257272/1‑93 (MQ=255)
gTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTg < 1:2207367/93‑1 (MQ=255)
gTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTg < 1:8184042/93‑1 (MQ=255)
tGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTgg < 1:5260793/93‑1 (MQ=255)
ggCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGAt > 1:3088900/1‑93 (MQ=255)
tGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTa > 1:3475395/1‑93 (MQ=255)
gCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATc > 1:7085121/1‑93 (MQ=255)
gaCGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGt < 2:1783938/92‑1 (MQ=255)
aaCGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGt > 2:1212631/1‑93 (MQ=255)
aCGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGtt > 2:4553223/1‑93 (MQ=255)
aCGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGtt < 1:6860480/93‑1 (MQ=255)
gcggcggAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAAc < 2:809557/93‑1 (MQ=255)
ggcggAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCg < 2:7085058/93‑1 (MQ=255)
ggcggAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCg < 1:5707818/93‑1 (MQ=255)
gcggAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCgt < 2:258435/93‑1 (MQ=255)
cggAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCggg > 1:3879671/1‑91 (MQ=255)
ggAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCgtgt > 1:7807512/1‑93 (MQ=255)
ggAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCgtgt > 1:8517906/1‑93 (MQ=255)
aaGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTg < 1:6263594/93‑1 (MQ=255)
aaGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTg < 1:7595292/93‑1 (MQ=255)
aGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTCTCGTTAACCGTGTTgc < 2:5792026/93‑1 (MQ=255)
aGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTgc > 2:3592718/1‑93 (MQ=255)
aGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTgc < 2:4592045/93‑1 (MQ=255)
gttgAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTAACATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGt < 2:7787680/93‑1 (MQ=255)
ttgAGTAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTCCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGAGTTGCGCGTc < 2:1958888/93‑1 (MQ=255)
ttgAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTc > 1:2863109/1‑93 (MQ=255)
ttgAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTc < 2:6159847/93‑1 (MQ=255)
ttgAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTc < 2:1078369/93‑1 (MQ=255)
tgAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTcc > 1:956606/1‑93 (MQ=255)
gAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCt > 2:1017431/1‑93 (MQ=255)
aGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCtt < 2:34647/93‑1 (MQ=255)
gCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCtta > 1:3863470/1‑93 (MQ=255)
gCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCtta > 2:6701940/1‑93 (MQ=255)
ttGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTtattat < 2:7059048/93‑1 (MQ=255)
gtgtgAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTc < 1:3205883/93‑1 (MQ=255)
gtgtgAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTc < 2:2272112/93‑1 (MQ=255)
gtgtgAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTc < 1:3729396/93‑1 (MQ=255)
tgtgAGCTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTcc < 2:2228899/93‑1 (MQ=255)
tgtgAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTcc < 2:8176691/93‑1 (MQ=255)
tgtgAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTcc < 2:5901942/93‑1 (MQ=255)
gtgAACTAACGTTGTGTTGGGGGTAGCAGGCTGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCg > 1:1531906/1‑93 (MQ=255)
tgAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCTGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGa < 1:1220163/93‑1 (MQ=255)
tgAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGa < 1:6093976/93‑1 (MQ=255)
tgAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGa < 1:5874846/93‑1 (MQ=255)
tgAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGa < 1:7225678/93‑1 (MQ=255)
gAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAg > 2:4973443/1‑93 (MQ=255)
gAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAg < 1:6587407/93‑1 (MQ=255)
gAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAg < 1:4456712/93‑1 (MQ=255)
gAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAg < 2:6631787/93‑1 (MQ=255)
aCTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGc > 2:2351305/1‑93 (MQ=255)
aCTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCCGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGc > 1:7868374/1‑93 (MQ=255)
cTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGcc > 1:361399/1‑93 (MQ=255)
cTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGcc > 1:1788299/1‑93 (MQ=255)
cTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGcc < 2:854495/93‑1 (MQ=255)
tAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCt < 1:5541673/93‑1 (MQ=255)
tAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCt > 1:1724221/1‑93 (MQ=255)
aaCGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTg > 1:7695527/1‑93 (MQ=255)
aaCGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTg > 2:1332433/1‑93 (MQ=255)
cGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGc < 1:6745496/93‑1 (MQ=255)
cGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGc < 1:642334/93‑1 (MQ=255)
gTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCg < 2:7432799/93‑1 (MQ=255)
ttGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCgg < 2:864926/93‑1 (MQ=255)
tGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCggg < 1:2748220/93‑1 (MQ=255)
aGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCa < 2:1806809/93‑1 (MQ=255)
gTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCAc < 1:1591359/93‑1 (MQ=255)
tGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTg > 1:1926008/1‑93 (MQ=255)
gggTGAGCAACCCGTGCGCTGACATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGa < 1:7143886/93‑1 (MQ=255)
ggTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGaa < 2:5358066/93‑1 (MQ=255)
ggTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGaa < 2:7596672/93‑1 (MQ=255)
gTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAag < 2:8471402/93‑1 (MQ=255)
tAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAaga < 1:902655/93‑1 (MQ=255)
agcagcCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGc < 2:3800269/93‑1 (MQ=255)
agcagcCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGc > 2:4738265/1‑93 (MQ=255)
agcagcCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGc < 2:5134054/93‑1 (MQ=255)
gcagcCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCa < 1:7021799/93‑1 (MQ=255)
gcagcCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCa < 1:2424639/93‑1 (MQ=255)
gcagcCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCa > 2:6453282/1‑93 (MQ=255)
gcCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGATAAGCAGGt > 2:4446668/1‑93 (MQ=255)
gcCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCAGGt < 1:3574980/93‑1 (MQ=255)
gcCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCAGGt < 2:4219107/93‑1 (MQ=255)
gcCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCAGGt < 2:3166470/93‑1 (MQ=255)
gcCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCAGGt < 1:8346034/93‑1 (MQ=255)
|
ATGAAGTTGGTGGAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCTGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCAGGT > NC_000913/1457525‑1457706
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATGAAGTTGGTGGAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCTGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCAGGTTGCT > NC_000913/1457525‑1457710
|
ATGAAGTTGGTGGAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCG < SRR4302541.3363936/94‑1 (MQ=60)
TGAAGTTGGTGGAGGTGGTGAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGT < SRR4302541.1568946/94‑1 (MQ=60)
TGAAGTTGGTGGAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGT < SRR4302541.7957513/94‑1 (MQ=60)
TGAAGTTGGTGGAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGT < SRR4302541.5166459/94‑1 (MQ=60)
GAAGTTGGTGGAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTG > SRR4302541.6150054/1‑94 (MQ=60)
AAGTTGGTGGAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGC < SRR4302541.3591259/94‑1 (MQ=60)
AGTTGGTGGAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCG < SRR4302541.1643569/94‑1 (MQ=60)
TTGGTGGAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCT > SRR4302541.4406637/1‑94 (MQ=60)
TGGTGGAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTG < SRR4302541.2198459/94‑1 (MQ=60)
TGGTGGAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTG < SRR4302541.2560083/94‑1 (MQ=60)
GGTGGAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGT > SRR4302541.291577/1‑94 (MQ=60)
GTGGAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGGGTTGGGGTACGCAGCCCGTGCGCTGTC > SRR4302541.5154740/1‑94 (MQ=60)
GGAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCAT > SRR4302541.1577450/1‑94 (MQ=60)
GAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAGCGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATT < SRR4302541.6771153/94‑1 (MQ=60)
AGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTC < SRR4302541.7238678/94‑1 (MQ=60)
AGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTC > SRR4302541.7453315/1‑94 (MQ=60)
GGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCG < SRR4302541.1541866/94‑1 (MQ=60)
GGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCG < SRR4302541.830650/94‑1 (MQ=60)
GGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGCCGGCGGAAGTTGTTGAGGAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCG < SRR4302541.1213783/94‑1 (MQ=60)
GGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACT < SRR4302541.3646110/94‑1 (MQ=60)
GGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACT < SRR4302541.115965/94‑1 (MQ=60)
GGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACT > SRR4302541.2362430/1‑94 (MQ=60)
GTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTC > SRR4302541.4940933/1‑94 (MQ=60)
CAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCT < SRR4302541.8856918/94‑1 (MQ=60)
CAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCT > SRR4302541.2163600/1‑94 (MQ=60)
AGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCGCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTG > SRR4302541.4299825/1‑94 (MQ=60)
GTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGG < SRR4302541.8273390/94‑1 (MQ=60)
GTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGG < SRR4302541.602050/94‑1 (MQ=60)
GTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGG < SRR4302541.823725/94‑1 (MQ=60)
GTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGG < SRR4302541.2228757/94‑1 (MQ=60)
TGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGA < SRR4302541.5315003/94‑1 (MQ=60)
GGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAGCGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGAT < SRR4302541.6930073/94‑1 (MQ=60)
GGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGAT > SRR4302541.3120232/1‑94 (MQ=60)
GGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATT < SRR4302541.2052935/94‑1 (MQ=60)
CTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTA > SRR4302541.3510145/1‑94 (MQ=60)
GGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATC > SRR4302541.7160483/1‑94 (MQ=60)
GGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATC < SRR4302541.5344713/94‑1 (MQ=60)
CAACGTCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTTTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGT < SRR4302541.4365124/94‑1 (MQ=60)
ACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTA < SRR4302541.6933789/94‑1 (MQ=60)
GGGGGGGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCATCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAAC < SRR4302541.7250741/94‑1 (MQ=60)
GGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAAC > SRR4302541.1315999/1‑94 (MQ=60)
GGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAAC < SRR4302541.6536872/94‑1 (MQ=60)
GGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGT > SRR4302541.5114973/1‑94 (MQ=60)
GGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGT < SRR4302541.5766004/94‑1 (MQ=60)
GGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGT < SRR4302541.5893177/94‑1 (MQ=60)
GCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGGG > SRR4302541.3918630/1‑94 (MQ=60)
CGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGT < SRR4302541.5235699/94‑1 (MQ=60)
CGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGT > SRR4302541.56388/1‑94 (MQ=60)
CGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGT > SRR4302541.8609583/1‑94 (MQ=60)
CGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGT > SRR4302541.7891781/1‑94 (MQ=60)
GGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTT > SRR4302541.8322467/1‑94 (MQ=60)
AAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGC < SRR4302541.7676435/94‑1 (MQ=60)
AAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGC < SRR4302541.6327556/94‑1 (MQ=60)
AAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGC < SRR4302541.7006079/94‑1 (MQ=60)
TGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGT > SRR4302541.6168861/1‑94 (MQ=60)
GTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTC > SRR4302541.2891879/1‑94 (MQ=60)
TTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCC > SRR4302541.965642/1‑94 (MQ=60)
TTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCC > SRR4302541.3617910/1‑94 (MQ=60)
TGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCT < SRR4302541.951121/94‑1 (MQ=60)
AGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCGGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTACCCGTGTTGCGCGTCCTTC > SRR4302541.3608198/1‑94 (MQ=60)
AGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTA > SRR4302541.3902331/1‑94 (MQ=60)
GCAGTTGTGTAAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTAT < SRR4302541.4268850/94‑1 (MQ=60)
CAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATT < SRR4302541.7178068/94‑1 (MQ=60)
AGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTA > SRR4302541.2623343/1‑94 (MQ=60)
GTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTAT < SRR4302541.34656/94‑1 (MQ=60)
GTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTAT < SRR4302541.5405227/94‑1 (MQ=60)
TGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCTGCGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACGGTGTTGCGCTTCCTCATTTTTC > SRR4302541.2721484/1‑94 (MQ=60)
GTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCC < SRR4302541.3766963/94‑1 (MQ=60)
GTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCC < SRR4302541.3238269/94‑1 (MQ=60)
TGTGAACTAACGTTGTGTTGGGGGTAGCAGGCTGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCG > SRR4302541.1547255/1‑94 (MQ=60)
TGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCTGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAG < SRR4302541.1232096/94‑1 (MQ=60)
TGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAG < SRR4302541.5934619/94‑1 (MQ=60)
TGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAG < SRR4302541.6156182/94‑1 (MQ=60)
TGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAG < SRR4302541.1830829/94‑1 (MQ=60)
TGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAG < SRR4302541.1739378/94‑1 (MQ=60)
TGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAG < SRR4302541.3854073/94‑1 (MQ=60)
TGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAG < SRR4302541.7302765/94‑1 (MQ=60)
TGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAG < SRR4302541.8811753/94‑1 (MQ=60)
TGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAACCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAG < SRR4302541.7153457/94‑1 (MQ=60)
GAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGTCTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGG < SRR4302541.7382398/94‑1 (MQ=60)
GAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGG < SRR4302541.6654843/94‑1 (MQ=60)
GAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGG < SRR4302541.4501571/94‑1 (MQ=60)
GAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGG < SRR4302541.7148726/94‑1 (MQ=60)
AACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCCGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGC > SRR4302541.7954826/1‑94 (MQ=60)
ACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCC > SRR4302541.7802746/1‑94 (MQ=60)
ACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCC > SRR4302541.1805672/1‑94 (MQ=60)
ACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCC > SRR4302541.364669/1‑94 (MQ=60)
CTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTTCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCT < SRR4302541.2643571/94‑1 (MQ=60)
CTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCT > SRR4302541.1741074/1‑94 (MQ=60)
CTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCT > SRR4302541.4875802/1‑94 (MQ=60)
TAACGTTGAGTTGGTGTAAGCACCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTG < SRR4302541.8041095/94‑1 (MQ=60)
TAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTACCCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTG > SRR4302541.8582458/1‑94 (MQ=60)
TAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTG < SRR4302541.5598416/94‑1 (MQ=60)
TAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTG > SRR4302541.7777366/1‑94 (MQ=60)
TAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTG > SRR4302541.5053995/1‑94 (MQ=60)
TAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTG > SRR4302541.6837076/1‑94 (MQ=60)
TAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTG < SRR4302541.3917256/94‑1 (MQ=60)
ACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGC < SRR4302541.2838942/94‑1 (MQ=60)
ACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGC > SRR4302541.2983017/1‑94 (MQ=60)
ACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGC < SRR4302541.2824003/94‑1 (MQ=60)
CGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCTAGGCCTGGCG > SRR4302541.5639405/1‑94 (MQ=60)
CGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCG < SRR4302541.6817579/94‑1 (MQ=60)
CGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCG < SRR4302541.648398/94‑1 (MQ=60)
CGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCG > SRR4302541.2100466/1‑94 (MQ=60)
GTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGG > SRR4302541.7842554/1‑94 (MQ=60)
GTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGG > SRR4302541.379698/1‑94 (MQ=60)
TGAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGC < SRR4302541.2775825/94‑1 (MQ=60)
GAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCA > SRR4302541.2283935/1‑94 (MQ=60)
GAGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCA < SRR4302541.189275/94‑1 (MQ=60)
AGTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCAC < SRR4302541.3531610/94‑1 (MQ=60)
GTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGgccg > SRR4302541.3559670/1‑90 (MQ=60)
GTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACT < SRR4302541.1607203/94‑1 (MQ=60)
GTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACT > SRR4302541.3363446/1‑94 (MQ=60)
GTTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACT < SRR4302541.7934409/94‑1 (MQ=60)
TTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTG > SRR4302541.1944550/1‑94 (MQ=60)
TTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTG < SRR4302541.3045488/94‑1 (MQ=60)
TTGGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTG > SRR4302541.2892121/1‑94 (MQ=60)
GGGGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGA < SRR4302541.7212741/94‑1 (MQ=60)
GGGTGAGCAACCCGTGCGCTGACATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAA < SRR4302541.7220018/94‑1 (MQ=60)
GGTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAG < SRR4302541.991244/94‑1 (MQ=60)
GTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGA < SRR4302541.6580201/94‑1 (MQ=60)
GTAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGA < SRR4302541.6329135/94‑1 (MQ=60)
GGAAGCCGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGTATTTATCGTTATCCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGA < SRR4302541.2495611/94‑1 (MQ=60)
TAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAG < SRR4302541.7709146/94‑1 (MQ=60)
TAAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAG < SRR4302541.911027/94‑1 (MQ=60)
AAGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGC > SRR4302541.4162190/1‑94 (MQ=60)
AGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCA < SRR4302541.6421127/94‑1 (MQ=60)
AGCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCA < SRR4302541.1756576/94‑1 (MQ=60)
GCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCAG < SRR4302541.7096444/94‑1 (MQ=60)
GCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCAG < SRR4302541.314118/94‑1 (MQ=60)
GCAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCAG < SRR4302541.2448590/94‑1 (MQ=60)
CAGCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCAGG > SRR4302541.3712391/1‑94 (MQ=60)
GCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCAGGTT < SRR4302541.8436624/94‑1 (MQ=60)
GCCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCAGGTT < SRR4302541.3611204/94‑1 (MQ=60)
CCCGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCAGGTTG < SRR4302541.3679560/94‑1 (MQ=60)
CGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCAGGTTGCT < SRR4302541.7715819/94‑1 (MQ=60)
|
ATGAAGTTGGTGGAGGTGGTCAGTGGGCTGGCAACGGCGGCGGAAGTTGTTGAGCAGTTGTGTGAACTAACGTTGAGTTGGGGTAAGCAGCCTGTGCGCTGTCATTCGACTCCTGGATTTATCGTTAACCGTGTTGCGCGTCCTTATTATTCCGAGGCCTGGCGGGCACTGGAAGAGCAGGTTGCT > NC_000913/1457525‑1457710
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
