Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
884 |
257.2 |
12958910 |
96.9% |
12557183 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,571,055 |
T→C |
L724L (TTA→TTG) |
pqqL ← |
putative peptidase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,571,055 | 0 | T | C | 100.0%
| 860.7
/ NA
| 242 | L724L (TTA→TTG) | pqqL | putative peptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (128/114); total (128/114) |
Only 100 of 246 total aligned reads displayed.
TTGTTCTTTTACAGTAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCTAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCTGGAGATGAAAACAATTG > NC_000913/1570965‑1571144
|
ttGTTCTTTTACAGTAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCaa < 2:2502566/93‑1 (MQ=255)
ttGTTCTTTTACAGTAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCaa < 2:2943956/93‑1 (MQ=255)
tGTTCTTTTACAGTAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAg > 1:887226/1‑93 (MQ=255)
tGTTCTTTTACAGTAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAg > 1:2985319/1‑93 (MQ=255)
tGTTCTTTTACAGTAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAg < 2:2042291/93‑1 (MQ=255)
gTTCTTTTACAGTAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGt < 2:3833448/93‑1 (MQ=255)
gTTCTTTTACAGTAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGt < 1:4964503/93‑1 (MQ=255)
ttCTTTTACAGTAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTa > 1:936646/1‑93 (MQ=255)
tCTTTTACAGTAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTaa > 2:3188648/1‑93 (MQ=255)
tCTTTTACAGTAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTaa > 2:277818/1‑93 (MQ=255)
tCTTTTACAGTAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTaa < 1:5975387/93‑1 (MQ=255)
ttttACAGTAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAAcg > 1:177835/1‑93 (MQ=255)
tttACAGTAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAAcgc < 1:2097982/93‑1 (MQ=255)
tACAGTAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGt < 1:4605958/93‑1 (MQ=255)
aGTAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAAt > 2:4869486/1‑93 (MQ=255)
tAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTa > 1:2236686/1‑93 (MQ=255)
aaCCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTaa > 1:646689/1‑93 (MQ=255)
aaCCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTaa < 2:5597527/93‑1 (MQ=255)
aCCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAAc < 1:4934359/93‑1 (MQ=255)
ccGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACg > 1:2420837/1‑93 (MQ=255)
ccGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACg < 1:5581592/93‑1 (MQ=255)
cGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGc < 2:4614421/93‑1 (MQ=255)
gATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGcc > 1:598959/1‑93 (MQ=255)
gATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGcc < 1:3923/93‑1 (MQ=255)
gATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGcc < 2:3273970/93‑1 (MQ=255)
gATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGcc < 1:2303522/93‑1 (MQ=255)
gATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGcc < 1:3791604/93‑1 (MQ=255)
aTGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCa > 2:2184189/1‑93 (MQ=255)
tGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCAc < 1:483231/93‑1 (MQ=255)
gTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAg > 2:4073734/1‑93 (MQ=255)
gTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAg > 2:765260/1‑93 (MQ=255)
tGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGtt < 1:3397691/93‑1 (MQ=255)
tGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGtt > 2:3004632/1‑93 (MQ=255)
tGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGtt < 2:587179/93‑1 (MQ=255)
gTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCGCGAGttt < 1:6131862/93‑1 (MQ=255)
gTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGttc < 2:3537324/93‑2 (MQ=255)
ccGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGt < 1:5596942/93‑1 (MQ=255)
cGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGtc > 2:734902/1‑93 (MQ=255)
cGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGtc < 1:1390876/93‑1 (MQ=255)
gTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGtct > 2:5662067/1‑93 (MQ=255)
gTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGtct < 2:932686/93‑1 (MQ=255)
tCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGtctt < 1:1149037/93‑1 (MQ=255)
tCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGtctt < 1:295299/93‑1 (MQ=255)
cgcgcgAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGtcttc > 1:5789144/1‑93 (MQ=255)
cgcgcgAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGtcttc < 2:4916747/93‑1 (MQ=255)
gcgcgAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGCTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGtcttct > 2:1779349/1‑93 (MQ=255)
gcgAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGc > 1:400712/1‑93 (MQ=255)
gcgAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGc < 2:171552/93‑1 (MQ=255)
gcgAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGAAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGc > 2:2393648/1‑93 (MQ=255)
cgAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCg > 2:4737858/1‑93 (MQ=255)
cgAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCg < 2:4107738/93‑1 (MQ=255)
gAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGa > 1:4309305/1‑93 (MQ=255)
gAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGa > 1:1448650/1‑93 (MQ=255)
aaTGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTa > 1:5345181/1‑93 (MQ=255)
aaTGCTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTa < 2:1504820/93‑1 (MQ=255)
aTGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTAc < 1:5446944/93‑1 (MQ=255)
tGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTAcc > 1:1929891/1‑93 (MQ=255)
tGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTAcc < 2:5000706/93‑1 (MQ=255)
gTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGa > 1:3042966/1‑93 (MQ=255)
ccTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATg > 2:6391450/1‑93 (MQ=255)
cTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGa < 1:5841497/93‑1 (MQ=255)
tGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGAc > 1:5240457/1‑93 (MQ=255)
gCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACa > 2:4537150/1‑93 (MQ=255)
gCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACa < 2:3994201/93‑1 (MQ=255)
cGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACaa > 2:5291977/1‑93 (MQ=255)
ggCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACaaa > 1:6329441/1‑93 (MQ=255)
gCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAAc < 2:5024866/93‑1 (MQ=255)
cTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACg < 2:6169203/93‑1 (MQ=255)
tAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGt < 1:1250404/93‑1 (MQ=255)
tAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGt > 1:4396329/1‑93 (MQ=255)
tAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCAACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGt < 1:644601/93‑1 (MQ=255)
aTGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGa > 2:5528411/1‑93 (MQ=255)
aTGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGa > 2:878705/1‑93 (MQ=255)
aTGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGa < 2:1685587/93‑1 (MQ=255)
cGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATc < 2:3020217/93‑1 (MQ=255)
aaTCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAATGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCg > 2:2240700/1‑93 (MQ=255)
aTCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGc > 2:2760471/1‑93 (MQ=255)
aTCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGc < 2:609827/93‑1 (MQ=255)
tCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGTTATCCGCt > 1:1008751/1‑93 (MQ=255)
tCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCt > 2:6227381/1‑93 (MQ=255)
tCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCt < 2:1459966/93‑1 (MQ=255)
cAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCTg < 1:1668631/93‑1 (MQ=255)
cAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCTg < 2:3703209/93‑1 (MQ=255)
agagTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCTgg > 2:5175917/1‑93 (MQ=255)
agagTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCTgg > 2:1311983/1‑93 (MQ=255)
gagTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCTGga > 2:1193266/1‑93 (MQ=255)
gagTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCTGga < 2:1670346/93‑1 (MQ=255)
gagTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCTGga > 1:2690354/1‑93 (MQ=255)
gtgtTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCTGgaga < 2:391096/93‑1 (MQ=255)
gtTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACTAACGTGATATCCGCTGGAGATg > 1:5369050/1‑93 (MQ=255)
gtTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCTGGAGATg > 2:5336508/1‑93 (MQ=255)
gtTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCTGGAGATg > 2:4718277/1‑93 (MQ=255)
gtTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCTGGAGATg < 1:3573554/93‑1 (MQ=255)
tttGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCTGGAGATGa > 1:6186842/1‑93 (MQ=255)
tttGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCTGGAGATGa < 1:3255422/93‑1 (MQ=255)
atCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCTGGAGATGAAAACAAtt < 2:3332522/93‑1 (MQ=255)
atCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCTGGAGATGAAAACAAtt < 1:237874/93‑1 (MQ=255)
atCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCTGGAGATGAAAACAAtt < 2:5969204/93‑1 (MQ=255)
tCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCTGGAGATGAAAACAATTg < 2:5233671/93‑1 (MQ=255)
tCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCTGGAGATGAAAACAATTg < 2:4400373/93‑1 (MQ=255)
|
TTGTTCTTTTACAGTAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCTAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCTGGAGATGAAAACAATTG > NC_000913/1570965‑1571144
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATTTTGTTCTTTTACAGTAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCTAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCTGGAGATGAAAACAATTGG > NC_000913/1570962‑1571145
|
ATTTTGTTCTTTTACAGTAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCC < SRR4302534.1631398/94‑1 (MQ=60)
TTTTGTTCTTTTACAGTAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCA < SRR4302534.4336958/94‑1 (MQ=60)
TTTTGTTCTTTTACAGTAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCA > SRR4302534.1452814/1‑94 (MQ=60)
TTGTTCTTTTACAGTAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAG > SRR4302534.909692/1‑94 (MQ=60)
TTGTTCTTTTACAGTAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAG > SRR4302534.3063399/1‑94 (MQ=60)
GTTCTTTTACAGTAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTA > SRR4302534.960468/1‑94 (MQ=60)
GTTCTTTTACAGTAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTA > SRR4302534.5206056/1‑94 (MQ=60)
GTTCTTTTACAGTAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTA < SRR4302534.5098913/94‑1 (MQ=60)
TTCTTTTACAGTAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAA < SRR4302534.3052500/94‑1 (MQ=60)
TCTTTTACAGTAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAAC < SRR4302534.6137675/94‑1 (MQ=60)
GTTTTACAGTAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACG > SRR4302534.182520/1‑94 (MQ=60)
TTTTACAGTAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGC < SRR4302534.4474173/94‑1 (MQ=60)
TTTTACAGTAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGC > SRR4302534.5734323/1‑94 (MQ=60)
TTTACAGTAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCG < SRR4302534.2153030/94‑1 (MQ=60)
TTACAGTAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGT > SRR4302534.5575575/1‑94 (MQ=60)
TACAGTAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTA > SRR4302534.2195744/1‑94 (MQ=60)
TACAGTAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTA < SRR4302534.4730948/94‑1 (MQ=60)
AGTAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATT < SRR4302534.1237555/94‑1 (MQ=60)
GTAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTA > SRR4302534.2295957/1‑94 (MQ=60)
TAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATTCCAAGTAACGAGTAATTAA > SRR4302534.4060589/1‑94 (MQ=60)
TAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAA > SRR4302534.1666429/1‑94 (MQ=60)
TAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAA > SRR4302534.662367/1‑94 (MQ=60)
AACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATGCCAAGTAACGCGTAATTAAC > SRR4302534.1631784/1‑94 (MQ=60)
AACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAAC > SRR4302534.6611531/1‑94 (MQ=60)
ACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACG < SRR4302534.5068081/94‑1 (MQ=60)
ACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACG > SRR4302534.2485209/1‑94 (MQ=60)
CCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGC > SRR4302534.1979299/1‑94 (MQ=60)
CCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGC < SRR4302534.5732401/94‑1 (MQ=60)
CCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGC > SRR4302534.1438193/1‑94 (MQ=60)
CGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCC > SRR4302534.3671922/1‑94 (MQ=60)
CGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCC > SRR4302534.613561/1‑94 (MQ=60)
GATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCA < SRR4302534.2364659/94‑1 (MQ=60)
GATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCA < SRR4302534.3893395/94‑1 (MQ=60)
GATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCA < SRR4302534.4036/94‑1 (MQ=60)
TGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACG < SRR4302534.495340/94‑1 (MQ=60)
GTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGT < SRR4302534.1283536/94‑1 (MQ=60)
GTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGT > SRR4302534.3136616/1‑94 (MQ=60)
TTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTT > SRR4302534.2550508/1‑94 (MQ=60)
TTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTT < SRR4302534.4374428/94‑1 (MQ=60)
TTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTT > SRR4302534.4964938/1‑94 (MQ=60)
TGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTT < SRR4302534.3488875/94‑1 (MQ=60)
TGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTT < SRR4302534.5706803/94‑1 (MQ=60)
GTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCGCGAGTTTG < SRR4302534.6298663/94‑1 (MQ=60)
GTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTG > SRR4302534.1862781/1‑94 (MQ=60)
GTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTG < SRR4302534.6002934/94‑1 (MQ=60)
GTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTG < SRR4302534.6411793/94‑1 (MQ=60)
GTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTG > SRR4302534.4095879/1‑94 (MQ=60)
GTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTG > SRR4302534.3102103/1‑94 (MQ=60)
TCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGT < SRR4302534.698822/94‑1 (MQ=60)
CCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTC < SRR4302534.5748292/94‑1 (MQ=60)
CCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTC > SRR4302534.960409/1‑94 (MQ=60)
CGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCT < SRR4302534.1427488/94‑1 (MQ=60)
TCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTC > SRR4302534.5946196/1‑94 (MQ=60)
TCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTC < SRR4302534.1179146/94‑1 (MQ=60)
TCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTC < SRR4302534.302935/94‑1 (MQ=60)
CGCGCGAGTTAATTGTTGTCCTGCTGCTAATGGCGAATCAGAGTGTGTGATTGACCCCAAGTAACGCGTAATTAACTCCACGAGTTTGTCTTCT < SRR4302534.1234675/94‑1 (MQ=60)
CGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCT > SRR4302534.6182088/1‑94 (MQ=60)
CGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGC > SRR4302534.410959/1‑94 (MQ=60)
CGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGA > SRR4302534.4426067/1‑94 (MQ=60)
CGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGA > SRR4302534.1486774/1‑94 (MQ=60)
GAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGAC > SRR4302534.533373/1‑94 (MQ=60)
TAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTA > SRR4302534.5813600/1‑94 (MQ=60)
TAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTA > SRR4302534.5489299/1‑94 (MQ=60)
AATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTAC > SRR4302534.2415458/1‑94 (MQ=60)
ATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACC > SRR4302534.1980351/1‑94 (MQ=60)
ATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACC < SRR4302534.5075314/94‑1 (MQ=60)
ATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACC < SRR4302534.5593701/94‑1 (MQ=60)
TGGTTTAGCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCG > SRR4302534.5505135/1‑94 (MQ=60)
TGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGGTTGTCTTCTGCGACATTACCG > SRR4302534.4503722/1‑94 (MQ=60)
GGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGA > SRR4302534.5387504/1‑94 (MQ=60)
GGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGA > SRR4302534.3122779/1‑94 (MQ=60)
atgctactgcactgcaaaaaactggaacTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACA < SRR4302534.3582292/66‑1 (MQ=60)
TTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACA < SRR4302534.5754153/94‑1 (MQ=60)
TTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAA > SRR4302534.5620502/1‑94 (MQ=60)
ACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATG > SRR4302534.1521729/1‑94 (MQ=60)
ACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATG > SRR4302534.6532713/1‑94 (MQ=60)
ACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATG < SRR4302534.3108594/94‑1 (MQ=60)
CTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGAC < SRR4302534.6000069/94‑1 (MQ=60)
CTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGAC > SRR4302534.5381953/1‑94 (MQ=60)
TGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACA < SRR4302534.4985980/94‑1 (MQ=60)
GCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAA < SRR4302534.2464558/94‑1 (MQ=60)
CGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAA > SRR4302534.6500452/1‑94 (MQ=60)
GGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAAC > SRR4302534.2348046/1‑94 (MQ=60)
GGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAAC < SRR4302534.3555142/94‑1 (MQ=60)
CTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGT < SRR4302534.226223/94‑1 (MQ=60)
CTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGT > SRR4302534.5955718/1‑94 (MQ=60)
CTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGT > SRR4302534.4514923/1‑94 (MQ=60)
TAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTG > SRR4302534.4739850/1‑94 (MQ=60)
TAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTG < SRR4302534.1283358/94‑1 (MQ=60)
TAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCAACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTG < SRR4302534.660236/94‑1 (MQ=60)
ATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGAT < SRR4302534.6354829/94‑1 (MQ=60)
GCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATC < SRR4302534.6343687/94‑1 (MQ=60)
CGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTATCTCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCC < SRR4302534.2137775/94‑1 (MQ=60)
CGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCC < SRR4302534.874488/94‑1 (MQ=60)
CGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCC < SRR4302534.3454933/94‑1 (MQ=60)
GAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCG > SRR4302534.41060/1‑94 (MQ=60)
GAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCG > SRR4302534.2394884/1‑94 (MQ=60)
GAATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCG > SRR4302534.180310/1‑94 (MQ=60)
ATCAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGTTATCCGCT > SRR4302534.1034666/1‑94 (MQ=60)
CAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCTGG < SRR4302534.4567007/94‑1 (MQ=60)
CAGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCTGG < SRR4302534.1712059/94‑1 (MQ=60)
AGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCTGGA > SRR4302534.131103/1‑94 (MQ=60)
AGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCTGGA > SRR4302534.6132274/1‑94 (MQ=60)
AGAGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCTGGA > SRR4302534.2761451/1‑94 (MQ=60)
AGTGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCTGGAGA < SRR4302534.2765039/94‑1 (MQ=60)
TGTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACTAACGTGATATCCGCTGGAGATG > SRR4302534.5513737/1‑94 (MQ=60)
TTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCTGGAGATGA < SRR4302534.2988785/94‑1 (MQ=60)
GTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCTGGAGATGA > SRR4302534.6355225/1‑94 (MQ=60)
GTTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCTGGAGATGA < SRR4302534.3669674/94‑1 (MQ=60)
TTTGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCTGGAGATGAA < SRR4302534.3342126/94‑1 (MQ=60)
TGATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCTGGAGATGAAAA < SRR4302534.6142982/94‑1 (MQ=60)
GATTGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCTGGAGATGAAAAC < SRR4302534.4020659/94‑1 (MQ=60)
TGATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCTGGAGATGAAAACAAT > SRR4302534.3468816/1‑94 (MQ=60)
GATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAGCTTGATATCCGCTGGAGATGAAAACAATT < SRR4302534.3682863/94‑1 (MQ=60)
ATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCGACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCTGGAGATGAAAACAATTG < SRR4302534.1093016/94‑1 (MQ=60)
ATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCTGGAGATGAAAACAATTG < SRR4302534.244097/94‑1 (MQ=60)
ATCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGGTTGTCTTCTGGGACATTACCGACAATGACAAAGGTGAGATCGGCCGGAGAGGAAAACAATTG > SRR4302534.3323156/1‑94 (MQ=60)
TCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCTGGAGATGAAAACAATTGG < SRR4302534.661547/94‑1 (MQ=60)
TCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCTGGAGATGAAAACAATTGG > SRR4302534.4947472/1‑94 (MQ=60)
TCCCAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCTGGAGATGAAAACAATTGG < SRR4302534.5497007/94‑1 (MQ=60)
|
ATTTTGTTCTTTTACAGTAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCTAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCTGGAGATGAAAACAATTGG > NC_000913/1570962‑1571145
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 5 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
