Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
521 |
238.2 |
12299412 |
96.0% |
11807435 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,015,142 |
T→C |
S189S (AGT→AGC) |
fliI → |
flagellum‑specific ATP synthase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,015,142 | 0 | T | C | 94.7%
| 477.4
/ 8.5
| 152 | S189S (AGT→AGC) | fliI | flagellum‑specific ATP synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (4/4); new base C (70/74); total (74/78) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.15e-01 |
Only 100 of 159 total aligned reads displayed.
GGACACCGGCGTGCGCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGTGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTAAAAGATT > NC_000913/2015052‑2015230
|
ggACACCGGCCTGCGCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAgcgt < 2:3514710/93‑1 (MQ=255)
acacCGGCGTGCGCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGtgc < 1:302628/93‑1 (MQ=255)
cacCGCCGTGCGCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGtgct < 2:4290151/93‑1 (MQ=255)
acCGGCGTGCGCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGtgctg < 1:5194967/93‑1 (MQ=255)
cGGCGTGCGCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTgctgct < 2:5711484/93‑1 (MQ=255)
cGGCGTGCGCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTgctgct < 1:1711128/93‑1 (MQ=255)
ggCGTGCGCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGctgctg > 2:3777397/1‑93 (MQ=255)
gCGTGCGCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTgg > 1:1619298/1‑93 (MQ=255)
gTGCGCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTgggg < 1:5977884/93‑1 (MQ=255)
tGCGCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTGCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTggggg > 1:4938375/1‑92 (MQ=255)
tGCGCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGga > 2:1496109/1‑93 (MQ=255)
tGCGCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGga < 1:3934781/93‑1 (MQ=255)
gcgcCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGgat < 2:1146235/93‑1 (MQ=255)
gcCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGgatga < 2:313284/93‑1 (MQ=255)
cccAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGgatgag > 2:1665576/1‑92 (MQ=255)
ccAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGTGTGCTGCTGGGGatgatg < 1:5842763/93‑1 (MQ=255)
ccAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGatgatg < 1:3693954/93‑1 (MQ=255)
caatcaatGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATgg > 1:3573372/1‑93 (MQ=255)
aatcaatGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGc > 2:2898174/1‑93 (MQ=255)
aatcaatGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGc > 2:1296254/1‑93 (MQ=255)
aatcaatGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGc > 1:132029/1‑93 (MQ=255)
aatcaatGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGc < 2:400926/93‑1 (MQ=255)
atcaatGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGTGTGCTGCTGGGGATGATggag > 2:1238544/1‑91 (MQ=255)
atcaatGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATggaa > 2:2284160/1‑91 (MQ=255)
caatGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACg > 1:1971619/1‑93 (MQ=255)
caatGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACg < 1:4168807/93‑1 (MQ=255)
aatGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGTGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGt > 1:4284979/1‑93 (MQ=255)
aatGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGt > 1:2265763/1‑93 (MQ=255)
aatGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGt < 1:3041230/93‑1 (MQ=255)
atGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGtt > 2:2037867/1‑93 (MQ=255)
tGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTa > 1:6130355/1‑93 (MQ=255)
gCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTac < 1:3822595/93‑1 (MQ=255)
ccTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGTGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGTAGGATGGCACGTTacac > 2:5476374/1‑93 (MQ=255)
ccTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTacac > 2:5106825/1‑93 (MQ=255)
ccTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTacac < 2:268385/93‑1 (MQ=255)
ccTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTacac > 2:6128607/1‑93 (MQ=255)
cTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACAcc < 2:5880152/93‑1 (MQ=255)
cTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACAcc < 1:1546303/93‑1 (MQ=255)
tGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACAccc > 1:435594/1‑93 (MQ=255)
tGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACAccc > 2:6007692/1‑93 (MQ=255)
tGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACAccc > 1:3160477/1‑93 (MQ=255)
gCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCcg < 1:2913779/93‑1 (MQ=255)
gTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGAt > 1:4394707/1‑93 (MQ=255)
ttGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATg < 2:2491377/93‑1 (MQ=255)
gCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCAt < 1:5846930/93‑1 (MQ=255)
gTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTg < 1:1600194/93‑1 (MQ=255)
ggggCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTCCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGt < 1:3049642/92‑1 (MQ=255)
gggCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTc < 1:2937597/93‑1 (MQ=255)
gCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGt < 2:775099/93‑1 (MQ=255)
gCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTggg < 2:4637974/93‑1 (MQ=255)
gCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTggg > 2:5559728/1‑93 (MQ=255)
gTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTgggct > 2:3747566/1‑91 (MQ=255)
tATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGttt > 2:1494876/1‑93 (MQ=255)
tATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGttt > 1:4524654/1‑93 (MQ=255)
tATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGttt > 1:5705096/1‑93 (MQ=255)
tATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGttt > 2:881085/1‑93 (MQ=255)
tATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGttt > 1:3466938/1‑93 (MQ=255)
aTGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTg > 1:2687551/1‑93 (MQ=255)
tGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGa > 2:4485204/1‑93 (MQ=255)
gggCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGAtt < 2:976702/93‑1 (MQ=255)
gggCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGAtt < 2:3938043/93‑1 (MQ=255)
ggCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTg > 1:1933735/1‑93 (MQ=255)
gCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTgg < 1:2174652/93‑1 (MQ=255)
gCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTgg < 2:2735504/93‑1 (MQ=255)
cTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTggg > 1:5025248/1‑92 (MQ=255)
cTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGt < 2:4777840/93‑1 (MQ=255)
tGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTg > 2:4893040/1‑93 (MQ=255)
tGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTg > 1:4114939/1‑93 (MQ=255)
agTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCAGCTGGGGATGAAGGCACGTTACACCCACGACGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTg < 1:4763245/92‑1 (MQ=255)
tttGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGaa < 1:2750778/93‑1 (MQ=255)
tGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACg < 1:4444199/93‑1 (MQ=255)
gCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGt < 2:3069802/93‑1 (MQ=255)
ccGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGTGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTg > 1:3400250/1‑93 (MQ=255)
gggTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTggg < 1:1119804/93‑1 (MQ=255)
gggTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTggg < 1:2526044/93‑1 (MQ=255)
gggTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTggg < 1:5223687/93‑1 (MQ=255)
ggTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGgc > 2:5824431/1‑93 (MQ=255)
tCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGgcgc > 2:5265982/1‑93 (MQ=255)
tCCGGCGTTGGTAAAAGCGGGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGgcgc > 2:3956405/1‑93 (MQ=255)
ccGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGcgcg > 2:5536771/1‑93 (MQ=255)
ccGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGcgcg > 1:748841/1‑93 (MQ=255)
ggCGTTGGTAAAAGTGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGaa < 2:4545354/93‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGaa > 1:4832718/1‑93 (MQ=255)
gCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAg > 1:3299906/1‑93 (MQ=255)
ggTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGt < 2:4297667/92‑1 (MQ=255)
gTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAgaa > 1:92488/1‑91 (MQ=255)
gTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTa > 2:352549/1‑93 (MQ=255)
gTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTa > 1:4013704/1‑93 (MQ=255)
ttGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTaa < 1:4884048/93‑1 (MQ=255)
ttGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTaa < 2:4707815/93‑1 (MQ=255)
ttGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTaa > 2:2133435/1‑93 (MQ=255)
ttGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTaa > 2:2524669/1‑93 (MQ=255)
ttGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTaa < 1:1663343/93‑1 (MQ=255)
ggTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTaaaa < 2:4949783/93‑1 (MQ=255)
ggTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTaaaa < 2:1793291/93‑1 (MQ=255)
gTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTAAAAg < 2:1229894/93‑1 (MQ=255)
gTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTAAAAg < 2:360769/93‑1 (MQ=255)
tAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTAAAAGa < 1:3200847/93‑1 (MQ=255)
tAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTAAAAGa < 1:1775332/93‑1 (MQ=255)
tAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTAAAAGa > 1:1094831/1‑93 (MQ=255)
|
GGACACCGGCGTGCGCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGTGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTAAAAGATT > NC_000913/2015052‑2015230
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TGGACACCGGCGTGCGCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGTGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTAAAAGATTTTATT > NC_000913/2015051‑2015235
|
TGGACACCGGCGTGCGCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGT < SRR4302532.25000/94‑1 (MQ=60)
TGGACACCGGCGTGCGCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGCTTGCCCGGTCCAGCGCTGGTAAAAGCGT > SRR4302532.761551/1‑94 (MQ=60)
GGACACCGGCGTGCGCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTG < SRR4302532.2052820/94‑1 (MQ=60)
ACACCGGCGTGCGCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCT < SRR4302532.313109/94‑1 (MQ=60)
ACCGGCGTGCGCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGC < SRR4302532.5374026/94‑1 (MQ=60)
CGGCGTGCGCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTG < SRR4302532.1768813/94‑1 (MQ=60)
GGCGTGCGCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGG > SRR4302532.1674100/1‑94 (MQ=60)
CGTGCGCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGG > SRR4302532.5098203/1‑94 (MQ=60)
GTGCGCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTGCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGG > SRR4302532.5107908/1‑94 (MQ=60)
GTGCGCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGA < SRR4302532.6184485/94‑1 (MQ=60)
TGCGCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGAT < SRR4302532.4067355/94‑1 (MQ=60)
CGCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGA > SRR4302532.3685884/1‑94 (MQ=60)
GCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGAT < SRR4302532.4978819/94‑1 (MQ=60)
CCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGTGTGCTGCTGGGGATGATGG < SRR4302532.6045544/94‑1 (MQ=60)
CCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGG < SRR4302532.3817967/94‑1 (MQ=60)
CCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGG > SRR4302532.3692946/1‑94 (MQ=60)
CCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGGGGGCAGCGCATGGGCCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGCAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGAgga > SRR4302532.1044600/1‑91 (MQ=60)
CAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGC > SRR4302532.136487/1‑94 (MQ=60)
AATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCA > SRR4302532.2852639/1‑94 (MQ=60)
TCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACG > SRR4302532.2037115/1‑94 (MQ=60)
CAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGTGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGT > SRR4302532.4429441/1‑94 (MQ=60)
CAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGT < SRR4302532.4308618/94‑1 (MQ=60)
CAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGT > SRR4302532.2340959/1‑94 (MQ=60)
AATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTT < SRR4302532.3141577/94‑1 (MQ=60)
AATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTACCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTT > SRR4302532.1302306/1‑94 (MQ=60)
ATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTA > SRR4302532.6341881/1‑94 (MQ=60)
GCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACA < SRR4302532.2714935/94‑1 (MQ=60)
GCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACA < SRR4302532.3967176/94‑1 (MQ=60)
GCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACA < SRR4302532.3951647/94‑1 (MQ=60)
CCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACAC > SRR4302532.5222968/1‑94 (MQ=60)
CTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCC > SRR4302532.3265424/1‑94 (MQ=60)
CTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCC > SRR4302532.450683/1‑94 (MQ=60)
CTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCC < SRR4302532.1598549/94‑1 (MQ=60)
GCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGC < SRR4302532.3010897/94‑1 (MQ=60)
GCTTACAGTTGGGCGCGGGCAGCGTATGGGGCTATTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGTTGATGGCACGTTACCCCCGC > SRR4302532.5152542/1‑94 (MQ=60)
CGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGAT > SRR4302532.4544196/1‑94 (MQ=60)
gtgggacgttgacacaGTATGGTGCTGTTTGCTGGGTCGAGCGTTGGTAAAAGTGTGCTGCTGGGGATGATGGCATGTTACACCCGCGCtgagg < SRR4302532.2770636/78‑6 (MQ=60)
GGGGTGGGCACGGTATTGGGCTGTTTGCCGGCTCTGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCAT < SRR4302532.5700838/94‑1 (MQ=60)
GCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATT < SRR4302532.4212954/94‑1 (MQ=60)
GCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATT < SRR4302532.6049821/94‑1 (MQ=60)
GTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGTGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGT < SRR4302532.3351229/94‑1 (MQ=60)
GTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGT < SRR4302532.1654358/94‑1 (MQ=60)
GTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGT < SRR4302532.1654357/94‑1 (MQ=60)
GTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGT > SRR4302532.847836/1‑94 (MQ=60)
TGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTC < SRR4302532.5983379/94‑1 (MQ=60)
GGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTCCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTC < SRR4302532.3150310/94‑1 (MQ=60)
GGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCG < SRR4302532.3035189/94‑1 (MQ=60)
GGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGT < SRR4302532.1835053/94‑1 (MQ=60)
CAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGG > SRR4302532.4838660/1‑94 (MQ=60)
GCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGT > SRR4302532.5744523/1‑94 (MQ=60)
GTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTT > SRR4302532.4679102/1‑94 (MQ=60)
GTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTT > SRR4302532.3583054/1‑94 (MQ=60)
GTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTT > SRR4302532.5904009/1‑94 (MQ=60)
TATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTG > SRR4302532.2777822/1‑94 (MQ=60)
GGGGCGGTTGGCCGGGTGCGGGGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGGGGGCTCGTTACACCCGCACCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATT < SRR4302532.2647508/94‑1 (MQ=53)
GGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTG > SRR4302532.1998088/1‑94 (MQ=60)
GGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTG < SRR4302532.455883/94‑1 (MQ=60)
GGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGG < SRR4302532.1710108/94‑1 (MQ=60)
GCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGT < SRR4302532.2247318/94‑1 (MQ=60)
GCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGG > SRR4302532.5197613/1‑94 (MQ=60)
CTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGTTGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGATTGTTTGGTG > SRR4302532.1747274/1‑94 (MQ=60)
CTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTG > SRR4302532.4253056/1‑94 (MQ=60)
AGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCAGCTGGGGATGAAGGCACGTTACACCCACGACGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGA < SRR4302532.4926416/94‑1 (MQ=60)
GTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAA < SRR4302532.3021125/94‑1 (MQ=60)
TTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAAC < SRR4302532.2843168/94‑1 (MQ=60)
TGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGT < SRR4302532.4387204/94‑1 (MQ=60)
TGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGT < SRR4302532.4595654/94‑1 (MQ=60)
GCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGTGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTG > SRR4302532.3514094/1‑94 (MQ=60)
GGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGC < SRR4302532.5403832/94‑1 (MQ=60)
GGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGC < SRR4302532.1157199/94‑1 (MQ=60)
GGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGC < SRR4302532.2610324/94‑1 (MQ=60)
TCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCG > SRR4302532.774472/1‑94 (MQ=60)
CGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAA > SRR4302532.4999070/1‑94 (MQ=60)
GGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAG < SRR4302532.6114809/94‑1 (MQ=60)
GGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAG > SRR4302532.3409707/1‑94 (MQ=60)
GCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGGGCGAAGA > SRR4302532.4502356/1‑94 (MQ=60)
CGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTA > SRR4302532.4148944/1‑94 (MQ=60)
CGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGAA > SRR4302532.95711/1‑94 (MQ=60)
GTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTAA > SRR4302532.3496079/1‑94 (MQ=60)
GTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGAGTATACTGCCACGTTACTCCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGTGGTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTAA < SRR4302532.126091/94‑1 (MQ=53)
TTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTAAA < SRR4302532.1719686/94‑1 (MQ=60)
TTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTAAA < SRR4302532.5051960/94‑1 (MQ=60)
TGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTAAAA > SRR4302532.314452/1‑94 (MQ=60)
TGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTAAAA > SRR4302532.3204625/1‑94 (MQ=60)
GTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTAAAAGA > SRR4302532.1131439/1‑94 (MQ=60)
TAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTAAAAGAT < SRR4302532.3307113/94‑1 (MQ=60)
TAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTAAAAGAT < SRR4302532.1834780/94‑1 (MQ=60)
TAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTAAAAGAT < SRR4302532.3885049/94‑1 (MQ=60)
AAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTAAAAGATT > SRR4302532.2247925/1‑94 (MQ=60)
AGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTAAAAGATTTTA < SRR4302532.380890/94‑1 (MQ=60)
GCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTAAAAGATTTTAT < SRR4302532.5778055/94‑1 (MQ=60)
CGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTAAAAGATTTTATT < SRR4302532.3399236/94‑1 (MQ=60)
CGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTAAAAGATTTTATT < SRR4302532.6181436/94‑1 (MQ=60)
CGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTAAAAGATTTTATT > SRR4302532.6018612/1‑94 (MQ=60)
CGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTAAAAGATTTTATT < SRR4302532.473978/94‑1 (MQ=60)
|
TGGACACCGGCGTGCGCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGTGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTAAAAGATTTTATT > NC_000913/2015051‑2015235
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
