Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
521 |
238.2 |
12299412 |
96.0% |
11807435 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,908,853 |
T→C |
G87G (GGA→GGG) |
chpA ← |
ChpA |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,908,853 | 0 | T | C | 99.1%
| 795.7
/ ‑4.9
| 224 | G87G (GGA→GGG) | chpA | ChpA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/0); new base C (117/105); total (119/105) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.00e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 243 total aligned reads displayed.
AGTGAGTTAGTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCTCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGATA > NC_000913/2908763‑2908942
|
tGAGTTAGTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGcccctc > 1:1065120/1‑93 (MQ=255)
tGAGTTAGTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGcccctc < 1:1807167/93‑1 (MQ=255)
tGAGTTAGTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGcccctc > 2:1983885/1‑93 (MQ=255)
aGTTAGTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCtt > 2:3420787/1‑93 (MQ=255)
aGTTAGTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCtt < 2:740264/93‑1 (MQ=255)
gTTAGTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCttc > 2:4205081/1‑92 (MQ=255)
gTTAGTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTg > 1:2073387/1‑93 (MQ=255)
tAGTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGcc < 1:2814454/93‑1 (MQ=255)
gTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCg < 1:4833469/93‑1 (MQ=255)
acacTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCa < 1:6104911/93‑1 (MQ=255)
acTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAGTGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAgg > 1:5156744/1‑93 (MQ=255)
tACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCg > 2:2460120/1‑93 (MQ=255)
aCCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGa > 1:2752910/1‑93 (MQ=255)
aCCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGa < 2:2973251/93‑1 (MQ=255)
aCCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGa < 2:788921/93‑1 (MQ=255)
cccAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGAt > 2:879503/1‑93 (MQ=255)
cccAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGAt > 2:2405091/1‑93 (MQ=255)
cccAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGAt < 2:5401165/93‑1 (MQ=255)
cccAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGAt > 2:3487919/1‑93 (MQ=255)
ccAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATa < 2:1052975/93‑1 (MQ=255)
ccAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATa > 1:5840128/1‑93 (MQ=255)
cAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATAc > 1:2169341/1‑93 (MQ=255)
aaTCAGTACGTTAATTTTGGCTTTATTGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACt < 1:3081014/93‑1 (MQ=255)
aaTCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACt < 1:2095038/93‑1 (MQ=255)
aTCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACtt < 2:4841686/93‑1 (MQ=255)
tCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACttt < 2:565000/93‑1 (MQ=255)
cAGTACGTTCATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACtttt < 1:5482404/93‑1 (MQ=255)
cAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACtttt < 2:185126/93‑1 (MQ=255)
gTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTa < 2:3641312/93‑1 (MQ=255)
gTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTa > 2:1491369/1‑93 (MQ=255)
gTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTa > 2:1777399/1‑93 (MQ=255)
gTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTg > 1:4723330/1‑93 (MQ=255)
ttAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGa > 1:3215567/1‑93 (MQ=255)
ttAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGa < 1:2390117/93‑1 (MQ=255)
aTTTTGTCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCa > 1:3408509/1‑93 (MQ=255)
ttttGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAg > 1:4246383/1‑93 (MQ=255)
ttGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCCACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCTCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCt > 1:2969490/1‑93 (MQ=255)
ttGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTACTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCt > 1:3140439/1‑93 (MQ=255)
gCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAAc < 1:4968144/93‑1 (MQ=255)
gCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAAc > 1:5730056/1‑93 (MQ=255)
gCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAAc < 2:2558542/93‑1 (MQ=255)
cTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACg > 1:5608279/1‑93 (MQ=255)
cTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACg < 2:2134649/93‑1 (MQ=255)
cTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGGTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACg > 1:2796127/1‑93 (MQ=255)
tttAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGc > 2:1317248/1‑93 (MQ=255)
ttAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCTCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCt > 1:6014983/1‑93 (MQ=255)
ttAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCt > 2:4396223/1‑93 (MQ=255)
tAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTa < 1:4648283/93‑1 (MQ=255)
aaTGAGTTGTAATTCCCCTCGGGCAACTGTTCCTTTCTCCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGCCGATACTTTTTACCTGACCAGCTAACGCttc < 1:270417/93‑3 (MQ=255)
tGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGc > 1:3989439/1‑93 (MQ=255)
gAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGcc > 2:3170548/1‑93 (MQ=255)
aGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCa < 1:627445/93‑1 (MQ=255)
gTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCAt > 1:1706831/1‑93 (MQ=255)
gTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCAt > 2:5052086/1‑93 (MQ=255)
gTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCAGCCAGGCGATACTTTTTAGCTGATCAGCTAACGCTACGCCAt > 1:4490256/1‑93 (MQ=255)
ttGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTTCCTGATCAGCTAACGCTACGCCATc < 1:4542791/93‑1 (MQ=255)
tGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCa > 2:2323708/1‑93 (MQ=255)
gTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCAc < 2:1040247/93‑1 (MQ=255)
tAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACg > 1:1439240/1‑93 (MQ=255)
aaTTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGt < 2:3776097/93‑1 (MQ=255)
aTTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCCGGCGATACTTTTTACCTGATCGGCTATTGCTACGCCATCACGtt > 1:4128854/1‑93 (MQ=255)
aTTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGtt > 2:818731/1‑93 (MQ=255)
ttCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTc > 2:5641296/1‑93 (MQ=255)
tCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTcc < 1:2841439/93‑1 (MQ=255)
tCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTcc > 1:2355685/1‑93 (MQ=255)
ccTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCt < 2:4948084/93‑1 (MQ=255)
ccTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCt > 2:3250450/1‑93 (MQ=255)
ccTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCt > 1:2039552/1‑93 (MQ=255)
ctctGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTg > 2:5202370/1‑93 (MQ=255)
ctGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGAc < 2:3038500/93‑1 (MQ=255)
tGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGAcc < 1:4355950/93‑1 (MQ=255)
tGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGAcc > 1:5319083/1‑93 (MQ=255)
ggggCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCg < 2:3364155/93‑1 (MQ=255)
ggggCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCg > 2:5175029/1‑93 (MQ=255)
ggCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGa < 1:602812/93‑1 (MQ=255)
ggCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGa < 1:4795657/93‑1 (MQ=255)
gCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGAt < 1:714945/93‑1 (MQ=255)
cAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATa > 1:5348855/1‑93 (MQ=255)
aaCTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATaa > 1:1346001/1‑93 (MQ=255)
tGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAaac < 2:5689736/93‑1 (MQ=255)
ttCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAaacaa > 2:5881372/1‑93 (MQ=255)
tCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAaacaac > 1:5235003/1‑93 (MQ=255)
tCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAaacaac > 1:4697798/1‑93 (MQ=255)
ccTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACt > 2:2812462/1‑93 (MQ=255)
cTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACtt < 2:4058777/93‑1 (MQ=255)
cTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACtt < 2:2628124/93‑1 (MQ=255)
cTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACtt > 2:3112038/1‑93 (MQ=255)
tttCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACttg > 2:639933/1‑92 (MQ=255)
tttCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTc < 1:3582422/93‑1 (MQ=255)
ttcttcGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCg > 2:5485672/1‑93 (MQ=255)
cttcGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGaa < 1:1600727/93‑1 (MQ=255)
ttcGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAAc > 1:38674/1‑93 (MQ=255)
ttcGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAAc > 2:1201569/1‑93 (MQ=255)
tcGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACg < 2:2087249/93‑1 (MQ=255)
gTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGa > 1:3681222/1‑93 (MQ=255)
gTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGa > 1:2479532/1‑93 (MQ=255)
gTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTCCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGa < 1:1180139/93‑1 (MQ=255)
ttGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGat < 1:2650384/93‑1 (MQ=255)
ttGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGat > 1:3330814/1‑93 (MQ=255)
ttGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGat < 2:2483831/93‑1 (MQ=255)
|
AGTGAGTTAGTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCTCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGATA > NC_000913/2908763‑2908942
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GAAGTGAGTTAGTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCTCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGATATCCT > NC_000913/2908761‑2908946
|
GAAGTGAGTTAGTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCC < SRR4302532.424121/94‑1 (MQ=60)
AAGTGAGTTAGTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCC > SRR4302532.2825700/1‑94 (MQ=60)
AGTGAGTTAGTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCT < SRR4302532.653503/94‑1 (MQ=60)
AGTGAGTTAGTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCT < SRR4302532.565209/94‑1 (MQ=60)
AGTGAGTTAGTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCT > SRR4302532.5339998/1‑94 (MQ=60)
AGTGAGTTAGTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCT < SRR4302532.3997105/94‑1 (MQ=60)
GTGAGTTAGTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTC < SRR4302532.751770/94‑1 (MQ=60)
GTGAGTTAGTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTC > SRR4302532.1100949/1‑94 (MQ=60)
GTGAGTTAGTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTC > SRR4302532.585471/1‑94 (MQ=60)
GTGAGTTAGTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTC < SRR4302532.5085076/94‑1 (MQ=60)
TGAGTTAGTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCT < SRR4302532.3395262/94‑1 (MQ=60)
TGAGTTAGTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCT > SRR4302532.2628303/1‑94 (MQ=60)
TGAGTTAGTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCT < SRR4302532.1867469/94‑1 (MQ=60)
GAGTTAGTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTT > SRR4302532.3787276/1‑94 (MQ=60)
AGTTAGTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTG > SRR4302532.4463711/1‑94 (MQ=60)
AGTTAGTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTG > SRR4302532.2142489/1‑94 (MQ=60)
GTTAGTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGC > SRR4302532.2118135/1‑94 (MQ=60)
TAGTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCC > SRR4302532.628496/1‑94 (MQ=60)
TAGTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCC < SRR4302532.2908660/94‑1 (MQ=60)
GTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGC < SRR4302532.4999844/94‑1 (MQ=60)
AACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCA < SRR4302532.2207457/94‑1 (MQ=60)
ACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAG < SRR4302532.4850492/94‑1 (MQ=60)
ACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAG > SRR4302532.2435213/1‑94 (MQ=60)
ACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAG < SRR4302532.6315597/94‑1 (MQ=60)
CACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAGTGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGG > SRR4302532.5334192/1‑94 (MQ=60)
TACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGA > SRR4302532.2845368/1‑94 (MQ=60)
ACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGAT < SRR4302532.5459467/94‑1 (MQ=60)
CCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATA > SRR4302532.6042819/1‑94 (MQ=60)
CCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATAC > SRR4302532.2241876/1‑94 (MQ=60)
CAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACT < SRR4302532.2942315/94‑1 (MQ=60)
AATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTATTGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTT < SRR4302532.3182891/94‑1 (MQ=60)
AATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTT < SRR4302532.2164922/94‑1 (MQ=60)
ATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTT < SRR4302532.1744268/94‑1 (MQ=60)
CAGTACGTTCATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTT < SRR4302532.5672492/94‑1 (MQ=60)
CAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTT > SRR4302532.368744/1‑94 (MQ=60)
CAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTT < SRR4302532.5990975/94‑1 (MQ=60)
AGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTA < SRR4302532.464408/94‑1 (MQ=60)
GTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTAC > SRR4302532.4875759/1‑94 (MQ=60)
TACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACC < SRR4302532.3634177/94‑1 (MQ=60)
ACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGGCCCTCTTGCCCGCCCGGCGATACTTTTTACCG > SRR4302532.4196955/1‑94 (MQ=60)
ACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCT > SRR4302532.1867931/1‑94 (MQ=60)
CGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTG > SRR4302532.4884488/1‑94 (MQ=60)
GTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGA > SRR4302532.3322344/1‑94 (MQ=60)
TTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGAT < SRR4302532.2469741/94‑1 (MQ=60)
TTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGAT < SRR4302532.127224/94‑1 (MQ=60)
TAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATC < SRR4302532.3171201/94‑1 (MQ=60)
AATTTTGTCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCA > SRR4302532.3522658/1‑94 (MQ=60)
AATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCA > SRR4302532.4668230/1‑94 (MQ=60)
ATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAG < SRR4302532.474700/94‑1 (MQ=60)
ATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAG > SRR4302532.4389056/1‑94 (MQ=60)
TTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCCACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCTCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCT > SRR4302532.3067798/1‑94 (MQ=60)
TTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCT < SRR4302532.4377372/94‑1 (MQ=60)
TTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCT > SRR4302532.5397181/1‑94 (MQ=60)
TTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCT > SRR4302532.5107550/1‑94 (MQ=60)
TTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCT < SRR4302532.3117011/94‑1 (MQ=60)
TTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTACTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCT > SRR4302532.3244661/1‑94 (MQ=60)
TTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACGTGATCAGCTA > SRR4302532.1632482/1‑94 (MQ=60)
GGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAAC > SRR4302532.5929604/1‑94 (MQ=60)
GCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACG > SRR4302532.5802935/1‑94 (MQ=60)
GCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACG < SRR4302532.5138484/94‑1 (MQ=60)
GCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGGTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACG > SRR4302532.2889848/1‑94 (MQ=60)
TTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCTCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCT > SRR4302532.6222693/1‑94 (MQ=60)
TTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCT < SRR4302532.5535013/94‑1 (MQ=60)
TAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTAC < SRR4302532.2911839/94‑1 (MQ=60)
TAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTAC < SRR4302532.4806755/94‑1 (MQ=60)
ATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGC > SRR4302532.455313/1‑94 (MQ=60)
ATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGC > SRR4302532.3318400/1‑94 (MQ=60)
ATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGC > SRR4302532.4123817/1‑94 (MQ=60)
AGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCAT < SRR4302532.649356/94‑1 (MQ=60)
AGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCAT > SRR4302532.1764385/1‑94 (MQ=60)
AGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCAGCCAGGCGATACTTTTTAGCTGATCAGCTAACGCTACGCCAT > SRR4302532.4643532/1‑94 (MQ=60)
GTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTGGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATC < SRR4302532.2706494/94‑1 (MQ=60)
tttctttccgtggggacatttttTTCCTTCCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCA < SRR4302532.4607871/71‑1 (MQ=60)
TTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTTCCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCA < SRR4302532.4697858/94‑1 (MQ=60)
TTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCA < SRR4302532.6135042/94‑1 (MQ=60)
TTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCA > SRR4302532.5725275/1‑94 (MQ=60)
TGTAATTCCTCTGGGGCACCTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCAC < SRR4302532.1159231/94‑1 (MQ=60)
TGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCAC > SRR4302532.6345881/1‑94 (MQ=60)
TGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCAC < SRR4302532.5245265/94‑1 (MQ=60)
GTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACG > SRR4302532.1487732/1‑94 (MQ=60)
AATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCCGGCGATACTTTTTACCTGATCGGCTATTGCTACGCCATCACGTT > SRR4302532.4267388/1‑94 (MQ=60)
TTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCC > SRR4302532.2434280/1‑94 (MQ=60)
TCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCT > SRR4302532.2107492/1‑94 (MQ=60)
TCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCT < SRR4302532.3429660/94‑1 (MQ=60)
TCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCT < SRR4302532.2936416/94‑1 (MQ=60)
CTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGA > SRR4302532.3840451/1‑94 (MQ=60)
TCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCACTCTTGCCCGCCACGCGATACTTTTTAACTGTTCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGAC > SRR4302532.1090874/1‑94 (MQ=60)
CCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGAC < SRR4302532.6088757/94‑1 (MQ=60)
CTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACC > SRR4302532.5503209/1‑94 (MQ=60)
TGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCG < SRR4302532.4503437/94‑1 (MQ=60)
GGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGG < SRR4302532.289936/94‑1 (MQ=60)
GGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGG < SRR4302532.2077195/94‑1 (MQ=60)
GGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGG > SRR4302532.1851013/1‑94 (MQ=60)
GGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGA < SRR4302532.2387053/94‑1 (MQ=60)
GGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGAT < SRR4302532.623870/94‑1 (MQ=60)
GGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGAT < SRR4302532.4960813/94‑1 (MQ=60)
GCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATA < SRR4302532.739356/94‑1 (MQ=60)
GCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATA > SRR4302532.5534414/1‑94 (MQ=60)
GCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATA < SRR4302532.2782805/94‑1 (MQ=60)
CAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAA > SRR4302532.1391000/1‑94 (MQ=60)
AACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAA > SRR4302532.246399/1‑94 (MQ=60)
AACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAA > SRR4302532.4968748/1‑94 (MQ=60)
ACTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAA > SRR4302532.3473184/1‑94 (MQ=60)
CTGTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAAC > SRR4302532.6317360/1‑94 (MQ=60)
GTTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAA > SRR4302532.4894761/1‑94 (MQ=60)
TTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAAC > SRR4302532.4858040/1‑94 (MQ=60)
TTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAAC > SRR4302532.5415532/1‑94 (MQ=60)
TTCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAAC > SRR4302532.1482881/1‑94 (MQ=60)
TCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACT > SRR4302532.3208419/1‑94 (MQ=60)
TCCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACT < SRR4302532.432555/94‑1 (MQ=60)
CCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTT < SRR4302532.2166133/94‑1 (MQ=60)
CCTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTT > SRR4302532.4785981/1‑94 (MQ=60)
CTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTC < SRR4302532.2908900/94‑1 (MQ=60)
CTTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTC < SRR4302532.4121702/94‑1 (MQ=60)
CTTTCTTCGTGGCTCCTCTTGCCCGCCGGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTATGCCACCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTC < SRR4302532.1172692/94‑1 (MQ=60)
TTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCG < SRR4302532.3702266/94‑1 (MQ=60)
TTTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCG > SRR4302532.6231439/1‑94 (MQ=60)
TTCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGA < SRR4302532.5865630/94‑1 (MQ=60)
TCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATCAAACAACTTCGAA > SRR4302532.287320/1‑94 (MQ=60)
TCTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAA > SRR4302532.287318/1‑94 (MQ=60)
CTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAAC < SRR4302532.1654909/94‑1 (MQ=60)
CTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAAC < SRR4302532.4948884/94‑1 (MQ=60)
CTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAAC > SRR4302532.40075/1‑94 (MQ=60)
CTTCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAAC < SRR4302532.2154238/94‑1 (MQ=60)
TCGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGG < SRR4302532.5511595/94‑1 (MQ=60)
CGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGA > SRR4302532.3804873/1‑94 (MQ=60)
CGTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGA > SRR4302532.2562134/1‑94 (MQ=60)
GTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGAT > SRR4302532.3441886/1‑94 (MQ=60)
GTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGAT < SRR4302532.1478642/94‑1 (MQ=60)
GTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGAT > SRR4302532.2556374/1‑94 (MQ=60)
GTTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTCCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGAT < SRR4302532.1219562/94‑1 (MQ=60)
TTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGATA < SRR4302532.2739303/94‑1 (MQ=60)
TTGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCAGCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGATA < SRR4302532.1687967/94‑1 (MQ=60)
TGCCCCACTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGATAT > SRR4302532.2852013/1‑94 (MQ=60)
GCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGATATC > SRR4302532.1120945/1‑94 (MQ=60)
GCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGATATC < SRR4302532.1034600/94‑1 (MQ=60)
GCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGATATC > SRR4302532.3681334/1‑94 (MQ=60)
GCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGATATC < SRR4302532.2294982/94‑1 (MQ=60)
CCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGATATCC > SRR4302532.4219708/1‑94 (MQ=60)
CCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGATATCC > SRR4302532.2720092/1‑94 (MQ=60)
CCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGATATCC < SRR4302532.104956/94‑1 (MQ=60)
CCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGATATCCT < SRR4302532.5531796/94‑1 (MQ=60)
CCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGATATCCT > SRR4302532.5238424/1‑94 (MQ=60)
CCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGATATCCT < SRR4302532.4600137/94‑1 (MQ=60)
|
GAAGTGAGTTAGTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCTCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGATATCCT > NC_000913/2908761‑2908946
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
