Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
521 |
238.2 |
12299412 |
96.0% |
11807435 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,005,601 |
+C |
coding (237/282 nt) |
b4568 → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,005,600 | 1 | . | C | 99.6%
| 821.1
/ ‑3.9
| 227 | coding (236/282 nt) | b4568 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/1); new base C (126/100); total (126/101) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.45e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.34e-01 |
Only 100 of 244 total aligned reads displayed.
GTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGG‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTG > NC_000913/4005509‑4005687
|
gTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGG‑c < 2:2742083/93‑1 (MQ=255)
aTGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGG‑cctg > 2:3739907/1‑90 (MQ=255)
gTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGCGGCCTGTAt < 2:5230122/93‑1 (MQ=255)
tttGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGCGCGGTGGCCTGTAtc < 1:2997060/93‑1 (MQ=255)
gggCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGGGGTGGCCTGTATctct > 1:4392296/1‑93 (MQ=255)
ggCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTctg < 2:794724/93‑1 (MQ=255)
ggCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTctg > 1:5839262/1‑93 (MQ=255)
gCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTctgc < 1:5104097/93‑1 (MQ=255)
cTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTctgct > 2:4879192/1‑93 (MQ=255)
tGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTctgctg < 2:4329743/93‑1 (MQ=255)
gggATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTgg > 1:4248257/1‑93 (MQ=255)
ggATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGa < 1:6075749/93‑1 (MQ=255)
ggATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGa > 2:5126022/1‑93 (MQ=255)
gATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGAt > 1:1758267/1‑93 (MQ=255)
aTTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATg < 1:376044/93‑1 (MQ=255)
aTTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATg < 1:3079817/93‑1 (MQ=255)
aTTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATg < 2:2159850/93‑1 (MQ=255)
aTTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATg > 1:829387/1‑93 (MQ=255)
ttGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATgg > 2:438275/1‑93 (MQ=255)
gcgcTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGt < 2:1442505/93‑1 (MQ=255)
cgcTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGtt > 2:2862628/1‑93 (MQ=255)
gctgctTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGGGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTa > 2:693515/1‑93 (MQ=255)
ctgctTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTAc > 1:5322887/1‑93 (MQ=255)
ttGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGa < 2:894798/93‑1 (MQ=255)
tGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGAt > 1:3637726/1‑93 (MQ=255)
ggCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGCTGGGTTACAAGATg > 1:2165659/1‑93 (MQ=255)
ggCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATg > 1:2601003/1‑93 (MQ=255)
gCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGc < 1:375124/93‑1 (MQ=255)
gCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGc > 2:2218192/1‑93 (MQ=255)
ccTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGGGGTGGCCTGTATATCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCt > 2:1136406/1‑93 (MQ=255)
ccTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCt > 1:5941374/1‑93 (MQ=255)
ccTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCt > 2:1194259/1‑93 (MQ=255)
ccTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCt > 1:3691002/1‑93 (MQ=255)
ccTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGGTACCAGATTCt > 1:2086386/1‑93 (MQ=255)
cTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTa > 2:3878374/1‑93 (MQ=255)
cTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTa > 2:5106187/1‑93 (MQ=255)
cTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCAGCTGGATGGGTTACCAGATGCTa > 1:3500820/1‑93 (MQ=255)
tGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTAc > 2:5527550/1‑93 (MQ=255)
tGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTAc > 2:3449117/1‑93 (MQ=255)
tGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTAc > 2:4990037/1‑93 (MQ=255)
gCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACg > 2:1571778/1‑93 (MQ=255)
gCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACg < 1:2817053/93‑1 (MQ=255)
gCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACg < 2:3007826/93‑1 (MQ=255)
cATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgt < 1:379429/93‑1 (MQ=255)
cATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgt < 2:4288825/93‑1 (MQ=255)
cATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgt > 1:1345075/1‑93 (MQ=255)
aTTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgtg > 1:931982/1‑93 (MQ=255)
tttGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgtgg > 1:991840/1‑93 (MQ=255)
tttGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgtgg > 2:1289899/1‑93 (MQ=255)
gATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgtggtga > 1:6127543/1‑92 (MQ=255)
gATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGc > 2:3965784/1‑93 (MQ=255)
ttATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCAc > 2:4618061/1‑93 (MQ=255)
tATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACt < 2:4253889/93‑1 (MQ=255)
tATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACt < 2:2662522/93‑1 (MQ=255)
tATCGAAAAAATGGCCTGGCTACATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTCCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACt < 1:5167213/93‑1 (MQ=255)
aTCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTg < 1:4169752/93‑1 (MQ=255)
tCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGa > 1:2690293/1‑93 (MQ=255)
tCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGa < 1:1001754/93‑1 (MQ=255)
tCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGCGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGACACCAGATGCTACGTGGCGCACTGa > 1:634097/1‑93 (MQ=255)
gAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGaaa > 1:1475015/1‑93 (MQ=255)
aaaaaTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGaaaaa < 1:856294/93‑1 (MQ=255)
aaaaTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGaaaaaa < 2:590716/93‑1 (MQ=255)
aaaaTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGaaaaaa < 1:4019550/93‑1 (MQ=255)
aaTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAaga < 2:2034476/93‑1 (MQ=255)
aaTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAaga < 1:3182281/93‑1 (MQ=255)
aaTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAaga < 2:3833571/93‑1 (MQ=255)
aTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAagag < 1:5604024/93‑1 (MQ=255)
gCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCg < 1:3397112/93‑1 (MQ=255)
cTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGt < 2:1634052/93‑1 (MQ=255)
cTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGt > 2:4562110/1‑93 (MQ=255)
tGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCgggt > 1:5415244/1‑91 (MQ=255)
tGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGtt < 2:3249152/93‑1 (MQ=255)
tGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGtt > 2:5369969/1‑93 (MQ=255)
ggCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGttt < 1:1196861/93‑1 (MQ=255)
ggCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGttt > 1:5065532/1‑93 (MQ=255)
gCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTc > 1:1794470/1‑93 (MQ=255)
gCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTc < 2:2501090/93‑1 (MQ=255)
cTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCt < 1:3538590/93‑1 (MQ=255)
tGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTg > 1:106291/1‑93 (MQ=255)
gCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGc > 2:416641/1‑93 (MQ=255)
cATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCa > 2:3454761/1‑93 (MQ=255)
aTACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCAc > 2:3118509/1‑93 (MQ=255)
tACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCAcc < 2:2727876/93‑1 (MQ=255)
tACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCAcc > 1:4491564/1‑93 (MQ=255)
tACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCAcc > 1:4776762/1‑93 (MQ=255)
tACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGGTTCTGCAcc > 1:193729/1‑93 (MQ=255)
cGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTg > 1:1777963/1‑93 (MQ=255)
tGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTgcgc > 2:1718479/1‑93 (MQ=255)
tGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTgcgc < 1:1232432/93‑1 (MQ=255)
gATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGGTGGGTTACCAGATGGTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTCCGcc > 2:4895506/1‑93 (MQ=255)
ttATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCcac < 2:5047659/93‑1 (MQ=255)
aTGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAg < 2:443573/93‑1 (MQ=255)
tggtggGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAgg > 2:1956131/1‑93 (MQ=255)
tggtggGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAgg > 1:5022680/1‑93 (MQ=255)
ggtggGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGt < 2:1819882/93‑1 (MQ=255)
ggtggGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGCGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGt > 2:2689064/1‑93 (MQ=255)
gtggGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTc < 1:5246909/93‑1 (MQ=255)
cGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCt < 1:1974706/93‑1 (MQ=255)
ggTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTg < 1:4519921/93‑1 (MQ=255)
ggTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGCGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTg > 1:1511635/1‑93 (MQ=255)
|
GTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGG‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTG > NC_000913/4005509‑4005687
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GG‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAAA > NC_000913/4005508‑4005694
|
CGTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATTCGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GG‑C > SRR4302532.3610611/1‑94 (MQ=60)
TAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GG‑Cct > SRR4302532.1241285/1‑92 (MQ=60)
TAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GG‑Cct > SRR4302532.5199712/1‑92 (MQ=60)
TAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GG‑Cct < SRR4302532.6045556/94‑3 (MQ=60)
GGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTAT < SRR4302532.5731743/94‑1 (MQ=60)
GTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATC > SRR4302532.6283943/1‑94 (MQ=60)
TTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCT < SRR4302532.1413493/94‑1 (MQ=60)
TTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGCGC‑GGT‑GGCCTGTATCT < SRR4302532.3096071/94‑1 (MQ=60)
TTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGC‑GGCCTGTATCTC > SRR4302532.3594419/1‑94 (MQ=60)
TGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGG‑GGT‑GGCCTGTATCTCT > SRR4302532.4541681/1‑94 (MQ=60)
TGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCT < SRR4302532.1510851/94‑1 (MQ=60)
TGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCT < SRR4302532.3241327/94‑1 (MQ=60)
GGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTG > SRR4302532.6041927/1‑94 (MQ=60)
GCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCT > SRR4302532.3642436/1‑94 (MQ=60)
GCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCT < SRR4302532.6304736/94‑1 (MQ=60)
GCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCT > SRR4302532.4468998/1‑94 (MQ=60)
GCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCT < SRR4302532.5279570/94‑1 (MQ=60)
CTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTG > SRR4302532.4377657/1‑94 (MQ=60)
CTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTG > SRR4302532.723081/1‑94 (MQ=60)
CTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTG > SRR4302532.5258567/1‑94 (MQ=60)
CTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTG < SRR4302532.941362/94‑1 (MQ=60)
TGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGG > SRR4302532.6359849/1‑94 (MQ=60)
TGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGG > SRR4302532.4390995/1‑94 (MQ=60)
GGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGA < SRR4302532.2064799/94‑1 (MQ=60)
GGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGAT > SRR4302532.1817272/1‑94 (MQ=60)
GGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGAT < SRR4302532.6285565/94‑1 (MQ=60)
GATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATG > SRR4302532.857771/1‑94 (MQ=60)
ATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGG < SRR4302532.389106/94‑1 (MQ=60)
ATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGG < SRR4302532.3181636/94‑1 (MQ=60)
TTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGG < SRR4302532.4018087/94‑1 (MQ=60)
TTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGG > SRR4302532.739298/1‑94 (MQ=60)
TGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGT < SRR4302532.3799064/94‑1 (MQ=60)
CGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTA > SRR4302532.2878107/1‑94 (MQ=60)
GCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTTTCTCTGCTGGGTGGGTTAC > SRR4302532.542318/1‑94 (MQ=60)
GCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTAC > SRR4302532.5507312/1‑94 (MQ=60)
TGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCA > SRR4302532.5248458/1‑94 (MQ=60)
GCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAG > SRR4302532.6086508/1‑94 (MQ=60)
CTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGA < SRR4302532.5842344/94‑1 (MQ=60)
TTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGAT > SRR4302532.3759774/1‑94 (MQ=60)
TGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGCTGGGTTACAAGATG > SRR4302532.2238095/1‑94 (MQ=60)
TGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATG > SRR4302532.2687963/1‑94 (MQ=60)
GGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGC < SRR4302532.909684/94‑1 (MQ=60)
GGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGC > SRR4302532.1725704/1‑94 (MQ=60)
GCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCT > SRR4302532.3814928/1‑94 (MQ=60)
GCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCT < SRR4302532.388149/94‑1 (MQ=60)
GCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCT > SRR4302532.6146960/1‑94 (MQ=60)
GCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGGTACCAGATTCT > SRR4302532.2155953/1‑94 (MQ=60)
GCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGAGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCT < SRR4302532.388151/94‑1 (MQ=60)
CCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTA > SRR4302532.2049520/1‑94 (MQ=60)
CCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTA > SRR4302532.3088128/1‑94 (MQ=60)
CCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCAGCTGGATGGGTTACCAGATGCTA > SRR4302532.3618097/1‑94 (MQ=60)
CTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTAC > SRR4302532.5404121/1‑94 (MQ=60)
CTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTAC > SRR4302532.860451/1‑94 (MQ=60)
GCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGT < SRR4302532.2911342/94‑1 (MQ=60)
GCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGT > SRR4302532.1390043/1‑94 (MQ=60)
CATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTG < SRR4302532.1818293/94‑1 (MQ=60)
CATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTG < SRR4302532.392655/94‑1 (MQ=60)
CATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTG > SRR4302532.1206807/1‑94 (MQ=60)
CATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTG > SRR4302532.963914/1‑94 (MQ=60)
ATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTCCCAGATGGTACGTGG > SRR4302532.3742470/1‑94 (MQ=60)
ATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGG > SRR4302532.1025693/1‑94 (MQ=60)
TGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGC > SRR4302532.3161570/1‑94 (MQ=60)
TGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGC < SRR4302532.1083285/94‑1 (MQ=60)
TGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGA > SRR4302532.6338986/1‑94 (MQ=60)
TGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGG‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTAGCAGATGCTACGTGGTGC > SRR4302532.2397215/1‑94 (MQ=60)
ATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCAC > SRR4302532.3758093/1‑94 (MQ=60)
ATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCAC > SRR4302532.1619791/1‑94 (MQ=60)
TTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACT < SRR4302532.5517789/94‑1 (MQ=60)
TATCGAAAAAATGGCCTGGCTACATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTCCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTG < SRR4302532.5345150/94‑1 (MQ=60)
ATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGA > SRR4302532.3227696/1‑94 (MQ=60)
ATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGA > SRR4302532.2780660/1‑94 (MQ=60)
ATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGA < SRR4302532.4309592/94‑1 (MQ=60)
ATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGC‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGACACCAGATGCTACGTGGCGCACTGA > SRR4302532.656222/1‑94 (MQ=60)
TCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAA < SRR4302532.1035852/94‑1 (MQ=60)
CGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGGTTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAA > SRR4302532.3816837/1‑94 (MQ=60)
CGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAA > SRR4302532.1524710/1‑94 (MQ=60)
GAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAA < SRR4302532.4159032/94‑1 (MQ=60)
GAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGG‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGCTACCAGATGCTATGGGGTGGACTGAAAA > SRR4302532.2530098/1‑94 (MQ=60)
AAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCTGTT‑GC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAA < SRR4302532.2866277/94‑1 (MQ=60)
AAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAA < SRR4302532.885722/94‑1 (MQ=60)
AAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAG < SRR4302532.4365637/94‑1 (MQ=60)
AAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAG < SRR4302532.4154997/94‑1 (MQ=60)
AAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGGGCACTGAAAAAAGA > SRR4302532.5552563/1‑94 (MQ=60)
AATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAG > SRR4302532.6323644/1‑94 (MQ=60)
AATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAG < SRR4302532.3287959/94‑1 (MQ=60)
AATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAG > SRR4302532.3426618/1‑94 (MQ=60)
AATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGCGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGTTGGGGTACCAGATGCTACGGGGGGCCCTGAAAAAAGAG > SRR4302532.5010463/1‑94 (MQ=60)
ATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGG < SRR4302532.5798547/94‑1 (MQ=60)
TGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGC < SRR4302532.155076/94‑1 (MQ=60)
GGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCG > SRR4302532.5285752/1‑94 (MQ=60)
GGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCG < SRR4302532.993481/94‑1 (MQ=60)
GCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGG < SRR4302532.3510823/94‑1 (MQ=60)
CCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGT > SRR4302532.1909600/1‑94 (MQ=60)
CCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGT > SRR4302532.5135111/1‑94 (MQ=60)
CTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGT‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTT < SRR4302532.4847339/94‑1 (MQ=60)
CTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTT < SRR4302532.5505547/94‑1 (MQ=60)
CTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGGT > SRR4302532.5602896/1‑94 (MQ=60)
TGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGTCGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTT < SRR4302532.5610335/94‑1 (MQ=60)
TGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTT > SRR4302532.5239515/1‑94 (MQ=60)
TGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTT > SRR4302532.1890412/1‑94 (MQ=60)
GGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTC < SRR4302532.128139/94‑1 (MQ=60)
GGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTC < SRR4302532.1240105/94‑1 (MQ=60)
GGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTC > SRR4302532.1854398/1‑94 (MQ=60)
GGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTC < SRR4302532.1236880/94‑1 (MQ=60)
CTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTG < SRR4302532.3656977/94‑1 (MQ=60)
CTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTG > SRR4302532.109959/1‑94 (MQ=60)
TGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGC > SRR4302532.1841243/1‑94 (MQ=60)
GCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCA > SRR4302532.3903602/1‑94 (MQ=60)
GCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCA < SRR4302532.2772311/94‑1 (MQ=60)
ATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACC > SRR4302532.4097005/1‑94 (MQ=60)
ATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACC > SRR4302532.4644886/1‑94 (MQ=60)
ATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACC > SRR4302532.4941258/1‑94 (MQ=60)
ATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACC > SRR4302532.4644887/1‑94 (MQ=60)
ATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGGTTCTGCACC > SRR4302532.200268/1‑94 (MQ=60)
ACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTG < SRR4302532.4605926/94‑1 (MQ=60)
ACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTG > SRR4302532.1837462/1‑94 (MQ=60)
TGATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCC < SRR4302532.1273669/94‑1 (MQ=60)
GATTATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCA > SRR4302532.5005456/1‑94 (MQ=60)
ATGGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGG > SRR4302532.5194950/1‑94 (MQ=60)
GGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTC < SRR4302532.2225472/94‑1 (MQ=60)
GGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTC < SRR4302532.3737225/94‑1 (MQ=60)
GGTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTC < SRR4302532.2035909/94‑1 (MQ=60)
GTGGGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCG < SRR4302532.5427772/94‑1 (MQ=60)
GGC‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGCGC > SRR4302532.4597611/1‑94 (MQ=60)
C‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTG < SRR4302532.3869111/94‑1 (MQ=60)
C‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTG < SRR4302532.2040303/94‑1 (MQ=60)
C‑GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGCGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTG > SRR4302532.1562686/1‑94 (MQ=60)
GGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGG < SRR4302532.4674216/94‑1 (MQ=60)
GT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGC > SRR4302532.741326/1‑94 (MQ=60)
GT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGC < SRR4302532.2452798/94‑1 (MQ=60)
GT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGC < SRR4302532.2206956/94‑1 (MQ=60)
C‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAA > SRR4302532.908659/1‑94 (MQ=60)
CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAAA < SRR4302532.5408030/94‑1 (MQ=60)
CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAAA < SRR4302532.5408029/94‑1 (MQ=60)
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CGTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGC‑GGT‑GG‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAAA > NC_000913/4005508‑4005694
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
