Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
593 |
264.2 |
13311096 |
97.8% |
13018251 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,005,601 |
+C |
coding (237/282 nt) |
b4568 → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,005,600 | 1 | . | C | 99.6%
| 845.4
/ ‑4.0
| 231 | coding (236/282 nt) | b4568 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/0); new base C (119/111); total (120/111) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.71e-01 |
Only 100 of 246 total aligned reads displayed.
GTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGG‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGC > NC_000913/4005509‑4005689
|
gTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGG‑c < 1:4639076/93‑1 (MQ=255)
gTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGG‑c > 2:4880620/1‑93 (MQ=255)
gTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGG‑c > 1:3242221/1‑93 (MQ=255)
tAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGG‑cc > 2:575607/1‑92 (MQ=255)
tAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGG‑cc < 2:2184606/93‑2 (MQ=255)
tAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGGGG‑cc > 1:3945879/1‑92 (MQ=255)
aTGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGG‑cctg < 2:5711777/93‑4 (MQ=255)
gTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTAt > 1:1724090/1‑93 (MQ=255)
tGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTAtctc < 2:2305670/93‑1 (MQ=255)
gggCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATctct > 2:1271151/1‑93 (MQ=255)
gCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTctgc < 1:4901647/93‑1 (MQ=255)
gCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTctgc < 2:4102921/93‑1 (MQ=255)
cTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTctgct > 2:3915832/1‑93 (MQ=255)
tGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTctgctg < 2:94205/93‑1 (MQ=255)
gggATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTgg > 2:3696015/1‑93 (MQ=255)
gggATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTgg > 1:3060531/1‑93 (MQ=255)
gggATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTgg > 2:6483974/1‑93 (MQ=255)
ggATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGa > 1:2098229/1‑93 (MQ=255)
gATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGAt > 1:5036915/1‑93 (MQ=255)
gATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGAt > 1:3577241/1‑93 (MQ=255)
tGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATggg > 1:4168399/1‑93 (MQ=255)
gcgcTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGt > 1:6294584/1‑93 (MQ=255)
gctgctTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTa > 2:4301986/1‑93 (MQ=255)
gctgctTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTa > 2:6475184/1‑93 (MQ=255)
ctgctTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTAc > 1:115484/1‑93 (MQ=255)
tGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGAt > 2:2894527/1‑93 (MQ=255)
tGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGAt < 2:208313/93‑1 (MQ=255)
tGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGAt < 2:3802844/93‑1 (MQ=255)
ggCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATg > 2:1899518/1‑93 (MQ=255)
gCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGc < 1:2619779/93‑1 (MQ=255)
gCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGc > 2:1521840/1‑93 (MQ=255)
gCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGc > 1:5895128/1‑93 (MQ=255)
ccTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCt < 2:6319495/93‑1 (MQ=255)
cTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTCCCAGATGCTa < 1:1007574/93‑1 (MQ=255)
cTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTa < 2:2527049/93‑1 (MQ=255)
cTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTa > 2:396388/1‑93 (MQ=255)
tGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTAc > 1:2712377/1‑93 (MQ=255)
tGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTAc > 1:4202923/1‑93 (MQ=255)
tGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTAc > 1:1397297/1‑93 (MQ=255)
tGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGGTACCCGATGCTag > 2:4707630/1‑92 (MQ=255)
cATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgt > 1:5530643/1‑93 (MQ=255)
cATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgt < 1:2627815/93‑1 (MQ=255)
aTTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgtg > 2:5991753/1‑93 (MQ=255)
aTTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTAACAGATGCTACgtg > 2:3656627/1‑93 (MQ=255)
ttGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgtggt < 2:3541426/93‑1 (MQ=255)
ttGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgggga > 1:5105627/1‑92 (MQ=255)
tGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgtggtg < 1:568933/93‑1 (MQ=255)
taTTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGc < 1:1607883/92‑1 (MQ=255)
aTTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCa < 1:527623/93‑1 (MQ=255)
aTTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCa > 2:3255036/1‑93 (MQ=255)
ttATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCAc > 2:2859799/1‑93 (MQ=255)
ttATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCAc > 1:1518039/1‑93 (MQ=255)
ttATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCAc < 2:1344418/93‑1 (MQ=255)
tATCGAAAAAAAGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACt < 2:208926/93‑1 (MQ=255)
aTCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTg < 2:5184053/93‑1 (MQ=255)
gAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGaaa < 1:442941/93‑1 (MQ=255)
aaaaaaTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGaaaa < 2:84845/93‑1 (MQ=255)
aaaaaaTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGaaaa > 2:5458234/1‑93 (MQ=255)
aaaaaTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGaaaaa > 1:5633115/1‑93 (MQ=255)
aaaaTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGaaaaaa > 1:6101193/1‑93 (MQ=255)
aaaTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAag < 1:906781/93‑1 (MQ=255)
aaTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTGTGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAaga < 2:5029157/93‑1 (MQ=255)
aaTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAaga < 2:2685754/93‑1 (MQ=255)
aaTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAaga < 1:4718726/93‑1 (MQ=255)
aaTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAaga < 2:1709017/93‑1 (MQ=255)
aTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAagag < 2:3936112/93‑1 (MQ=255)
tGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAgg < 2:1963173/93‑1 (MQ=255)
tGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAgg > 1:2161913/1‑93 (MQ=255)
cTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGt > 2:4147716/1‑93 (MQ=255)
tGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGtt > 2:3723398/1‑93 (MQ=255)
tGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGtt < 1:829984/93‑1 (MQ=255)
gCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTc > 1:2278422/1‑93 (MQ=255)
cTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCt > 2:4416573/1‑93 (MQ=255)
cTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCt < 2:2975101/93‑1 (MQ=255)
cTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCt < 2:3486424/93‑1 (MQ=255)
tGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTg > 1:1756885/1‑93 (MQ=255)
gCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGc > 2:4906861/1‑93 (MQ=255)
aTACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCAc < 1:3774366/93‑1 (MQ=255)
aTACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCAc < 1:6608487/93‑1 (MQ=255)
cGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTg < 1:6390294/93‑1 (MQ=255)
cGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTg > 1:2854425/1‑93 (MQ=255)
gCTGATTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTgc < 2:5525049/93‑1 (MQ=255)
aTTATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCca > 1:4110602/1‑93 (MQ=255)
ttATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCcac > 1:6013884/1‑93 (MQ=255)
ttATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCcac > 1:4519091/1‑93 (MQ=255)
tATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCcaca > 1:4125640/1‑93 (MQ=255)
tATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCcaca < 1:718532/93‑1 (MQ=255)
tATGGTGGGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCcaca < 1:522525/93‑1 (MQ=255)
tggtggGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGGTGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGGTTCTGCACCTGCGCCACAgg > 1:1969414/1‑93 (MQ=255)
ggtggGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGt < 2:1173112/93‑1 (MQ=255)
ggtggGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGt < 1:5768668/93‑1 (MQ=255)
ggtggGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGt > 2:4759050/1‑93 (MQ=255)
gtggGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTc > 1:2462278/1‑93 (MQ=255)
tggGCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCg > 2:6112889/1‑93 (MQ=255)
ggCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAg > 1:3326127/1‑93 (MQ=255)
ggCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAg > 2:3289787/1‑93 (MQ=255)
gCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGc < 2:6384512/93‑1 (MQ=255)
gCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGc > 1:248800/1‑93 (MQ=255)
gCGGTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGc > 1:1249295/1‑93 (MQ=255)
ggTGGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTg < 2:5833779/93‑1 (MQ=255)
|
GTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGG‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGC > NC_000913/4005509‑4005689
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGG‑C‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAAA > NC_000913/4005508‑4005694
|
CGTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGG‑C > SRR4302547.3306932/1‑94 (MQ=60)
GTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGG‑C‑C > SRR4302547.2669495/1‑94 (MQ=60)
GTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGG‑C‑C < SRR4302547.4735162/94‑1 (MQ=60)
AATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGG‑Cctg < SRR4302547.4066431/94‑4 (MQ=60)
GGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTAT > SRR4302547.1757981/1‑94 (MQ=60)
GGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTAT < SRR4302547.4118645/94‑1 (MQ=60)
GTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGG‑Cctgtatt > SRR4302547.600225/1‑87 (MQ=60)
TTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCT < SRR4302547.4465141/94‑1 (MQ=60)
TGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCT < SRR4302547.5923988/94‑1 (MQ=60)
GGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTG > SRR4302547.4536090/1‑94 (MQ=60)
GGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTG < SRR4302547.3901588/94‑1 (MQ=60)
GGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGC > SRR4302547.3030592/1‑94 (MQ=60)
GCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCT < SRR4302547.5003143/94‑1 (MQ=60)
TGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGG > SRR4302547.3121411/1‑94 (MQ=60)
TGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGG < SRR4302547.61110/94‑1 (MQ=60)
GGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGA > SRR4302547.2140054/1‑94 (MQ=60)
GGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGAT > SRR4302547.5140950/1‑94 (MQ=60)
GGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGAT > SRR4302547.3650209/1‑94 (MQ=60)
GATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATG < SRR4302547.5207391/94‑1 (MQ=60)
GATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAAGGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATG < SRR4302547.2891292/94‑1 (MQ=60)
GATTCCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATAATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATG < SRR4302547.1770245/94‑1 (MQ=60)
TTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGG > SRR4302547.4253298/1‑94 (MQ=60)
TGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGT > SRR4302547.6425432/1‑94 (MQ=60)
TGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGT < SRR4302547.713047/94‑1 (MQ=60)
GCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTAC > SRR4302547.117584/1‑94 (MQ=60)
GCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTAC > SRR4302547.6670033/1‑94 (MQ=60)
CTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACC < SRR4302547.2738752/94‑1 (MQ=60)
CTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACC < SRR4302547.4538534/94‑1 (MQ=60)
TGCTTGCCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCA < SRR4302547.917140/94‑1 (MQ=60)
CTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGA > SRR4302547.2175064/1‑94 (MQ=60)
TTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGAT < SRR4302547.2127505/94‑1 (MQ=60)
GGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGC > SRR4302547.6017197/1‑94 (MQ=60)
GCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCT < SRR4302547.2672565/94‑1 (MQ=60)
GCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCT < SRR4302547.1761658/94‑1 (MQ=60)
CCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTA > SRR4302547.2533788/1‑94 (MQ=60)
CCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTA < SRR4302547.163072/94‑1 (MQ=60)
CCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTA > SRR4302547.2602080/1‑94 (MQ=60)
CCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTA > SRR4302547.5328147/1‑94 (MQ=60)
CTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTCCCAGATGCTAC < SRR4302547.1027248/94‑1 (MQ=60)
CTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTAC > SRR4302547.4288663/1‑94 (MQ=60)
CTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTAC > SRR4302547.2766830/1‑94 (MQ=60)
CTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTAC > SRR4302547.1425250/1‑94 (MQ=60)
CTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTAC > SRR4302547.6176335/1‑94 (MQ=60)
TGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACG < SRR4302547.1363321/94‑1 (MQ=60)
GCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGT < SRR4302547.1793516/94‑1 (MQ=60)
GCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGT > SRR4302547.5644799/1‑94 (MQ=60)
GCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCCGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGT > SRR4302547.1008068/1‑94 (MQ=60)
CATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTG < SRR4302547.2680745/94‑1 (MQ=60)
CATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTG > SRR4302547.4788354/1‑94 (MQ=60)
CATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTG > SRR4302547.6384532/1‑94 (MQ=60)
ATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGG < SRR4302547.6280181/94‑1 (MQ=60)
TTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGggga > SRR4302547.5210850/1‑90 (MQ=60)
TTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTG < SRR4302547.3728575/94‑1 (MQ=60)
TTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTG < SRR4302547.2073030/94‑1 (MQ=60)
TGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGC > SRR4302547.5867897/1‑94 (MQ=60)
TGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGC < SRR4302547.579159/94‑1 (MQ=60)
TATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCA < SRR4302547.1639754/94‑1 (MQ=60)
ATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCAC < SRR4302547.537161/94‑1 (MQ=60)
ATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCAC < SRR4302547.5111318/94‑1 (MQ=60)
ATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCAC > SRR4302547.4147947/1‑94 (MQ=60)
ATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCAC > SRR4302547.1548275/1‑94 (MQ=60)
TATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTG > SRR4302547.79699/1‑94 (MQ=60)
ATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGA < SRR4302547.5602654/94‑1 (MQ=60)
TCGAAAAAATGGCCTGTCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAA < SRR4302547.2726658/94‑1 (MQ=60)
TCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAA < SRR4302547.4195120/94‑1 (MQ=60)
CGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAA > SRR4302547.5434553/1‑94 (MQ=60)
GAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAA < SRR4302547.451191/94‑1 (MQ=60)
AAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAA > SRR4302547.5749369/1‑94 (MQ=60)
AAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAA > SRR4302547.3211029/1‑94 (MQ=60)
AAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAA > SRR4302547.6227740/1‑94 (MQ=60)
AAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGA > SRR4302547.586786/1‑94 (MQ=60)
AAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGA < SRR4302547.924259/94‑1 (MQ=60)
AATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAG > SRR4302547.1732219/1‑94 (MQ=60)
AATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAG < SRR4302547.4816439/94‑1 (MQ=60)
AATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGG‑CATGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAG > SRR4302547.2309989/1‑94 (MQ=60)
ATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGG > SRR4302547.2205122/1‑94 (MQ=60)
ATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGG < SRR4302547.5335568/94‑1 (MQ=60)
TGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGG > SRR4302547.3103531/1‑94 (MQ=60)
TGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGC < SRR4302547.981949/94‑1 (MQ=60)
GGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCTGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCG < SRR4302547.755913/94‑1 (MQ=60)
GGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCG < SRR4302547.4258082/94‑1 (MQ=60)
GGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGGTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCG > SRR4302547.4525844/1‑94 (MQ=60)
TGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTT < SRR4302547.845834/94‑1 (MQ=60)
GGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTC > SRR4302547.2324524/1‑94 (MQ=60)
CTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTG > SRR4302547.4738926/1‑94 (MQ=60)
CTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTG > SRR4302547.4622884/1‑94 (MQ=60)
CTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTG > SRR4302547.1791674/1‑94 (MQ=60)
CTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGGTTCTG > SRR4302547.2479332/1‑94 (MQ=60)
CTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGCTACCAGATGCTACCTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGCTTCTG > SRR4302547.1242445/1‑94 (MQ=60)
TGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGC < SRR4302547.5731772/94‑1 (MQ=60)
CATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCAC > SRR4302547.5220125/1‑94 (MQ=60)
ATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACC < SRR4302547.3851342/94‑1 (MQ=60)
ATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACC < SRR4302547.6746054/94‑1 (MQ=60)
TACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCT > SRR4302547.4218984/1‑94 (MQ=60)
TACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCT > SRR4302547.6482440/1‑94 (MQ=60)
TACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCT < SRR4302547.3800795/94‑1 (MQ=60)
ACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTG > SRR4302547.2911461/1‑94 (MQ=60)
ACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTG > SRR4302547.336632/1‑94 (MQ=60)
ACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTG < SRR4302547.4269048/94‑1 (MQ=60)
CGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGC < SRR4302547.2678129/94‑1 (MQ=60)
CGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGC < SRR4302547.6523632/94‑1 (MQ=60)
CGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGC < SRR4302547.2212825/94‑1 (MQ=60)
CGCTGATTATGGTGCGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGC < SRR4302547.6715423/94‑1 (MQ=60)
TGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCC > SRR4302547.5804220/1‑94 (MQ=60)
GATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCA > SRR4302547.3611532/1‑94 (MQ=60)
GATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCA > SRR4302547.5060925/1‑94 (MQ=60)
GATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCA > SRR4302547.4194163/1‑94 (MQ=60)
ATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCAC > SRR4302547.6138702/1‑94 (MQ=60)
ATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCAC > SRR4302547.4612449/1‑94 (MQ=60)
TTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACA > SRR4302547.4209547/1‑94 (MQ=60)
TATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAG < SRR4302547.731869/94‑1 (MQ=60)
TATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAG < SRR4302547.531991/94‑1 (MQ=60)
TATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAG < SRR4302547.4837753/94‑1 (MQ=60)
ATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGGTGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGGTTCTGCACCTGCGCCACAGG > SRR4302547.2008533/1‑94 (MQ=60)
ATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGG > SRR4302547.1360864/1‑94 (MQ=60)
GGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTC > SRR4302547.2512047/1‑94 (MQ=60)
GGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTC < SRR4302547.5887976/94‑1 (MQ=60)
GTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCG < SRR4302547.1028282/94‑1 (MQ=60)
TGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGA > SRR4302547.3380902/1‑94 (MQ=60)
GGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAG > SRR4302547.1439913/1‑94 (MQ=60)
GGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAG > SRR4302547.3393336/1‑94 (MQ=60)
GGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGC > SRR4302547.253455/1‑94 (MQ=60)
GGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGC > SRR4302547.1274507/1‑94 (MQ=60)
CGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTG < SRR4302547.1557198/94‑1 (MQ=60)
GGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGG > SRR4302547.1611634/1‑94 (MQ=60)
GGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGG > SRR4302547.3846052/1‑94 (MQ=60)
GTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGC > SRR4302547.4188759/1‑94 (MQ=60)
TGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCG < SRR4302547.2634814/94‑1 (MQ=60)
TGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCG < SRR4302547.1303713/94‑1 (MQ=60)
ggcC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGA < SRR4302547.6289866/91‑1 (MQ=60)
ggcC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGA > SRR4302547.2904435/4‑94 (MQ=60)
ggcC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGA < SRR4302547.5900329/91‑1 (MQ=60)
C‑C‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAA > SRR4302547.3510905/1‑94 (MQ=60)
C‑C‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAA < SRR4302547.6704873/94‑1 (MQ=60)
C‑C‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAA > SRR4302547.4759715/1‑94 (MQ=60)
C‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAAA > SRR4302547.3602628/1‑94 (MQ=60)
C‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGGTTCTGGACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAAA > SRR4302547.6539198/1‑94 (MQ=60)
|
CGTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGG‑C‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAAA > NC_000913/4005508‑4005694
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
