Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
521 |
238.2 |
12299412 |
96.0% |
11807435 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,277,306 |
A→G |
I417V (ATT→GTT) |
yjcD → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,277,306 | 0 | A | G | 93.0%
| 715.6
/ 25.2
| 230 | I417V (ATT→GTT) | yjcD | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (12/4); new base G (102/112); total (114/116) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.02e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 |
Only 100 of 248 total aligned reads displayed.
TGATGCGATGGCGGGTCTGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGATTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTTCTATGCGGGTGGCTG > NC_000913/4277215‑4277397
|
gATGCGATGGCGGGTCTGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGtt < 2:3680281/93‑1 (MQ=255)
gATGCGATGGCGGGTCTGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGtt < 1:3998369/93‑1 (MQ=255)
aTGCGATGGCGGGTCTGGTTACGTCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTg < 1:2001029/93‑1 (MQ=255)
aTGCGATGGCGGGTCTGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTg < 1:1667627/93‑1 (MQ=255)
gCGATGGCGGGTCTGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGtggttggt > 2:227131/1‑93 (MQ=255)
gCGATGGCGGGTCTGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGtggttggt > 2:4876462/1‑93 (MQ=255)
cGATGGCGGGTCTGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGgtc > 2:678038/1‑93 (MQ=255)
gATGGCGGGTCTGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGgtcg < 1:4555784/93‑1 (MQ=255)
aTGGCGGGTCTGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGATTTgtcgt > 1:5149438/1‑93 (MQ=255)
tGGCGGGTCTTGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGgtcgtc < 2:1243368/93‑1 (MQ=255)
ggCGGGTCTGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCt < 2:3812019/93‑1 (MQ=255)
cGGGTCTGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTgg < 2:5530237/93‑1 (MQ=255)
gggTCTGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGt < 1:5156330/93‑1 (MQ=255)
ggTCTGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGtt > 2:1623782/1‑93 (MQ=255)
ggTCTGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGtt < 1:108549/93‑1 (MQ=255)
tCTGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTc > 2:778261/1‑93 (MQ=255)
tCTGGTTACAGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTc > 1:3988771/1‑93 (MQ=255)
ggTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTcccg > 1:1135862/1‑91 (MQ=255)
ggTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCgg > 2:2281667/1‑93 (MQ=255)
ggTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCgg > 1:1539666/1‑93 (MQ=255)
gTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGc < 2:3377900/93‑1 (MQ=255)
ttACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCg > 1:2866075/1‑93 (MQ=255)
ttACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCg > 2:1097823/1‑93 (MQ=255)
ttACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCg > 2:4206275/1‑93 (MQ=255)
ggCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATg < 1:4874703/93‑1 (MQ=255)
gCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATgg > 1:5315836/1‑93 (MQ=255)
cTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGgc < 2:1002740/93‑1 (MQ=255)
cTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGgc > 2:5431189/1‑93 (MQ=255)
gTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGgcgc > 2:6077818/1‑93 (MQ=255)
gTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGgagc > 2:3425379/1‑93 (MQ=255)
tATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCa > 2:1435316/1‑93 (MQ=255)
tATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCa < 2:5223048/93‑1 (MQ=255)
aTTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCaa > 2:5950988/1‑93 (MQ=255)
aTTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTAGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCaa > 1:1859486/1‑93 (MQ=255)
ttCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAg > 2:2928691/1‑93 (MQ=255)
ttCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAg < 2:205435/93‑1 (MQ=255)
ttCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAg < 1:2331251/93‑1 (MQ=255)
tCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGt < 1:2076568/93‑1 (MQ=255)
cATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGtt < 1:1586218/93‑1 (MQ=255)
cATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGATTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGtt > 1:3319872/1‑93 (MQ=255)
aTCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGtta > 1:364378/1‑92 (MQ=255)
aTCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTg > 1:2997666/1‑93 (MQ=255)
tCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGa > 2:6081237/1‑93 (MQ=255)
gTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAAc < 2:1810429/93‑1 (MQ=255)
gTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAAc > 1:1010015/1‑93 (MQ=255)
gCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACAt < 1:5021573/93‑1 (MQ=255)
cTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATc > 1:3753754/1‑93 (MQ=255)
tGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCg > 2:3271804/1‑93 (MQ=255)
aCCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGt < 2:4545398/93‑1 (MQ=255)
ccTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTa < 2:3908927/93‑1 (MQ=255)
tGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACg > 2:938875/1‑93 (MQ=255)
tGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACg > 1:1423224/1‑93 (MQ=255)
tGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGGACg > 1:4441541/1‑93 (MQ=255)
gTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACgg > 1:3849600/1‑93 (MQ=255)
gTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACgg < 2:3602459/93‑1 (MQ=255)
aaCATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAATTTGAACATCGGTACGGTc < 2:2683959/93‑1 (MQ=255)
aaCATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGATTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTc > 2:5511781/1‑93 (MQ=255)
tCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCGAGTTGAACATCGGTACGGGCGTTa > 1:2365056/1‑93 (MQ=255)
tCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTAGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTa > 2:515313/1‑93 (MQ=255)
cGTAACAGTCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTAt < 1:3593757/93‑1 (MQ=255)
cGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTAt < 1:4472462/93‑1 (MQ=255)
cGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTAt < 1:5778321/93‑1 (MQ=255)
cGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTAt < 2:2508488/93‑1 (MQ=255)
gTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATc > 1:245264/1‑93 (MQ=255)
aaCAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGc < 1:736704/93‑1 (MQ=255)
aaCAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGc < 1:1698609/93‑1 (MQ=255)
aCNGCCANCATAATCGGCTTCNCGACTCTGGTGATTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGcc < 2:3817080/93‑1 (MQ=255)
aCAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGcc > 1:4299265/1‑93 (MQ=255)
aCAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGcc > 1:4685688/1‑93 (MQ=255)
cAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCg < 1:1039390/93‑1 (MQ=255)
cAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCg < 2:1776449/93‑1 (MQ=255)
catcatGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGgc < 1:5905081/93‑1 (MQ=255)
catcatGAGCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGgc < 1:534918/93‑1 (MQ=255)
tcatGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGgcgc < 1:5695181/93‑1 (MQ=255)
tcatGATCGGCTTCGCGACTATGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGgcgc > 2:411510/1‑93 (MQ=255)
tGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTgg > 2:5617869/1‑93 (MQ=255)
gATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTggg > 2:5655061/1‑92 (MQ=255)
aTCGGCTTCGCGACTCTGGTGATTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTgggg > 2:5062489/1‑91 (MQ=255)
tCGGCTTCGCGACTCTGGTGATTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGa > 1:5562614/1‑93 (MQ=255)
cGGCTTCGCGACTCTTGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGAc < 1:1317387/93‑1 (MQ=255)
cGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGGCTGGTTTCCGACGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGAc < 1:4096706/93‑1 (MQ=255)
ggCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGAcc > 1:3115300/1‑93 (MQ=255)
gCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCt > 2:5010815/1‑93 (MQ=255)
tCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTTCt > 1:3808329/1‑93 (MQ=255)
cgcgACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTTCTa < 2:614965/93‑1 (MQ=255)
cgcgACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTTCTa < 2:3215416/93‑1 (MQ=255)
gcgACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTTCTAt > 2:2607830/1‑93 (MQ=255)
gACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTTCTATGc > 2:1866135/1‑93 (MQ=255)
gACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTTCTATGc < 2:211762/93‑1 (MQ=255)
aCTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTTCTATGCg > 2:5862951/1‑93 (MQ=255)
aCTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTTCTATGCg > 2:1946416/1‑93 (MQ=255)
aCTCTGGTGATTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTTCTATGCg < 1:2617474/93‑1 (MQ=255)
ctctGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTTCTATGCgg < 1:3125481/93‑1 (MQ=255)
tctGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTTCTATGCggg > 1:3235917/1‑93 (MQ=255)
tctGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTTCTATGCggg > 2:4642634/1‑93 (MQ=255)
tctGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCCGGTGACCTTCTATGCggg > 1:5413077/1‑93 (MQ=255)
tctGGTGATTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTTCTATGCggg > 1:85109/1‑93 (MQ=255)
ctGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTTCTATGCGGGt < 1:622527/93‑1 (MQ=255)
ggtggtTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTTCTATGCGGGTgg > 2:1725319/1‑93 (MQ=255)
gTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTTCTATGCGGGTGGc < 2:1347992/93‑1 (MQ=255)
|
TGATGCGATGGCGGGTCTGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGATTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTTCTATGCGGGTGGCTG > NC_000913/4277215‑4277397
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TTGATGCGATGGCGGGTCTGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGATTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTTCTATGCGGGTGGCTGG > NC_000913/4277214‑4277398
|
TTGATGCGATGGCGGGTCTGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTACCATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGT < SRR4302532.4560900/94‑1 (MQ=60)
TTGATGCGATGGCGGGTCTGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGAT > SRR4302532.67023/1‑94 (MQ=60)
TGATGCGATGGCGGGTCTGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGCCCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTT < SRR4302532.5687182/94‑1 (MQ=60)
GATGCGATGGCGGGTCTGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTG < SRR4302532.5235922/94‑1 (MQ=60)
GATGCGATGGCGGGTCTGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTG < SRR4302532.4133072/94‑1 (MQ=60)
ATGCGATGGCGGGTCTGGTTACGTCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGG < SRR4302532.2067719/94‑1 (MQ=60)
ATGCGATGGCGGGTCTGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGG < SRR4302532.1724070/94‑1 (MQ=60)
GCGATGGCGGGTCTGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTC < SRR4302532.6051231/94‑1 (MQ=60)
CGATGGCGGGTCTGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCG > SRR4302532.3980213/1‑94 (MQ=60)
GATGGCGGGTCTGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGT < SRR4302532.4711225/94‑1 (MQ=60)
GATGGCGGGTCTGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGGTGGTCGT > SRR4302532.2505980/1‑94 (MQ=60)
GATGGCGGGTCTGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGATTTGTCGT > SRR4302532.5326586/1‑94 (MQ=60)
GGCGGGTCTGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTG < SRR4302532.2034002/94‑1 (MQ=60)
CGGGTCTGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGT > SRR4302532.4494552/1‑94 (MQ=60)
CGGGTCTGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGT > SRR4302532.2886134/1‑94 (MQ=60)
CGGGTCTGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGT > SRR4302532.3756911/1‑94 (MQ=60)
GGGTCTGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTTACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGCCTCTGGCGGTTGGTCGTGTGGTT > SRR4302532.114127/1‑94 (MQ=60)
GGGTCTGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTT < SRR4302532.5333762/94‑1 (MQ=60)
GGGTCTGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTT > SRR4302532.1648914/1‑94 (MQ=60)
GGTCTGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTT < SRR4302532.112291/94‑1 (MQ=60)
GGTCTGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTT < SRR4302532.4962958/94‑1 (MQ=60)
GTCTGGTTACAGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTC > SRR4302532.4123127/1‑94 (MQ=60)
CTGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCG > SRR4302532.4518310/1‑94 (MQ=60)
TGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGG > SRR4302532.1591688/1‑94 (MQ=60)
TGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCCG > SRR4302532.1173754/1‑94 (MQ=60)
GGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGC > SRR4302532.1046790/1‑94 (MQ=60)
GTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCG > SRR4302532.2961940/1‑94 (MQ=60)
TCGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAAT < SRR4302532.4124806/94‑1 (MQ=60)
TCGGCTGTATTCAGCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAAT < SRR4302532.5354613/94‑1 (MQ=60)
GGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGG > SRR4302532.5499741/1‑94 (MQ=60)
GGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGG < SRR4302532.5042283/94‑1 (MQ=60)
CTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCG < SRR4302532.1599720/94‑1 (MQ=60)
TGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGC > SRR4302532.1272845/1‑94 (MQ=60)
GTATTCATCGTGCTGTCCTGTAACATCGTAACAGGGATCATGATCGTCTTCGCGACTCTTGCGGTTGGTCGTCTGGCTTCCGGTGAATGGCGCA > SRR4302532.3147436/1‑94 (MQ=60)
GTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCA > SRR4302532.3563567/1‑94 (MQ=60)
TATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTAGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAA > SRR4302532.1921124/1‑94 (MQ=60)
ATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAG < SRR4302532.4627438/94‑1 (MQ=60)
TTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGT < SRR4302532.1427363/94‑1 (MQ=60)
TTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGT < SRR4302532.2408905/94‑1 (MQ=60)
TCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTT < SRR4302532.2145791/94‑1 (MQ=60)
TCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGATTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTT > SRR4302532.3430570/1‑94 (MQ=60)
CATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTG < SRR4302532.1639900/94‑1 (MQ=60)
CATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTG > SRR4302532.3096693/1‑94 (MQ=60)
CATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTA > SRR4302532.377005/1‑94 (MQ=60)
CGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAAC > SRR4302532.1044355/1‑94 (MQ=60)
GTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACA < SRR4302532.5638437/94‑1 (MQ=60)
GTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACA > SRR4302532.5592892/1‑94 (MQ=60)
TGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACAT < SRR4302532.1099078/94‑1 (MQ=60)
GCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATC < SRR4302532.3837802/94‑1 (MQ=60)
GCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATC > SRR4302532.3879989/1‑94 (MQ=60)
GCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATC < SRR4302532.5193803/94‑1 (MQ=60)
CTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCG < SRR4302532.4182665/94‑1 (MQ=60)
CTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCG < SRR4302532.2912245/94‑1 (MQ=60)
GACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGT > SRR4302532.6336886/1‑94 (MQ=60)
ACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTA > SRR4302532.3058881/1‑94 (MQ=60)
ACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTA > SRR4302532.1970646/1‑94 (MQ=60)
ACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTA < SRR4302532.533297/94‑1 (MQ=60)
CCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTAC > SRR4302532.5207898/1‑94 (MQ=60)
CCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTAC > SRR4302532.5077059/1‑94 (MQ=60)
CCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTAC > SRR4302532.6026550/1‑94 (MQ=60)
CCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTAC < SRR4302532.2202945/94‑1 (MQ=60)
CCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGATTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTAC < SRR4302532.3978408/94‑1 (MQ=60)
CTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACG > SRR4302532.1471018/1‑94 (MQ=60)
CTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACG < SRR4302532.3822105/94‑1 (MQ=60)
CTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGGACG > SRR4302532.4592894/1‑94 (MQ=60)
CTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAACGGCGCAAGTTGAACATCGGTACG > SRR4302532.4642625/1‑94 (MQ=60)
TGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGG > SRR4302532.3979590/1‑94 (MQ=60)
TGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGG > SRR4302532.3223533/1‑94 (MQ=60)
AACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCG > SRR4302532.207012/1‑94 (MQ=60)
ATCGTGACATGCATCAGTATCGGCTTCGCGGCTCTGGTGATTGGTAGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTA < SRR4302532.5815576/94‑1 (MQ=60)
ATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCGAGTTGAACATCGGTACGGGCGTTA > SRR4302532.2443951/1‑94 (MQ=60)
TCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTAT < SRR4302532.1607668/94‑1 (MQ=60)
CGTAACAGTCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATC < SRR4302532.3713941/94‑1 (MQ=60)
CGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATC < SRR4302532.4624986/94‑1 (MQ=60)
CGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATC > SRR4302532.5587909/1‑94 (MQ=60)
CGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATC < SRR4302532.4196580/94‑1 (MQ=60)
CGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATC > SRR4302532.253762/1‑94 (MQ=60)
CGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATC < SRR4302532.5979324/94‑1 (MQ=60)
gttatAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGGGGTTTGTCTTCTGGTTTCCGGCGTATGGCGCAAGTTTAACATCGGTACGGTCGTTATCG > SRR4302532.5839022/6‑94 (MQ=60)
GTAACAGGCATCATTATCGGCTTCGCGACTCTGGTGATTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGCTGAACATCGGTACGGTCGTTATCG > SRR4302532.1495377/1‑94 (MQ=60)
GTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCG < SRR4302532.243719/94‑1 (MQ=60)
AACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCC < SRR4302532.5903022/94‑1 (MQ=60)
AACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCC > SRR4302532.3898442/1‑94 (MQ=60)
AACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCC < SRR4302532.761793/94‑1 (MQ=60)
AACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCC > SRR4302532.4845501/1‑94 (MQ=60)
AACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCC > SRR4302532.4444534/1‑94 (MQ=60)
AACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCC < SRR4302532.1755924/94‑1 (MQ=60)
AACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCC < SRR4302532.1755923/94‑1 (MQ=60)
ACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCG > SRR4302532.4592956/1‑94 (MQ=60)
CAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGT < SRR4302532.1074450/94‑1 (MQ=60)
GCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGC > SRR4302532.3350278/1‑94 (MQ=60)
CATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCG < SRR4302532.6109569/94‑1 (MQ=60)
CATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCG < SRR4302532.3325047/94‑1 (MQ=60)
CATCATGAGCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCG < SRR4302532.553558/94‑1 (MQ=60)
ATCATGATCGGCTTCGCGGCTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGC < SRR4302532.3323877/94‑1 (MQ=60)
ATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGT > SRR4302532.971449/1‑94 (MQ=60)
ATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGC > SRR4302532.4766475/1‑94 (MQ=60)
TCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCT < SRR4302532.5893863/94‑1 (MQ=60)
CATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTG > SRR4302532.320807/1‑94 (MQ=60)
ATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGG > SRR4302532.4001364/1‑94 (MQ=60)
ATGATCGGCTTCGCGACTCTGGCGATTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTAGCGCTGG > SRR4302532.5812275/1‑94 (MQ=60)
TGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGT < SRR4302532.2703108/94‑1 (MQ=60)
ATCGGCTTCGCGACTCTGGTGATTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGA > SRR4302532.5755753/1‑94 (MQ=60)
CGGCTTCGCGACTCTTGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACC < SRR4302532.1361430/94‑1 (MQ=60)
CGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACC > SRR4302532.3218672/1‑94 (MQ=60)
CGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACC < SRR4302532.42747/94‑1 (MQ=60)
CGGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGGCTGGTTTCCGACGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACC < SRR4302532.4234222/94‑1 (MQ=60)
CGGCTTCGCGACTCTGGTGATTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACC > SRR4302532.2249384/1‑94 (MQ=60)
GGCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCT > SRR4302532.1761946/1‑94 (MQ=60)
GGCTTCGCGACTCTGGTGATTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCT > SRR4302532.764340/1‑94 (MQ=60)
GCTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTT < SRR4302532.1455530/94‑1 (MQ=60)
CTTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTTC > SRR4302532.5522556/1‑94 (MQ=60)
TTCGCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTTCT > SRR4302532.3936909/1‑94 (MQ=60)
GCGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTTCTATG < SRR4302532.999493/94‑1 (MQ=60)
CGACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTTCTATGC < SRR4302532.1746810/94‑1 (MQ=60)
GACTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTTCTATGCG < SRR4302532.4986642/94‑1 (MQ=60)
ACTCTGGTGATTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTTCTATGCGG < SRR4302532.2705083/94‑1 (MQ=60)
CTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTTCTATGCGGG > SRR4302532.3343347/1‑94 (MQ=60)
CTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTTCTATGCGGG < SRR4302532.3229226/94‑1 (MQ=60)
CTCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCCGGTGACCTTCTATGCGGG > SRR4302532.5600629/1‑94 (MQ=60)
CTCTGGTGATTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTTCTATGCGGG > SRR4302532.88118/1‑94 (MQ=60)
TCTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTTCTATGCGGGT < SRR4302532.5839942/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTTCTATGCGGGTG < SRR4302532.644257/94‑1 (MQ=60)
TGGTTGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTTCTATGCGGGTGG < SRR4302532.5502999/94‑1 (MQ=60)
TGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTTCTATGCGGGTGG < SRR4302532.3645986/94‑1 (MQ=60)
TGGTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTTCTATGCGGGTGG < SRR4302532.3141703/94‑1 (MQ=60)
GTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTTCTATGCGGGTGGCT < SRR4302532.5341416/94‑1 (MQ=60)
GTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTTCTATGCGGGTGGCT < SRR4302532.678601/94‑1 (MQ=60)
GTGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTTCTATGCGGGTGGCT < SRR4302532.1134531/94‑1 (MQ=60)
TGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTTCTATGCGGGTGGCTG > SRR4302532.3305843/1‑94 (MQ=60)
TGGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTTCTATGCGGGTGGCTG > SRR4302532.2577916/1‑94 (MQ=60)
GGTTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTTCTATGCGGGTGGCTGG > SRR4302532.4641679/1‑94 (MQ=60)
GATTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTTCTATGCGGGTGGCTGG < SRR4302532.25060/94‑1 (MQ=60)
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TTGATGCGATGGCGGGTCTGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCTGGTGATTGGTCGTCTGGTTTCCGGCGAATGGCGCAAGTTGAACATCGGTACGGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTTCTATGCGGGTGGCTGG > NC_000913/4277214‑4277398
|
| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
