Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
593 |
264.2 |
13311096 |
97.8% |
13018251 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,014,440 |
C→T |
P103S (CCT→TCT) |
ymbA → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,014,440 | 0 | C | T | 80.9%
| 592.3
/ 117.8
| 246 | P103S (CCT→TCT) | ymbA | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (14/33); new base T (89/110); total (103/143) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.13e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.19e-01 |
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
TTGTGGGCCAGCCCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAGTGGTGAGTGG > NC_000913/1014350‑1014529
|
ttGTGGGCCAGCCCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTct < 2:1327554/93‑1 (MQ=255)
ttGTGGGCCAGCCCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTct > 2:1746350/1‑93 (MQ=255)
tgtgGGCCAGCCCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGtctc < 2:3542646/93‑1 (MQ=255)
tgtgGGCCAGCCCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGtctc < 2:6186645/93‑1 (MQ=255)
tgtgGGCCAGCCCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCctc > 1:2033810/1‑93 (MQ=255)
gtgGGCCAGCCCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCctct < 1:3746414/93‑1 (MQ=255)
tgGGCCAGCCCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTCCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTg > 2:1530850/1‑93 (MQ=255)
gggCCAGCCCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTgg > 1:3176599/1‑93 (MQ=255)
ggCCAGCCCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTggg > 1:6499157/1‑93 (MQ=255)
ggCCAGCCCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTggg > 2:2824920/1‑93 (MQ=255)
gCCAGCCCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCCTCTGGGa < 1:4780756/93‑1 (MQ=255)
ccAGCCCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCCTCTGGGaa < 1:6242952/93‑1 (MQ=255)
cAGCCCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAg > 1:1603137/1‑93 (MQ=255)
cAGCCCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGCGGTTCCCTCCCAGTCTCTGGGacg > 1:4301357/1‑91 (MQ=255)
aGCCCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAgc < 2:1126510/93‑1 (MQ=255)
aGCCCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAgc > 2:12203/1‑93 (MQ=255)
aGCCCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCCTCTGGGAAgc < 2:3207213/93‑1 (MQ=255)
gCCCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAgcg > 2:1620651/1‑93 (MQ=255)
gCCCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCCTCTGGGAAgcg < 2:4023272/93‑1 (MQ=255)
cccGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCCACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCCTCTGGGAAgcgc > 2:2508266/1‑93 (MQ=255)
cccGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAgcgc < 1:4754375/93‑1 (MQ=255)
cGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCCTCTGGGAAGCGccc < 1:3829068/93‑1 (MQ=255)
gTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCa < 1:5899917/93‑1 (MQ=255)
gTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCCTCTGGGAAGCGCCCa < 1:1906296/93‑1 (MQ=255)
ttGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAg > 2:4248597/1‑93 (MQ=255)
tGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAgg < 1:89684/93‑1 (MQ=255)
aTCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCCTCTGGGAAGCGCCCAGGaca < 2:2288208/93‑1 (MQ=255)
aTCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCCTCTGGGAAGCGCCCAGGaca < 2:4328972/93‑1 (MQ=255)
tCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGacac < 2:5583875/93‑1 (MQ=255)
tCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCCTCTGGGAAGCGCCCAGGacac < 2:3364795/93‑1 (MQ=255)
cAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACg > 2:3907318/1‑93 (MQ=255)
cAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACg < 1:5695198/93‑1 (MQ=255)
cAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACg > 2:5526166/1‑93 (MQ=255)
aCAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCt > 2:6115475/1‑93 (MQ=255)
aGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCa > 2:2456427/1‑93 (MQ=255)
gTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCaa > 2:6617287/1‑93 (MQ=255)
gTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCaa < 1:5984422/93‑1 (MQ=255)
ttGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAAt > 2:1275098/1‑93 (MQ=255)
ttGCCCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAAt < 1:2999938/93‑1 (MQ=255)
aaCACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTAcc < 2:256696/93‑1 (MQ=255)
aaCACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTAcc < 2:5441011/93‑1 (MQ=255)
acacCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCg > 2:1052317/1‑93 (MQ=255)
acacCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCg > 1:1760484/1‑93 (MQ=255)
acacCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCg > 2:4481856/1‑93 (MQ=255)
cacCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGt < 2:4542678/93‑1 (MQ=255)
ccTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAAc > 2:515537/1‑93 (MQ=255)
ccTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAAc > 2:4689542/1‑93 (MQ=255)
cTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACg > 2:6340484/1‑93 (MQ=255)
tGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACgg < 1:3572583/93‑1 (MQ=255)
tGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACgg < 2:6442722/93‑1 (MQ=255)
tGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACgg < 2:1970076/93‑1 (MQ=255)
ggTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCGATGTTACAGTAACGGa > 1:4276509/1‑93 (MQ=255)
ggTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGa > 2:525072/1‑93 (MQ=255)
tGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGtt < 1:2521092/93‑1 (MQ=255)
tGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGtt < 1:3146844/93‑1 (MQ=255)
gCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGttt > 1:5804493/1‑93 (MQ=255)
cAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTaa < 1:5650849/93‑1 (MQ=255)
cAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTaa < 1:2705500/93‑1 (MQ=255)
cAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTaa < 1:22400/93‑1 (MQ=255)
aaCCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAAc > 2:4848511/1‑93 (MQ=255)
aCCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACg < 1:5827643/93‑1 (MQ=255)
ccTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACgg < 2:5621989/93‑1 (MQ=255)
cTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGt < 1:3386192/93‑1 (MQ=255)
tGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTc > 2:4231259/1‑93 (MQ=255)
tGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTc > 1:5135922/1‑93 (MQ=255)
tGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTc < 2:5931429/93‑1 (MQ=255)
tGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTc < 1:6602212/93‑1 (MQ=255)
aGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGc > 1:529901/1‑93 (MQ=255)
gTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCt > 1:3719557/1‑93 (MQ=255)
aCGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTat < 1:5080480/93‑1 (MQ=255)
aCGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTat < 2:475685/93‑1 (MQ=255)
aCGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTat < 2:5957259/93‑1 (MQ=255)
gCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTatga > 2:2116085/1‑93 (MQ=255)
gCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTatga < 2:3786148/93‑1 (MQ=255)
cAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTatgat < 1:4990381/93‑1 (MQ=255)
gCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCaa > 1:2682372/1‑93 (MQ=255)
gCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCaa > 1:5860785/1‑93 (MQ=255)
gCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCaa < 1:5543919/93‑1 (MQ=255)
cGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGt < 2:827322/93‑1 (MQ=255)
cGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGt < 1:6077774/93‑1 (MQ=255)
cTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCAt < 1:4858577/93‑1 (MQ=255)
tGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCAtt < 2:4605833/93‑1 (MQ=255)
tGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCAtt > 1:5272473/1‑93 (MQ=255)
gggTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGAAACGCTCAATGTTAACGTAACGAAGCTTAACGGTAGCTATGATTGCAAGGTGATTg > 1:4705071/1‑93 (MQ=255)
ggtggtTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGt > 2:3041420/1‑93 (MQ=255)
gtggtTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTc < 2:1667382/93‑1 (MQ=255)
tggtTGCCTCCCAGCCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCa < 1:1043510/93‑1 (MQ=255)
tgcttGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCa < 1:3886824/90‑1 (MQ=255)
ggtTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAg > 1:5480935/1‑93 (MQ=255)
gtTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAgt > 1:4950896/1‑93 (MQ=255)
ttGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAgtg < 1:3461653/93‑1 (MQ=255)
tGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAgtgg < 1:2480115/93‑1 (MQ=255)
gCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAgtggt < 1:1415433/93‑1 (MQ=255)
gCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAgtggt < 2:73940/93‑1 (MQ=255)
ccTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAgtggtg < 2:1578619/93‑1 (MQ=255)
ccTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAgtggtg < 2:3622863/93‑1 (MQ=255)
cTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAGTGGTGa < 1:4621969/93‑1 (MQ=255)
tCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAGTGGTGAg > 1:677307/1‑93 (MQ=255)
cccAGCCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAGTGGTGAGt < 1:2318252/93‑1 (MQ=255)
cAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAGTGGTGAGTgg > 1:2858543/1‑93 (MQ=255)
|
TTGTGGGCCAGCCCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAGTGGTGAGTGG > NC_000913/1014350‑1014529
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CTTGTGGGCCAGCCCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAGTGGTGAGTGGCT > NC_000913/1014349‑1014531
|
CTTGTGGGCCAGCCCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCT < SRR4302547.6573117/94‑1 (MQ=60)
TTGTGGGCCAGCCCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCCTC < SRR4302547.3941680/94‑1 (MQ=60)
TTGTGGGCCAGCCCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCCTC > SRR4302547.2074330/1‑94 (MQ=60)
TGTGGGCCAGCCCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCT > SRR4302547.5831082/1‑94 (MQ=60)
GTGGGCCAGCCCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCCTCTG < SRR4302547.3822890/94‑1 (MQ=60)
TGGGCCAGCCCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGG > SRR4302547.3239868/1‑94 (MQ=60)
TGGGCCAGCCCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCCTCTGG < SRR4302547.4961605/94‑1 (MQ=60)
GGGCCAGCCCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGG > SRR4302547.6634428/1‑94 (MQ=60)
GGCCAGCCCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGA > SRR4302547.1894509/1‑94 (MQ=60)
GCCAGCCCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCCTCTGGGAA < SRR4302547.4879774/94‑1 (MQ=60)
CCAGCCCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAG > SRR4302547.1634934/1‑94 (MQ=60)
CCAGCCCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCCTCTGGGAAG < SRR4302547.6372645/94‑1 (MQ=60)
CCAGCCCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGCGGTTCCCTCCCAGTCTCTGGGACG > SRR4302547.4389824/1‑94 (MQ=60)
AGCCCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCG > SRR4302547.3836762/1‑94 (MQ=60)
AGCCCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCG < SRR4302547.2494728/94‑1 (MQ=60)
GCCCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGC < SRR4302547.5451049/94‑1 (MQ=60)
CCCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCC < SRR4302547.4852893/94‑1 (MQ=60)
CCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCC < SRR4302547.3109484/94‑1 (MQ=60)
CCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCCTCTGGGAAGCGCCC > SRR4302547.3157397/1‑94 (MQ=60)
CCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGACCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCC > SRR4302547.215320/1‑94 (MQ=60)
CGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCA < SRR4302547.435943/94‑1 (MQ=60)
CGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCCTCTGGGAAGCGCCCA < SRR4302547.3907060/94‑1 (MQ=60)
CGTGGGATCAACAGGCGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCA < SRR4302547.1598628/94‑1 (MQ=60)
GTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAG < SRR4302547.6022092/94‑1 (MQ=60)
GTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAG < SRR4302547.5671750/94‑1 (MQ=60)
GTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCCTCTGGGAAGCGCCCAG < SRR4302547.1944020/94‑1 (MQ=60)
TGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGA < SRR4302547.2862973/94‑1 (MQ=60)
TGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGA < SRR4302547.91354/94‑1 (MQ=60)
GGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGAC > SRR4302547.6120678/1‑94 (MQ=60)
GGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCCTCTGGGAAGCGCCCAGGAC < SRR4302547.3331595/94‑1 (MQ=60)
ATCGACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCCTCTGGGAAGCGCCCAGGACAC > SRR4302547.3832212/1‑94 (MQ=60)
TCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACG > SRR4302547.6725457/1‑94 (MQ=60)
CAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGC > SRR4302547.4831595/1‑94 (MQ=60)
CAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGC < SRR4302547.5812828/94‑1 (MQ=60)
CAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGC > SRR4302547.1799089/1‑94 (MQ=60)
CAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGC > SRR4302547.750485/1‑94 (MQ=60)
AACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCT < SRR4302547.2535091/94‑1 (MQ=60)
AACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCT > SRR4302547.2421142/1‑94 (MQ=60)
CAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTTGGAAGCGCCCAGGACACGCTCA < SRR4302547.4312438/94‑1 (MQ=60)
AGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAA > SRR4302547.3725252/1‑94 (MQ=60)
GTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAAT < SRR4302547.6108564/94‑1 (MQ=60)
TTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATG < SRR4302547.6240758/94‑1 (MQ=60)
TTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATG < SRR4302547.221717/94‑1 (MQ=60)
TTGCCCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATG < SRR4302547.3059597/94‑1 (MQ=60)
GCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTT < SRR4302547.3495555/94‑1 (MQ=60)
GCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTAC < SRR4302547.5905506/94‑1 (MQ=60)
AACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCG > SRR4302547.1795383/1‑94 (MQ=60)
ACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGT < SRR4302547.6559170/94‑1 (MQ=60)
CCCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAA < SRR4302547.5964413/94‑1 (MQ=60)
CCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAAC < SRR4302547.4943333/94‑1 (MQ=60)
TGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCGATGTTACAGTAACGGA > SRR4302547.4364339/1‑94 (MQ=60)
TGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGA < SRR4302547.4931491/94‑1 (MQ=60)
TGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGA < SRR4302547.3645468/94‑1 (MQ=60)
GTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGT > SRR4302547.5459242/1‑94 (MQ=60)
TTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTT > SRR4302547.5205828/1‑94 (MQ=60)
TTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTT > SRR4302547.4521650/1‑94 (MQ=60)
TGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTT < SRR4302547.4171395/94‑1 (MQ=60)
TGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTT < SRR4302547.3209373/94‑1 (MQ=60)
TGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTT < SRR4302547.2572048/94‑1 (MQ=60)
TGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTT > SRR4302547.4857891/1‑94 (MQ=60)
TGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTT > SRR4302547.5924589/1‑94 (MQ=60)
GCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTA < SRR4302547.4849342/94‑1 (MQ=60)
CCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAA > SRR4302547.5315056/1‑94 (MQ=60)
CAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAAC < SRR4302547.5767504/94‑1 (MQ=60)
CAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAAC < SRR4302547.22832/94‑1 (MQ=60)
CAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAAC > SRR4302547.2984151/1‑94 (MQ=60)
CAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAAC < SRR4302547.2759828/94‑1 (MQ=60)
CAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAAC > SRR4302547.2664732/1‑94 (MQ=60)
AACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACG < SRR4302547.3691958/94‑1 (MQ=60)
ACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGG < SRR4302547.5948247/94‑1 (MQ=60)
ACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGGTTAACGG > SRR4302547.1643706/1‑94 (MQ=60)
CCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGT > SRR4302547.5953045/1‑94 (MQ=60)
CCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGT < SRR4302547.2350675/94‑1 (MQ=60)
CTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTC < SRR4302547.3455069/94‑1 (MQ=60)
CTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTC > SRR4302547.5241734/1‑94 (MQ=60)
TGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCG > SRR4302547.5328296/1‑94 (MQ=60)
TGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCG < SRR4302547.6739638/94‑1 (MQ=60)
GAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGC > SRR4302547.539469/1‑94 (MQ=60)
AGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCT > SRR4302547.3795480/1‑94 (MQ=60)
AGTAAGCAACTGCCCGGCTGGGTGGATGACTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCT > SRR4302547.2808922/1‑94 (MQ=60)
GTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTA > SRR4302547.6243964/1‑94 (MQ=60)
ACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATG < SRR4302547.5185309/94‑1 (MQ=60)
CGCACCTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGA < SRR4302547.674261/94‑1 (MQ=60)
CGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGA > SRR4302547.6094751/1‑94 (MQ=60)
CAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATG < SRR4302547.5093539/94‑1 (MQ=60)
CAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATG > SRR4302547.5938193/1‑94 (MQ=60)
AACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGG > SRR4302547.4481366/1‑94 (MQ=60)
ACTGCCCGGCTGGGTGGTTCCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGC < SRR4302547.5623273/94‑1 (MQ=60)
TGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAA > SRR4302547.5982072/1‑94 (MQ=60)
TGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAA > SRR4302547.2736233/1‑94 (MQ=60)
GCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAG < SRR4302547.6049009/94‑1 (MQ=60)
GCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAG < SRR4302547.5658315/94‑1 (MQ=60)
CCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGG < SRR4302547.1360651/94‑1 (MQ=60)
CCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGT < SRR4302547.597846/94‑1 (MQ=60)
CCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGT > SRR4302547.2620222/1‑94 (MQ=60)
CCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGT < SRR4302547.2014606/94‑1 (MQ=60)
CGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTC < SRR4302547.6203851/94‑1 (MQ=60)
GCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCAT > SRR4302547.3460602/1‑94 (MQ=60)
GCTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCAT < SRR4302547.5749275/94‑1 (MQ=60)
CTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATT < SRR4302547.4959239/94‑1 (MQ=60)
CTGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATT > SRR4302547.5381123/1‑94 (MQ=60)
TGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTG > SRR4302547.1596128/1‑94 (MQ=60)
TGGGTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGAAACGCTCAATGTTAACGTAACGAAGCTTAACGGTAGCTATGATTGCAAGGTGATTG > SRR4302547.4802507/1‑94 (MQ=60)
GGGTGGTTGCCTCCCAGCCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGT < SRR4302547.3226529/94‑1 (MQ=60)
GTGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCA < SRR4302547.5155093/94‑1 (MQ=60)
TGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAG < SRR4302547.5085420/94‑1 (MQ=60)
TGGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAG > SRR4302547.5594111/1‑94 (MQ=60)
TGGTTGCCTCCCAGCCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAG < SRR4302547.1064104/94‑1 (MQ=60)
TGCTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAG < SRR4302547.3965888/94‑1 (MQ=60)
GGTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAGT > SRR4302547.5053396/1‑94 (MQ=60)
GTTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAGTG < SRR4302547.3805711/94‑1 (MQ=60)
GTTGCCTCCCAGCCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAGTG < SRR4302547.5770442/94‑1 (MQ=60)
TTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAGTGG < SRR4302547.3532245/94‑1 (MQ=60)
TTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAGTGG < SRR4302547.2752604/94‑1 (MQ=60)
TTGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAGTGG < SRR4302547.5226492/94‑1 (MQ=60)
TGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAGTGGT < SRR4302547.3629216/94‑1 (MQ=60)
TGCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAGTGGT < SRR4302547.2530243/94‑1 (MQ=60)
GCCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAGTGGTG < SRR4302547.1443735/94‑1 (MQ=60)
CCTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAGTGGTGA > SRR4302547.5090082/1‑94 (MQ=60)
CTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAGTGGTGAG < SRR4302547.3245184/94‑1 (MQ=60)
CTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAGTGGTGAG < SRR4302547.4717682/94‑1 (MQ=60)
CTCCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAGTGGTGAG > SRR4302547.689783/1‑94 (MQ=60)
CCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAGTGGTGAGTG > SRR4302547.4786080/1‑94 (MQ=60)
CCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAGTGGTGAGTG > SRR4302547.6729237/1‑94 (MQ=60)
CCCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAGTGGTGAGTG < SRR4302547.5392326/94‑1 (MQ=60)
CCCAGCCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAGTGGTGAGTG < SRR4302547.2365237/94‑1 (MQ=60)
CCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAGTGGTGAGTGG > SRR4302547.2915654/1‑94 (MQ=60)
CCAGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAGTGGTGAGTGG > SRR4302547.856884/1‑94 (MQ=60)
AGTCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAGTGGTGAGTGGCT < SRR4302547.2812231/94‑1 (MQ=60)
|
CTTGTGGGCCAGCCCGTTGGATCAACAGTTGCGCAACACCCTGGTTGCCAACCTGAGTACGCAACTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAGTGGTGAGTGGCT > NC_000913/1014349‑1014531
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
