Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
593 |
264.2 |
13311096 |
97.8% |
13018251 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,322,824 |
T→C |
S19P (TCT→CCT) |
yciQ → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,322,824 | 0 | T | C | 99.6%
| 830.7
/ NA
| 223 | S19P (TCT→CCT) | yciQ | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (106/116); total (107/116) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.80e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 238 total aligned reads displayed.
TTCTTATAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCATCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAGATGGG > NC_000913/1322734‑1322913
|
tCTTATAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCAcctc > 1:2228587/1‑93 (MQ=255)
ttATAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTa > 1:4949956/1‑93 (MQ=255)
ttATAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTa < 2:5702114/93‑1 (MQ=255)
tataACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTaa < 2:2289131/93‑1 (MQ=255)
ataACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAg > 2:3419743/1‑93 (MQ=255)
aaCAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGtt > 1:2974697/1‑93 (MQ=255)
aaCAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGtt > 1:6265301/1‑93 (MQ=255)
aCAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTa < 2:6495364/93‑1 (MQ=255)
aaTTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGc > 1:5634344/1‑93 (MQ=255)
aaTTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGc < 2:2691483/93‑1 (MQ=255)
aaTTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGc > 2:1039317/1‑93 (MQ=255)
ttGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAg < 2:4966423/93‑1 (MQ=255)
gTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGaaaa < 1:1984144/93‑1 (MQ=255)
gTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGaaaa < 1:1418513/93‑1 (MQ=255)
cACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCCTTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACg > 1:6070295/1‑93 (MQ=255)
cACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACg < 2:5338377/93‑1 (MQ=255)
ggATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCATCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGgag > 1:6582420/1‑93 (MQ=255)
ggATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGgag < 1:2697113/93‑1 (MQ=255)
ggATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGgag < 1:4923344/93‑1 (MQ=255)
ggATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGgag > 1:3604873/1‑93 (MQ=255)
aTGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGAt < 1:4136868/93‑1 (MQ=255)
aTGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGAt < 2:3879928/93‑1 (MQ=255)
aTGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGAt > 2:6242842/1‑93 (MQ=255)
tGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATc < 2:6159918/93‑1 (MQ=255)
tGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATc > 1:4674965/1‑93 (MQ=255)
ggAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATcc < 1:2483296/93‑1 (MQ=255)
ggAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTAACACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATcc < 1:2740765/93‑1 (MQ=255)
aaGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCct < 2:1330683/93‑1 (MQ=255)
aGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCctt < 1:168934/93‑1 (MQ=255)
gACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCcttc > 1:3271889/1‑93 (MQ=255)
aCTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCcttct < 1:1905252/93‑1 (MQ=255)
cTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCcttctt < 2:2840619/93‑1 (MQ=255)
tATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCCGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTa < 1:633926/93‑1 (MQ=255)
tATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTa < 1:2394444/93‑1 (MQ=255)
aTGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTAt < 1:3978079/93‑1 (MQ=255)
gCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATgaa > 1:998557/1‑93 (MQ=255)
gCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATgaa > 2:806947/1‑93 (MQ=255)
cAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATgaag > 2:1852713/1‑93 (MQ=255)
aGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATgaaga < 2:4536537/93‑1 (MQ=255)
aGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATgaaga > 1:80221/1‑93 (MQ=255)
aGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATgaaga < 1:2890907/93‑1 (MQ=255)
aGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATgaaga < 1:2634402/93‑1 (MQ=255)
aGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATgaaga < 2:5577123/93‑1 (MQ=255)
aGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGCTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTAagaaga > 2:4389750/1‑93 (MQ=255)
gggAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATgaagaa > 1:1124949/1‑93 (MQ=255)
gggAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATgaagaa < 2:3085518/93‑1 (MQ=255)
gggAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATgaagaa < 2:1412492/93‑1 (MQ=255)
gggAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATgaagaa > 1:5060451/1‑93 (MQ=255)
gggAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATgaagaa < 1:5354685/93‑1 (MQ=255)
ggAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGaagaag < 1:1519831/93‑1 (MQ=255)
ggAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGaagaag > 2:2253/1‑93 (MQ=255)
gAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAgg < 1:5511663/93‑1 (MQ=255)
aaGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAggg > 2:6635471/1‑93 (MQ=255)
aGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGa > 2:5975792/1‑93 (MQ=255)
gTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGAt < 1:4523657/93‑1 (MQ=255)
gTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGAt > 2:4693138/1‑93 (MQ=255)
gTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGAt > 2:4612063/1‑93 (MQ=255)
tCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGGAGAAGGGAtctc > 2:3813943/1‑93 (MQ=255)
cGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCg > 2:3930197/1‑93 (MQ=255)
gCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGc < 1:5981862/93‑1 (MQ=255)
gCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGc > 2:1609324/1‑93 (MQ=255)
gCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGc > 1:1121461/1‑93 (MQ=255)
cTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGct < 2:3653858/93‑1 (MQ=255)
cTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGct > 1:5243419/1‑93 (MQ=255)
tGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGctc > 2:474421/1‑93 (MQ=255)
tGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGctc > 1:3086649/1‑93 (MQ=255)
gCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGctct > 1:4887160/1‑93 (MQ=255)
gCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGctct < 1:294491/93‑1 (MQ=255)
gCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGctct > 2:4710893/1‑93 (MQ=255)
cATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCtt > 1:3843692/1‑93 (MQ=255)
ttttGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTg > 1:500415/1‑93 (MQ=255)
ttGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGAt < 1:3478240/93‑1 (MQ=255)
ttGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGAt > 1:4636764/1‑93 (MQ=255)
ttGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGAt > 2:3524458/1‑93 (MQ=255)
ttGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGAGCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGAt < 1:5143963/93‑1 (MQ=255)
tGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATg < 2:3283245/93‑1 (MQ=255)
gCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGt < 2:1692792/93‑1 (MQ=255)
gCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGt > 2:703601/1‑93 (MQ=255)
cTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGtt > 1:3688034/1‑93 (MQ=255)
gATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGc < 2:4023623/93‑1 (MQ=255)
aTAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGcc > 2:149643/1‑93 (MQ=255)
tAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCa > 2:5648891/1‑93 (MQ=255)
aGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCAc < 1:5820774/93‑1 (MQ=255)
aGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCAc < 2:4459158/93‑1 (MQ=255)
gCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAGCACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCAct > 2:114140/1‑93 (MQ=255)
gCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCAct < 2:2943010/93‑1 (MQ=255)
cAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCActc < 1:4457072/93‑1 (MQ=255)
cAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCActc > 2:371450/1‑93 (MQ=255)
cAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCActc < 1:1595769/93‑1 (MQ=255)
aGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCActct > 1:4740046/1‑93 (MQ=255)
aGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCActct > 1:2669707/1‑93 (MQ=255)
gggCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTg < 2:4286517/93‑1 (MQ=255)
cTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCaa > 2:121410/1‑93 (MQ=255)
gTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAAcc > 1:3382661/1‑93 (MQ=255)
tttGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCa < 1:5906918/93‑1 (MQ=255)
ttGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAg > 2:5248404/1‑93 (MQ=255)
ttATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAGAt < 2:6541543/92‑1 (MQ=255)
tATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAGATg < 2:4867156/93‑1 (MQ=255)
tATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAGATg > 2:1800922/1‑93 (MQ=255)
atcaccTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAGATgg < 2:2195348/93‑1 (MQ=255)
|
TTCTTATAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCATCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAGATGGG > NC_000913/1322734‑1322913
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CCTTTCTTATAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCATCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAGATGGGGTG > NC_000913/1322731‑1322916
|
CCTTTCTTATAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCAC > SRR4302547.6650492/1‑94 (MQ=60)
CCTTTCTTATAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCAC > SRR4302547.490139/1‑94 (MQ=60)
CCTTTCTTATAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCAC > SRR4302547.5232915/1‑94 (MQ=60)
CCTTTCTTATAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCAC < SRR4302547.238347/94‑1 (MQ=60)
CCTTTCTTATAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCAC > SRR4302547.4822832/1‑94 (MQ=60)
CTTTCTTATAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACC > SRR4302547.136404/1‑94 (MQ=60)
CTTTCTTATAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACC > SRR4302547.3680178/1‑94 (MQ=60)
TTTCTTATAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCT < SRR4302547.3954567/94‑1 (MQ=60)
TTCTTATAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTC < SRR4302547.3813711/94‑1 (MQ=60)
TTCTTATAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTC > SRR4302547.2273504/1‑94 (MQ=60)
TTCTTATAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTC > SRR4302547.1663724/1‑94 (MQ=60)
TCTTATAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCT < SRR4302547.5009202/94‑1 (MQ=60)
CTTATAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTA > SRR4302547.5052446/1‑94 (MQ=60)
TATAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAG < SRR4302547.3769239/94‑1 (MQ=60)
ATAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGT > SRR4302547.4629814/1‑94 (MQ=60)
TAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTT > SRR4302547.6395444/1‑94 (MQ=60)
TAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTT < SRR4302547.4207973/94‑1 (MQ=60)
TAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTT > SRR4302547.3033892/1‑94 (MQ=60)
TAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTT > SRR4302547.3033893/1‑94 (MQ=60)
AACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTA < SRR4302547.2567182/94‑1 (MQ=60)
CAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATG < SRR4302547.564018/94‑1 (MQ=60)
AAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGC > SRR4302547.5750623/1‑94 (MQ=60)
AATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCA < SRR4302547.29954/94‑1 (MQ=60)
ATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAG < SRR4302547.344644/94‑1 (MQ=60)
ATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAG > SRR4302547.5534149/1‑94 (MQ=60)
GCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTTATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAA > SRR4302547.6156326/1‑94 (MQ=60)
CGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAA > SRR4302547.5349961/1‑94 (MQ=60)
GTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAAC < SRR4302547.2023545/94‑1 (MQ=60)
GTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAAC < SRR4302547.1446910/94‑1 (MQ=60)
tcccttcttcataagaagggatctccgtGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACAC > SRR4302547.4909454/29‑94 (MQ=60)
TCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACAC > SRR4302547.3247943/1‑94 (MQ=60)
CCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCCTTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACG > SRR4302547.6196207/1‑94 (MQ=60)
CCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACG > SRR4302547.4597144/1‑94 (MQ=60)
CACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGG < SRR4302547.6396277/94‑1 (MQ=60)
CACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGG < SRR4302547.6248770/94‑1 (MQ=60)
ACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGA < SRR4302547.2784752/94‑1 (MQ=60)
CGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCATCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAG > SRR4302547.6719493/1‑94 (MQ=60)
CGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAG > SRR4302547.3678387/1‑94 (MQ=60)
GGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGA < SRR4302547.3762070/94‑1 (MQ=60)
GGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGA < SRR4302547.5025310/94‑1 (MQ=60)
GGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGA > SRR4302547.6026978/1‑94 (MQ=60)
GGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGA < SRR4302547.2751257/94‑1 (MQ=60)
GATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGAT < SRR4302547.6028985/94‑1 (MQ=60)
ATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATC > SRR4302547.4771783/1‑94 (MQ=60)
ATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATC < SRR4302547.4221039/94‑1 (MQ=60)
TGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCC > SRR4302547.3306733/1‑94 (MQ=60)
GGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCC < SRR4302547.2533483/94‑1 (MQ=60)
GGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTAACACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCA < SRR4302547.2795751/94‑1 (MQ=60)
GAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGTTAGCAGGGCCGTTTGTATCACCTCTAAGATATGCAGAAAACACGGAGgacaat > SRR4302547.3015444/1‑88 (MQ=60)
AAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTT > SRR4302547.3368319/1‑94 (MQ=60)
AAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTT > SRR4302547.6573841/1‑94 (MQ=60)
AGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTC > SRR4302547.3337405/1‑94 (MQ=60)
AGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTC > SRR4302547.4459891/1‑94 (MQ=60)
AGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTC > SRR4302547.5238952/1‑94 (MQ=60)
AGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTC < SRR4302547.172027/94‑1 (MQ=60)
ACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTT < SRR4302547.1942952/94‑1 (MQ=60)
TATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCCGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTAT < SRR4302547.645633/94‑1 (MQ=60)
TATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTAT < SRR4302547.2442944/94‑1 (MQ=60)
TATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTAT < SRR4302547.2987970/94‑1 (MQ=60)
ATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATG < SRR4302547.4058971/94‑1 (MQ=60)
TGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCCTCTTATGA > SRR4302547.516711/1‑94 (MQ=60)
GGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAA > SRR4302547.1018018/1‑94 (MQ=60)
GCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAG < SRR4302547.6049707/94‑1 (MQ=60)
CAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGA > SRR4302547.81720/1‑94 (MQ=60)
AGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAA < SRR4302547.507475/94‑1 (MQ=60)
AGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAA > SRR4302547.5164894/1‑94 (MQ=60)
AGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAA < SRR4302547.2948570/94‑1 (MQ=60)
AGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAA > SRR4302547.2788933/1‑94 (MQ=60)
AGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAA < SRR4302547.2687461/94‑1 (MQ=60)
AGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAA < SRR4302547.4369263/94‑1 (MQ=60)
AGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAA < SRR4302547.816181/94‑1 (MQ=60)
AGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAA > SRR4302547.1147643/1‑94 (MQ=60)
GGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAG < SRR4302547.5465099/94‑1 (MQ=60)
GGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAG < SRR4302547.6476042/94‑1 (MQ=60)
GGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGG > SRR4302547.966050/1‑94 (MQ=60)
GGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGG < SRR4302547.1550104/94‑1 (MQ=60)
GAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGG < SRR4302547.5625452/94‑1 (MQ=60)
GTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATC < SRR4302547.4617141/94‑1 (MQ=60)
GTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATC > SRR4302547.190567/1‑94 (MQ=60)
TTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTC > SRR4302547.2671234/1‑94 (MQ=60)
CGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGC > SRR4302547.3966098/1‑94 (MQ=60)
CGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGC > SRR4302547.1144077/1‑94 (MQ=60)
CGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGC < SRR4302547.5077521/94‑1 (MQ=60)
CGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGC > SRR4302547.19918/1‑94 (MQ=60)
GCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCT > SRR4302547.1548103/1‑94 (MQ=60)
GCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCT > SRR4302547.5351341/1‑94 (MQ=60)
GCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCT < SRR4302547.2725115/94‑1 (MQ=60)
GCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCT < SRR4302547.6105951/94‑1 (MQ=60)
CTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACATGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTC < SRR4302547.1618051/94‑1 (MQ=60)
CTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTC > SRR4302547.205496/1‑94 (MQ=60)
CTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTC > SRR4302547.2106266/1‑94 (MQ=60)
CTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTC > SRR4302547.3147895/1‑94 (MQ=60)
TGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCT > SRR4302547.4988399/1‑94 (MQ=60)
GCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTT < SRR4302547.299965/94‑1 (MQ=60)
GCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTT > SRR4302547.3921959/1‑94 (MQ=60)
CATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTT > SRR4302547.4964548/1‑94 (MQ=60)
ATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTG < SRR4302547.1425820/94‑1 (MQ=60)
ATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTG > SRR4302547.509529/1‑94 (MQ=60)
TTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGAT > SRR4302547.4732810/1‑94 (MQ=60)
TTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATG < SRR4302547.3549188/94‑1 (MQ=60)
TTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATG < SRR4302547.1549211/94‑1 (MQ=60)
TTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGAGCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATG < SRR4302547.5249918/94‑1 (MQ=60)
GCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTT > SRR4302547.3763322/1‑94 (MQ=60)
GCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTT < SRR4302547.1778247/94‑1 (MQ=60)
TGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAACCACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGA < SRR4302547.4697526/94‑1 (MQ=60)
GTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAA > SRR4302547.36239/1‑94 (MQ=60)
GTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAA > SRR4302547.2500880/1‑94 (MQ=60)
TTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAG < SRR4302547.473433/94‑1 (MQ=60)
TTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAG < SRR4302547.2279481/94‑1 (MQ=60)
TGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGC < SRR4302547.3074512/94‑1 (MQ=60)
GATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCC < SRR4302547.2836875/94‑1 (MQ=60)
GATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCC < SRR4302547.611873/94‑1 (MQ=60)
AGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACT < SRR4302547.5941198/94‑1 (MQ=60)
AGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACT > SRR4302547.5152949/1‑94 (MQ=60)
CAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCT > SRR4302547.2723343/1‑94 (MQ=60)
CAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCT < SRR4302547.869403/94‑1 (MQ=60)
CAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCT < SRR4302547.4549193/94‑1 (MQ=60)
CAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCT > SRR4302547.4838288/1‑94 (MQ=60)
CAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCT < SRR4302547.1627443/94‑1 (MQ=60)
AGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTG > SRR4302547.5814203/1‑94 (MQ=60)
AGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTG > SRR4302547.1146426/1‑94 (MQ=60)
GGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCA < SRR4302547.5422763/94‑1 (MQ=60)
TGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACC > SRR4302547.3451422/1‑94 (MQ=60)
GTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCA > SRR4302547.5041319/1‑94 (MQ=60)
TTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAG < SRR4302547.6029244/94‑1 (MQ=60)
TGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAGAT > SRR4302547.5512195/1‑94 (MQ=60)
TATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAGATGG > SRR4302547.3615458/1‑94 (MQ=60)
TATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAGATGG < SRR4302547.2695493/94‑1 (MQ=60)
ATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAGATGGG < SRR4302547.4862300/94‑1 (MQ=60)
TCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAGATGGGG > SRR4302547.258570/1‑94 (MQ=60)
TCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAGATGGGG > SRR4302547.666717/1‑94 (MQ=60)
TCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCCCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAGATGGGG < SRR4302547.4802801/94‑1 (MQ=60)
CACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAGATGGGGT > SRR4302547.6351909/1‑94 (MQ=60)
CACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAGATGGGGT < SRR4302547.4889993/94‑1 (MQ=60)
CACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAGATGGGGT > SRR4302547.5321048/1‑94 (MQ=60)
CACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAGATGGGGT > SRR4302547.680896/1‑94 (MQ=60)
CACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAGATGGGGT < SRR4302547.1361271/94‑1 (MQ=60)
ACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAGATGGGGTG < SRR4302547.5657506/94‑1 (MQ=60)
|
CCTTTCTTATAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCATCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAGATGGGGTG > NC_000913/1322731‑1322916
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
