Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
521 |
238.2 |
12299412 |
96.0% |
11807435 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,322,824 |
T→C |
S19P (TCT→CCT) |
yciQ → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,322,824 | 0 | T | C | 99.1%
| 766.9
/ ‑3.8
| 212 | S19P (TCT→CCT) | yciQ | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/2); new base C (96/114); total (96/116) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.02e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 228 total aligned reads displayed.
TTCTTATAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCATCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAGATGGG > NC_000913/1322734‑1322913
|
ttCTTATAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCAcct > 2:250385/1‑93 (MQ=255)
tCTTATAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCAcctc < 2:3100962/93‑1 (MQ=255)
cTTATAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACctct > 1:5825597/1‑93 (MQ=255)
ttATAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTa > 1:2132371/1‑93 (MQ=255)
tataACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTaa < 1:1235171/93‑1 (MQ=255)
taACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGt > 1:1016740/1‑93 (MQ=255)
taACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGt > 1:3952164/1‑93 (MQ=255)
taACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGt > 2:3687519/1‑93 (MQ=255)
aCAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTa < 2:1325244/93‑1 (MQ=255)
aCAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTa < 2:2327810/93‑1 (MQ=255)
aCAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTa < 2:464382/93‑1 (MQ=255)
cAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTAt < 1:1563385/93‑1 (MQ=255)
cAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTAt < 2:5336755/93‑1 (MQ=255)
cAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTAt > 1:4964307/1‑93 (MQ=255)
cAAAGTGCGTTCCACGGTTGGAAGATTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGAGAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTAt < 1:5884522/93‑1 (MQ=255)
aaTTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGc > 1:3356787/1‑93 (MQ=255)
aaTTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGc > 2:4857745/1‑93 (MQ=255)
ttGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGATTCGGTGCGTTTTGCTGTTGATAGCCGGACTGTTTGTATCATTTCTAAGTTATggta > 2:2122465/1‑90 (MQ=255)
tGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGa > 1:2945254/1‑93 (MQ=255)
tGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGa > 1:844060/1‑93 (MQ=255)
tGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGa > 1:1909402/1‑93 (MQ=255)
tGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGa < 1:5346897/93‑1 (MQ=255)
gCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCCGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGaa > 2:2169530/1‑93 (MQ=255)
gCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGaa < 2:3890890/93‑1 (MQ=255)
tCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAaca < 2:4708515/93‑1 (MQ=255)
tCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAaca < 2:5789247/93‑1 (MQ=255)
ccACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAacac < 2:2450306/93‑1 (MQ=255)
cACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACg < 2:4476695/93‑1 (MQ=255)
cACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACg < 2:2008721/93‑1 (MQ=255)
cACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACg > 2:2658745/1‑93 (MQ=255)
aCGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACgg > 1:3430487/1‑93 (MQ=255)
cGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGga > 2:4697146/1‑93 (MQ=255)
ggATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGgag > 2:3546120/1‑93 (MQ=255)
gATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGgaga > 1:2352924/1‑93 (MQ=255)
gATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGgaga < 1:4780093/93‑1 (MQ=255)
ggAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATcc > 1:1971383/1‑93 (MQ=255)
aaGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCct > 2:447042/1‑93 (MQ=255)
gACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCcttc < 2:5820522/93‑1 (MQ=255)
gACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCcttc < 1:3217249/93‑1 (MQ=255)
aCTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCcttct > 1:4186042/1‑93 (MQ=255)
aCTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCcttct > 2:3425945/1‑93 (MQ=255)
tATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTa < 1:1642791/93‑1 (MQ=255)
tGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATg > 2:5638619/1‑93 (MQ=255)
tGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATg < 2:4741947/93‑1 (MQ=255)
tGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATg < 1:3651877/93‑1 (MQ=255)
gCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATgaa < 1:3157868/93‑1 (MQ=255)
aGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATgaaga < 2:267614/93‑1 (MQ=255)
gggAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATgaagaa > 1:3338435/1‑93 (MQ=255)
ggAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCATCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGaagaag < 1:5133151/93‑1 (MQ=255)
ggAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGaagaag < 2:1454418/93‑1 (MQ=255)
ggAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGaagaag < 1:3789260/93‑1 (MQ=255)
gAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAgg < 2:3279006/93‑1 (MQ=255)
aaGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAggg < 2:4321490/93‑1 (MQ=255)
aGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGa < 2:1861331/93‑1 (MQ=255)
aGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGa > 2:1942487/1‑93 (MQ=255)
aGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGa < 1:1049413/93‑1 (MQ=255)
gTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGAt < 2:657503/93‑1 (MQ=255)
tttCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGAtc < 2:1013667/93‑1 (MQ=255)
tttCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGAtc < 2:5088165/93‑1 (MQ=255)
tCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGAtctc > 2:4793675/1‑93 (MQ=255)
tCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGAtctc < 1:5749342/93‑1 (MQ=255)
tCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGAtctc > 2:3957013/1‑93 (MQ=255)
cTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGct < 1:4250233/93‑1 (MQ=255)
tGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGctc < 2:1294531/93‑1 (MQ=255)
tGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGctc > 1:4347040/1‑93 (MQ=255)
aTTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCttg > 2:3375945/1‑92 (MQ=255)
aTTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTAATGAAGAAGGGATCTCGCTCttt > 1:3483237/1‑93 (MQ=255)
ttttGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTg > 2:2906920/1‑93 (MQ=255)
ttttGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTg > 2:6028642/1‑93 (MQ=255)
cTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGACCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGtt < 1:2453995/93‑1 (MQ=255)
tGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTg > 1:4380628/1‑93 (MQ=255)
tGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTg > 1:1877558/1‑93 (MQ=255)
tGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTg > 1:4623712/1‑93 (MQ=255)
gTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGa > 2:1828562/1‑93 (MQ=255)
gTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGa > 1:2860116/1‑93 (MQ=255)
gTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGa < 1:490919/93‑1 (MQ=255)
gTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGa < 1:1315052/93‑1 (MQ=255)
tGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAg > 2:900544/1‑93 (MQ=255)
tAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCa < 1:5513772/93‑1 (MQ=255)
tAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCa < 1:4471753/93‑1 (MQ=255)
aGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCAc < 2:5882158/93‑1 (MQ=255)
gCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCAct > 2:3641369/1‑93 (MQ=255)
aGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCActct < 1:1388083/93‑1 (MQ=255)
aGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCActct < 2:4817867/93‑1 (MQ=255)
gggCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTg > 1:3680553/1‑93 (MQ=255)
ggCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGc < 2:5212398/93‑1 (MQ=255)
cTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCaa > 2:943799/1‑93 (MQ=255)
cTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCaa < 2:2785526/93‑1 (MQ=255)
gTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAAcc > 1:3611153/1‑93 (MQ=255)
tttGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCa > 1:2340656/1‑93 (MQ=255)
tttGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCa > 2:3775862/1‑93 (MQ=255)
tttGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGAAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCa > 1:112042/1‑93 (MQ=255)
ttGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAg > 1:4239975/1‑93 (MQ=255)
tGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAGa > 2:1190010/1‑93 (MQ=255)
gTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAGAt < 1:3257539/93‑1 (MQ=255)
tATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAGATg < 2:3473528/93‑1 (MQ=255)
tATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAGATg < 2:1642057/93‑1 (MQ=255)
gatcaccTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGTTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAGATg < 1:6016390/92‑1 (MQ=255)
atcaccTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAGATgg < 2:4068446/93‑1 (MQ=255)
atcaccTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAGATgg < 1:5659035/93‑1 (MQ=255)
|
TTCTTATAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCATCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAGATGGG > NC_000913/1322734‑1322913
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CCTTTCTTATAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCATCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAGATGGGGT > NC_000913/1322731‑1322915
|
CCTTTCTTATAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCAC > SRR4302532.2815692/1‑94 (MQ=60)
CCTTTCTTATAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCAC > SRR4302532.4390052/1‑94 (MQ=60)
CTTTCTTATAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACC < SRR4302532.386239/94‑1 (MQ=60)
CTTTCTTATAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACC > SRR4302532.840344/1‑94 (MQ=60)
TCTTATAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCT > SRR4302532.6027877/1‑94 (MQ=60)
CTTATAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTA > SRR4302532.2203586/1‑94 (MQ=60)
TTATAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAA > SRR4302532.1557196/1‑94 (MQ=60)
TATAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAG < SRR4302532.1276485/94‑1 (MQ=60)
ATAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGT > SRR4302532.4085346/1‑94 (MQ=60)
ATAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGT > SRR4302532.5953965/1‑94 (MQ=60)
ATAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGT > SRR4302532.1051260/1‑94 (MQ=60)
TAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTT < SRR4302532.3377510/94‑1 (MQ=60)
AACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTA > SRR4302532.5943717/1‑94 (MQ=60)
ACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTAT > SRR4302532.5134550/1‑94 (MQ=60)
ACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTAT < SRR4302532.4364300/94‑1 (MQ=60)
CAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATG < SRR4302532.1616256/94‑1 (MQ=60)
CAAAGTGCGTTCCACGGTTGGAAGATTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGAGAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATG < SRR4302532.6088319/94‑1 (MQ=60)
AAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGC > SRR4302532.3468901/1‑94 (MQ=60)
TTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGA > SRR4302532.3042983/1‑94 (MQ=60)
TTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGA > SRR4302532.873065/1‑94 (MQ=60)
TTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGA > SRR4302532.1972794/1‑94 (MQ=60)
TGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAA > SRR4302532.3494347/1‑94 (MQ=60)
TGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAA < SRR4302532.5532405/94‑1 (MQ=60)
CGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGGTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCCCTAAGGTATGCAGAAAA > SRR4302532.5686587/1‑94 (MQ=60)
GTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAAC > SRR4302532.4488955/1‑94 (MQ=60)
TTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACA < SRR4302532.4838262/94‑1 (MQ=60)
TCCACGGATGGAAGACGATGGTAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACAC < SRR4302532.4273121/94‑1 (MQ=60)
CCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACG > SRR4302532.6172544/1‑94 (MQ=60)
CCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACG < SRR4302532.4597381/94‑1 (MQ=60)
CACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGG > SRR4302532.3545432/1‑94 (MQ=60)
CGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAG < SRR4302532.1378717/94‑1 (MQ=60)
GGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGA > SRR4302532.2431615/1‑94 (MQ=60)
GGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGA > SRR4302532.2431436/1‑94 (MQ=60)
GATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGAT < SRR4302532.4944708/94‑1 (MQ=60)
ATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATC > SRR4302532.685348/1‑94 (MQ=60)
TGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCC < SRR4302532.2366970/94‑1 (MQ=60)
TGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCC > SRR4302532.2036867/1‑94 (MQ=60)
GGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATACC > SRR4302532.5858303/1‑94 (MQ=60)
GACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCT > SRR4302532.4326473/1‑94 (MQ=60)
GACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCT < SRR4302532.3324081/94‑1 (MQ=60)
GACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCT < SRR4302532.2927472/94‑1 (MQ=60)
CTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTA < SRR4302532.1244807/94‑1 (MQ=60)
CTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTA < SRR4302532.3491917/94‑1 (MQ=60)
CTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTA > SRR4302532.4515543/1‑94 (MQ=60)
TATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTAT < SRR4302532.1977854/94‑1 (MQ=60)
TATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTAT < SRR4302532.1698425/94‑1 (MQ=60)
TGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGA < SRR4302532.3774434/94‑1 (MQ=60)
TGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGA < SRR4302532.3774435/94‑1 (MQ=60)
GCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAG > SRR4302532.3668125/1‑94 (MQ=60)
GCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAG < SRR4302532.3262695/94‑1 (MQ=60)
GCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAG < SRR4302532.3262694/94‑1 (MQ=60)
CAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGA > SRR4302532.1119835/1‑94 (MQ=60)
AGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAA < SRR4302532.5420936/94‑1 (MQ=60)
AGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAA > SRR4302532.3449840/1‑94 (MQ=60)
AGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAA < SRR4302532.6049939/94‑1 (MQ=60)
GGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAG < SRR4302532.5197161/94‑1 (MQ=60)
GGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCATCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGG < SRR4302532.5309728/94‑1 (MQ=60)
GGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGG < SRR4302532.3917093/94‑1 (MQ=60)
GGAAGTTTCGCTGCATTGTGCTGTTGATAGCAGAGCTGTTTGTATCATCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGG < SRR4302532.5817539/94‑1 (MQ=60)
GAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGG > SRR4302532.5436381/1‑94 (MQ=60)
AGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGAT < SRR4302532.1084791/94‑1 (MQ=60)
AGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGAT < SRR4302532.3284908/94‑1 (MQ=60)
TTCGCGGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGACTGTTTGTATCCCCTCTAAGTTATGCAGAAAACCCGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTC < SRR4302532.3465538/94‑1 (MQ=60)
TCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCG < SRR4302532.5949470/94‑1 (MQ=60)
GCTGCATTTTGCTGCTGATAGCAGGGCTGTTAGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAAGGATCTCTCT < SRR4302532.2163761/94‑1 (MQ=60)
CTTCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTC < SRR4302532.4785110/94‑1 (MQ=60)
CTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTC > SRR4302532.4385420/1‑94 (MQ=60)
CTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTC > SRR4302532.4493954/1‑94 (MQ=60)
CTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTC < SRR4302532.4393049/94‑1 (MQ=60)
GCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTT < SRR4302532.3750635/94‑1 (MQ=60)
CATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTAATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTT > SRR4302532.3599906/1‑94 (MQ=60)
ATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTG > SRR4302532.1280068/1‑94 (MQ=60)
TTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGAT < SRR4302532.979202/94‑1 (MQ=60)
TTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGAT < SRR4302532.2428753/94‑1 (MQ=60)
CTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTG > SRR4302532.1939776/1‑94 (MQ=60)
CTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTG > SRR4302532.4529427/1‑94 (MQ=60)
CTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTG > SRR4302532.1798179/1‑94 (MQ=60)
CTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTG > SRR4302532.4781368/1‑94 (MQ=60)
CTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTA > SRR4302532.1939592/1‑94 (MQ=60)
CTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGACCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTG < SRR4302532.2535617/94‑1 (MQ=60)
TGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGA > SRR4302532.2955763/1‑94 (MQ=60)
TGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGA < SRR4302532.463499/94‑1 (MQ=60)
GTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAA < SRR4302532.508081/94‑1 (MQ=60)
GTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAA < SRR4302532.1359021/94‑1 (MQ=60)
GTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAA < SRR4302532.1632622/94‑1 (MQ=60)
TTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAG < SRR4302532.3003245/94‑1 (MQ=60)
TTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAG > SRR4302532.1347581/1‑94 (MQ=60)
TTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAG < SRR4302532.3890719/94‑1 (MQ=60)
TGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGC > SRR4302532.6317316/1‑94 (MQ=60)
TGATAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGC > SRR4302532.3740884/1‑94 (MQ=60)
TAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCAC < SRR4302532.4624247/94‑1 (MQ=60)
TAGCAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCAC < SRR4302532.5705115/94‑1 (MQ=60)
CAGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCT < SRR4302532.5045621/94‑1 (MQ=60)
AGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTG < SRR4302532.1434608/94‑1 (MQ=60)
AGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTG > SRR4302532.1967854/1‑94 (MQ=60)
AGGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTG > SRR4302532.3804196/1‑94 (MQ=60)
GGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGC > SRR4302532.1074355/1‑94 (MQ=60)
GGGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGC > SRR4302532.4206388/1‑94 (MQ=60)
GGCTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCA < SRR4302532.2105043/94‑1 (MQ=60)
CTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAAC > SRR4302532.5077996/1‑94 (MQ=60)
CTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAAC > SRR4302532.2868525/1‑94 (MQ=60)
CTGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAAC > SRR4302532.3075432/1‑94 (MQ=60)
TGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACC < SRR4302532.3336245/94‑1 (MQ=60)
TGTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACC > SRR4302532.3731897/1‑94 (MQ=60)
GTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCA > SRR4302532.2418669/1‑94 (MQ=60)
GTTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGAAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCA > SRR4302532.115901/1‑94 (MQ=60)
TTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAG > SRR4302532.4382405/1‑94 (MQ=60)
TTTGTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAG < SRR4302532.4504305/94‑1 (MQ=60)
GTATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAGATG < SRR4302532.3365778/94‑1 (MQ=60)
GATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGTTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAGATGG < SRR4302532.6224157/94‑1 (MQ=60)
ATCACGTCTAATTTATGCATAAAACACGGAGATCCATTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTGGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAGATGGG < SRR4302532.5719973/94‑1 (MQ=60)
ATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAGATGGG > SRR4302532.3578599/1‑94 (MQ=60)
ATCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAGATGGG < SRR4302532.5856163/94‑1 (MQ=60)
TCACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAGATGGGG < SRR4302532.3917776/94‑1 (MQ=60)
CACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAGATGGGGT < SRR4302532.2557850/94‑1 (MQ=60)
CACCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAGATGGGGG > SRR4302532.330786/1‑94 (MQ=60)
|
CCTTTCTTATAACAAATTGCGTTCCACGGATGGAAGACTATGGCAGGGAAGTTTCGCTGCATTTTGCTGTTGATAGCAGGGCTGTTTGTATCATCTCTAAGTTATGCAGAAAACACGGAGATCCCTTCTTATGAAGAAGGGATCTCGCTCTTTGATGTTGAAGCCACTCTGCAACCAGATGGGGT > NC_000913/1322731‑1322915
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
