Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
593 |
264.2 |
13311096 |
97.8% |
13018251 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,774,277 |
A→G |
M223V (ATG→GTG) |
ydiF → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,774,277 | 0 | A | G | 82.4%
| 523.9
/ 103.2
| 222 | M223V (ATG→GTG) | ydiF | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (15/24); new base G (86/97); total (101/121) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.78e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.02e-01 |
Only 100 of 244 total aligned reads displayed.
ACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTC > NC_000913/1774185‑1774366
|
aCAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGtga > 2:3785282/1‑93 (MQ=255)
aGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTgtggtg > 2:3197455/1‑93 (MQ=255)
tGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTggtgat < 2:4122996/93‑1 (MQ=255)
gAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGgtgatg > 2:1837632/1‑93 (MQ=255)
aGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCa > 2:5762959/1‑93 (MQ=255)
ggCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAg > 1:3763628/1‑93 (MQ=255)
gCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAgg < 2:1251690/93‑1 (MQ=255)
gCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAgg > 1:5621769/1‑93 (MQ=255)
cTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGt < 1:1395042/93‑1 (MQ=255)
cTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTAATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGt < 2:44630/93‑1 (MQ=255)
tACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTg > 1:4608310/1‑93 (MQ=255)
tACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTg < 1:3686693/93‑1 (MQ=255)
gCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAg > 1:63308/1‑93 (MQ=255)
gCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAg > 1:4272001/1‑93 (MQ=255)
cACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGaa < 1:3501601/93‑1 (MQ=255)
cACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGCAGaa > 1:6013819/1‑93 (MQ=255)
aCTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGaaa > 1:4106858/1‑93 (MQ=255)
cTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCa > 2:4169096/1‑88 (MQ=255)
cTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGaaaa < 2:5118766/93‑1 (MQ=255)
cTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGaaaa > 2:5482762/1‑93 (MQ=255)
ttttGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGCATTGTGATGATGCAGGGGCAGAAAAt > 1:883062/1‑93 (MQ=255)
tGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGt > 1:1126622/1‑93 (MQ=255)
gAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGtt < 1:2310522/93‑1 (MQ=255)
aaGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTa < 2:6190233/93‑1 (MQ=255)
aGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTaa > 1:2391702/1‑93 (MQ=255)
gATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGGGATGCAGGCGCAGAAAATGGTTaaa > 2:1353796/1‑92 (MQ=255)
aGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAg > 2:4809413/1‑93 (MQ=255)
gTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGcc < 2:2816778/93‑1 (MQ=255)
gTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGcc < 1:4663125/93‑1 (MQ=255)
gATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCAc < 2:5890087/93‑1 (MQ=255)
gATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCAc < 2:4939210/93‑1 (MQ=255)
tGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGc < 2:2878980/93‑1 (MQ=255)
tGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGc < 2:2260417/93‑1 (MQ=255)
aTCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGc < 1:6638334/93‑1 (MQ=255)
tctcGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCa > 1:5024874/1‑93 (MQ=255)
ctcGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCAt < 2:3743729/93‑1 (MQ=255)
gACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCt < 2:3511151/93‑1 (MQ=255)
aCGCATTGATTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTa > 1:6473592/1‑93 (MQ=255)
gCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTaaa > 2:6618456/1‑93 (MQ=255)
gCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTaaa > 1:3283175/1‑93 (MQ=255)
cATTTGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAAt < 2:4885848/93‑1 (MQ=255)
cATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAAt > 1:282956/1‑93 (MQ=255)
aTTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATc > 2:2722193/1‑93 (MQ=255)
aTTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATc < 1:3009423/93‑1 (MQ=255)
aTTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATc < 1:6073165/93‑1 (MQ=255)
ttGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCt > 2:4845009/1‑93 (MQ=255)
ttGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCt < 1:6368979/93‑1 (MQ=255)
ttGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCt < 1:281274/93‑1 (MQ=255)
ggTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGt < 2:4004374/93‑1 (MQ=255)
ggTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGt < 1:3044098/93‑1 (MQ=255)
ggTTATTGCCAGGGCGGTGCA‑AATAAAGGCGGTATTGTTGGGATGGAGGGGAAAAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTc < 1:3611102/93‑1 (MQ=255)
gTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTc < 2:5441897/93‑1 (MQ=255)
gTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTc < 2:2000600/93‑1 (MQ=255)
ttATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTcc < 2:701872/93‑1 (MQ=255)
gtATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTcc < 2:5544158/92‑1 (MQ=255)
aTTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGt < 2:3692019/93‑1 (MQ=255)
ttGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTa > 1:2551526/1‑93 (MQ=255)
gCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTAtt > 1:2717841/1‑93 (MQ=255)
cccAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTc > 1:4552740/1‑93 (MQ=255)
cccAGGCGGTGCACAATAACGGCGGGATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTc > 2:2116558/1‑93 (MQ=255)
cAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCg > 1:5962791/1‑93 (MQ=255)
cAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCg < 1:1227900/93‑1 (MQ=255)
cAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCg < 2:4263608/93‑1 (MQ=255)
cAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCg > 2:6334221/1‑93 (MQ=255)
aGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCgg > 1:1078840/1‑93 (MQ=255)
ggCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCggg > 1:1181255/1‑93 (MQ=255)
ggCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCggg < 1:1338090/93‑1 (MQ=255)
ggCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGCTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCggg > 1:4736831/1‑93 (MQ=255)
gCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGt < 2:564796/93‑1 (MQ=255)
cGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGtt > 2:4683644/1‑93 (MQ=255)
cGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGtt < 1:4374680/93‑1 (MQ=255)
ggTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTa < 1:5108898/93‑1 (MQ=255)
gTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTAt < 2:2042704/93‑1 (MQ=255)
tGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATc > 2:352588/1‑93 (MQ=255)
cacaATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTTCGTATTCCGGGTTATCtg > 2:911488/1‑93 (MQ=255)
acaATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCtgg < 2:3894624/93‑1 (MQ=255)
caATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCtggt < 1:2184706/93‑1 (MQ=255)
caATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCtggt > 2:3266076/1‑93 (MQ=255)
aTAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCtggtgg > 1:5399625/1‑93 (MQ=255)
aTAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCtggtgg > 2:2596457/1‑93 (MQ=255)
tAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGa > 1:1621190/1‑93 (MQ=255)
tAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGa < 1:2126820/93‑1 (MQ=255)
aCGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGata > 2:849818/1‑93 (MQ=255)
aCGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGata > 2:1666010/1‑93 (MQ=255)
cggcggTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGatat < 1:2247906/93‑1 (MQ=255)
ggTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGATATtgtg < 1:1925382/93‑1 (MQ=255)
ggTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGATATtgtg < 2:2511297/93‑1 (MQ=255)
gTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTgtgg < 2:5171657/93‑1 (MQ=255)
gTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTgtgg > 1:5444320/1‑93 (MQ=255)
gTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTgtgg > 1:6165997/1‑93 (MQ=255)
gTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTgtgg < 2:2142116/93‑1 (MQ=255)
gTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTgtgg > 1:1460389/1‑93 (MQ=255)
aTTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTgtggtg > 2:1002533/1‑93 (MQ=255)
aTTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTgtggtg < 2:5055915/93‑1 (MQ=255)
aTTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGATATCTGGTGGATATTgtggtg > 1:4233303/1‑93 (MQ=255)
ttGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGtggtgg > 1:5724133/1‑93 (MQ=255)
ttGTGATGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGtggtgg > 1:1829869/1‑93 (MQ=255)
tgtgGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTggtggt < 1:5921278/93‑1 (MQ=255)
gtggtgATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTc < 2:3243473/93‑1 (MQ=255)
gtggtgATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTc < 1:3821219/93‑1 (MQ=255)
|
ACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTC > NC_000913/1774185‑1774366
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGA > NC_000913/1774184‑1774368
|
GACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGG < SRR4302547.1610678/94‑1 (MQ=60)
TGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATG < SRR4302547.1243091/94‑1 (MQ=60)
TGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATG < SRR4302547.614052/94‑1 (MQ=60)
AGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAG > SRR4302547.3327119/1‑94 (MQ=60)
AGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAG > SRR4302547.3840397/1‑94 (MQ=60)
GGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGG > SRR4302547.5737791/1‑94 (MQ=60)
GCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGG > SRR4302547.3815851/1‑94 (MQ=60)
CTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTG < SRR4302547.1422950/94‑1 (MQ=60)
CTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTG > SRR4302547.4703683/1‑94 (MQ=60)
TACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGC < SRR4302547.3761959/94‑1 (MQ=60)
TACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGC < SRR4302547.5525497/94‑1 (MQ=60)
TACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGC < SRR4302547.2232543/94‑1 (MQ=60)
ACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGCA < SRR4302547.2769823/94‑1 (MQ=60)
cattACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAG < SRR4302547.4254011/90‑1 (MQ=60)
CGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAG > SRR4302547.64494/1‑94 (MQ=60)
CGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAG > SRR4302547.4359689/1‑94 (MQ=60)
GCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGA > SRR4302547.147750/1‑94 (MQ=60)
CCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGCAGAA > SRR4302547.6138633/1‑94 (MQ=60)
CACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAA < SRR4302547.3573060/94‑1 (MQ=60)
CACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAA < SRR4302547.3002095/94‑1 (MQ=60)
CACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAA > SRR4302547.4190337/1‑94 (MQ=60)
CTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAAT > SRR4302547.4695324/1‑94 (MQ=60)
CTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGCATTGTGATGATGCAGGGGCAGAAAAT > SRR4302547.900035/1‑94 (MQ=60)
TTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATG > SRR4302547.6702964/1‑94 (MQ=60)
TTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGT > SRR4302547.1149358/1‑94 (MQ=60)
TTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGT < SRR4302547.4452253/94‑1 (MQ=60)
GAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTA < SRR4302547.3318019/94‑1 (MQ=60)
GAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTA < SRR4302547.2283242/94‑1 (MQ=60)
GAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTA < SRR4302547.2357375/94‑1 (MQ=60)
AAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAA > SRR4302547.2440155/1‑94 (MQ=60)
AGATGGGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAAGGGTTAAG < SRR4302547.5297727/94‑1 (MQ=60)
ATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGGTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACAGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAACATGGGTAAGAA > SRR4302547.43585/1‑94 (MQ=60)
TGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAA > SRR4302547.6602777/1‑94 (MQ=60)
GTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCA < SRR4302547.4759693/94‑1 (MQ=60)
TGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCAC < SRR4302547.1925973/94‑1 (MQ=60)
TGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCT < SRR4302547.5667999/94‑1 (MQ=60)
TATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGC > SRR4302547.5432728/1‑94 (MQ=60)
TATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGC > SRR4302547.1241631/1‑94 (MQ=60)
ATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCA < SRR4302547.6776501/94‑1 (MQ=60)
ATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCA > SRR4302547.5128694/1‑94 (MQ=60)
CTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATC > SRR4302547.5744562/1‑94 (MQ=60)
GACGCATTGATTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTA > SRR4302547.6608382/1‑94 (MQ=60)
ACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAA > SRR4302547.6299242/1‑94 (MQ=60)
CGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAA > SRR4302547.6453795/1‑94 (MQ=60)
CGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAA > SRR4302547.707282/1‑94 (MQ=60)
CGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAA > SRR4302547.3349007/1‑94 (MQ=60)
GCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAAT > SRR4302547.288216/1‑94 (MQ=60)
GCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAAT < SRR4302547.2826617/94‑1 (MQ=60)
GCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAAT > SRR4302547.481501/1‑94 (MQ=60)
CATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATC > SRR4302547.1136500/1‑94 (MQ=60)
CATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATC < SRR4302547.141687/94‑1 (MQ=60)
ATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCT < SRR4302547.3069262/94‑1 (MQ=60)
ATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCT < SRR4302547.6199151/94‑1 (MQ=60)
TTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTG < SRR4302547.6501862/94‑1 (MQ=60)
TTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTG < SRR4302547.286507/94‑1 (MQ=60)
TGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGT < SRR4302547.1370531/94‑1 (MQ=60)
GGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTC < SRR4302547.3104670/94‑1 (MQ=60)
GGTTATTGCCAGGGCGGTGCA‑AATAAAGGCGGTATTGTTGGGATGGAGGGGAAAAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCC < SRR4302547.3684765/94‑1 (MQ=34)
GTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCC < SRR4302547.4695806/94‑1 (MQ=60)
GTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCC < SRR4302547.8171/94‑1 (MQ=60)
TTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCG < SRR4302547.4345320/94‑1 (MQ=60)
ATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTA > SRR4302547.2603050/1‑94 (MQ=60)
ATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTA < SRR4302547.2572839/94‑1 (MQ=60)
TTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTAT < SRR4302547.656079/94‑1 (MQ=60)
TGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATACAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGACACGCTGCATCCTACATCTGTCCGTATT > SRR4302547.2740890/1‑94 (MQ=60)
TGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATT < SRR4302547.3783941/94‑1 (MQ=60)
TGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATT > SRR4302547.2772401/1‑94 (MQ=60)
TGCCCAGACGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATT < SRR4302547.2668471/94‑1 (MQ=60)
GCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTC > SRR4302547.4646916/1‑94 (MQ=60)
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CCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCC < SRR4302547.1645360/94‑1 (MQ=60)
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CCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCC > SRR4302547.4500332/1‑94 (MQ=60)
CCCAGGCGGGGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGCAGAAAAGGGTTAAGAAAGGCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCC > SRR4302547.1783265/1‑94 (MQ=60)
CCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCG > SRR4302547.6486156/1‑94 (MQ=60)
CCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCG > SRR4302547.1315381/1‑94 (MQ=60)
CCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCG > SRR4302547.2873398/1‑94 (MQ=60)
CCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCG > SRR4302547.6086449/1‑94 (MQ=60)
CAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGG < SRR4302547.1252669/94‑1 (MQ=60)
CAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGG < SRR4302547.5161432/94‑1 (MQ=60)
CAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGG > SRR4302547.1100368/1‑94 (MQ=60)
CAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGG > SRR4302547.3382038/1‑94 (MQ=60)
CAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGG < SRR4302547.2216459/94‑1 (MQ=60)
AGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGG > SRR4302547.367374/1‑94 (MQ=60)
AGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGG > SRR4302547.1205121/1‑94 (MQ=60)
AGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGG < SRR4302547.5987041/94‑1 (MQ=60)
AGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGCTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGG > SRR4302547.4835002/1‑94 (MQ=60)
GGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGT < SRR4302547.1364985/94‑1 (MQ=60)
CGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTA < SRR4302547.4464581/94‑1 (MQ=60)
GGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTAT < SRR4302547.5214184/94‑1 (MQ=60)
GGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTAT > SRR4302547.2366809/1‑94 (MQ=60)
GTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATC < SRR4302547.2310088/94‑1 (MQ=60)
CACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGG > SRR4302547.4931467/1‑94 (MQ=60)
CACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGG < SRR4302547.6113307/94‑1 (MQ=60)
ACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGT > SRR4302547.2898253/1‑94 (MQ=60)
CAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTG > SRR4302547.5587216/1‑94 (MQ=60)
CAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTG > SRR4302547.3704379/1‑94 (MQ=60)
CAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTG < SRR4302547.2228493/94‑1 (MQ=60)
AATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGG > SRR4302547.5511218/1‑94 (MQ=60)
AATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGG < SRR4302547.6171569/94‑1 (MQ=60)
AATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGG < SRR4302547.384853/94‑1 (MQ=60)
ATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGA > SRR4302547.1653271/1‑94 (MQ=60)
TAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGAT < SRR4302547.2169197/94‑1 (MQ=60)
ACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGATAT < SRR4302547.2123867/94‑1 (MQ=60)
CGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGATATT < SRR4302547.2293284/94‑1 (MQ=60)
GGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTG < SRR4302547.1574717/94‑1 (MQ=60)
CGGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTG > SRR4302547.4103167/1‑94 (MQ=60)
GGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGG < SRR4302547.5495678/94‑1 (MQ=60)
GGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGG > SRR4302547.1489572/1‑94 (MQ=60)
GGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGG > SRR4302547.6293978/1‑94 (MQ=60)
GGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGG < SRR4302547.1963520/94‑1 (MQ=60)
GGTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGG > SRR4302547.5556814/1‑94 (MQ=60)
GTATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGT < SRR4302547.6045032/94‑1 (MQ=60)
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TATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTG < SRR4302547.1203736/94‑1 (MQ=60)
TATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTG < SRR4302547.6257715/94‑1 (MQ=60)
TATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTG < SRR4302547.931930/94‑1 (MQ=60)
TATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGATATCTGGTGGATATTGTGGTG > SRR4302547.4319855/1‑94 (MQ=60)
ATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGG > SRR4302547.5842374/1‑94 (MQ=60)
ATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGG < SRR4302547.4757827/94‑1 (MQ=60)
ATTGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGG > SRR4302547.5064403/1‑94 (MQ=60)
ATTGTGATGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGG < SRR4302547.3649496/94‑1 (MQ=60)
ATTGTGATGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGG > SRR4302547.1866036/1‑94 (MQ=60)
TGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTC < SRR4302547.4235200/94‑1 (MQ=60)
TGTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTC < SRR4302547.6044011/94‑1 (MQ=60)
GTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCG < SRR4302547.3070446/94‑1 (MQ=60)
GTGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCG < SRR4302547.3899083/94‑1 (MQ=60)
TGGTGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGA > SRR4302547.5896185/1‑94 (MQ=60)
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GACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGA > NC_000913/1774184‑1774368
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
