Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
593 |
264.2 |
13311096 |
97.8% |
13018251 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,838,055 |
Δ1 bp |
coding (509/1458 nt) |
ascF → |
PTS system enzyme IIBC |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,838,055 | 0 | G | . | 100.0%
| 1088.4
/ NA
| 231 | coding (509/1458 nt) | ascF | PTS system enzyme IIBC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base . (102/129); total (102/129) |
Only 100 of 238 total aligned reads displayed.
CAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑C‑GCATCTGCCGCGCATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGC > NC_000913/2837968‑2838142
|
cAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCcgcgatca > 1:3860855/1‑89 (MQ=255)
cAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCa < 2:5782203/93‑1 (MQ=255)
cAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCa > 2:1148556/1‑93 (MQ=255)
aaaGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGAG‑GCATCTGCCGC‑CATCaaa > 1:771452/1‑93 (MQ=255)
aaaGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCaaa > 1:2701325/1‑93 (MQ=255)
ggATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAAttt > 2:5015562/1‑93 (MQ=255)
gATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTa > 2:3317852/1‑93 (MQ=255)
aTCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTaa > 2:3683869/1‑93 (MQ=255)
aTCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTaa > 2:6520158/1‑93 (MQ=255)
tCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTaaa < 2:589529/93‑1 (MQ=255)
tCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTaaa < 1:6612111/93‑1 (MQ=255)
ccGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAAcc < 2:1992510/93‑1 (MQ=255)
ccGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAAcc > 1:3954128/1‑93 (MQ=255)
gACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCaa > 2:5733649/1‑93 (MQ=255)
gACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCaa > 1:837204/1‑93 (MQ=255)
gACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCaa < 2:3005296/93‑1 (MQ=255)
aCCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAat > 2:3866106/1‑93 (MQ=255)
ccTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAata < 2:4820998/93‑1 (MQ=255)
ccTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAata < 2:2852929/93‑1 (MQ=255)
cTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAatat < 2:882737/93‑1 (MQ=255)
cTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAatat > 2:5148460/1‑93 (MQ=255)
ttAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATg < 1:3216152/93‑1 (MQ=255)
ttAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATg > 2:48991/1‑93 (MQ=255)
ttAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATg < 2:2439622/93‑1 (MQ=255)
ttAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATg < 1:1653114/93‑1 (MQ=255)
tAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGt > 2:6125935/1‑93 (MQ=255)
aaCCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTc < 1:2604748/93‑1 (MQ=255)
aaCCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTc < 2:5120682/93‑1 (MQ=255)
aaCCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTc < 2:5270663/93‑1 (MQ=255)
aaCCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTc > 1:1995501/1‑93 (MQ=255)
aCCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCg < 2:4325552/93‑1 (MQ=255)
aCCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCg > 2:3172419/1‑93 (MQ=255)
aCCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCg > 2:1872463/1‑93 (MQ=255)
aCCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCg > 1:1121061/1‑93 (MQ=255)
aCCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCg > 1:5054290/1‑93 (MQ=255)
aCCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCg > 1:4375389/1‑93 (MQ=255)
cATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCt < 1:2903588/93‑1 (MQ=255)
aTTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTg < 1:3389826/93‑1 (MQ=255)
aTTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTCCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTg < 1:5709341/93‑1 (MQ=255)
cTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCg > 2:5955852/1‑93 (MQ=255)
tGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGa > 2:4077075/1‑93 (MQ=255)
gAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGAt < 1:5835078/93‑1 (MQ=255)
gAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGAt < 1:2507225/93‑1 (MQ=255)
aaTGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGAtt < 1:4867586/93‑1 (MQ=255)
aaTGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGAtt < 2:831102/93‑1 (MQ=255)
aTGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTg < 1:3436860/93‑1 (MQ=255)
tgtgATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGc < 1:860311/93‑1 (MQ=255)
gtgATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGcc > 1:1389054/1‑93 (MQ=255)
tgATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCa > 2:6377345/1‑93 (MQ=255)
gATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCAt < 2:5665426/93‑1 (MQ=255)
aTTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATc > 2:2675143/1‑93 (MQ=255)
ttGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATcg > 2:2350641/1‑93 (MQ=255)
tGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATcgc > 2:1518724/1‑93 (MQ=255)
tGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCggg < 2:4419336/93‑1 (MQ=255)
aCGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGgtg > 2:4055446/1‑93 (MQ=255)
cGGTTCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGgtgt < 1:1813545/93‑1 (MQ=255)
cGGTGCTTCCTTCTTCCTGCCGTTGATGCTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGgtgt < 2:1462001/93‑1 (MQ=255)
gTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGc > 2:1755569/1‑93 (MQ=255)
gTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGc < 2:5460939/93‑1 (MQ=255)
gTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGc > 1:6377968/1‑93 (MQ=255)
gTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGc < 1:4940433/93‑1 (MQ=255)
gTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGGGTGc > 1:3070622/1‑93 (MQ=255)
gTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑AATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGc < 2:4578980/93‑1 (MQ=255)
gCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTg > 2:1289144/1‑93 (MQ=255)
cTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTgg > 1:5665842/1‑93 (MQ=255)
ttcttcttcCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTa < 1:5986129/93‑1 (MQ=255)
tcttcttcCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTAc > 1:5516759/1‑93 (MQ=255)
tctccttcCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTAc < 1:5702726/93‑1 (MQ=255)
ttcttcCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACAt < 2:2079163/93‑1 (MQ=255)
ttcttcCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACAt > 1:3668210/1‑93 (MQ=255)
ttcttcCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACAt > 2:5420475/1‑93 (MQ=255)
ttcttcCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACAt < 2:3913775/93‑1 (MQ=255)
ctgccTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATcc < 2:3503920/90‑1 (MQ=255)
ttcCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCg > 1:2851984/1‑93 (MQ=255)
tGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGtt > 2:5600100/1‑93 (MQ=255)
tGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGtt < 1:4570032/93‑1 (MQ=255)
tGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGtt < 2:1097682/93‑1 (MQ=255)
gCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTTCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGttt < 1:4832307/93‑1 (MQ=255)
gATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGa < 1:5875507/93‑1 (MQ=255)
aTGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGaa > 2:4605312/1‑93 (MQ=255)
aTGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGaa < 1:4339543/93‑1 (MQ=255)
tGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAAc < 2:4456874/93‑1 (MQ=255)
ggTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACt < 2:6304466/93‑1 (MQ=255)
ggTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACt < 1:5422682/93‑1 (MQ=255)
gTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTg > 2:2194514/1‑93 (MQ=255)
cgcggcATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGAt < 1:5835033/89‑1 (MQ=255)
cgcggcATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGAt < 1:3156010/89‑1 (MQ=255)
cgcggcATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGAt < 1:6111936/89‑1 (MQ=255)
cgcggcATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGAt < 1:159456/89‑1 (MQ=255)
gcggcATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATg > 1:2352392/4‑93 (MQ=255)
gcggcATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATg < 1:4757581/90‑1 (MQ=255)
gcggcATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATg > 1:1429507/4‑93 (MQ=255)
gcATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCg < 1:1072418/93‑1 (MQ=255)
gcATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCg > 2:1053843/1‑93 (MQ=255)
gaaTCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCg > 1:3520242/3‑93 (MQ=255)
aTCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGaa < 1:2118697/93‑1 (MQ=255)
tCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGaca > 2:6024173/1‑91 (MQ=255)
tCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGaaa < 1:5191055/93‑1 (MQ=255)
tCTGCCGC‑CATAAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGaaa < 1:1207789/93‑1 (MQ=255)
tGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGc > 1:4538385/1‑93 (MQ=255)
|
CAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑C‑GCATCTGCCGCGCATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGC > NC_000913/2837968‑2838142
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑C‑GCATCTGCCGCGCATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGCCCA > NC_000913/2837963‑2838148
|
GCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGCC < SRR4302547.2617383/94‑1 (MQ=60)
ACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGCG‑ATCA > SRR4302547.3939425/1‑94 (MQ=60)
CAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAA < SRR4302547.1267356/94‑1 (MQ=60)
AAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGAG‑GCATCTGCCGC‑CATCAAA > SRR4302547.786026/1‑94 (MQ=60)
AAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAA > SRR4302547.2755542/1‑94 (MQ=60)
AAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAAT > SRR4302547.1474906/1‑94 (MQ=60)
GATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAA < SRR4302547.5826320/94‑1 (MQ=60)
GATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAA < SRR4302547.3911116/94‑1 (MQ=60)
TCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAA < SRR4302547.6749744/94‑1 (MQ=60)
TCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAA < SRR4302547.5260354/94‑1 (MQ=60)
GCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACC < SRR4302547.1316951/94‑1 (MQ=60)
GCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACC > SRR4302547.4034556/1‑94 (MQ=60)
GCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACC > SRR4302547.5409425/1‑94 (MQ=60)
CGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAA > SRR4302547.853184/1‑94 (MQ=60)
CGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAA < SRR4302547.4930186/94‑1 (MQ=60)
GACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAAT < SRR4302547.5816920/94‑1 (MQ=60)
GACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAAT > SRR4302547.937761/1‑94 (MQ=60)
GACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAAT > SRR4302547.5560212/1‑94 (MQ=60)
CCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATAT < SRR4302547.6029540/94‑1 (MQ=60)
CCTTAACCATTCTGAACGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATAT > SRR4302547.6747690/1‑94 (MQ=60)
CTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATG < SRR4302547.5014687/94‑1 (MQ=60)
CTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATG > SRR4302547.4447774/1‑94 (MQ=60)
TTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGT < SRR4302547.1685726/94‑1 (MQ=60)
TTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGT < SRR4302547.3280305/94‑1 (MQ=60)
TGAACCATTCGGAATGTGATTGGTGACGGTTCTTTCTTCTTCCTGCCGTTGATGGTCG‑CTGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGT < SRR4302547.1866838/94‑1 (MQ=60)
TAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTC > SRR4302547.2035190/1‑94 (MQ=60)
AACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCG > SRR4302547.5158629/1‑94 (MQ=60)
AACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCG > SRR4302547.3259522/1‑94 (MQ=60)
AACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCG > SRR4302547.4465298/1‑94 (MQ=60)
AACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCG < SRR4302547.2657246/94‑1 (MQ=60)
AACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCG > SRR4302547.4009523/1‑94 (MQ=60)
AACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCG > SRR4302547.1143668/1‑94 (MQ=60)
CATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTG < SRR4302547.4940934/94‑1 (MQ=60)
CATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTG > SRR4302547.168025/1‑94 (MQ=60)
CATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTG > SRR4302547.1747494/1‑94 (MQ=60)
CATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTG < SRR4302547.89871/94‑1 (MQ=60)
CATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTG < SRR4302547.2961488/94‑1 (MQ=60)
CTTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGG < SRR4302547.794755/94‑1 (MQ=60)
ATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGG < SRR4302547.3458791/94‑1 (MQ=60)
ATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTCCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGG < SRR4302547.5827265/94‑1 (MQ=60)
TTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGC < SRR4302547.2820047/94‑1 (MQ=60)
TCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCG < SRR4302547.6005913/94‑1 (MQ=60)
GAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATT < SRR4302547.2557908/94‑1 (MQ=60)
GAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATT < SRR4302547.5955808/94‑1 (MQ=60)
AATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTG > SRR4302547.2916230/1‑94 (MQ=60)
AATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTG < SRR4302547.4968458/94‑1 (MQ=60)
AATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTG > SRR4302547.5955806/1‑94 (MQ=60)
ATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGC < SRR4302547.3506933/94‑1 (MQ=60)
TGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCC > SRR4302547.1416856/1‑94 (MQ=60)
TGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCC < SRR4302547.876747/94‑1 (MQ=60)
GATCGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATC > SRR4302547.3325672/1‑94 (MQ=60)
ATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCG < SRR4302547.28707/94‑1 (MQ=60)
ATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCG > SRR4302547.243913/1‑94 (MQ=60)
ACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGT > SRR4302547.446205/1‑94 (MQ=60)
CGGTTCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTG < SRR4302547.1849374/94‑1 (MQ=60)
GGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGC > SRR4302547.4253390/1‑94 (MQ=60)
GGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGC > SRR4302547.6511065/1‑94 (MQ=60)
GGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGC > SRR4302547.6173983/1‑94 (MQ=60)
GGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGGGTGC > SRR4302547.3131632/1‑94 (MQ=60)
GGTGATTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGC < SRR4302547.563064/94‑1 (MQ=60)
GTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCT < SRR4302547.5042745/94‑1 (MQ=60)
GCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGG < SRR4302547.5018869/94‑1 (MQ=60)
GCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGG > SRR4302547.5782831/1‑94 (MQ=60)
CTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGT < SRR4302547.1143014/94‑1 (MQ=60)
TTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGACATCGCGGGTGTGCTGGTA > SRR4302547.1420827/1‑94 (MQ=60)
TTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTAC < SRR4302547.6110308/94‑1 (MQ=60)
TTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTAC > SRR4302547.5630648/1‑94 (MQ=60)
TCTCCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACA < SRR4302547.5820525/94‑1 (MQ=60)
CTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACAT > SRR4302547.3743022/1‑94 (MQ=60)
CTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACAT > SRR4302547.5703819/1‑94 (MQ=60)
CTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCG > SRR4302547.2587503/1‑94 (MQ=60)
CTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCG > SRR4302547.2908988/1‑94 (MQ=60)
CTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCG < SRR4302547.2555729/94‑1 (MQ=60)
TTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGA < SRR4302547.3118436/94‑1 (MQ=60)
CCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGT > SRR4302547.6364341/1‑94 (MQ=60)
CTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTT > SRR4302547.3716690/1‑94 (MQ=60)
CTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTT < SRR4302547.2716009/94‑1 (MQ=60)
TGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTT < SRR4302547.4660763/94‑1 (MQ=60)
TGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTT < SRR4302547.4664594/94‑1 (MQ=60)
GCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTTCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTT < SRR4302547.4932474/94‑1 (MQ=60)
GCCGCTGAGGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTT > SRR4302547.5480783/1‑94 (MQ=60)
CCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTT > SRR4302547.4710351/1‑94 (MQ=60)
CGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTAT > SRR4302547.5126089/1‑94 (MQ=60)
GCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATT < SRR4302547.3055647/94‑1 (MQ=60)
TGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGA > SRR4302547.59047/1‑94 (MQ=60)
GATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAA < SRR4302547.5997139/94‑1 (MQ=60)
ATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAAC < SRR4302547.4428790/94‑1 (MQ=60)
ATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAAC > SRR4302547.165351/1‑94 (MQ=60)
ATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAAC < SRR4302547.6754837/94‑1 (MQ=60)
TGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACT < SRR4302547.481653/94‑1 (MQ=60)
GGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGCGTTTTATTGAACTG > SRR4302547.3393473/1‑94 (MQ=60)
GGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTG < SRR4302547.2387417/94‑1 (MQ=60)
GGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTG < SRR4302547.6488856/94‑1 (MQ=60)
GGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTG < SRR4302547.5534831/94‑1 (MQ=60)
GTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGA < SRR4302547.1211175/94‑1 (MQ=60)
GTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGA > SRR4302547.1472729/1‑94 (MQ=60)
gtcccgGCATCTGCCGC‑CATTAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGA < SRR4302547.1469247/88‑1 (MQ=60)
TCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGAT < SRR4302547.1685489/94‑1 (MQ=60)
CG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATG < SRR4302547.162379/94‑1 (MQ=60)
CG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATG < SRR4302547.5955762/94‑1 (MQ=60)
CG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATG < SRR4302547.6238720/94‑1 (MQ=60)
CG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATG > SRR4302547.2400061/1‑94 (MQ=60)
CG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATG > SRR4302547.1458094/1‑94 (MQ=60)
CG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATG < SRR4302547.3218770/94‑1 (MQ=60)
CG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATG < SRR4302547.874718/94‑1 (MQ=60)
gcgGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGG < SRR4302547.4856155/91‑1 (MQ=60)
G‑GCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCG > SRR4302547.401403/1‑94 (MQ=60)
G‑GCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCG < SRR4302547.205511/94‑1 (MQ=60)
ggaATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCG > SRR4302547.3592099/4‑94 (MQ=60)
GCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGA < SRR4302547.1093785/94‑1 (MQ=60)
GCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGA < SRR4302547.4579600/94‑1 (MQ=60)
CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAA > SRR4302547.194742/1‑94 (MQ=60)
ATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAA > SRR4302547.794493/1‑94 (MQ=60)
ATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAA > SRR4302547.3524102/1‑94 (MQ=60)
ATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAA > SRR4302547.5989105/1‑94 (MQ=60)
ATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAA > SRR4302547.5918404/1‑94 (MQ=60)
ATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAA < SRR4302547.2160927/94‑1 (MQ=60)
TCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACGTCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAG > SRR4302547.3722520/1‑94 (MQ=60)
TCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAG < SRR4302547.5297891/94‑1 (MQ=60)
TCTGCCGC‑CATAAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAG < SRR4302547.1232168/94‑1 (MQ=60)
CTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGC > SRR4302547.4632189/1‑94 (MQ=60)
CTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGC < SRR4302547.3467935/94‑1 (MQ=60)
CTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGC < SRR4302547.3172094/94‑1 (MQ=60)
GCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGG < SRR4302547.4985857/94‑1 (MQ=60)
GCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGG < SRR4302547.6138692/94‑1 (MQ=60)
CCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGC < SRR4302547.4089752/94‑1 (MQ=60)
CGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGCC < SRR4302547.2964155/94‑1 (MQ=60)
CGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGCC > SRR4302547.828804/1‑94 (MQ=60)
CCATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGCCCA < SRR4302547.560894/94‑1 (MQ=60)
CCATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGCCCA > SRR4302547.182996/1‑94 (MQ=60)
CCATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGCCCA > SRR4302547.3303750/1‑94 (MQ=60)
CCATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGCCCA > SRR4302547.1671069/1‑94 (MQ=60)
|
GCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑C‑GCATCTGCCGCGCATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGCCCA > NC_000913/2837963‑2838148
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
