Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
593 |
264.2 |
13311096 |
97.8% |
13018251 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,930,677 |
+G |
intergenic (+175/‑264) |
kup → / → rbsD |
low affinity potassium transport system/RbsD |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,930,676 | 1 | . | G | 100.0%
| 849.5
/ NA
| 229 | intergenic (+174/‑265) | kup/rbsD | low affinity potassium transport system/RbsD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base G (110/119); total (110/119) |
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
GTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑GCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAA > NC_000913/3930584‑3930763
|
gTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTc < 2:3926360/93‑1 (MQ=255)
agaagaAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑gg < 1:2271645/93‑2 (MQ=255)
aagaagTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑ggca < 2:4459124/93‑4 (MQ=255)
agaagTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑ggcaa < 2:4707033/93‑5 (MQ=255)
ttttCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGcc < 2:4519488/93‑1 (MQ=255)
tttCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGccc < 1:2840768/93‑1 (MQ=255)
tCCACCGCTGCGGTCTGTAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGt < 1:2499377/93‑1 (MQ=255)
tCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGt < 1:5476707/93‑1 (MQ=255)
tCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGt < 2:4346860/93‑1 (MQ=255)
cACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTgg < 2:2811493/93‑1 (MQ=255)
cACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTgg > 1:2192677/1‑93 (MQ=255)
aCCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGt > 1:3375325/1‑93 (MQ=255)
tGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTg < 2:2212464/93‑1 (MQ=255)
gCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGc > 2:2179659/1‑93 (MQ=255)
cgTCTGGAAGGATTACGTTGCCGGATGATGGAACCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTAGTATTTGCGt < 1:5961289/92‑1 (MQ=255)
tCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCt < 1:5604335/93‑1 (MQ=255)
tGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTgc < 1:1810796/93‑1 (MQ=255)
tGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTgc > 2:4262670/1‑93 (MQ=255)
ggAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTgcg < 1:4498833/93‑1 (MQ=255)
ggAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTgcg > 1:939237/1‑93 (MQ=255)
ggAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTgcg < 1:3604321/93‑1 (MQ=255)
aaGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGcgcg > 2:5169592/1‑93 (MQ=255)
aaGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGcgcg > 2:6001229/1‑93 (MQ=255)
aaGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGcgcg > 1:4194226/1‑93 (MQ=255)
ggATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGc > 2:6130592/1‑93 (MQ=255)
ggATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGc > 1:6357092/1‑93 (MQ=255)
ggATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGc > 2:3748409/1‑93 (MQ=255)
ggATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCATCTGCGCGGc > 2:4018696/1‑93 (MQ=255)
gATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCa > 2:3477382/1‑93 (MQ=255)
aTTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCaa < 1:4776174/93‑1 (MQ=255)
aTTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCaa < 2:4084011/93‑1 (MQ=255)
tAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGc > 2:702478/1‑93 (MQ=255)
tAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGc < 1:6122656/93‑1 (MQ=255)
aaGTTTCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCt < 1:3666540/93‑1 (MQ=255)
gTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGt < 2:2890395/93‑1 (MQ=255)
gTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGt < 1:1020650/93‑1 (MQ=255)
gTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGt > 2:66017/1‑93 (MQ=255)
ttGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTa < 1:6228706/93‑1 (MQ=255)
tGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTAc < 1:848121/93‑1 (MQ=255)
tGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTAc > 2:5952650/1‑93 (MQ=255)
tGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTAc > 2:2696074/1‑93 (MQ=255)
tGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTAc > 2:2151787/1‑93 (MQ=255)
gCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTTCt < 1:6435702/93‑1 (MQ=255)
gCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACt < 2:3328067/93‑1 (MQ=255)
ccGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACtt < 2:1073556/93‑1 (MQ=255)
ggATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgc > 1:5943034/1‑93 (MQ=255)
ggATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgc < 2:310127/93‑1 (MQ=255)
ggATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgc < 2:3314467/93‑1 (MQ=255)
ggATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgc < 1:3231753/93‑1 (MQ=255)
ggATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgc > 2:810848/1‑93 (MQ=255)
ggATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgc > 2:1390875/1‑93 (MQ=255)
gatgatGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgct < 2:1225549/93‑1 (MQ=255)
gatgatGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgct > 2:126488/1‑93 (MQ=255)
tgatgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctgc < 1:4012401/93‑1 (MQ=255)
tgatgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctgc > 1:4825614/1‑93 (MQ=255)
gatgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctgct < 2:1700656/93‑1 (MQ=255)
gatgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctgct > 1:428309/1‑93 (MQ=255)
gatgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctgct > 1:4639172/1‑93 (MQ=255)
gatgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctgct > 1:6506580/1‑93 (MQ=255)
gAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCaa < 2:192617/93‑1 (MQ=255)
aaaCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAAc < 1:5324079/93‑1 (MQ=255)
aaaCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAAc < 1:1487079/93‑1 (MQ=255)
aaCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACg < 1:217635/93‑1 (MQ=255)
aaCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACg < 2:1601476/93‑1 (MQ=255)
aCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGt < 2:3868184/93‑1 (MQ=255)
aCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGt < 1:2807232/93‑1 (MQ=255)
cctcctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTa < 2:5076146/93‑1 (MQ=255)
cctcctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTa > 2:4635611/1‑93 (MQ=255)
tcctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAAt > 1:6536380/1‑93 (MQ=255)
tcctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAAt < 1:5016767/93‑1 (MQ=255)
cctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATg < 1:2125963/93‑1 (MQ=255)
cctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATg > 2:3088758/1‑93 (MQ=255)
cttcttTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATgc < 2:48430/93‑1 (MQ=255)
cttcttTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATgc > 1:1344925/1‑93 (MQ=255)
cttcttTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATgc < 2:2143226/93‑1 (MQ=255)
tcttTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATgcgc < 1:1264848/93‑1 (MQ=255)
tcttTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATgcgc > 2:2467249/1‑93 (MQ=255)
cttTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCt > 1:2262201/1‑93 (MQ=255)
cttTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCt < 2:5540804/93‑1 (MQ=255)
tttATGTCGCATGATTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTg < 1:3870851/93‑1 (MQ=255)
tttATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTg > 2:5745540/1‑93 (MQ=255)
ttATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGc < 2:5309150/93‑1 (MQ=255)
aTGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGt > 1:4516432/1‑93 (MQ=255)
cGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCATCGTAATGCGCTGCGTGCAc < 2:6102091/93‑1 (MQ=255)
gCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCAcc > 1:5135153/1‑93 (MQ=255)
gCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCAcc > 2:2330730/1‑93 (MQ=255)
gCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCAcc > 2:6340248/1‑93 (MQ=255)
cATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCa > 2:2598399/1‑93 (MQ=255)
cATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCa > 2:3678037/1‑93 (MQ=255)
gAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGAt < 2:53910/93‑1 (MQ=255)
gAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGAt < 2:4779025/93‑1 (MQ=255)
gAGTCGTAGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGAt < 1:123934/93‑1 (MQ=255)
tCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCaa > 1:486597/1‑93 (MQ=255)
cGTTGATCNTCGGCAAACGCCCGTNGNATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAAt < 1:263785/93‑1 (MQ=255)
gTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAAtt > 2:909887/1‑93 (MQ=255)
ttGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAAttt > 2:718712/1‑93 (MQ=255)
ttGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAAttt < 1:1034540/93‑1 (MQ=255)
gATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGa < 2:4753610/93‑1 (MQ=255)
tCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGaaa > 2:6316070/1‑93 (MQ=255)
tCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGaaa < 1:3064324/93‑1 (MQ=255)
|
GTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑GCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAA > NC_000913/3930584‑3930763
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑G‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGC > NC_000913/3930586‑3930769
|
AGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑Ggc < SRR4302547.2317592/94‑3 (MQ=60)
AGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑Ggc < SRR4302547.3667672/94‑3 (MQ=60)
AGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑Ggc < SRR4302547.1511756/94‑3 (MQ=60)
AAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAA < SRR4302547.2487297/94‑1 (MQ=60)
AAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAA < SRR4302547.6479175/94‑1 (MQ=60)
AGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAA > SRR4302547.1195741/1‑94 (MQ=60)
GAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAAC < SRR4302547.3612475/94‑1 (MQ=60)
GAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAAC > SRR4302547.4719408/1‑94 (MQ=60)
AAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACG < SRR4302547.5010742/94‑1 (MQ=60)
GTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCC > SRR4302547.1717605/1‑94 (MQ=60)
TTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCG < SRR4302547.5383029/94‑1 (MQ=60)
TTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCG < SRR4302547.2897536/94‑1 (MQ=60)
TTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCCTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCG < SRR4302547.5525588/94‑1 (MQ=60)
TCCACCGCTGCGGTCTGTAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTG < SRR4302547.2549871/94‑1 (MQ=60)
TCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTG < SRR4302547.5589821/94‑1 (MQ=60)
CCACCTTTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTGGCCGGATGATGGAAACTGCCTTCGGGAGGTCGCAGGTGTCGTTGATCCGCGG‑CAAACGCCCGTGG > SRR4302547.6786571/1‑94 (MQ=21)
CCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGG < SRR4302547.861876/94‑1 (MQ=60)
CCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGG > SRR4302547.2236692/1‑94 (MQ=60)
CACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGT > SRR4302547.1556529/1‑94 (MQ=60)
CACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGT < SRR4302547.4966420/94‑1 (MQ=60)
CACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGT > SRR4302547.3443897/1‑94 (MQ=60)
ACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTA < SRR4302547.4598080/94‑1 (MQ=60)
CCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTAT > SRR4302547.898948/1‑94 (MQ=60)
GCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATTATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTTGTATTT < SRR4302547.2225837/94‑1 (MQ=60)
CGTCTGGAAGGATTACGTTGCCGGATGATGGAACCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTAGTATTTGCGTT < SRR4302547.6084910/94‑1 (MQ=60)
GTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCT < SRR4302547.2295330/94‑1 (MQ=60)
GTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCT < SRR4302547.4907104/94‑1 (MQ=60)
TCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTG < SRR4302547.5719955/94‑1 (MQ=60)
CTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGC < SRR4302547.4526295/94‑1 (MQ=60)
TGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCG > SRR4302547.4875694/1‑94 (MQ=60)
TGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCG > SRR4302547.957428/1‑94 (MQ=60)
TGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCG < SRR4302547.134579/94‑1 (MQ=60)
TGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCG > SRR4302547.4284551/1‑94 (MQ=60)
TGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCG < SRR4302547.1846573/94‑1 (MQ=60)
GGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGC > SRR4302547.5541964/1‑94 (MQ=60)
GGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGC > SRR4302547.6196995/1‑94 (MQ=60)
GGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGC < SRR4302547.3677821/94‑1 (MQ=60)
GGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGC < SRR4302547.4591765/94‑1 (MQ=60)
GGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGC > SRR4302547.6757815/1‑94 (MQ=60)
GGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGC < SRR4302547.1051950/94‑1 (MQ=60)
GAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCG > SRR4302547.4279756/1‑94 (MQ=60)
GAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCG < SRR4302547.2824490/94‑1 (MQ=60)
AGGATTAAGTTTCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGC > SRR4302547.5414602/1‑94 (MQ=60)
AGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGC > SRR4302547.5895431/1‑94 (MQ=60)
AGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGC > SRR4302547.2164880/1‑94 (MQ=60)
AGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGC > SRR4302547.6489643/1‑94 (MQ=60)
GATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGTTATTTGCGTCTGCGCGGCAA < SRR4302547.6598911/94‑1 (MQ=60)
GATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAA > SRR4302547.2308106/1‑94 (MQ=60)
ATTAAGTTGCCTGATGATGGAATCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCATCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAG < SRR4302547.4495500/94‑1 (MQ=60)
ATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAG < SRR4302547.4875119/94‑1 (MQ=60)
TAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCT < SRR4302547.2244070/94‑1 (MQ=60)
TAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCT < SRR4302547.6249666/94‑1 (MQ=60)
AAGTTTCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTG < SRR4302547.3741327/94‑1 (MQ=60)
AAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTG > SRR4302547.5819779/1‑94 (MQ=60)
GTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTA < SRR4302547.1040659/94‑1 (MQ=60)
TTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTAC < SRR4302547.6358063/94‑1 (MQ=60)
TGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACT < SRR4302547.864318/94‑1 (MQ=60)
GCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTTCTT < SRR4302547.6569841/94‑1 (MQ=60)
CCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTG > SRR4302547.6218671/1‑94 (MQ=60)
CCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTG > SRR4302547.4129865/1‑94 (MQ=60)
CGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGC > SRR4302547.6066266/1‑94 (MQ=60)
GGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCT < SRR4302547.3296255/94‑1 (MQ=60)
ATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGC > SRR4302547.4925657/1‑94 (MQ=60)
ATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGC > SRR4302547.1153658/1‑94 (MQ=60)
TGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCT > SRR4302547.4735259/1‑94 (MQ=60)
TGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCT > SRR4302547.6642033/1‑94 (MQ=60)
TGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCT > SRR4302547.436238/1‑94 (MQ=60)
TGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCT < SRR4302547.4093958/94‑1 (MQ=60)
GATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTG > SRR4302547.2199064/1‑94 (MQ=60)
ATGGAACCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGC < SRR4302547.6282200/94‑1 (MQ=60)
GGAAACCTCCTTCTTTATGTTGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAA > SRR4302547.6617428/1‑94 (MQ=60)
GGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAA > SRR4302547.2886192/1‑94 (MQ=60)
GAACCCTCCTTCTGTATGTCGCATGAGTCGTTGCTCCTCGG‑CAAAGGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAAC < SRR4302547.355765/94‑1 (MQ=60)
AAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACG < SRR4302547.5433825/94‑1 (MQ=60)
AAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACG < SRR4302547.1516766/94‑1 (MQ=60)
AACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGT > SRR4302547.6067527/1‑94 (MQ=60)
AACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGT < SRR4302547.221740/94‑1 (MQ=60)
ACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTA > SRR4302547.2961845/1‑94 (MQ=60)
ACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTA < SRR4302547.2863417/94‑1 (MQ=60)
CCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAA < SRR4302547.3818318/94‑1 (MQ=60)
CTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAAT > SRR4302547.3739185/1‑94 (MQ=60)
CTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAAT > SRR4302547.6672399/1‑94 (MQ=60)
TCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATG < SRR4302547.5120458/94‑1 (MQ=60)
CCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGC < SRR4302547.2168328/94‑1 (MQ=60)
CCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGC > SRR4302547.1371941/1‑94 (MQ=60)
CTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCG < SRR4302547.127446/94‑1 (MQ=60)
CTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCG > SRR4302547.3116723/1‑94 (MQ=60)
TTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGC < SRR4302547.6412367/94‑1 (MQ=60)
TCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCT < SRR4302547.4810878/94‑1 (MQ=60)
TCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCT < SRR4302547.1290324/94‑1 (MQ=60)
TCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCT > SRR4302547.2307908/1‑94 (MQ=60)
TCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCT > SRR4302547.2207978/1‑94 (MQ=60)
CTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGGTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTG > SRR4302547.6667722/1‑94 (MQ=60)
TTTATGTCGCATGATTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGC < SRR4302547.3949643/94‑1 (MQ=60)
TTATGTCGCATGCGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCG < SRR4302547.2629269/94‑1 (MQ=60)
TTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCG < SRR4302547.3819211/94‑1 (MQ=60)
TTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCG > SRR4302547.1132727/1‑94 (MQ=60)
TATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGT < SRR4302547.4637089/94‑1 (MQ=60)
TATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGT > SRR4302547.4609741/1‑94 (MQ=60)
TATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGT < SRR4302547.992405/94‑1 (MQ=60)
ATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTG < SRR4302547.4127902/94‑1 (MQ=60)
CGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACC > SRR4302547.5240954/1‑94 (MQ=60)
GCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCA < SRR4302547.2833941/94‑1 (MQ=60)
GCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCA > SRR4302547.4035481/1‑94 (MQ=60)
TGAGTCGGTGATCCTC‑GCCAAACGTCCGTGGTATTTGCGTCTGGCCGCCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCTCTGCGTGCACCAGAT < SRR4302547.936074/94‑1 (MQ=60)
GAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATC > SRR4302547.1371863/1‑94 (MQ=60)
GAGTCGTAGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATC < SRR4302547.126188/94‑1 (MQ=60)
GTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAA > SRR4302547.495510/1‑94 (MQ=60)
CGTTGATCNTCGG‑CAAACGCCCGTNGNATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATT < SRR4302547.268710/94‑1 (MQ=60)
GTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTT < SRR4302547.5103919/94‑1 (MQ=60)
GTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTT > SRR4302547.3240545/1‑94 (MQ=60)
GTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTT < SRR4302547.5153770/94‑1 (MQ=60)
GTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTT < SRR4302547.5609733/94‑1 (MQ=60)
TTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTG < SRR4302547.1054898/94‑1 (MQ=60)
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TGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGA > SRR4302547.2415481/1‑94 (MQ=60)
GATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAA > SRR4302547.3215664/1‑94 (MQ=60)
ATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAA < SRR4302547.6559577/94‑1 (MQ=60)
TCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAAT < SRR4302547.3125252/94‑1 (MQ=60)
TCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAAT > SRR4302547.3543797/1‑94 (MQ=60)
CCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATC > SRR4302547.3193568/1‑94 (MQ=60)
CCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATC < SRR4302547.4016732/94‑1 (MQ=60)
CTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCC > SRR4302547.3771048/1‑94 (MQ=60)
CTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCC > SRR4302547.2441609/1‑94 (MQ=60)
cgG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCG > SRR4302547.186336/3‑94 (MQ=60)
cgG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCG > SRR4302547.5441283/3‑94 (MQ=60)
cgG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCG < SRR4302547.2646618/92‑1 (MQ=60)
G‑G‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGC < SRR4302547.5908219/94‑1 (MQ=60)
|
AGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑G‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGC > NC_000913/3930586‑3930769
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
