Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A11 F36 I0 R1
|
229 |
12610.8 |
9774876 |
98.4% |
9618477 |
135.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
RA |
NZ_CP022686 |
3,871,944 |
C→T |
84.6% |
E2K (GAA→AAA) |
ecpR ← |
ECP biosynthesis operon DNA‑binding transcriptional regulator EcpR |
|
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
* | NZ_CP022686 | 3,871,944 | 0 | C | T | 84.6%
| 739.1
/ 111.0
| 288 | E2K (GAA→AAA) | ecpR | ECP biosynthesis operon DNA‑binding transcriptional regulator EcpR |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (20/24); new base T (100/143); total (120/168) |
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.21e-01 |
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 288 total aligned reads displayed.
ACACGAAATCTTTTCTGATTTTCTCCAGCGATAGATAAATTAATCTGTCGATATCCACAATCAGTTCAGATAGTCCTTTATAGAAGTAGGCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTCCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAGTAAATCGGAAGTAAATAAGATACGTAGCACATATCAATA > NZ_CP022686/3871809‑3872080
|
aaaTCTTTTCTGATTTTCTCCAGCGATAGATAAATTAATCTGTCGATATCCACAATCAGTTCAGATAGTCCTTTATAGAAGTAGGCGTCATGGGGAGCCCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGtt > 7:547286/1‑140 (MQ=255)
aTCTTTTCTGATTTTCTCCAGCGATAGATAAATTAATCTGTCGATATCCACAATCAGTTCAGATAGTCCTTTATAGAAGTAGGCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGtttt < 5:843894/140‑1 (MQ=255)
aTCTTTTCTGATTTTCTCCAGCGATAGATAAATTAATCTGTCGATATCCACAATCAGTTCAGATAGTCCTTTATAGAAGTAGGCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTCCATATGGtt < 2:428042/138‑1 (MQ=255)
attttCTGATTTTCTCCAGCGATAGATAAATTAATCTGTCGATATCCACAATCAGTTCAGATAGTCCTTTATAGAAGTAGGCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTa < 4:492233/139‑1 (MQ=255)
taTTTTCTCCAGCGATAGATAAATTAATCTGTCGATATCCACAATCAGTTCAGATAGTCCTTTATAGAAGTAGGCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTCCATATGGTTTTTAACCTCAt < 5:915863/139‑1 (MQ=255)
gctgttCTCCAGCGATAGATAAATTAATCTGTCGATATCCACAATCAGTTCAGATAGTCCTTTATAGAAGTAGGCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGGTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCAt < 4:692293/136‑1 (MQ=255)
gATTTTCTCCAGCGATAGATAAATTAATCTGTCGATATCCACAATCAGTTCAGATAGTCCTTTATAGAAGTAGGCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTc < 1:837278/138‑1 (MQ=255)
gATTTTCTCCAGCGATAGATAAATTAATCTGTCGATATCCACAAGCAGTTCAGATAGTCCTTTATAGAAGTAGGCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCAt < 6:86182/140‑1 (MQ=255)
ttCTCCAGCGATAGATAAATTAATCTGTCGATATCCACAATCAGTTCAGATAGTCCTTTATAGAAGTAGGCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTAACAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTAATAGTc > 7:24991/1‑140 (MQ=255)
tctcCAGCGATAGATAAATTAATCTGTCGATATCCACAATCAGTTCAGATAGTCCTTTATAGAAGTAGGCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTcc < 8:14477/140‑1 (MQ=255)
cAGCGATAGATAAATTAATATGTCGATATCCACAATCAGTTCAGATAGTCCTTTATAGAAGTAGGCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCctgc < 6:104923/140‑1 (MQ=255)
gatagataAATTAATCTGTCGATATCCACAATCAGTTCAGATAGTCCTTTATAGACGTAGGCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCctgctg < 2:306396/138‑1 (MQ=255)
gatagataAATTAATCTGTCGATATCCACAATCAGTTCAGATAGTCCTTTATAGAAGTAGGCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCctgctg < 1:389889/138‑1 (MQ=255)
gatagataAATTAATCTGTCGATATCCACAATCAGTTCAGATAGTCCTTTATAGAAGTAGGCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTCGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCctgctg < 1:1110425/138‑1 (MQ=255)
aTTAATCTGTCGATATCCACAATCAGTTCAGATAGTCCTTTATAGAAGTAGGCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATAATTTTg > 6:286689/1‑140 (MQ=255)
ttAATCTGTCGATATCCACAATCAGTTCAGATAGTCCTTTATAGAAGTAGGCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCAtttt < 2:341560/138‑1 (MQ=255)
ttAATCTGTCGATATCCACAATCAGTTCAGATAGTCCTTTATAGAAGTAGGCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGc < 5:484774/140‑1 (MQ=255)
ttAATCTGTCGATATCCACAATCAGTTCAGATAGTCCTTTATAGAAGTAGGCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTCCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGc < 6:112381/140‑1 (MQ=255)
tCTGTCGATATCCACAATCAGTTCAGATAGTCCTTTATAGAAGTAGGCGTCATGGGGAGCCCAGATGTATTTATCAGAACGGTGTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATg > 7:1081451/1‑140 (MQ=255)
tCGATATCCACAATCAGTTCAGATAGTCCTTTATAGAAGTAGGCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCac > 4:101575/1‑140 (MQ=255)
tCGATATCCACAATCAGTTCAGATAGTCCTTTATAGAAGTAGGCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTCCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCac > 5:628620/1‑140 (MQ=255)
gATATCCACAATCAGTTCAGATAGTCCTTTATAGAAGTAGGCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAAGGGTTTTGTCATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCac < 1:28981/138‑1 (MQ=255)
ttCAGATAGTCCTTTATAGAAGTAGGCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTCCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTa < 4:97244/140‑1 (MQ=255)
aGTCCTTTATAGAAGTAGGCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAAtttt < 2:153891/138‑1 (MQ=255)
aGTCCTTTATAGAAGTAGGCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTCCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTa < 5:1061232/140‑1 (MQ=255)
tCCTTTATAGAAGTAGGCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTCCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACa > 8:629634/1‑140 (MQ=255)
ccTTTATAGAAGTAGGCGTCATGGGGAGACCAGCTGTATTTATCATAACGTTTTTGACATTTCATATGATTGTGAACCTCATATTCCCAGCTGTAATCATGTAGCAATGTCACTACTTTCCAAACCTTTAATTTTTAcct > 7:728318/1‑138 (MQ=255)
ccTTTATAGAAGTAGGCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAg > 4:1067654/1‑140 (MQ=255)
ccTTTATAGAAGTAGGCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACAATTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTAc > 1:706510/1‑138 (MQ=255)
tttATAGAAGTAGGCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAg < 2:1125258/138‑1 (MQ=255)
tttATAGAAGTAGGCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTATAAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAg > 1:1250763/1‑138 (MQ=255)
tataGAAGTAGGCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTaa > 3:1014447/1‑139 (MQ=255)
tataGAAGTAGGCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTAc > 6:941530/1‑140 (MQ=255)
tataGAAGTAGGCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTCCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTAc > 5:968817/1‑140 (MQ=255)
ataGAAGTAGGCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACa > 3:455898/1‑140 (MQ=255)
aaGTCGGCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCa < 3:725998/140‑1 (MQ=255)
aaGTAGGCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCa > 7:452407/1‑140 (MQ=255)
aaGTAGGCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCa > 8:832463/1‑140 (MQ=255)
gTAGGCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTCCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGt > 4:752293/1‑140 (MQ=255)
ggCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGTTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACATGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTc > 3:656799/1‑140 (MQ=255)
ggCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTc > 7:835449/1‑140 (MQ=255)
ggCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTc > 4:839582/1‑140 (MQ=255)
ggCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTCCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTc > 8:735980/1‑140 (MQ=255)
ggCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTCCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTc > 5:119541/1‑140 (MQ=255)
cATGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAg > 5:727083/1‑140 (MQ=255)
aTGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAGt < 6:1184649/140‑1 (MQ=255)
tGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAg > 2:66409/1‑138 (MQ=255)
gaCCAGATGTATTTATCAGAACGGATTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAGTAAATCgg < 7:618123/140‑1 (MQ=255)
cAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAAtttt < 1:527368/105‑1 (MQ=255)
cAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAGTAAATCGGa > 2:936342/1‑138 (MQ=255)
cgATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAGTAAATCGGaa < 2:772352/137‑1 (MQ=255)
aGATGTATTTCTCAGAACGGGTTTGACATTTCATATGGTTGTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAGTAAATCGGaa < 2:513095/138‑1 (MQ=255)
gATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAGTAAATCGGAAGTa > 7:589215/1‑140 (MQ=255)
aTGTATTTATCAGAACGGTTTTGTCTTTTCATATGTTTTTTAACCTAATAGTGCCTGGTGTAATCATTTTGCCTATTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTTCTGGTACATTCAGGTTCTTTAGTAAATCGGAAGtta < 6:65410/140‑3 (MQ=255)
aTGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAGTAAATCGGAAGt < 2:860655/138‑1 (MQ=255)
aTGTATTTATCAGAACGGATTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGGAATCATTTAGCCATGGCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAGTAAATCGGAAGTaa < 7:775808/140‑1 (MQ=255)
tttATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATATTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAGTAAATCGGAAGTAAATaat > 4:1122017/1‑139 (MQ=255)
tttATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCACACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAGTAAATCGGAAGTAAATAAg < 5:390832/140‑1 (MQ=255)
tttATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACTTTCAGTTTCTTTAGTAAATCGGAAGTAAATAAg > 8:1099910/1‑140 (MQ=255)
tttATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAGTAAATCGGAAGTAAATa < 2:566703/138‑1 (MQ=255)
tttATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAGTAAATCGGAAGTAAATAAg > 5:203093/1‑140 (MQ=255)
tttATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAGTAAATCGGAAGTAAATAAg < 3:148785/140‑1 (MQ=255)
tttATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAGTAAATCGGAAGTAAATAAg > 3:208334/1‑140 (MQ=255)
tttATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAGTAAATCGGAAGTAAATAAg < 4:284604/140‑1 (MQ=255)
tttATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAGTAAATCGGAAGTAAATAAg < 7:317880/140‑1 (MQ=255)
tttATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCAATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAGTAAATCGGAAGTAAATAAg > 8:1015791/1‑140 (MQ=255)
tttATCAGAACGGTTTTGACATTCCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTGCAGGTACATTCAGTTTCTTTAGTAAATCGGAAGTAAATAAg < 8:262585/140‑1 (MQ=255)
tttATCAGAAAGGTTTTGAGATTTCATATGGTTTTTTACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAAACTGTAATTTTTTCAGGTACTTTCAGTTTGTTTAGTAATTCGGAAGTAAATa < 1:1089511/138‑1 (MQ=255)
tATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAGTAAATCGGAAGTAAAt < 5:287820/135‑1 (MQ=255)
tATCAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTGCTTAAGTAAATCGGAAGTAAATAAGAt > 5:1043831/1‑140 (MQ=255)
cAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACATGTACATTCAGTTTCTTTAGTAAATCGGAAGTAAATAAGATACg < 7:901469/140‑1 (MQ=255)
cAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAGTAAATCGGAAGTAAATAAGATa < 1:50251/138‑1 (MQ=255)
cAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAGTAAATCGGAAGTAAATAAGATACg > 4:546237/1‑140 (MQ=255)
cAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAGTAAATCGGAAGTAAATAAGATACg > 3:481596/1‑140 (MQ=255)
cAGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAGTAAATCGGAAGTAAATAAGATACg > 5:1134230/1‑140 (MQ=255)
aaGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTCACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAGTAAATCGGAAGTAAATAAGATa < 2:120358/137‑1 (MQ=255)
aGAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAGTAAATCGGAAGTAAATAAGATACGt < 3:388897/140‑1 (MQ=255)
gAACGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTATCCTCATAGTCCCTTCTGTAATCATTTTGCCATGTAACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACATGTACATTCATTTTCTTTAGTAATTCGGAAGTTATTAAGATACg > 2:764375/1‑138 (MQ=255)
aaCTGTTTTGACATTTCATATGGGTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTAATTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAGTAAATCGGAAGTAAATAAGATACGTAg < 3:548725/140‑1 (MQ=255)
aaCGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAGTAAATCGGAAGTAAATAAGATACGTAg > 7:1039135/1‑140 (MQ=255)
aaCGGTTTTGACATTCCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAGTAAATCGGAAGTAAATAAGATACGTAg > 4:156164/1‑140 (MQ=255)
ctgTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAGTAAATCGGAAGTAAATAAGATACGTAGca < 4:1168445/138‑1 (MQ=255)
cGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAGTAAATCGGAAGTAAATAAGATACGTAg < 1:474170/138‑1 (MQ=255)
cGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAGTAAATCGGAAGTAAATAAGATACGTAGca < 7:1021322/140‑1 (MQ=255)
cGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAGTAAATCGGAAGTAAATAAGATACGTAGca < 3:907262/140‑1 (MQ=255)
cGGTTTTGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAGTAAATCGGAAGTAAATAAGATACGTAGca < 3:607680/140‑1 (MQ=255)
cGGTTTTGACATTTCATATGGTTATTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAGTAAATCGGAAGTAAATAAGATACGTAGca < 7:377142/140‑1 (MQ=255)
cGGTTTTGACATTTCATATGGATTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAGTAAATCGGAAGTAAATAAGATACGTAGca < 5:462736/140‑1 (MQ=255)
cGGTTTTGACATTCCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAGTAAATCGGAAGTAAATAAGATACGTAGca < 8:108057/140‑1 (MQ=255)
ttttGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAGTAAATCGGAAGTAAATAAGATACGTAGcac < 1:1151939/138‑1 (MQ=255)
ttttGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAGTAAATCGGAAGTAAATAAGATACGTAGCACat > 6:432702/1‑140 (MQ=255)
ttttGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAGTAAATCGGAAGTAAATAAGATACGTAGCACat < 3:267695/140‑1 (MQ=255)
ttttGACATTTCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGGCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAGTAAATCGGAAGTAAATAAGATACGTAGCACat < 7:230501/140‑1 (MQ=255)
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ATTGAGATTGATAAACACGAAATCTTTTCTGATTTTCTCCAGCGATAGATAAATTAATCTGTCGATATCCACAATCAGTTCAGATAGTCCTTTATAGAAGTAGGCGTCATGGGGAGACCAGATGTATTTATCAGAACGGTTTTGACATTCCATATGGTTTTTAACCTCATAGTCCCTGCTGTAATCATTTTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTACATTCAGTTTCTTTAGTAAATCGGAAGTAAATAAGATACGTAGCACATATCAATATAGGTTAAACGAGA > NZ_CP022686/3871795‑3872094
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |