Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
343 |
268.7 |
10873516 |
97.0% |
10547310 |
150.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009974 |
1,896,637 |
C→G |
intergenic (‑4415/‑4182) |
RPPX_08470 ← / → RPPX_08480 |
tryptophan synthase subunit beta/hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009974 | 1,896,637 | 0 | C | G | 92.6%
| 143.5
/ 12.4
| 110 | intergenic (‑4415/‑4182) | RPPX_08470/RPPX_08480 | tryptophan synthase subunit beta/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (3/5); new base G (48/52); total (52/58) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.20e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.22e-01 |
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
GTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGT > CP009974/1896487‑1896669
|
gTTGGTAGCGACGTAGACGTGGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGc < 2:3933782/151‑1 (MQ=14)
gTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGc < 2:2760960/151‑1 (MQ=31)
gTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGc < 2:1682764/151‑1 (MQ=31)
gTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGc < 2:4887072/151‑1 (MQ=32)
gTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGc > 2:1981168/1‑151 (MQ=31)
gTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGAGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGGGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCCGc > 2:5024685/1‑151 (MQ=9)
tGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCGGTTGTACCGTTAGCCGGGATGGTGATGGTGGTTTTGCCATCGTCCAGGGTAAAGGTCAGCGCCGCATGCTTGTCGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGGGt > 1:1583626/1‑151 (MQ=2)
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tGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGt < 1:4196966/151‑1 (MQ=31)
tGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGt > 2:3737480/1‑151 (MQ=31)
tGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGt > 2:356098/1‑151 (MQ=31)
tGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGt > 2:3737278/1‑151 (MQ=31)
ggTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTg < 2:766323/151‑1 (MQ=31)
ggTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTg < 2:1770324/151‑1 (MQ=31)
gTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGa < 2:2821962/151‑1 (MQ=11)
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tAGGCGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGACGGTGTAgg < 2:3175023/151‑1 (MQ=11)
tAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACAGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGGGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGATGGTGTAgg > 1:164128/1‑151 (MQ=11)
tAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACAGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGGGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGATGGTGTAgg > 1:685312/1‑151 (MQ=11)
aGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACAGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGGGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGATGGTGTAGGt < 1:4378012/151‑1 (MQ=11)
aGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACAGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGGGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGATGGTGTAGGt > 1:2329314/1‑151 (MQ=11)
aGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACAGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGGGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGATGGTGTAGGt < 1:2350643/151‑1 (MQ=11)
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aGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACAGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGGGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGATGGGGTAggg > 2:3231797/1‑150 (MQ=11)
gACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCGGCACGGTGCTGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGTGTGACGGTGTAGGTg < 2:1240821/151‑1 (MQ=11)
gACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGACGGTGTAGGTg < 2:562795/151‑1 (MQ=11)
aCGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGACGGTGTAGGTGa > 2:3905288/1‑151 (MQ=11)
cGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGACGGTGTAGGTGAt < 2:1797164/151‑1 (MQ=11)
cGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGACGGTGTAGGTGAt < 1:1868132/151‑1 (MQ=11)
cGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGACGGTGTAGGTGAt < 1:2259847/151‑1 (MQ=11)
cGTTGTCCGGGGCAGCCAAGGTGGCAGTACCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACAGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGGGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGTTCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCCGGGTGATGGTGTAGGTGAt < 1:1219326/151‑1 (MQ=11)
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gTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGACGGTGTAGGTGAtc > 1:511660/1‑151 (MQ=11)
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gTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGACGGTGTAGGTGAtc < 2:515092/151‑1 (MQ=11)
ttGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACAGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGGGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGATGGTGTAGGTGAtct < 2:3320121/151‑1 (MQ=11)
ttGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACAGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGGGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGATGGTGTAGGTGAtct < 1:1846364/151‑1 (MQ=11)
ttGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACAGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGGGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGATGGTGTAGGTGAtct > 1:763030/1‑151 (MQ=11)
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tGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGACGGTGTAGGTGAtctc < 2:3114730/151‑1 (MQ=11)
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gttaggggCAGCCACGGTGGCAGTAGCCACGGTGCCGTGGGCCGGCACAGTGATGACGGTTTTGCCGGCGCTCAGGGTGAGGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGATGGTGTAGGTGATCTcg < 2:5000558/147‑1 (MQ=11)
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tCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACAGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGGGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGATGGTGTAGGTGATCTcgc > 1:2615218/1‑151 (MQ=11)
tCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACAGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGGGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGATGGTGTAGGTGATCTcgc > 1:3204062/1‑151 (MQ=11)
tCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACAGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGGGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGATGGTGTAGGTGATCTcgc < 2:3270155/151‑1 (MQ=11)
tCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACAGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGGGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGACGTCTTTGTTGGTCAGGGTGATGGTGTAGGTGAtctccc > 1:1111693/1‑149 (MQ=11)
tCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGACGGTGTAGGTGATCTcgc > 1:1530203/1‑151 (MQ=11)
ccGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACAGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGGGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGATGGTGTAGGTGATCTcgcc < 2:4451554/151‑1 (MQ=11)
ccGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACAGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGGGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGCTGGCCAGGGCGATGGTGTAGGTGATCTcgcc > 2:4379898/1‑151 (MQ=11)
ccGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGACGGTGTAGGTGATCTcgcc < 1:924467/151‑1 (MQ=11)
ccGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGACGGTGTAGGTGATCTcgcc > 1:3161843/1‑151 (MQ=11)
ggggCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACAGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGGGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGATGGTGTAGGTGATCTcgccgc < 2:1532955/151‑1 (MQ=11)
ggggCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACAGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGGGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGATGGTGTAGGTGATCTcgccgc > 1:3318692/1‑151 (MQ=11)
ggggCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGACGGTGTAGGTGATCTcgccgc > 1:2832469/1‑151 (MQ=11)
ggggCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGACGGTGTAGGTGATCTcgccgc < 2:3590637/151‑1 (MQ=11)
ggggCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGGGCAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGACGGTGTAGGTGATCTcgccgc > 2:4440679/1‑151 (MQ=11)
gcggCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGACGGTGTAGGTGATCTcgccgc < 2:4199245/149‑1 (MQ=11)
gggCAGCCCCGGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGACGGTGTAGGTGATCTCgccgcc < 2:919336/151‑1 (MQ=11)
gggCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACAGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGGGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGATGGTGTAGGTGATCTCgccgcc < 1:4718919/151‑1 (MQ=255)
gggCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGACGGTGTAGGTGATCTCgccgcc > 1:4633975/1‑151 (MQ=11)
gggCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGACGGTGTAGGTGATCTCgccgcc < 1:4436892/151‑1 (MQ=11)
gggCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGACGGTGTAGGTGATCTCgccgcc > 1:4117264/1‑151 (MQ=11)
gggCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGACGGTGTAGGTGATCTCgccgcc > 1:3097486/1‑151 (MQ=11)
gggCAGCCACGGTGGCAGGACCCACGGTGCCATTAGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGACGGTGTAGGTGATCTCgccgcc < 1:3009536/151‑1 (MQ=11)
ngCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACAGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGGGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTTTTGGTCAGGGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCt > 1:1141290/2‑151 (MQ=11)
ggCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACAGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGGGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCt > 2:1439351/1‑151 (MQ=11)
ggCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGACGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCt > 1:465626/1‑151 (MQ=11)
ggCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGACGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCt > 1:1686700/1‑151 (MQ=11)
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ccACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGACGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGt < 2:2699639/151‑1 (MQ=11)
|
GTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGT > CP009974/1896487‑1896669
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
