Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
343 |
268.7 |
10873516 |
97.0% |
10547310 |
150.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009974 |
3,400,410 |
A→G |
T381A (ACC→GCC) |
RPPX_15160 → |
chemotaxis protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009974 | 3,400,410 | 0 | A | G | 100.0%
| 851.6
/ NA
| 240 | T381A (ACC→GCC) | RPPX_15160 | chemotaxis protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (130/110); total (130/110) |
Only 100 of 240 total aligned reads displayed.
GCTGGCTCCGGGCAGCAGGGCCTGGCACGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTACCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGCCGACCAGACCGCCGTGGCCACCTACGACATCGAGCAAATG > CP009974/3400263‑3400556
|
gctggctCCGGGCAGCAGGGCCTGGCACGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCg > 1:4392947/1‑151 (MQ=255)
ctCCGGGCAGCAGGGCCTGGCACGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCgaccag > 2:1317611/1‑151 (MQ=255)
tCCGGGCAGCAGGGCCTGGCACGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCgaccaga > 2:3458383/1‑151 (MQ=255)
cGGGCAGCAGGGCCTGGCACGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCgaccagacc < 1:1587101/151‑1 (MQ=255)
gggCAGCAGGGCCTGGCACGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCgaccagacca < 1:247829/151‑1 (MQ=255)
cagcagGGCCTGGCACGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATc < 1:2066884/151‑1 (MQ=255)
ggcagGGCCTGGCACGCATGGAAGAGACCATGCAGCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATct < 2:2129827/150‑1 (MQ=255)
agcagGGCCTGGCACGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATct > 1:702596/1‑151 (MQ=255)
agcagGGCCTGGCACGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTCATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATct > 2:4987494/1‑151 (MQ=255)
gggCCTGGCACGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATctgctg > 1:3696008/1‑151 (MQ=255)
ggCCTGGCACGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGt > 1:943254/1‑151 (MQ=255)
cTGGCACGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGc > 2:1378743/1‑151 (MQ=255)
ggCACGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTc < 1:4518422/151‑1 (MQ=255)
ggCACGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCAGCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTCCTGTCGCTc > 2:4257925/1‑151 (MQ=255)
gCACGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCa > 1:4925961/1‑151 (MQ=255)
gCACGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCa < 2:3696008/151‑1 (MQ=255)
cACGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCaa > 1:560315/1‑151 (MQ=255)
aCGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAAc < 1:1150733/151‑1 (MQ=255)
aCGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAAc < 1:2201830/151‑1 (MQ=255)
aCGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAAc > 1:1387868/1‑151 (MQ=255)
cGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAAcg > 2:3722962/1‑151 (MQ=255)
gCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAAcgc > 2:2391555/1‑151 (MQ=255)
cATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAAcgcc > 1:4993070/1‑151 (MQ=255)
aTGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAAcgccg > 1:5204044/1‑151 (MQ=255)
aaGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCac > 2:3770909/1‑150 (MQ=255)
gagaCCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAGGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCg < 1:4080738/151‑1 (MQ=255)
gaCCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGaa < 1:2230442/151‑1 (MQ=255)
ccATGCGCCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGc < 2:2893271/151‑1 (MQ=255)
ccATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGc > 1:1783794/1‑151 (MQ=255)
tGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGa < 1:3212292/151‑1 (MQ=255)
tGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGa > 1:2828712/1‑151 (MQ=255)
gCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGaa < 2:4097487/151‑1 (MQ=255)
gCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGaa > 1:2669198/1‑151 (MQ=255)
cACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGaaa > 1:1065481/1‑151 (MQ=255)
aCCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGaaaa < 1:827356/151‑1 (MQ=255)
ccAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAg > 2:367753/1‑151 (MQ=255)
cAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAgg > 2:732566/1‑151 (MQ=255)
cAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAgg < 1:166589/151‑1 (MQ=255)
cAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAgg > 1:5238051/1‑151 (MQ=255)
aGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGc > 1:311083/1‑151 (MQ=255)
gTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCg < 2:4379730/151‑1 (MQ=255)
aTGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTg < 1:3933084/151‑1 (MQ=255)
gggCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGaa > 1:899520/1‑151 (MQ=255)
gggCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGaa > 1:1317666/1‑151 (MQ=255)
gggCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGaa < 2:3547788/151‑1 (MQ=255)
gcgcTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAata > 1:2991896/1‑151 (MQ=255)
cgcTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAatat < 1:4855339/151‑1 (MQ=255)
gcTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATg > 1:4743199/1‑151 (MQ=255)
tGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGc > 2:5279632/1‑151 (MQ=255)
tGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCCCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCACCGACGCGGAACAGGCCGGCGAATATGGc > 2:2171976/1‑151 (MQ=255)
gCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGcc > 2:759770/1‑151 (MQ=255)
gACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCcgcg > 2:1588952/1‑151 (MQ=255)
ccTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGCAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGc > 2:5395217/1‑151 (MQ=255)
ccTGGTCAATGACAAGATCGGTATCCCCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGc < 1:3170195/151‑1 (MQ=255)
ctagTCAATGCCAAGCTCGGTAGCCTCAACGAAAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCt < 2:3081693/148‑1 (MQ=255)
tGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCtt < 1:3571480/151‑1 (MQ=255)
tCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGc < 2:1015235/151‑1 (MQ=255)
tCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGc > 1:3360402/1‑151 (MQ=255)
cAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGcc > 2:4335359/1‑151 (MQ=255)
aTGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGt > 1:2573231/1‑151 (MQ=255)
gCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTgg < 1:2046142/151‑1 (MQ=255)
cgaaGCGCGGTATCCTCAACGAGAAAGCGAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGt < 2:5039793/149‑1 (MQ=255)
aaGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTcg < 1:598468/151‑1 (MQ=255)
gCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTcgcg > 2:2253773/1‑151 (MQ=255)
tCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGAc > 1:3080786/1‑151 (MQ=255)
ggTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCg > 2:1485955/1‑151 (MQ=255)
tATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGaa > 1:4586325/1‑151 (MQ=255)
aTCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAg > 1:3268634/1‑151 (MQ=255)
cTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCCAAGCGGAACAGGCCGGAGAGTATGGCCGCGGCTTTGCCGTACTCccgaccgagctgc > 2:2704174/1‑146 (MQ=255)
aaCGAGAAAGCCAGCAACAGCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGcgcc < 2:3102958/151‑1 (MQ=255)
gagaAAGGCAGCAACATCACCCAGATCGTGGGAGCCATCGTCAAGGTGGCCGAGCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAACGCCAGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTGGCGACCGAAGTGCGCCGCt < 2:3629230/151‑1 (MQ=38)
gaAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTg > 2:837962/1‑151 (MQ=255)
aaaGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCTATCTGCTGTCGCTCGACGCCCCCAGCGAAGCGGACTAGGCCGGTGCATGTGGCCGCGCCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTgg < 2:4560357/151‑1 (MQ=255)
aaaGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTgg < 2:1818356/151‑1 (MQ=255)
aaaGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTgg > 1:4145288/1‑151 (MQ=255)
aaGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGc > 2:2614969/1‑151 (MQ=255)
cAGCAACATCACCCAGATTGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGCCGAc > 1:526906/1‑151 (MQ=255)
aGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGCCGAcc < 1:2613988/151‑1 (MQ=255)
aGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGCCGAcc < 2:680738/151‑1 (MQ=255)
gCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGCCGACCa > 2:1675214/1‑151 (MQ=255)
cATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGCCGACCAGAcc > 1:2413663/1‑151 (MQ=255)
cAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTCGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGTCGACCAGGCCGCCGtcg > 2:4170559/1‑149 (MQ=255)
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gtggtAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGCCGACCAGACCGCCGTGGCCACCt > 2:3206785/1‑151 (MQ=255)
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CCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCG > SRR10918230.2793194/1‑151 (MQ=60)
CCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCG < SRR10918230.663574/151‑1 (MQ=60)
ACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGG > SRR10918230.4936536/1‑151 (MQ=60)
CCTGGTCAATGACAAGATCGGTATCCCCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGC < SRR10918230.3183992/151‑1 (MQ=60)
TGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTT < SRR10918230.3586944/151‑1 (MQ=60)
GGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTT < SRR10918230.910557/151‑1 (MQ=60)
GTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTG > SRR10918230.3584535/1‑151 (MQ=60)
TCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGC > SRR10918230.3374956/1‑151 (MQ=60)
ATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGT > SRR10918230.2584379/1‑151 (MQ=60)
GCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGG < SRR10918230.1357573/151‑1 (MQ=60)
GCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGG > SRR10918230.3927381/1‑151 (MQ=60)
GCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGG < SRR10918230.2054778/151‑1 (MQ=60)
CCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGT < SRR10918230.1283651/151‑1 (MQ=60)
CCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGT < SRR10918230.2599105/151‑1 (MQ=60)
CAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTC > SRR10918230.3303473/1‑151 (MQ=60)
CAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTC < SRR10918230.294770/151‑1 (MQ=60)
AAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCG < SRR10918230.600599/151‑1 (MQ=60)
AGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGC < SRR10918230.811534/151‑1 (MQ=60)
TCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGAC < SRR10918230.2217523/151‑1 (MQ=60)
TCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGAC > SRR10918230.3094218/1‑151 (MQ=60)
GTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGA > SRR10918230.1315386/1‑151 (MQ=60)
TATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAA > SRR10918230.4607054/1‑151 (MQ=60)
ATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAG > SRR10918230.3282846/1‑151 (MQ=60)
CCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTG < SRR10918230.2537166/151‑1 (MQ=60)
CCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTG < SRR10918230.1171140/151‑1 (MQ=60)
CTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCAGCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGC < SRR10918230.2847465/151‑1 (MQ=60)
ACGAGAAAGTCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCG > SRR10918230.3259486/1‑151 (MQ=60)
GAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCT < SRR10918230.867276/151‑1 (MQ=60)
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GAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTG < SRR10918230.3455221/151‑1 (MQ=60)
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AGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGCC < SRR10918230.2254610/151‑1 (MQ=60)
CAGCAACATCACCCAGATTGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGCCGAC > SRR10918230.528743/1‑151 (MQ=60)
AGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGCCGACC < SRR10918230.2625359/151‑1 (MQ=60)
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GCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGCCGACCA > SRR10918230.611164/1‑151 (MQ=60)
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CTGGCTGGCTCCGGGCAGCAGGGCCTGGCACGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTACCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGCCGACCAGACCGCCGTGGCCACCTACGACATCGAGCAAATGGTGC > CP009974/3400260‑3400560
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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
