Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F1 I1 R1
|
404 |
265.1 |
10478538 |
96.8% |
10143224 |
150.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009974 |
3,400,410 |
A→G |
T381A (ACC→GCC) |
RPPX_15160 → |
chemotaxis protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009974 | 3,400,410 | 0 | A | G | 99.6%
| 876.5
/ NA
| 245 | T381A (ACC→GCC) | RPPX_15160 | chemotaxis protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (117/127); total (117/128) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 245 total aligned reads displayed.
GGCTGGCTCCGGGCAGCAGGGCCTGGCACGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTACCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGCCGACCAGACCGCCGTGGCCACCTACGACATCGAGCAAATG > CP009974/3400262‑3400556
|
tgctggctCCGGGCAGCAGGGCCTGGCACGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGcc > 1:3316977/2‑151 (MQ=255)
ggctggctCCGGGCAGCAGGGCCTGGCACGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGcc < 1:1009495/151‑1 (MQ=255)
gctggctCCGGGCAGCAGGGCCTGGCACGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCg < 1:3709991/151‑1 (MQ=255)
ctggctCCGGGCAGCAGGGCCTGGCACGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCga < 2:4481633/151‑1 (MQ=255)
ctggctCCGGGCAGCAGGGCCTGGCACGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCga < 2:1468085/151‑1 (MQ=255)
tggctCCGGGCAGCAGGGCCTGGCACGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCACGGTTGCCgac > 2:1504426/1‑151 (MQ=255)
tggctCCGGGCAGCAGGGCCTGGCACGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCgac < 1:2330608/151‑1 (MQ=255)
gctCCGGGCAGCAGGGCCTGGCACGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCgacca > 2:4747510/1‑151 (MQ=255)
ctCCGGGCAGCAGGGCCTGGCACGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCgaccag < 1:744057/151‑1 (MQ=255)
cGGGCAGCAGGGCCTGGCACGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCgaccagacc > 2:3371842/1‑151 (MQ=255)
cagcagGGCCTGGCACGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATc < 2:2181940/151‑1 (MQ=255)
gcagGGCCTGGCACGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATctg < 1:3490557/151‑1 (MQ=255)
agGGCCTGGCACGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCAAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGACGGTGGTAACCATCGTCAAGGCCGCCGACAAGACCACTctgcc > 2:4804831/1‑150 (MQ=255)
gcatagCACGCATGGAAGAGACCATGGACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTc < 2:405106/146‑1 (MQ=255)
gCCTGGCACGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTc > 2:661717/1‑151 (MQ=255)
ccTGGCACGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTTCTGCCg > 2:2619945/1‑151 (MQ=255)
ggCACGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTc < 1:309597/151‑1 (MQ=255)
gCACGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCa > 1:2938754/1‑151 (MQ=255)
gCACGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCa > 1:88908/1‑151 (MQ=255)
aCGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAAc < 1:5112683/151‑1 (MQ=255)
aCGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAAc < 2:1665319/151‑1 (MQ=255)
gCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAAcgc < 1:4748172/151‑1 (MQ=255)
gCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAAcgc < 1:837693/151‑1 (MQ=255)
aTGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAAcgccg > 1:2480143/1‑151 (MQ=255)
ggAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACgccgcc < 2:4261037/151‑1 (MQ=255)
agagACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATc < 2:3292616/151‑1 (MQ=255)
agagACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATc < 1:3058156/151‑1 (MQ=255)
gaCCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGaa < 2:3906137/151‑1 (MQ=255)
aCCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAg < 2:3847129/151‑1 (MQ=255)
cATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCg > 1:526362/1‑151 (MQ=255)
tGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATAGTCAAGGTTGCCGACCAGAGCAATCTGCTGTAGATAAACGCAGACATAGAAGCGGa > 2:3737784/1‑151 (MQ=255)
cACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGaaa > 2:2993252/1‑151 (MQ=255)
aCCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGACGCGGaaaa > 2:2525204/1‑151 (MQ=255)
aGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGc > 2:1932885/1‑151 (MQ=255)
aGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGc > 2:3488837/1‑151 (MQ=255)
gTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCg < 2:5129899/151‑1 (MQ=255)
tGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCgg < 1:577032/151‑1 (MQ=255)
aTGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCggag > 1:2686111/1‑149 (MQ=255)
cgcTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAatat > 1:1126279/1‑151 (MQ=255)
cgcTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAatat < 1:1446446/151‑1 (MQ=255)
gcTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATg > 1:2737248/1‑151 (MQ=255)
ccGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAACAGGCCGCTGAATATGGCcg > 2:4765183/1‑151 (MQ=255)
cGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCcgc < 1:795004/151‑1 (MQ=255)
aCCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCgg > 2:2857817/1‑151 (MQ=255)
aCCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGACATCGAAGCGGAAACGGCCGGTGAATATGGCCGCgg > 2:3258485/1‑151 (MQ=255)
cTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCt > 2:633186/1‑151 (MQ=255)
tGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCtt < 1:516632/151‑1 (MQ=255)
ggTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCttt < 2:3843630/151‑1 (MQ=255)
ggTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCttt > 1:4911203/1‑151 (MQ=255)
gTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTg < 1:3187425/151‑1 (MQ=255)
gTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTg > 2:1315222/1‑151 (MQ=255)
gTCAATGCCAAGCTCGGTATCCGCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTg < 2:440783/151‑1 (MQ=255)
tCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGc < 1:4091176/151‑1 (MQ=255)
cAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTCTGcc > 2:2595589/1‑151 (MQ=255)
aTGCAAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGt < 1:4619720/151‑1 (MQ=255)
gCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTgg > 2:4884562/1‑151 (MQ=255)
gCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTcgcg < 2:3531113/151‑1 (MQ=255)
gCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTcgcg < 1:4240289/151‑1 (MQ=255)
cGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGAcc < 1:2601661/151‑1 (MQ=255)
tATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGaa > 1:4542613/1‑151 (MQ=255)
tATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGaa > 2:102490/1‑151 (MQ=255)
aTCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAg > 1:1537487/1‑151 (MQ=255)
tCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGt > 2:1826281/1‑151 (MQ=255)
ccTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTg < 2:3574974/151‑1 (MQ=255)
cAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTgcgc > 2:1768632/1‑151 (MQ=255)
aCGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGcgccg < 2:3343143/151‑1 (MQ=255)
aCGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGcgccg < 1:1789052/151‑1 (MQ=255)
gagaAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCt < 2:1239501/151‑1 (MQ=255)
aaaGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTgg > 1:3026159/1‑151 (MQ=255)
aaaGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTgg > 1:1738565/1‑151 (MQ=255)
ccAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGGCgc > 2:5218890/1‑150 (MQ=255)
ccAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGCCGa < 2:340274/151‑1 (MQ=255)
cAGCAACAGCACCCAGAGGGTGGTGACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGCCGAc < 2:2825446/151‑1 (MQ=255)
aaCATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGCCGACCAgc > 2:816712/1‑150 (MQ=255)
aaCATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGCCGACCAGa > 1:3354740/1‑151 (MQ=255)
aCATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGCCGACCAGAc > 1:2809491/1‑151 (MQ=255)
aTCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGCCGGCCCGAccg > 1:3040001/1‑151 (MQ=255)
aTCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGCCGACCAGAccg > 2:1103246/1‑151 (MQ=255)
ccAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGCCGACCAGACCGCCGTg > 2:321340/1‑151 (MQ=255)
aGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGCCGCCCAGACCCCCGCGGc > 2:2763610/1‑151 (MQ=255)
aTGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGCCGACCAGACCGCCGTGGCCa < 1:3911428/151‑1 (MQ=255)
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tggtggTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGCCGACCAGACCGCCGTGGCCAc > 1:4598202/1‑151 (MQ=255)
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ATGCAAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGT < SRR10918231.4641808/151‑1 (MQ=60)
TGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTG < SRR10918231.3355439/151‑1 (MQ=60)
GCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGG < SRR10918231.64908/151‑1 (MQ=60)
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GCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCG < SRR10918231.4260323/151‑1 (MQ=60)
CGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACC < SRR10918231.2613655/151‑1 (MQ=60)
CGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACC > SRR10918231.1786/1‑151 (MQ=60)
AGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACC < SRR10918231.240374/151‑1 (MQ=60)
GGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCG > SRR10918231.2621927/1‑151 (MQ=60)
GTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGA > SRR10918231.305844/1‑151 (MQ=60)
GTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGA > SRR10918231.903100/1‑151 (MQ=60)
GTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGA > SRR10918231.305823/1‑151 (MQ=60)
TATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAA > SRR10918231.4564257/1‑151 (MQ=60)
ATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAG > SRR10918231.1544576/1‑151 (MQ=60)
AACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCC > SRR10918231.3509878/1‑151 (MQ=60)
AACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCC > SRR10918231.1510695/1‑151 (MQ=60)
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ACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCG < SRR10918231.1797208/151‑1 (MQ=60)
AGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTT < SRR10918231.2700260/151‑1 (MQ=60)
GAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTG < SRR10918231.4807709/151‑1 (MQ=60)
GAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTG < SRR10918231.782896/151‑1 (MQ=60)
AAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGG > SRR10918231.3040012/1‑151 (MQ=60)
AAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGG > SRR10918231.1746543/1‑151 (MQ=60)
AGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGCC > SRR10918231.2808474/1‑151 (MQ=60)
AGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGCC > SRR10918231.937/1‑151 (MQ=60)
GCAACATCACCCAGAGGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGCCGACCA < SRR10918231.2778867/151‑1 (MQ=60)
AACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGCCGACCAGA > SRR10918231.3369955/1‑151 (MQ=60)
AACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGCCGACCAGA < SRR10918231.3176899/151‑1 (MQ=60)
ACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGCCGACCAGAC > SRR10918231.2822369/1‑151 (MQ=60)
CATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGCCGACCAGACC < SRR10918231.2862441/151‑1 (MQ=60)
ATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGCCGGCCCGACCG > SRR10918231.3053918/1‑151 (MQ=60)
ATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGCCGACCAGACCG < SRR10918231.4350378/151‑1 (MQ=60)
CCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGCCGACCAGACCGCCGT < SRR10918231.345368/151‑1 (MQ=60)
AGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGCCGACCAGACCGCCGTGGC > SRR10918231.3309859/1‑151 (MQ=60)
ATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGCCGACCAGACCGCCGTGGCCA < SRR10918231.3929685/151‑1 (MQ=60)
TGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGCCGACCAGACCGCCGTGGCCAC > SRR10918231.4620172/1‑151 (MQ=60)
TGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGCCGACCAGACCGCCGTGGCCAC > SRR10918231.4620173/1‑151 (MQ=60)
GTGGTAACCATCGTCAAGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGCCGACCAGACCGCCGTGGCCACCT > SRR10918231.4248434/1‑151 (MQ=60)
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AGGTTGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGCCGACCAGACCGCCGTGGCCACCTACGACATCGAGCAAAT > SRR10918231.1368857/1‑151 (MQ=60)
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TGCCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGCCGACCAGACCGCCGTGGCCACCTACGACATCGAGCAAATGGTG > SRR10918231.4050619/1‑151 (MQ=60)
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TGGCTGGCTCCGGGCAGCAGGGCCTGGCACGCATGGAAGAGACCATGCACCAGGTGATGGGCGCTGCCGACCTGGTCAATGCCAAGCTCGGTATCCTCAACGAGAAAGCCAGCAACATCACCCAGATGGTGGTAACCATCGTCAAGGTTACCGACCAGACCAATCTGCTGTCGCTCAACGCCGCCATCGAAGCGGAAAAGGCCGGTGAATATGGCCGCGGCTTTGCCGTGGTCGCGACCGAAGTGCGCCGCTTGGCCGACCAGACCGCCGTGGCCACCTACGACATCGAGCAAATGGTG > CP009974/3400261‑3400559
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
