Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
343 |
268.7 |
10873516 |
97.0% |
10547310 |
150.6 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 738 total aligned reads displayed.
GCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGAGCCAGCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACG > CP009974/1896241‑1896538
|
GCTCAGGGTCACGACTAGGTCGTGAGCCAG‑GGCGGTGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTC < SRR10918230.3281187/151‑1 (MQ=22)
GCTCAGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGTTGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTG > SRR10918230.2244874/1‑151 (MQ=49)
CTCAGGGTCACGACTAGGTCGTGAGCCAG‑GGCGGTGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCA < SRR10918230.1426913/151‑1 (MQ=20)
CTCAGGGTCACGACTAGGTCGTGAGCCAG‑GGCGGTGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCA < SRR10918230.3976268/151‑1 (MQ=20)
CTCAGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGTTGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGA > SRR10918230.3331194/1‑151 (MQ=51)
TCAGGGTCACGACTAGGTCGTGAGCCAG‑GGCGGTGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCAC < SRR10918230.154760/151‑1 (MQ=18)
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CAGGGTCACGACTAGGTCGTGAGCCAG‑GGCGGTGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACC < SRR10918230.2733851/151‑1 (MQ=17)
CAGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAGGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACC < SRR10918230.4627576/151‑1 (MQ=0)
AGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGTTGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCG < SRR10918230.353028/151‑1 (MQ=56)
GGTCACGACTAGGTCGTGAGCCAG‑GGCGGTGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGAC < SRR10918230.3027400/151‑1 (MQ=20)
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TCACGACTAGGTCGTGAGCCAG‑GGCGGTGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGT < SRR10918230.2327306/151‑1 (MQ=20)
TCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTG‑GTTGACGTGCACAGTGAAGGTTGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCTGTGATGGTGACCTTGACGATGTCGCCTTCGCTGCCTGGAGTGCCTGGCTCGTCGGTGACCtcggt < SRR10918230.3660182/151‑6 (MQ=16)
CGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTG‑GTTGACGTGCACAGTGAAGGTTGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCTGTGATGGTGACCTTGACGATGTCGCCTTCGCTGCCTGGAGTGCCTGGCTCGTCGGTGACCtcggtgct > SRR10918230.161401/1‑143 (MQ=9)
cgattaggtcgtgagccagggcggtGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCT < SRR10918230.5124188/126‑1 (MQ=23)
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TAGGTCGTGAGCCAG‑GGCGGTGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCTAAGTCTGGGCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCTCCGACGTGCTGACC > SRR10918230.5191567/1‑151 (MQ=21)
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CAGGTCGTGAGCCAG‑GGCGGTGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACC < SRR10918230.3919388/151‑1 (MQ=60)
AGGTCGTGGGCCAGCGGCTG‑GTTGACGTGTACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCG > SRR10918230.4728021/1‑151 (MQ=60)
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GTCGTGGGCCAGCGGCTG‑GTTGACGTGCACAGTGAAGGTTGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCTGTGATGGTGACCTTGACGATGTCGCCTTCGCTGCCTGGAGTGCCTGGCTCGTCGGTGACCTCGGTGCTGACCGGG < SRR10918230.2159244/151‑1 (MQ=3)
GTCGTGAGCCAG‑GGCGGTGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGG < SRR10918230.3108717/151‑1 (MQ=60)
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CGTGAGCCAG‑GGCGGTGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGT > SRR10918230.4896870/1‑151 (MQ=30)
gtgagccagggcggtGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTC > SRR10918230.4505673/16‑151 (MQ=60)
gtgagccagggcggtGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCctcgtc > SRR10918230.1790897/16‑145 (MQ=30)
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TGGGCCAGCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGTTGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCT < SRR10918230.773600/151‑1 (MQ=60)
tgagccagggcggtGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCT > SRR10918230.887877/15‑151 (MQ=60)
gagccagggcggtGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTT < SRR10918230.2598365/138‑1 (MQ=34)
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agccagggcggtGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTG < SRR10918230.1024606/139‑1 (MQ=60)
agccagggcggtGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTG < SRR10918230.3672733/139‑1 (MQ=36)
GCCAGCGGCTG‑GTTGACGTGTACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGT > SRR10918230.3534725/1‑151 (MQ=60)
gccagggcggtGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGT > SRR10918230.4153390/12‑151 (MQ=60)
gccagggcggtGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGT < SRR10918230.4783678/140‑1 (MQ=37)
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CCAGCGGCTG‑GTTGACGTGTACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTC < SRR10918230.403356/151‑1 (MQ=60)
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CCAGCGGCTG‑GTTGACGTGCACAGTGAAGGTTGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCTGTGATGGTGACCTTGACGATGTCGCCTTCGCTGCCTGGAGTGCCTGGCTCGTCGGTGACCTCGGTGCTGACCGGGGTCTTGTC > SRR10918230.863923/1‑151 (MQ=23)
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cagggcggtGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCC > SRR10918230.4832018/10‑151 (MQ=60)
cagggcggtGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCC < SRR10918230.819199/142‑1 (MQ=39)
AGCGGCTG‑GTTGACGTGTACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGA < SRR10918230.2545233/151‑1 (MQ=60)
GCGGCTG‑GTTGACGTGTACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAG < SRR10918230.602693/151‑1 (MQ=60)
CGGCTG‑GTTGACGTGTACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGT > SRR10918230.2967165/1‑151 (MQ=60)
CGGCTG‑GTTGACGTGCACAGTGAAGGTTGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCTGTGATGGTGACCTTGACGATGTCGCCTTCGCTGCCTGGAGTGCCTGGCTCGTCGGTGACCTCGGTGCTGACCGGGGTCTTGTCcagg < SRR10918230.3294713/151‑5 (MQ=43)
ggcggtGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCcagc < SRR10918230.4864587/145‑5 (MQ=60)
GGCTG‑GTTGACGTGTACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTG > SRR10918230.3857776/1‑151 (MQ=60)
GGCTG‑GTTGACGTGCACAGTGAAGGTTGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCTGTGATGGTGACCTTGACGATGTCGCCTTCGCTGCCTGGAGTGCCTGGCTCGTCGGTGACCTCGGTGCTGACCGGGGTCTTGTgcaggt > SRR10918230.3212257/1‑145 (MQ=42)
GGCTG‑GTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAGGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACTTTGACCAAGTCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTG < SRR10918230.2194605/151‑1 (MQ=14)
GCTG‑GTTGACGTGTACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGT < SRR10918230.5034253/151‑1 (MQ=60)
CTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGTTGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTC > SRR10918230.3091901/1‑151 (MQ=60)
CTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGTTGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTC > SRR10918230.1006812/1‑151 (MQ=60)
CTG‑GTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAGGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACTTTGACCAAGTCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTC > SRR10918230.4718125/1‑151 (MQ=17)
ttcagacgtgtgctcttccgatcTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTC < SRR10918230.5398175/128‑1 (MQ=60)
ggtGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTC < SRR10918230.2887279/148‑1 (MQ=36)
ggtGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTC > SRR10918230.3355671/4‑151 (MQ=36)
T‑GTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAG < SRR10918230.2074576/151‑1 (MQ=60)
GTTGACGTGCACAGTGAAGGTTGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCTGTGATGGTGACCTTGACGATGTCGCCTTCGCTGCCTGGAGTGCCTGGCTCGTCGGTGACCTCGGTGCTGACCGGGGTCTTGTCcaggttcagg > SRR10918230.4956037/1‑141 (MQ=43)
TTGACGTGTACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTT < SRR10918230.5451237/151‑1 (MQ=60)
TGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTG > SRR10918230.1946945/1‑151 (MQ=60)
TGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAGGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACTTTGACCAAGTCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTG > SRR10918230.4323494/1‑151 (MQ=24)
GATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCcagcgtcagctgt > SRR10918230.1984464/1‑138 (MQ=38)
GACGTGTACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGC < SRR10918230.2350452/151‑1 (MQ=60)
GACGTGCACAGTGAAGGTTGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCTGTGATGGTGACCTTGACGATGTCGCCTTCGCTGCCTGGAGTGCCTGGCTCGTCGGTGACCTCGGTGCTGACCGGGGTCTTGTCcaggttcaggttt > SRR10918230.5326233/1‑138 (MQ=0)
ATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCcagcgtcagctgtt < SRR10918230.1855034/151‑15 (MQ=60)
ATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCcagcgtcagctgtt > SRR10918230.5154457/1‑137 (MQ=38)
TGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCcagcgtcagctgttc < SRR10918230.4440278/151‑16 (MQ=60)
TGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCcagcgtcagctgttc < SRR10918230.1670257/151‑16 (MQ=39)
TGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCcagcgtcagctgttc > SRR10918230.574792/1‑136 (MQ=39)
CGTGCACAGTGAAGGTTGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCTGTGATGGTGACCTTGACGATGTCGCCTTCGCTGCCTGGAGTGCCTGGCTCGTCGGTGACCTCGGTGCTGACCGGGGTCTTGTCcaggttcaggttttc < SRR10918230.2830311/151‑16 (MQ=0)
GTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCcagcgtcagctgttcg > SRR10918230.315528/1‑135 (MQ=39)
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ACGGTGAACGTCGGTTTGACGTGCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCcagcgtcagctgttcgaact < SRR10918230.5009954/151‑21 (MQ=60)
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GGCCACCGAGGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACTTTGACCAAGTCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTA > SRR10918230.1098374/1‑151 (MQ=18)
GGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTA < SRR10918230.4808396/151‑1 (MQ=60)
GGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTT > SRR10918230.1736845/1‑151 (MQ=32)
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GCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTG < SRR10918230.373222/151‑1 (MQ=32)
GCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTG > SRR10918230.664056/1‑151 (MQ=32)
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CTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTG < SRR10918230.1491643/151‑1 (MQ=60)
CTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTG < SRR10918230.860967/151‑1 (MQ=60)
CTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGAcatc < SRR10918230.2039685/151‑5 (MQ=14)
TGGTCGGCCGTGATGGTGACTTTGACCAAGTCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGACCGGGGGTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTTAACGGgagcgattgacatcc > SRR10918230.1329939/1‑136 (MQ=13)
TGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGAcatca > SRR10918230.4771085/1‑146 (MQ=60)
GGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGAT < SRR10918230.1451845/151‑1 (MQ=60)
GGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGAT > SRR10918230.4217723/1‑151 (MQ=60)
GGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGAcatcac < SRR10918230.5283486/151‑7 (MQ=5)
GTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGAcatcaca > SRR10918230.3594022/1‑144 (MQ=60)
TCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCTAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGAcatcacga > SRR10918230.1041051/1‑143 (MQ=60)
TCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCTCCTTCAACGGTTGCGATCGAcatcacaa > SRR10918230.1313566/1‑143 (MQ=6)
TCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGAcatcacaa > SRR10918230.614604/1‑143 (MQ=0)
GGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCcagcgtcagagatcggaagagcacacgtctgaactccagtcacggacatcaacctcgtatgccg > SRR10918230.2176556/1‑87 (MQ=60)
GGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGAcatcacgaca > SRR10918230.1525160/1‑141 (MQ=60)
GCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAG < SRR10918230.4349409/151‑1 (MQ=60)
GCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAG < SRR10918230.5344312/151‑1 (MQ=60)
GCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTagggatcgacatcacgacac > SRR10918230.4662300/1‑131 (MQ=60)
CCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGAcatcacgacagg > SRR10918230.2578953/1‑139 (MQ=60)
CGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGAcatcacgacaggg > SRR10918230.4579251/1‑138 (MQ=60)
GTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGAcatcacgacagggt < SRR10918230.1285804/151‑15 (MQ=60)
TGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGAcatcacgacagggtc > SRR10918230.942161/1‑136 (MQ=60)
ATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGAcatcacgacagggtcgt > SRR10918230.346693/1‑134 (MQ=58)
TGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGAcatcacgacagggtcgtt < SRR10918230.913206/151‑19 (MQ=55)
GGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTG < SRR10918230.2619205/151‑1 (MQ=60)
GTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGG > SRR10918230.3392888/1‑151 (MQ=60)
TGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGAcatcacgacagggtcgttgct < SRR10918230.1919972/151‑22 (MQ=44)
TGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGAC < SRR10918230.687300/151‑1 (MQ=19)
TGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGAC < SRR10918230.1185190/151‑1 (MQ=19)
CCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTA < SRR10918230.3216177/151‑1 (MQ=7)
CAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAG < SRR10918230.2892085/151‑1 (MQ=6)
GGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGAC < SRR10918230.1633906/151‑1 (MQ=1)
TCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGT < SRR10918230.3077907/151‑1 (MQ=0)
TCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGT < SRR10918230.2449357/151‑1 (MQ=0)
CGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTT < SRR10918230.4288510/151‑1 (MQ=60)
CGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGG < SRR10918230.1822673/151‑1 (MQ=60)
GTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCcagcgtcagctgttcgaacttagatcggaagagcacacgtctgaactccagtcacggacatcaatctcgtatgccgtcttctgcttgaaaaaaaaaa > SRR10918230.2454683/1‑54 (MQ=60)
GGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCA > SRR10918230.2997654/1‑151 (MQ=60)
ggatgCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCAC < SRR10918230.2127208/146‑1 (MQ=60)
GGCTCGTCTGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAG < SRR10918230.4478845/151‑1 (MQ=60)
TCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGC < SRR10918230.1141975/151‑1 (MQ=60)
CGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCC > SRR10918230.3901076/1‑151 (MQ=60)
CGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCC > SRR10918230.4942097/1‑151 (MQ=60)
GGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggtt < SRR10918230.5148281/151‑5 (MQ=60)
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GCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGAGCCAGCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACG > CP009974/1896241‑1896538
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
