Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F1 I1 R1
|
368 |
332.2 |
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97.0% |
12699304 |
150.6 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 742 total aligned reads displayed.
GCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGAGCCAGCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACG > CP009974/1896241‑1896538
|
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TCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTG‑GTTGACGTGTACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGT < SRR10918232.2997764/151‑1 (MQ=60)
TCACGACCAGGTCGTGAGCCAG‑GGCGGTGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGT < SRR10918232.3293468/151‑1 (MQ=60)
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atcttaggtcgtgagccagggcggtGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCT < SRR10918232.4601171/126‑1 (MQ=23)
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GACTAGGTCGTGAGCCAG‑GGCGGTGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTG > SRR10918232.6115020/1‑151 (MQ=21)
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TAGGTCGTGAGCCAG‑GGCGGTGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACC > SRR10918232.4481523/1‑151 (MQ=26)
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gtgagccagggcggtGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGAagatcgga > SRR10918232.3229882/16‑143 (MQ=27)
tgagccagggcggtGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCT > SRR10918232.6447457/15‑151 (MQ=32)
GGGCCAGCGGCTG‑GTTGACGTGTACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTT > SRR10918232.5857387/1‑151 (MQ=60)
atgacattccgtgactggagttcagacgtgtgctcttccgatctTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTT < SRR10918232.252143/107‑1 (MQ=19)
agccagggcggtGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTG > SRR10918232.2861977/13‑151 (MQ=36)
GCCAGCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGTTGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTTCTGACCGGGGTCTTGT > SRR10918232.3044575/1‑151 (MQ=60)
CCAGCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGTTGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTC > SRR10918232.3355895/1‑151 (MQ=60)
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cagggcggtGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCC < SRR10918232.2495520/142‑1 (MQ=39)
agggcggtGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGcgtcagatcgg > SRR10918232.6295947/9‑140 (MQ=34)
GCGGCTG‑GTTGACGTGCACAGTGAAGGTTGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCTGTGATGGTGACCTTGACGATGTCGCCTTCGCTGCCTGGAGTGCCTGGCTCGTCGGTGACCTCGGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAG > SRR10918232.3656416/1‑151 (MQ=18)
GCGGCTG‑GTTGACGTGCACAGTGAAGGTTGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCTGTGATGGTGACCTTGACGATGTCGCCTTCGCTGCCTGGAGTGCCTGGCTCGTCGGTGACCTCGGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAG < SRR10918232.2966486/151‑1 (MQ=18)
GCGGCTG‑GTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAGGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACTTTGACCAAGTCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGACCGGGGGTTTGTCGAG > SRR10918232.3794618/1‑151 (MQ=0)
ggcggtGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCcagc > SRR10918232.983892/7‑147 (MQ=60)
ggcggtGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCcagc > SRR10918232.512906/7‑147 (MQ=60)
GGCTG‑GTTGACGTGTACTTTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGGCGGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGGCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCTTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTG < SRR10918232.2609230/151‑1 (MQ=60)
GGCTG‑GTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAGGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACTTTGACCAAGTCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTG > SRR10918232.294510/1‑151 (MQ=14)
gcggcgtcgatGTGCACGGTGAACGTCGGTGTGACGTTATCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCcagcg < SRR10918232.3585119/140‑6 (MQ=60)
GCTG‑GTTGACGTGCACAGTGAAGGTTGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCTGTGATGGTGACCTTGACGATGTCGCCTTCGCTGCCTGGAGTGCCTGGCTCGTCGGTGACCTCGGTGCTGACCGGGGTCTTGTCcaggtt > SRR10918232.1955237/1‑145 (MQ=43)
cggtGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGT < SRR10918232.1733706/147‑1 (MQ=36)
CTG‑GTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAGGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACTTTGACCAAGTCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTC < SRR10918232.6085277/151‑1 (MQ=17)
ggtGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTC > SRR10918232.612477/4‑151 (MQ=60)
ggtGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTC < SRR10918232.876276/148‑1 (MQ=36)
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G‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGTTGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAG > SRR10918232.4528957/1‑151 (MQ=60)
G‑GTTGACGTGCACAGTGAAGGTTGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCTGTGATGGTGACCTTGACGATGTCGCCTTCGCTGCCTGGAGTGCCTGGCTCGTCGGTGACCTCGGTGCTGACCGGGGTCTTGTCcaggttcag < SRR10918232.4388043/151‑10 (MQ=43)
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G‑GGTGACGTGCACGGTGAAGGTTGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAG < SRR10918232.1323900/151‑1 (MQ=60)
GTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCcagcgtcagc > SRR10918232.5367649/1‑141 (MQ=60)
GTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCcagcgtcagc > SRR10918232.5486699/1‑141 (MQ=60)
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TGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAGGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACTTTGACCAAGTCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTG < SRR10918232.4141423/151‑1 (MQ=24)
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GACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAGGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACTTTGACCAAGTCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGC < SRR10918232.349157/151‑1 (MQ=26)
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TGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCcagcgtcagctgttc < SRR10918232.65898/151‑16 (MQ=39)
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TGCACGGTGAAGGTTGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCcagcgtcagctgttcga < SRR10918232.3157105/151‑18 (MQ=60)
TGCACGGTGAAGGTTGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCcagcgtcagctgttcga > SRR10918232.5211850/1‑134 (MQ=60)
CGGTGAAGGTTGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTT < SRR10918232.5694249/151‑1 (MQ=60)
GGTGAAGGTTGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTG > SRR10918232.5185719/1‑151 (MQ=60)
GTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGC < SRR10918232.2232670/151‑1 (MQ=29)
TGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCC > SRR10918232.236649/1‑151 (MQ=27)
GAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCcagcgtcagctgttcgaacttgcca > SRR10918232.5783889/1‑126 (MQ=60)
GAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCG < SRR10918232.4778185/151‑1 (MQ=27)
AAGGTTGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAA > SRR10918232.3992017/1‑151 (MQ=60)
AGGTTGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAAC < SRR10918232.3194911/151‑1 (MQ=60)
AGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGAC > SRR10918232.974862/1‑151 (MQ=60)
ACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGAC < SRR10918232.3533468/151‑1 (MQ=31)
ACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGAC < SRR10918232.4441117/151‑1 (MQ=31)
GGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACA < SRR10918232.2066267/151‑1 (MQ=60)
CGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCcagcgtcagctgttcgaacttgccaacg < SRR10918232.4116764/151‑29 (MQ=60)
GTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACAT < SRR10918232.2446173/151‑1 (MQ=34)
GTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGGCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTGGCCGACAT > SRR10918232.1196495/1‑151 (MQ=26)
TCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAGGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACTTTGACCAAGTCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCGAACTTGCCAACGTC < SRR10918232.5079689/151‑1 (MQ=25)
TCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAGGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACTTTGACCAAGTCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCGAACTTGCCAACGTC > SRR10918232.3307586/1‑151 (MQ=25)
GGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCG < SRR10918232.2097435/151‑1 (MQ=60)
GGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCG < SRR10918232.20061/151‑1 (MQ=34)
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GGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCC > SRR10918232.1715152/1‑151 (MQ=32)
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TTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCA > SRR10918232.6455580/1‑151 (MQ=60)
CTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCA > SRR10918232.2256546/1‑151 (MQ=60)
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GACGTTCTCGGCCACCGAGGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACTTTGACCAAGTCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCT < SRR10918232.4419766/151‑1 (MQ=23)
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ccgatctTACCGAAGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAAC < SRR10918232.3927290/144‑1 (MQ=60)
TCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAAC > SRR10918232.5911959/1‑151 (MQ=36)
CTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACG > SRR10918232.5413415/1‑151 (MQ=60)
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TCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGG < SRR10918232.2399721/151‑1 (MQ=60)
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GGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTA < SRR10918232.1746261/151‑1 (MQ=60)
GGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTT < SRR10918232.5241219/151‑1 (MQ=32)
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CCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGC < SRR10918232.3136205/151‑1 (MQ=60)
CACCGAGGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACTTTGACCAAGTCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCG < SRR10918232.2147027/151‑1 (MQ=18)
ACCGAAGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGA < SRR10918232.39720/151‑1 (MQ=60)
CCGAGGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACTTTGACCAAGTCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGAT < SRR10918232.498049/151‑1 (MQ=17)
CGAAGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATC > SRR10918232.3111658/1‑151 (MQ=60)
CGAAGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATC < SRR10918232.5275400/151‑1 (MQ=60)
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GAGGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACTTTGACCAAGTCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCG < SRR10918232.5177082/151‑1 (MQ=17)
GAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCG > SRR10918232.3847025/1‑151 (MQ=60)
GAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGGCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCG > SRR10918232.1538832/1‑151 (MQ=60)
GAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCG > SRR10918232.3706154/1‑151 (MQ=28)
AAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA > SRR10918232.2987233/1‑151 (MQ=60)
AAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA > SRR10918232.889660/1‑151 (MQ=60)
GTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGAca > SRR10918232.2551264/1‑149 (MQ=60)
GTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGAca > SRR10918232.4754511/1‑149 (MQ=20)
TCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGAcat < SRR10918232.550797/151‑4 (MQ=17)
TGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGAcatca < SRR10918232.2913521/151‑6 (MQ=60)
GGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGAcatcac > SRR10918232.4153304/1‑145 (MQ=60)
GGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGAcatcac < SRR10918232.4836223/151‑7 (MQ=5)
GTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATC > SRR10918232.5026163/1‑151 (MQ=60)
GTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGGCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATC < SRR10918232.4810842/151‑1 (MQ=60)
GTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGAcatcacg < SRR10918232.534174/151‑8 (MQ=60)
TCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTCCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGAcatcacga > SRR10918232.4351371/1‑143 (MQ=60)
CGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGAcatcacgac < SRR10918232.1492603/151‑10 (MQ=60)
GGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGAcatcacgaca > SRR10918232.4244386/1‑141 (MQ=60)
CGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGG > SRR10918232.470337/1‑151 (MQ=60)
CCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGAcatcacgacagg > SRR10918232.2728637/1‑139 (MQ=60)
GTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGT > SRR10918232.2777352/1‑151 (MQ=60)
GATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGAcatcacgacagggtcg > SRR10918232.505098/1‑135 (MQ=60)
ATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTGCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGccatcactacaggttcgt > SRR10918232.458844/1‑133 (MQ=60)
GGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGAcatcacgacagggtcgttg < SRR10918232.6238540/151‑20 (MQ=51)
GTGACCTTGCCCAGGTCGCCGTCGTTGCCTGGGGTCTCCGGATCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGAcatcacgacagggtcgttgc < SRR10918232.492914/151‑21 (MQ=0)
GTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGAcatcacgacagggtcgttgc > SRR10918232.4213751/1‑131 (MQ=48)
GACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGAcatcacgacagggtcgttgcta > SRR10918232.2504289/1‑129 (MQ=41)
GACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTG < SRR10918232.4054834/151‑1 (MQ=60)
CCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCC < SRR10918232.6490804/151‑1 (MQ=60)
CTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGAcatcacgacagggtcgttgctaccg > SRR10918232.4733596/1‑126 (MQ=30)
TGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGAC > SRR10918232.3588325/1‑151 (MQ=60)
TGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGAC > SRR10918232.3635565/1‑151 (MQ=60)
TGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGAC < SRR10918232.4373576/151‑1 (MQ=60)
ACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGT < SRR10918232.1591070/151‑1 (MQ=13)
GGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGAC < SRR10918232.795161/151‑1 (MQ=1)
CGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTT < SRR10918232.1851628/151‑1 (MQ=0)
CCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGT < SRR10918232.2053423/151‑1 (MQ=60)
CTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTagatcggaagagcacacgtctgaactccagtcacggaatgtcatctcgtatgccgtcttctgcttgaaaaaaaaaaaaatagctacaagatgta > SRR10918232.2670964/1‑57 (MQ=60)
TTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCC > SRR10918232.1789205/1‑151 (MQ=60)
agggatgCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTC > SRR10918232.5579736/8‑151 (MQ=60)
CCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGG > SRR10918232.1891319/1‑151 (MQ=60)
CCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGG > SRR10918232.5722527/1‑151 (MQ=60)
CCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGC < SRR10918232.5888127/151‑1 (MQ=60)
CGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCC > SRR10918232.5645378/1‑151 (MQ=60)
GGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGCGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTACACGTTGTCCGGCGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggtg > SRR10918232.756742/1‑147 (MQ=60)
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GCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGAGCCAGCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACG > CP009974/1896241‑1896538
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |