Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
336 |
367.5 |
14491858 |
96.8% |
14028118 |
150.7 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 787 total aligned reads displayed.
GCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGAGCCAGCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACG > CP009974/1896241‑1896538
|
TCAGGGTCACGACTAGGTCGTGAGCCAG‑GGCGGTGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCAC > SRR10918235.2936885/1‑151 (MQ=18)
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GCAGGGTCACGACTAGGTCGTGAGCCAG‑GGCGGTGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCAC < SRR10918235.6525259/151‑1 (MQ=18)
CAGGGTCACGACTAGGTCGTGAGCCAG‑GGCGGTGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACC < SRR10918235.2915659/151‑1 (MQ=17)
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CAGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGTTGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACC < SRR10918235.1337015/151‑1 (MQ=55)
AGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTG‑GTTGACGTGTACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCG < SRR10918235.1708158/151‑1 (MQ=57)
AGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTG‑GTTGACGTGTACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCG > SRR10918235.3962434/1‑151 (MQ=57)
GGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTG‑GTTGACGTGCACAGTGAAGGTTGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCTGTGATGGTGACCTTGACGATGTCGCCTTCGCTGCCTGGAGTGCCTGGCTCGTCGGTGACCtc < SRR10918235.311508/151‑3 (MQ=21)
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GGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGGTG‑GTTGACGTGTACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGAC < SRR10918235.3759907/151‑1 (MQ=59)
TCACGACTAGGTCGTGAGCCAG‑GGCGGTGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGT < SRR10918235.3304427/151‑1 (MQ=20)
TCACGACCAGGTCGTGAGCCAG‑GGCGGTGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGT < SRR10918235.5480042/151‑1 (MQ=60)
TCACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGTTGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGT > SRR10918235.3133226/1‑151 (MQ=60)
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GACTAGGTCGTGAGCCAG‑GGCGGTGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTG < SRR10918235.1057276/151‑1 (MQ=21)
GACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTG‑GTTGACGTGTACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTG > SRR10918235.5027948/1‑151 (MQ=60)
ACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGTTGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGA > SRR10918235.2298212/1‑151 (MQ=60)
ACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGTTGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGA < SRR10918235.563741/151‑1 (MQ=60)
ACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGTTGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGA < SRR10918235.84128/151‑1 (MQ=60)
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TAGGTCGTGAGCCAG‑GGCGGTGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACC < SRR10918235.2575418/151‑1 (MQ=26)
CAGGTCGTGAGCCAG‑GGCGGTGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACC < SRR10918235.5388918/151‑1 (MQ=60)
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AGTCGTGGGCCAGCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGTTGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGTCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGG > SRR10918235.1373236/1‑151 (MQ=60)
AGTCGTGGGCCAGCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGTTGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGG < SRR10918235.2599145/151‑1 (MQ=60)
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gtggttcttttgcaggcagaagtcggcagacgaggtagccgaaggtgactggggttcagacgtgtgctcttCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTC < SRR10918235.455479/80‑1 (MQ=60)
gtgagccagggcggtGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTC > SRR10918235.488037/16‑151 (MQ=33)
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tgagccagggcggtGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCT > SRR10918235.1224050/15‑151 (MQ=32)
tgagccagggcggtGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCT > SRR10918235.7185971/15‑151 (MQ=32)
tgagccagggcggtGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCT > SRR10918235.5983087/15‑151 (MQ=32)
tgagccagggcggtGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCT < SRR10918235.4243985/137‑1 (MQ=32)
tgagccagggcggtGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCT > SRR10918235.6733400/15‑151 (MQ=32)
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gcgccagggcggtGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTT < SRR10918235.5726092/138‑1 (MQ=34)
gagccagggcggtGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTT > SRR10918235.4982999/14‑151 (MQ=60)
gagccagggcggtGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTT < SRR10918235.3797617/138‑1 (MQ=34)
GGCCAGCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGTTGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTG > SRR10918235.1440870/1‑151 (MQ=60)
tgccagggcggtGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGACCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTG < SRR10918235.1502124/139‑1 (MQ=35)
GCCAGCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGTTGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGT < SRR10918235.1675658/151‑1 (MQ=60)
agacgtgtgctcttccgatctACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGT < SRR10918235.3190812/130‑1 (MQ=39)
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CCAGCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGTTGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTC < SRR10918235.5529285/151‑1 (MQ=60)
CCAGCGGCTG‑GTTGACGTGCACAGTGAAGGTTGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCTGTGATGGTGACCTTGACGATGTCGCCTTCGCTGCCTGGAGTGCCTGGCTCGTCGGTGACCTCGGTGCTGACCGGGGTCTTGTC > SRR10918235.3842971/1‑151 (MQ=23)
ccagggcggtGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTC < SRR10918235.6435017/141‑1 (MQ=39)
CAGCGGCTG‑GTTGACGTGTACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCG > SRR10918235.913137/1‑151 (MQ=60)
CAGCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGTTGGCTTGACGTTCTCTGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGGCTTGTCC > SRR10918235.2285884/1‑151 (MQ=60)
tagggcggtGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCC < SRR10918235.6341445/142‑1 (MQ=39)
cagggcggtGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCC > SRR10918235.4942333/10‑151 (MQ=39)
AGCGGCTG‑GTTGACGTGCACAGTGAAGGTTGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCTGTGATGGTGACCTTGACGATGTCGCCTTCGCTGCCTGGAGTGCCTGGCTCGTCGGTGACCTCGGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCA < SRR10918235.2874603/151‑1 (MQ=20)
AGCGGCTG‑GTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAGGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACTTTGACCAAGTCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGG > SRR10918235.2481846/1‑151 (MQ=4)
CGGCTG‑GTTGACGTGCACAGTGAAGGTTGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCTGTGATGGTGACCTTGACGATGTCGCCTTCGCTGCCTGGAGTGCCTGGCTCGTCGGTGACCTCGGTGCTGACCGGGGTCTTGTCcagg < SRR10918235.4927160/151‑5 (MQ=43)
GGCTG‑GTTGACGTGTACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGGTTTGTCGAGTG > SRR10918235.3243940/1‑151 (MQ=60)
GGCTG‑GTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAGGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACTTTGACCAAGTCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTG > SRR10918235.2848603/1‑151 (MQ=14)
gcggtGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCcagcg > SRR10918235.6046456/6‑146 (MQ=37)
GTTG‑GTTGACGTGCACAGTGAAGGTTGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGCTCGGCTGTGATGGTGACCTTGACGATGTCGCCTTCGCTGCCTGGAGTGCCTGGCTCGTCGGTGACCTCGGTGCTGACCGGGGTCTTGTCcaggtt < SRR10918235.4286032/151‑7 (MQ=42)
ggtGTTGATGTGCACGGTGAACCTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTC > SRR10918235.5009123/4‑151 (MQ=35)
gtGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCcagcgtcg > SRR10918235.1039845/3‑143 (MQ=60)
G‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGTTGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAG < SRR10918235.4315915/151‑1 (MQ=60)
GTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCcagcgtcagg > SRR10918235.696199/1‑141 (MQ=37)
GTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCcagcgtcagc < SRR10918235.558503/151‑11 (MQ=37)
GTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCcagcgtcagc > SRR10918235.3494110/1‑141 (MQ=37)
GTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCcagcgtcagc < SRR10918235.4527238/151‑11 (MQ=37)
GTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCcagcgtcagc > SRR10918235.691891/1‑141 (MQ=37)
TTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCT < SRR10918235.2098688/151‑1 (MQ=35)
TTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAGGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACTTTGACCAAGTCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTT < SRR10918235.4347753/151‑1 (MQ=23)
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ACGTGCACGGTGAAGGTTGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCcagcgtcagctgtt > SRR10918235.5754546/1‑137 (MQ=60)
ACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAGGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACTTTGACCAAGTCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCT > SRR10918235.5558523/1‑151 (MQ=27)
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TGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCC > SRR10918235.1826198/1‑151 (MQ=60)
GAAGGTTGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCcagcgtcagctgttcgaacttgcca < SRR10918235.6831118/151‑26 (MQ=60)
GAAGGTTGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCcagcgtcagctgttcgaacttgcca > SRR10918235.1575696/1‑126 (MQ=60)
GAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCG > SRR10918235.6863299/1‑151 (MQ=27)
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AGGTTGGCTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAAC < SRR10918235.3267180/151‑1 (MQ=60)
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CGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGGGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCccgcgtcagctgttcgaacttgccaacg > SRR10918235.2256704/1‑123 (MQ=60)
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CTGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCC < SRR10918235.3345440/151‑1 (MQ=31)
CGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAGGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACTTTGACCAAGTCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCGAACTTGCCAACGTCC > SRR10918235.5341737/1‑151 (MQ=25)
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GGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTA < SRR10918235.1886347/151‑1 (MQ=60)
GGCCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTT > SRR10918235.2827625/1‑151 (MQ=32)
GCTACCGAAGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTG > SRR10918235.4144389/1‑151 (MQ=60)
GCCACTGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTG < SRR10918235.2401352/151‑1 (MQ=27)
CCACCGAGGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACTTTGACCAAGTCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGC < SRR10918235.1250978/151‑1 (MQ=18)
CCACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGC < SRR10918235.1781666/151‑1 (MQ=32)
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ACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGA < SRR10918235.6491128/151‑1 (MQ=60)
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CGAGGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACTTTGACCAAGTCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATC < SRR10918235.7270897/151‑1 (MQ=17)
CGAAGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATC < SRR10918235.4446196/151‑1 (MQ=60)
CGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATC < SRR10918235.1105258/151‑1 (MQ=60)
CGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGCTAGCGATC > SRR10918235.4204266/1‑151 (MQ=60)
GGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACTTTGACCAAGTCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGAC < SRR10918235.2138233/151‑1 (MQ=16)
AGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGAC < SRR10918235.610109/151‑1 (MQ=60)
TCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGAcat < SRR10918235.5278806/151‑4 (MQ=60)
TCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGAcat < SRR10918235.4991319/151‑4 (MQ=60)
GGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGAcatcac < SRR10918235.3425019/151‑7 (MQ=60)
TCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGATCGCCTTCGTTGCCCGGCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGAcatcacaa < SRR10918235.5996185/151‑9 (MQ=0)
GCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAG > SRR10918235.7064408/1‑151 (MQ=60)
GCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTagcgctcgacatcacgacag > SRR10918235.4819327/1‑131 (MQ=60)
GCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGAcatcacgacag > SRR10918235.3358908/1‑140 (MQ=60)
CGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGAcatcacgacaggg > SRR10918235.5189078/1‑138 (MQ=60)
GTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGAcatcacgacagggt < SRR10918235.7218818/151‑15 (MQ=60)
GTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGAcatcacgacagggt > SRR10918235.4170/1‑137 (MQ=60)
TGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGAcatcacgacagggtc > SRR10918235.5153976/1‑136 (MQ=60)
TGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGAcatcacgacagggtc < SRR10918235.7158709/151‑16 (MQ=60)
GATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCG > SRR10918235.3823558/1‑151 (MQ=60)
ATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGAcatcacgacagggtcgt < SRR10918235.6360816/151‑18 (MQ=58)
TGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTTACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCCAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCATCGGTAGCGATCGAcatcacgacagggtcgtg > SRR10918235.3525598/1‑133 (MQ=53)
GGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGGCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGAcatcacgacagggtcgttg < SRR10918235.6402811/151‑20 (MQ=50)
GTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGG > SRR10918235.2646162/1‑151 (MQ=60)
TGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGAcatcacgacagggtcgttgct < SRR10918235.878389/151‑22 (MQ=44)
GACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGAcatcacgacagggtcgttgcta < SRR10918235.3014323/151‑23 (MQ=41)
GACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTG > SRR10918235.6670735/1‑151 (MQ=60)
GACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTG > SRR10918235.4858064/1‑151 (MQ=60)
ACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGAcatcacgacagggtcgttgctac > SRR10918235.4094913/1‑128 (MQ=37)
TGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGAC > SRR10918235.6197193/1‑151 (MQ=60)
CCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTA < SRR10918235.6806791/151‑1 (MQ=7)
CAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAG > SRR10918235.1659622/1‑151 (MQ=60)
GGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGAC < SRR10918235.6517391/151‑1 (MQ=1)
GGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGAC < SRR10918235.5508818/151‑1 (MQ=60)
TCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGT < SRR10918235.1208496/151‑1 (MQ=0)
CGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTT < SRR10918235.6459406/151‑1 (MQ=0)
CGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTT > SRR10918235.369951/1‑151 (MQ=0)
CCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGT > SRR10918235.6021929/1‑151 (MQ=60)
tcgttgcgagggatgCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCG < SRR10918235.6953031/136‑1 (MQ=60)
TGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGC > SRR10918235.4745892/1‑151 (MQ=60)
agggatgCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTC > SRR10918235.1406416/8‑151 (MQ=60)
GGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCA > SRR10918235.5100803/1‑151 (MQ=60)
GGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggtt > SRR10918235.4415476/1‑147 (MQ=60)
GGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggtt > SRR10918235.6154239/1‑147 (MQ=60)
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GCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGAGCCAGCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACG > CP009974/1896241‑1896538
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
