Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
343 |
268.7 |
10873516 |
97.0% |
10547310 |
150.6 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 469 total aligned reads displayed.
TGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑CGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGGGTCAGTTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGAC > CP009974/1898166‑1898466
|
TGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCC > SRR10918230.2931359/1‑151 (MQ=60)
TGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCC < SRR10918230.977486/151‑1 (MQ=60)
TGATGGTGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCT < SRR10918230.907213/151‑1 (MQ=31)
TGATGGTGAACTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGATGACGTGCACTGTGAAGGTCGGTTTCACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTGATGGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCC < SRR10918230.1811387/151‑1 (MQ=4)
ATGGTGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGC < SRR10918230.2805579/151‑1 (MQ=35)
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GGTGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCG > SRR10918230.2166141/1‑151 (MQ=39)
TGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGT > SRR10918230.1652247/1‑151 (MQ=52)
GCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTAC > SRR10918230.2586615/1‑151 (MQ=60)
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AGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cct > SRR10918230.160895/1‑149 (MQ=35)
GGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctc < SRR10918230.3622018/151‑4 (MQ=35)
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GGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGC > SRR10918230.3450408/1‑151 (MQ=60)
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GGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcg < SRR10918230.1838403/151‑5 (MQ=36)
GGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcg > SRR10918230.5402901/1‑147 (MQ=36)
GGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcg > SRR10918230.512210/1‑147 (MQ=36)
GGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcg > SRR10918230.1991411/1‑147 (MQ=36)
GTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcgg < SRR10918230.3917252/151‑6 (MQ=36)
GTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcgg < SRR10918230.2780704/151‑6 (MQ=36)
TCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggt > SRR10918230.1292319/1‑145 (MQ=36)
TCACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggt < SRR10918230.4646140/151‑7 (MQ=36)
CACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtg > SRR10918230.5457251/1‑144 (MQ=36)
CACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtg > SRR10918230.753029/1‑144 (MQ=36)
CACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtg > SRR10918230.2121417/1‑144 (MQ=36)
CACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtg > SRR10918230.3859461/1‑144 (MQ=36)
ACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACCTCGGTAG > SRR10918230.4129062/1‑151 (MQ=35)
ACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgc > SRR10918230.3874394/1‑143 (MQ=36)
CGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTC < SRR10918230.6869/151‑1 (MQ=60)
CGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgct > SRR10918230.2013212/1‑142 (MQ=36)
CGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgct < SRR10918230.5073798/151‑10 (MQ=36)
GACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctg < SRR10918230.3230058/151‑11 (MQ=36)
GACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctg < SRR10918230.3569650/151‑11 (MQ=36)
ACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctga > SRR10918230.3629034/1‑140 (MQ=36)
ACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctga > SRR10918230.1116387/1‑140 (MQ=36)
CCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGT < SRR10918230.5028145/151‑1 (MQ=60)
CCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgac > SRR10918230.1716196/1‑139 (MQ=36)
CCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgac > SRR10918230.3677136/1‑139 (MQ=36)
AGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactg > SRR10918230.3079576/1‑137 (MQ=36)
AGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactg < SRR10918230.3884772/151‑15 (MQ=36)
GGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑C < SRR10918230.3178708/151‑1 (MQ=60)
GTCGTGGGGCAGCGGCTGGTTGACGTGGACAGTGAGGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactgga < SRR10918230.1988295/151‑17 (MQ=31)
GTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGGAGTAATAGTGCCTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactgga < SRR10918230.4994203/151‑17 (MQ=35)
GTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactgga > SRR10918230.732997/1‑135 (MQ=36)
GTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactgga < SRR10918230.2094240/151‑17 (MQ=36)
GTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGGCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactgga > SRR10918230.1788955/1‑135 (MQ=35)
tggagttcagacgtgtgctcttccgatctGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑CGG < SRR10918230.5295279/122‑1 (MQ=60)
TCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactggag < SRR10918230.1008939/151‑18 (MQ=37)
TCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactggag > SRR10918230.1267513/1‑134 (MQ=36)
TCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactggag > SRR10918230.1406492/1‑134 (MQ=36)
CGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactggagt < SRR10918230.5373729/151‑19 (MQ=37)
CGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑CGGT > SRR10918230.2183280/1‑151 (MQ=60)
GTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactggagtc < SRR10918230.2654582/151‑20 (MQ=35)
GTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑CGGTA > SRR10918230.2873437/1‑151 (MQ=60)
GTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactggagtc < SRR10918230.1787675/151‑20 (MQ=34)
GTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactggagtc < SRR10918230.2966576/151‑20 (MQ=34)
TGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactggagtgt > SRR10918230.255532/1‑131 (MQ=33)
GGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑CGGTAGT < SRR10918230.4496946/151‑1 (MQ=60)
GGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactggagtctt < SRR10918230.2286535/151‑22 (MQ=31)
GGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactggagtctt < SRR10918230.4919768/151‑22 (MQ=31)
GGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactggagtctt < SRR10918230.3255353/151‑22 (MQ=31)
GGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactggagtctt < SRR10918230.72975/151‑22 (MQ=31)
GGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑CGGTAGTG > SRR10918230.922202/1‑151 (MQ=60)
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GCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactggagtcttgt > SRR10918230.4922967/1‑128 (MQ=29)
GCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactggagtcttgt < SRR10918230.1076235/151‑24 (MQ=29)
GCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑CGGTAGTGC < SRR10918230.1049249/151‑1 (MQ=60)
CCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggggctgactggagacgtgtc > SRR10918230.1852863/1‑127 (MQ=29)
CCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑CGGTAGTGCT < SRR10918230.446861/151‑1 (MQ=60)
CCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactggagtcttgtc < SRR10918230.2698135/151‑25 (MQ=28)
CCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactggagtcttgtc > SRR10918230.2433812/1‑127 (MQ=28)
CCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactggagtcttgtc < SRR10918230.1916707/151‑25 (MQ=28)
CCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactggagtcttgtc < SRR10918230.4395317/151‑25 (MQ=28)
CCAGCGGCTGGGTGACGTGCTCGGTGGAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactggagtcttgtc < SRR10918230.1457842/151‑25 (MQ=26)
CAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactggagtcttgtcc < SRR10918230.3769075/151‑26 (MQ=29)
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CAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactggagtcttgtcc < SRR10918230.1532929/151‑26 (MQ=28)
CAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactggagtcttgtcc < SRR10918230.5452820/151‑26 (MQ=28)
CAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactggagtcttgtcc < SRR10918230.3327840/151‑26 (MQ=28)
CAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactggagtcttgtcc > SRR10918230.3490867/1‑126 (MQ=28)
CAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactggagtcttgtcc < SRR10918230.5208167/151‑26 (MQ=28)
CAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactggagccttgtcc > SRR10918230.4964883/1‑126 (MQ=28)
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CGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑CGGTAGTGCTGACC < SRR10918230.3552030/151‑1 (MQ=60)
CGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑CGGTAGTGCTGACC > SRR10918230.4218740/1‑151 (MQ=60)
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CGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactggagtcttgtccagg < SRR10918230.3413489/151‑29 (MQ=28)
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GGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactggagtcttgtccaggt < SRR10918230.2472174/151‑30 (MQ=28)
GGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactggagtcttgtccaggt > SRR10918230.4459287/1‑122 (MQ=28)
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TGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑CGGTAGTGCTGACCGGGG > SRR10918230.4107407/1‑151 (MQ=60)
TGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactggagtcttgtccaggttca < SRR10918230.4692973/151‑33 (MQ=28)
TGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactggagtcttgtccaggttca > SRR10918230.1100338/1‑119 (MQ=28)
TGGTTGACGGGCTCAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGTAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCCTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactggagtcttgtccaggttca < SRR10918230.2547585/151‑33 (MQ=25)
GGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactggagtcttgtccaggtagat > SRR10918230.4812958/1‑118 (MQ=29)
GGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑CGGTAGTGCTGACCGGGGT > SRR10918230.4685494/1‑151 (MQ=60)
GGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactggagtcttgtccaggttcag < SRR10918230.4799646/151‑34 (MQ=26)
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GTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactggagtcttgtccaggttcagg > SRR10918230.3191764/1‑117 (MQ=25)
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CGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactggagtcttgtccaggttcaggttttc < SRR10918230.1645921/151‑40 (MQ=17)
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TGCACGGTGAACGTTGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑CGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGA > SRR10918230.595081/1‑151 (MQ=60)
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AGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactggagtcttgtccaggttcaggttttcgaacttc > SRR10918230.4678402/1‑105 (MQ=2)
AGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactggagtcttgtccaggttcaggttttcgaacttc > SRR10918230.3718402/1‑105 (MQ=2)
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TGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑Cctcggtgctgactggagtcttgtccaggttcaggttttcgaacttcca > SRR10918230.3814375/1‑103 (MQ=0)
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GCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCTGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑CGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGGGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCG > SRR10918230.2249312/1‑151 (MQ=60)
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TGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA‑‑‑CGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGGGTCAGTTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGAC > CP009974/1898166‑1898466
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
