Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F1 I1 R1
|
404 |
265.1 |
10478538 |
96.8% |
10143224 |
150.7 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 363 total aligned reads displayed.
TGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGGGTCAGTTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGAC > CP009974/1898166‑1898466
|
TGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCC > SRR10918231.3252658/1‑151 (MQ=60)
TGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCC < SRR10918231.2637778/151‑1 (MQ=43)
TGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCC > SRR10918231.4392841/1‑151 (MQ=43)
TGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCC > SRR10918231.3696756/1‑151 (MQ=43)
ACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCG > SRR10918231.3788223/1‑151 (MQ=46)
CTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGG < SRR10918231.4338129/151‑1 (MQ=50)
TGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGT > SRR10918231.4496232/1‑151 (MQ=52)
GCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTAC > SRR10918231.3205360/1‑151 (MQ=60)
GTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCG > SRR10918231.3019768/1‑151 (MQ=39)
GTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCG > SRR10918231.2254260/1‑151 (MQ=39)
ATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCG < SRR10918231.4579431/151‑1 (MQ=36)
GTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGG > SRR10918231.1353947/1‑151 (MQ=60)
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TGCTCAGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGT > SRR10918231.3277310/1‑151 (MQ=31)
GCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTC > SRR10918231.5182246/1‑151 (MQ=32)
GCTCAGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTGTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTC < SRR10918231.291212/151‑1 (MQ=31)
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CTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA < SRR10918231.704519/151‑1 (MQ=34)
CTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA < SRR10918231.942159/151‑1 (MQ=34)
CTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA < SRR10918231.3753839/151‑1 (MQ=34)
TCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCAC > SRR10918231.4763233/1‑151 (MQ=35)
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CAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACC > SRR10918231.2639212/1‑151 (MQ=35)
AGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACct > SRR10918231.4437442/1‑149 (MQ=35)
AGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACct > SRR10918231.4940250/1‑149 (MQ=35)
AGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACct < SRR10918231.440438/151‑3 (MQ=35)
GGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctc > SRR10918231.303087/1‑148 (MQ=35)
GGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctc < SRR10918231.4625503/151‑4 (MQ=35)
GGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctc > SRR10918231.1957138/1‑148 (MQ=35)
GGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGC > SRR10918231.2860254/1‑151 (MQ=60)
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GGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcg > SRR10918231.5090100/1‑147 (MQ=36)
GTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcgg < SRR10918231.3725269/151‑6 (MQ=36)
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TCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTC > SRR10918231.4714598/1‑151 (MQ=60)
TCACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggt > SRR10918231.1628853/1‑145 (MQ=36)
CACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtg < SRR10918231.4324334/151‑8 (MQ=36)
CACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtg < SRR10918231.2454074/151‑8 (MQ=36)
CACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGATGGTTGACGTGCACGGTGAAGGGCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtg < SRR10918231.2245849/151‑8 (MQ=34)
ACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgc < SRR10918231.2711196/151‑9 (MQ=36)
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CGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTC > SRR10918231.4601761/1‑151 (MQ=60)
CGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgct < SRR10918231.4816/151‑10 (MQ=36)
CGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgct > SRR10918231.3636728/1‑142 (MQ=36)
CGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgct < SRR10918231.5042278/151‑10 (MQ=36)
GACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctg > SRR10918231.455125/1‑141 (MQ=36)
GACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctg > SRR10918231.5230248/1‑141 (MQ=36)
GACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctg > SRR10918231.4526574/1‑141 (MQ=36)
GACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctg < SRR10918231.1953880/151‑11 (MQ=36)
GACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctg > SRR10918231.3374051/1‑141 (MQ=36)
ACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctga > SRR10918231.1135714/1‑140 (MQ=36)
CCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgac < SRR10918231.311101/151‑13 (MQ=36)
CAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGACGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATATTGACTTTGACGAGGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggttctgact > SRR10918231.539413/1‑138 (MQ=18)
CAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgact > SRR10918231.5167148/1‑138 (MQ=36)
CAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgact < SRR10918231.1907147/151‑14 (MQ=36)
CAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgact > SRR10918231.3928025/1‑138 (MQ=36)
CAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgact < SRR10918231.4650203/151‑14 (MQ=36)
CAAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgact < SRR10918231.1500440/151‑14 (MQ=36)
AGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgactg > SRR10918231.3363041/1‑137 (MQ=36)
AGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgactg > SRR10918231.4121699/1‑137 (MQ=36)
AGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgactg < SRR10918231.5123881/151‑15 (MQ=36)
GGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCAC < SRR10918231.4991377/151‑1 (MQ=60)
GGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCAC < SRR10918231.1607062/151‑1 (MQ=60)
GGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgactgg > SRR10918231.2586248/1‑136 (MQ=36)
GTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgactgga > SRR10918231.2325871/1‑135 (MQ=37)
TCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgactggag > SRR10918231.784962/1‑134 (MQ=37)
TCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgactggag > SRR10918231.3669083/1‑134 (MQ=36)
TCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgactggag < SRR10918231.2888688/151‑18 (MQ=36)
CGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgactggagt > SRR10918231.1936578/1‑133 (MQ=36)
GTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgactggagtc > SRR10918231.4553773/1‑132 (MQ=34)
TGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgactggagtct < SRR10918231.4819257/151‑21 (MQ=33)
TGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgactggagtct > SRR10918231.125906/1‑131 (MQ=33)
TGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgactggagtct > SRR10918231.4967040/1‑131 (MQ=33)
GGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACGGTAGT < SRR10918231.2157613/151‑1 (MQ=60)
GGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACGGTAGT < SRR10918231.3018337/151‑1 (MQ=60)
GGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgactggagtctt > SRR10918231.5103216/1‑130 (MQ=31)
GGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgactggagtctt < SRR10918231.1611096/151‑22 (MQ=31)
GGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgactggagtcttg > SRR10918231.848978/1‑129 (MQ=29)
GGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgactggagtcttg > SRR10918231.1072099/1‑129 (MQ=29)
GCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGC > SRR10918231.817961/1‑151 (MQ=60)
GCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgactggagtcttgt > SRR10918231.590149/1‑128 (MQ=28)
GCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgactggagtcttgt < SRR10918231.1862336/151‑24 (MQ=28)
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AGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGA > SRR10918231.1003158/1‑151 (MQ=60)
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GCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGAC < SRR10918231.2846863/151‑1 (MQ=60)
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GCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGCTGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgactggagtcttgtccaggttcaggttttcgaa < SRR10918231.4796398/151‑43 (MQ=8)
GCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgactggagtcttgtccaggttcaggttttcgaa < SRR10918231.5034896/151‑43 (MQ=9)
GCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgactggagtcttgtccaggttcaggttttcgaa < SRR10918231.3652482/151‑43 (MQ=9)
GCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgactggagtcttgtccaggttcaggttttcgaa < SRR10918231.4515888/151‑43 (MQ=9)
CACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgactggagtcttgtccaggttcaggttttcgaac < SRR10918231.4679718/151‑44 (MQ=7)
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TGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGGGTCAGTTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGAC > CP009974/1898166‑1898466
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
