Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F1 I1 R1
|
368 |
332.2 |
13092066 |
97.0% |
12699304 |
150.6 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 478 total aligned reads displayed.
TGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGGGTCAGTTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGA > CP009974/1898166‑1898465
|
GTGGTGACCTGGGCATTGGTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGC < SRR10918232.5282366/151‑1 (MQ=34)
ATGGTGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGC < SRR10918232.323912/151‑1 (MQ=35)
TGGTGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCC < SRR10918232.5187015/151‑1 (MQ=37)
TGGTGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCC < SRR10918232.5665179/151‑1 (MQ=37)
GACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCC < SRR10918232.1071575/151‑1 (MQ=44)
GGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTA > SRR10918232.4504109/1‑151 (MQ=58)
CATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACC > SRR10918232.3841796/1‑151 (MQ=60)
ATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCG > SRR10918232.6117952/1‑151 (MQ=36)
TTGTTGCTCAGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGT > SRR10918232.5379890/1‑151 (MQ=36)
TGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGG > SRR10918232.3489368/1‑151 (MQ=60)
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TGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTC < SRR10918232.5082863/151‑1 (MQ=34)
GTTGCTCAGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCG < SRR10918232.4471355/151‑1 (MQ=32)
GTTGCTCAGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCG > SRR10918232.6235006/1‑151 (MQ=32)
GTTGCGCAGGGTAGCGGCCAGGTCGTGCGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGG < SRR10918232.506675/151‑1 (MQ=60)
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TTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGG < SRR10918232.3905838/151‑1 (MQ=31)
TGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGT > SRR10918232.4383914/1‑151 (MQ=31)
TGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGT > SRR10918232.4476562/1‑151 (MQ=31)
GCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTC < SRR10918232.5418011/151‑1 (MQ=32)
CTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA < SRR10918232.6548089/151‑1 (MQ=34)
TCAGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCAC > SRR10918232.6058759/1‑151 (MQ=35)
TCAGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCAC > SRR10918232.3072661/1‑151 (MQ=35)
gactggagttcagacgtgtgctcttccgatCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCA < SRR10918232.5830007/121‑1 (MQ=60)
CAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACC < SRR10918232.3171098/151‑1 (MQ=35)
CAGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACC < SRR10918232.4845164/151‑1 (MQ=35)
GGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACct < SRR10918232.5020279/151‑3 (MQ=35)
AGTGTCACGACCAAGTTGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACct < SRR10918232.1918858/151‑3 (MQ=34)
AGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACct > SRR10918232.6250884/1‑149 (MQ=35)
AGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACct > SRR10918232.6557069/1‑149 (MQ=35)
GGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGG < SRR10918232.6450708/151‑1 (MQ=60)
GGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctc < SRR10918232.1872433/151‑4 (MQ=35)
GGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcg > SRR10918232.927857/1‑147 (MQ=36)
GGTCACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcg < SRR10918232.5409698/151‑5 (MQ=36)
GGTCACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcg < SRR10918232.6417489/151‑5 (MQ=36)
GTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcgg > SRR10918232.2953189/1‑146 (MQ=36)
GTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcgg < SRR10918232.5421462/151‑6 (MQ=36)
GTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcgg < SRR10918232.4120588/151‑6 (MQ=36)
TCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTC < SRR10918232.1358275/151‑1 (MQ=60)
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TCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTC < SRR10918232.5700067/151‑1 (MQ=60)
TCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGTAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggt > SRR10918232.4937623/1‑145 (MQ=35)
TCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggt > SRR10918232.5341426/1‑145 (MQ=36)
TCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggt < SRR10918232.6029636/151‑7 (MQ=36)
TCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggt > SRR10918232.6562659/1‑145 (MQ=36)
CACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtg > SRR10918232.2613462/1‑144 (MQ=36)
CACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtg > SRR10918232.2642349/1‑144 (MQ=36)
CACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtg > SRR10918232.5127780/1‑144 (MQ=36)
ACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgc > SRR10918232.4328836/1‑143 (MQ=36)
ACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgc < SRR10918232.2074017/151‑9 (MQ=36)
GACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCG < SRR10918232.4610913/151‑1 (MQ=60)
GACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCG > SRR10918232.1791576/1‑151 (MQ=60)
GACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctg > SRR10918232.5690077/1‑141 (MQ=36)
GACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctg > SRR10918232.4405330/1‑141 (MQ=36)
GACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctg > SRR10918232.5673381/1‑141 (MQ=36)
GACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctg < SRR10918232.5054241/151‑11 (MQ=36)
GACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctg > SRR10918232.6011756/1‑141 (MQ=36)
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ACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctga > SRR10918232.2800952/1‑140 (MQ=36)
ACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctga > SRR10918232.5060275/1‑140 (MQ=36)
ACCAGGTCGTGGGCCAGCGGATGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctga < SRR10918232.2418756/151‑12 (MQ=35)
ACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctga > SRR10918232.166614/1‑140 (MQ=36)
CCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgac < SRR10918232.3933119/151‑13 (MQ=36)
CCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgac > SRR10918232.3596125/1‑139 (MQ=36)
CCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgac < SRR10918232.556122/151‑13 (MQ=36)
CAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTC > SRR10918232.5486121/1‑151 (MQ=60)
CAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTC > SRR10918232.36173/1‑151 (MQ=60)
CAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgact > SRR10918232.1279415/1‑138 (MQ=36)
CAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgact < SRR10918232.168114/151‑14 (MQ=36)
CAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgact > SRR10918232.3970414/1‑138 (MQ=36)
AGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA < SRR10918232.1005749/151‑1 (MQ=60)
AGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA < SRR10918232.4775520/151‑1 (MQ=60)
AGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCA < SRR10918232.3758868/151‑1 (MQ=60)
AAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgactg < SRR10918232.1738852/151‑15 (MQ=36)
GGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgactgg < SRR10918232.6204462/151‑16 (MQ=36)
GGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgactgg < SRR10918232.1343384/151‑16 (MQ=36)
GGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgactgg < SRR10918232.5176476/151‑16 (MQ=36)
AGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgactgg > SRR10918232.6301794/1‑136 (MQ=37)
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GCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgactggagtcttgt > SRR10918232.4438947/1‑128 (MQ=28)
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CCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCT > SRR10918232.6089240/1‑151 (MQ=60)
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GCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGACCGG < SRR10918232.4594652/151‑1 (MQ=60)
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CGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgactggagtcttgtccaggttcaggttttc < SRR10918232.1612158/151‑40 (MQ=17)
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CTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGGGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGA < SRR10918232.2246205/151‑1 (MQ=60)
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TGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGGGTCAGTTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGA > CP009974/1898166‑1898465
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
