Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
343 |
268.7 |
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97.0% |
10547310 |
150.6 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 425 total aligned reads displayed.
GCTGTCGAGAACTACTGGTAAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAGCGCCCCCGGCAATTTCAAG > CP009974/3105259‑3105558
|
AGAACTACTGGTAAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGG > SRR10918230.5176647/1‑151 (MQ=60)
gtggacacacaccggaggttggacgcaggccgtcgTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTG > SRR10918230.1088837/36‑151 (MQ=0)
AACTACTGGTAAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTG > SRR10918230.5440029/1‑151 (MQ=60)
ACTACTGGTAAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGA < SRR10918230.3369724/151‑1 (MQ=60)
gtggacacacatcggtggttggacacagcccaCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAGTTTCCACCCGCCATGCACTGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGT > SRR10918230.3086895/33‑151 (MQ=0)
gtggacacacatcggtggttggacacagcccaCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAGTTTCCACCCGCCATGCACTGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGT > SRR10918230.3568547/33‑151 (MQ=0)
TACTGGTAAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATG < SRR10918230.4826122/151‑1 (MQ=60)
TGGTAAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGAC > SRR10918230.2723384/1‑151 (MQ=60)
GGTAAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACA < SRR10918230.1076489/151‑1 (MQ=60)
acaccggaggttggacgcaggccgtcgTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACAC > SRR10918230.2798470/28‑151 (MQ=0)
caccggaggttggacgcaggccgtcgTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACA > SRR10918230.2476840/27‑151 (MQ=0)
AAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACAC > SRR10918230.987288/1‑151 (MQ=60)
catcggtggttggacacagcccaCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAGTTTCCACCCGCCATGCACTGTTGCTGCCGCCAGCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGgtgacacatc > SRR10918230.1677322/24‑141 (MQ=0)
AGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACA < SRR10918230.1571697/151‑1 (MQ=60)
atcggtggttggacacagcccaCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACAT > SRR10918230.807082/23‑151 (MQ=0)
ggaggttggacgcaggccgtcgTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACCTC > SRR10918230.4731186/23‑151 (MQ=1)
gccggttgcttgagttcagacgtgtgctcccccgatctCCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATTGGTGGTGGACCCACAT < SRR10918230.2517146/113‑1 (MQ=0)
gaggttggacgcaggccgtcgTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACCTCG > SRR10918230.3435016/22‑151 (MQ=1)
TTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTG > SRR10918230.2369636/1‑151 (MQ=60)
gttggacacagcccaCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGT < SRR10918230.4373609/136‑1 (MQ=15)
GCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGT < SRR10918230.5073955/151‑1 (MQ=60)
ttggacacagcccaCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTT < SRR10918230.1038751/137‑1 (MQ=16)
gacgccggccgccgTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACCTCGGAGGTTG < SRR10918230.3785478/137‑1 (MQ=0)
gacgcaggccgtcgTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACCTCGGAGGTTG < SRR10918230.454856/137‑1 (MQ=0)
acgcaggccgtcgTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACCTCGGAGGTTGG > SRR10918230.1021924/14‑151 (MQ=3)
CCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGA < SRR10918230.4698505/151‑1 (MQ=59)
CCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGA < SRR10918230.2002684/151‑1 (MQ=59)
cacagcccaCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACA > SRR10918230.353167/10‑151 (MQ=16)
GTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGCCA > SRR10918230.339448/1‑151 (MQ=54)
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cagcccgtcGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGTCCTGCTGGCCAATCTCCACACGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACACA < SRR10918230.163927/142‑1 (MQ=3)
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gccgtcgTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACCTCGGAGGTTGGACACAG > SRR10918230.3514096/8‑151 (MQ=6)
gccgtcgTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACCTCGGAGGTTGGACACAG < SRR10918230.2755432/144‑1 (MQ=0)
agcccactgtaggagcgggtttacccgcgaaagggccggctctgcttgctaaagcccaagagccattccgtgttgctggccccagagtattctcgggtcatcccgtTCCTACA‑CCGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAG < SRR10918230.256593/45‑1 (MQ=30)
cccaCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCACCGCATCCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGCACACACATCGGCGGGTGGACACAccc > SRR10918230.5009932/5‑148 (MQ=0)
GGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGC > SRR10918230.304799/1‑151 (MQ=45)
ccgtcGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGTCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACAGCGGGGGCTGGACACAGGCC < SRR10918230.1599529/146‑1 (MQ=1)
GCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCG < SRR10918230.2308733/151‑1 (MQ=41)
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CGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACCTCGGAGGTTGGACACAGCCCGC > SRR10918230.495268/1‑151 (MQ=0)
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GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGTCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACACAGGCCGCCGT < SRR10918230.4973481/151‑1 (MQ=26)
cgcctgcctgtACCCGCGAAAA‑GGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTCGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTTTA > SRR10918230.2824095/12‑151 (MQ=0)
GGAGCGGGTTTCCCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGcccactgtagg < SRR10918230.3286782/151‑12 (MQ=48)
gacCGGGTTCCCCCGCGAAAG‑GGCCGGTCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACACAGGCCGCCGTGTAG < SRR10918230.3148830/148‑1 (MQ=34)
GAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGcccactgtagga < SRR10918230.1967848/151‑13 (MQ=48)
CGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGG > SRR10918230.1552308/1‑151 (MQ=33)
AGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGcccactgtaggag > SRR10918230.764119/1‑138 (MQ=48)
tgcctgtACCCGCGAAAA‑GGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccg > SRR10918230.1942025/8‑144 (MQ=5)
CGGGTTTCCCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAG < SRR10918230.2638001/151‑1 (MQ=16)
gcctgtACCCGCGAAAA‑GGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACCCACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgc > SRR10918230.3211581/7‑143 (MQ=7)
GTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGcccactgtaggagcgggc > SRR10918230.1136702/1‑133 (MQ=45)
GTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGTCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGGGGTGGACACACGTCGGGGGCTGGACACAGGCCGACGTGTGGGAGCCG > SRR10918230.4858841/1‑151 (MQ=7)
tgtACCCGCGAAAA‑GGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaa > SRR10918230.2855659/4‑140 (MQ=16)
gtACCCGCGAAAA‑GGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaaa < SRR10918230.2924145/149‑13 (MQ=18)
TTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTT < SRR10918230.3075819/151‑1 (MQ=42)
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agccgggaagG‑GGCCGGCCGTGCTGGCCAATTTCCACGTGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTGGCGGGTAAACCCGCTCCTAGA‑TAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTAC < SRR10918230.4314565/141‑1 (MQ=16)
ACCCGCGAAAG‑GGCCGGTCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTT < SRR10918230.228622/151‑1 (MQ=31)
ACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTT < SRR10918230.2138614/151‑1 (MQ=20)
CCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTA < SRR10918230.5317643/151‑1 (MQ=20)
CCGCGAAAG‑GGCCGGTCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTCGACACAGGCCGCCGTGTATGAGCGGGcgtac > SRR10918230.5222662/1‑146 (MQ=26)
CCGCGAAAA‑GGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGGTGGACACAGGCCGCCGctgaggcgcgaaagggc > SRR10918230.2526780/1‑134 (MQ=7)
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GCGAAAG‑GGCCGGTCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCC < SRR10918230.91285/151‑1 (MQ=23)
CGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCG < SRR10918230.4399409/151‑1 (MQ=20)
CGAAAA‑GGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaaagggccgg < SRR10918230.2495095/151‑20 (MQ=20)
AAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCCTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAA < SRR10918230.4466352/151‑1 (MQ=14)
AAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAca > SRR10918230.557761/1‑149 (MQ=25)
AAA‑GGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaaagggccggccc < SRR10918230.3833419/151‑23 (MQ=31)
AG‑GGCCGGTCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCagatcg > SRR10918230.946305/1‑145 (MQ=11)
AA‑GGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaaagggccggccct < SRR10918230.843312/151‑24 (MQ=31)
gaGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCCTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAag > SRR10918230.652430/3‑149 (MQ=18)
G‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAA < SRR10918230.4111250/151‑1 (MQ=23)
G‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAC > SRR10918230.2176487/1‑151 (MQ=20)
G‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTGTACCCGCGAAC > SRR10918230.1930486/1‑151 (MQ=20)
G‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAagg < SRR10918230.5329912/151‑4 (MQ=30)
A‑GGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CCGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaaagggccggccctg > SRR10918230.3358263/1‑127 (MQ=20)
GCCGGTCGTGGTGGCCAATCGCCACCCGGCGTCCACCGTTGCCGCCGCCACCGTCTTCGCGGGTAACCCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAgag < SRR10918230.3180420/151‑4 (MQ=47)
GCCGGTCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAgag < SRR10918230.2082368/151‑4 (MQ=5)
GCCGGTCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAgag < SRR10918230.4178395/151‑4 (MQ=5)
GCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCCTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACatccgaaaggcc > SRR10918230.2891527/1‑139 (MQ=19)
GCCGGCCCTGCTAGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACAC < SRR10918230.3239706/151‑1 (MQ=20)
CCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaaagggccggccctgctg > SRR10918230.3000080/1‑124 (MQ=27)
CCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGGGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaaagggccggccctgctg > SRR10918230.5349334/1‑124 (MQ=20)
CCGGCCCTGCTGGCTAATTTCCACCCGCTGTTCACCGTTGCCACCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACGCCTACC‑C‑‑‑‑CGGTGGTGGACACACATCTGGGGTTGGACACAGGCCACC‑‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAgaggccagcc < SRR10918230.4319339/151‑11 (MQ=0)
CCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCCTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGcctgcggattccacgctgactcggacacccattcc > SRR10918230.3526457/1‑116 (MQ=29)
CCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCCTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAagggcc > SRR10918230.3345345/1‑145 (MQ=20)
CCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTGCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAagggcc < SRR10918230.3584687/151‑7 (MQ=23)
CGGTCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGGCACAGGCAGCCGTGGAGGCGCGGGTgtacgggcgaagaggc > SRR10918230.1761021/1‑135 (MQ=0)
CGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaaagggccggccctgctgg < SRR10918230.1593086/151‑29 (MQ=28)
CGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACGG > SRR10918230.3564857/1‑151 (MQ=0)
CGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCG < SRR10918230.3470246/151‑1 (MQ=20)
CGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGCCACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAagggccg > SRR10918230.2070915/1‑144 (MQ=16)
GGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaaagggccggccctgctggc > SRR10918230.4660629/1‑122 (MQ=28)
GGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaaagggccggccctgctggc > SRR10918230.1429908/1‑122 (MQ=28)
GGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaaagggccggccctgagatc > SRR10918230.3485480/1‑122 (MQ=28)
GGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAagggccgg > SRR10918230.4928507/1‑143 (MQ=17)
GCGCTGCTGGCCAATGTCCACCCGCCGTTGACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGC < SRR10918230.327694/151‑1 (MQ=19)
GCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGTC > SRR10918230.3975002/1‑151 (MQ=20)
GCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGC > SRR10918230.4768065/1‑151 (MQ=20)
GCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCCTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAagggccggc < SRR10918230.5387992/151‑10 (MQ=15)
GCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCCTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAagggccggc < SRR10918230.5375991/151‑10 (MQ=15)
GCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCCTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAagggccggc < SRR10918230.1725762/151‑10 (MQ=15)
CCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCA < SRR10918230.1997097/151‑1 (MQ=20)
CCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCCTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTTGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGccccctgtagcggcgggtttaccccccacagggccggcc > SRR10918230.236033/1‑112 (MQ=27)
CTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCCTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACGCAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAagggccggccct < SRR10918230.4112047/151‑13 (MQ=4)
GGCTGGCGAAGTTCCACCCGCCGTTCGCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAG < SRR10918230.72227/151‑1 (MQ=22)
CGCTGGCCAATTTCCGCCCGCCGTTCACCGTTGCCGCAACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaaagggccggccctgctggccaatt < SRR10918230.5028119/151‑35 (MQ=5)
GCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACCGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAagggccggccctgc < SRR10918230.4147802/151‑15 (MQ=21)
GTGGCCAATTTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCCCCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGGGGACACAGATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaaagggccggccctgctggccaatttc < SRR10918230.4002506/151‑37 (MQ=5)
tgaccaatttccagcagctaTTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAagggccggccctgctg < SRR10918230.270969/131‑17 (MQ=1)
TGGCCAATTTCCACCCGGCATTCACTGGTGCTGCCGCCATCGTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAagggccggccctgctg < SRR10918230.269359/151‑17 (MQ=0)
TGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTGACCCGCGAACACCGGCAGAGCCG > SRR10918230.1222292/1‑151 (MQ=30)
TGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaaagggccggccctgctggccaatttcc > SRR10918230.3897764/1‑114 (MQ=6)
GGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAagggccggccctgctgg > SRR10918230.1484955/1‑134 (MQ=0)
GCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGT > SRR10918230.2415590/1‑151 (MQ=31)
GCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaaagggccggccctgctggccaatttccac < SRR10918230.4378065/151‑40 (MQ=6)
CCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGCTG > SRR10918230.2697343/1‑151 (MQ=30)
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CCAATTTCCACCCGCCCTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAagggccggccctgctggcc < SRR10918230.2881024/151‑20 (MQ=0)
CAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaaagggccggccctgctggccaatttccaccc > SRR10918230.4737585/1‑110 (MQ=6)
CAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaaagggccggccctgctggccaatttccaccc > SRR10918230.3108828/1‑110 (MQ=6)
AATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaaagggccggccctgctggccaatttccacccg > SRR10918230.2231336/1‑109 (MQ=6)
TTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaaagggccggccctgctggccaatttccacccgcc < SRR10918230.2430339/151‑45 (MQ=32)
TTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaaagggccggccctgctggccaatttccacccgcc > SRR10918230.1793466/1‑107 (MQ=6)
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CTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGCTTACCCGCGAAgcggccggccccgctggccaat > SRR10918230.1042658/1‑129 (MQ=3)
TCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAAATTGGTGGTGGCCACACATCTGGGGCTGGACACAGGCCTCCGTTTAGAAGCGGGatgaccctcgaagaggcccgcccgcctggcctttc > SRR10918230.1443085/1‑116 (MQ=0)
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CACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaaagggccggccctgctggccaatttccacccgccgttc < SRR10918230.48798/151‑49 (MQ=33)
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GCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCAC < SRR10918230.3928242/151‑1 (MQ=48)
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GTTCACCGTTGCCGCAGCCTCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGG < SRR10918230.770626/151‑1 (MQ=49)
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TTCACCGTTGCCGCCGCCCCCGTATTCGCGGGTACACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAgaggccggccctgctggccaatctccaccagccg < SRR10918230.2124425/151‑35 (MQ=21)
TTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaaagggccggccctgctggccaatctccacccgccgttcaccgctgcc > SRR10918230.3637776/1‑94 (MQ=19)
TCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGAT < SRR10918230.1614190/151‑1 (MQ=59)
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ACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTC > SRR10918230.1583378/1‑151 (MQ=60)
CCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCT > SRR10918230.1921034/1‑151 (MQ=60)
CGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTT < SRR10918230.125566/151‑1 (MQ=60)
CGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGCTTACCCGCGAggaggccggccctgctggccaatctccaccagcccctcac > SRR10918230.1249787/1‑111 (MQ=1)
GTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGTTACACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACATGCCGCCGTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCCAACACCGGCAGAGCCGCTGCCATACACCGCCCTGGATTATTC > SRR10918230.1537526/1‑151 (MQ=30)
GTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTC > SRR10918230.2209604/1‑151 (MQ=60)
GTTGCCGCCGCCACCGTATGCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTC < SRR10918230.3934923/151‑1 (MQ=60)
TTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACACAGGCCGCCGTGGGGGAGCGGGTatccccgcgacgcgggcggccccgcgcgcccatatccaccacccgctccccc > SRR10918230.5056461/1‑99 (MQ=6)
GCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCC < SRR10918230.3893923/151‑1 (MQ=60)
CCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACAACCGTGGGTGGACACAGGCCGCCGgttacccgcgaaagggccggccctgctggccagtttccactcgccgttctccgttgtcgcagctcact > SRR10918230.4470849/1‑83 (MQ=6)
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GCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGC > SRR10918230.1993840/1‑151 (MQ=60)
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CCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCA < SRR10918230.3713617/151‑1 (MQ=60)
CCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAagggccggcgctgctggccgattaccaccggccatccgctgttgacgcc > SRR10918230.126671/1‑102 (MQ=0)
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CGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCAT > SRR10918230.3063508/1‑151 (MQ=60)
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CCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCG < SRR10918230.1423503/151‑1 (MQ=60)
CGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGC > SRR10918230.606318/1‑151 (MQ=60)
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ATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCC < SRR10918230.2394409/151‑1 (MQ=60)
TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCT > SRR10918230.1312165/1‑151 (MQ=60)
GCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACA > SRR10918230.323078/1‑151 (MQ=60)
AAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAGCGCCC < SRR10918230.1669763/151‑1 (MQ=60)
AACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAGCGCCCC > SRR10918230.888963/1‑151 (MQ=60)
AACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACCTCGAGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACggccacccccgttgccaaaacccgccccctggcgacagctgccgccgcagccggattcacgcgta > SRR10918230.2741068/1‑86 (MQ=0)
ACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAGCGCCCCC < SRR10918230.1716867/151‑1 (MQ=60)
ACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAGCGCCCCC < SRR10918230.248241/151‑1 (MQ=60)
CCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAGCGCCCCCG > SRR10918230.520560/1‑151 (MQ=60)
CCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAGCGCCCCCGG < SRR10918230.624394/151‑1 (MQ=60)
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CTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGT > SRR10918230.160773/1‑54 (MQ=2)
CCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCAgatcggaagagcacacgtctgaactccag > SRR10918230.5129068/1‑122 (MQ=60)
CCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAGCGCCCCCGGCAATT > SRR10918230.2268842/1‑151 (MQ=60)
CCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATGCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAGCGCCCCCGGCAATT > SRR10918230.1116333/1‑151 (MQ=60)
TACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAGCGCCCCCGGCAATTTC < SRR10918230.3253175/151‑1 (MQ=60)
TACA‑CAGATTGGTGGGGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGT < SRR10918230.108057/50‑1 (MQ=24)
CA‑CAGTTTGGTGGTGGCCACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGT < SRR10918230.1519256/48‑1 (MQ=24)
|
GCTGTCGAGAACTACTGGTAAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAGCGCCCCCGGCAATTTCAAG > CP009974/3105259‑3105558
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
