Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F1 I1 R1
|
368 |
332.2 |
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97.0% |
12699304 |
150.6 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 488 total aligned reads displayed.
GCTGTCGAGAACTACTGGTAAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAGCGCCCCCGGCAATTTCAAG > CP009974/3105259‑3105558
|
GCTGTCGAGAACTACTGGTAAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGC > SRR10918232.7832/1‑151 (MQ=60)
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GTCGAGAACTACTGGTAAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGA < SRR10918232.3261817/151‑1 (MQ=60)
TCGAGAACTACTGGTAAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGAT > SRR10918232.5313199/1‑151 (MQ=60)
GAGAACTACTGGTAAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTG < SRR10918232.4672750/151‑1 (MQ=60)
AGAACTACTGGTAAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGG < SRR10918232.1258060/151‑1 (MQ=60)
GAACTACTGGTAAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGT > SRR10918232.1742728/1‑151 (MQ=60)
tggacacacaccggaggttggacgcaggccgtcgTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGG > SRR10918232.517728/35‑151 (MQ=0)
CTACTGGTAAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGAT > SRR10918232.1143942/1‑151 (MQ=60)
CTACTGGTAAGACAAGGGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGAT < SRR10918232.800349/151‑1 (MQ=59)
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gacacacaccggaggttggacgcaggccgtcgTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTG > SRR10918232.6390134/33‑151 (MQ=0)
acacacaccggaggttggacgcaggccgtcgTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGG > SRR10918232.3884431/32‑151 (MQ=0)
ccgtgactggagttcagacgtgtgctcttccgatctaGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGA < SRR10918232.356617/114‑1 (MQ=6)
cccccccggaggttggccgcaggccgtcgTGTAGGAGCGGGTTCCCCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGAC < SRR10918232.1276472/122‑1 (MQ=0)
acacaccggaggttggacgcaggccgtcgTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGAC > SRR10918232.6290903/30‑151 (MQ=0)
acacacatcggtggttggacacagcccaCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAGTTTCCACCCGCCATGCACTGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGAC > SRR10918232.4402160/29‑151 (MQ=0)
TGGTAAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGATGGAC > SRR10918232.2319426/1‑151 (MQ=60)
GTAAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGATGGACAC > SRR10918232.5777794/1‑151 (MQ=60)
cacatcggtggttggacacagcccaCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAGTTTCCACCCGCCATGCACTGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACA > SRR10918232.3016643/26‑151 (MQ=0)
accggaggttggacgcaggccgtcgTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACAC > SRR10918232.1667416/26‑151 (MQ=1)
AAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGATGGACACAC < SRR10918232.4946342/151‑1 (MQ=60)
AAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTCAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGATGGACACAC > SRR10918232.3498842/1‑151 (MQ=60)
ccggacgttccacgccggcagtccagtcgtgtgggcttccccgccgaagG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACC < SRR10918232.5452664/102‑1 (MQ=0)
catcggtggttggacacagcccaCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCCCGGGCACACCCGCCCCTACACCGATTGGTGGTGGACACACA > SRR10918232.2684257/24‑151 (MQ=0)
cggaggttggacgcaggccgtcgTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACCT > SRR10918232.2510471/24‑151 (MQ=1)
ACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGATGGACACACATC < SRR10918232.3458814/151‑1 (MQ=60)
ACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGATGGACACACATC < SRR10918232.630568/151‑1 (MQ=60)
ggtggttggacacagcccaCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACATCGG < SRR10918232.2291379/132‑1 (MQ=2)
ggtggtgatccacagcctactgtgggaGCGGGTTTACCCGCTAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCGCCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACATCGG < SRR10918232.5263306/124‑1 (MQ=14)
AATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGATGGACACACATCGG > SRR10918232.3619777/1‑151 (MQ=60)
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gttggacgcaggccgtcgTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACCTCGGAG < SRR10918232.3824148/133‑1 (MQ=1)
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TTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGATGGACACACATCGGTG < SRR10918232.3586677/151‑1 (MQ=60)
ttggacgcaggccgtcgTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACCTCGGAGG < SRR10918232.4178102/134‑1 (MQ=1)
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ggacgcaggcggtcgTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACCTCGGAGGTT < SRR10918232.4527806/136‑1 (MQ=0)
ggacgcaggccgtcgTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACCTCGGAGGTT > SRR10918232.721401/16‑151 (MQ=0)
tggacacagcccaCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCGACTCCTACACAGATTGGTGGTGGGCACACATaggttgatg > SRR10918232.1680480/14‑142 (MQ=17)
tgacattccgtgactggagttcagacgtgtgctcttccgatctGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGG < SRR10918232.417956/108‑1 (MQ=20)
aatacagccgcgcggaggaGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGTCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGA < SRR10918232.1586530/132‑1 (MQ=11)
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ccgtcgTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGGCACACCTCGGAGGTTGGACACAGC > SRR10918232.2544201/7‑151 (MQ=4)
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GGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGC > SRR10918232.2597275/1‑151 (MQ=45)
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GGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCC < SRR10918232.3065743/151‑1 (MQ=43)
tcgTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACCTCGGAGGTTGGACACAGCCCG > SRR10918232.2019835/4‑151 (MQ=0)
caCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGccca < SRR10918232.3326109/149‑5 (MQ=45)
caCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGccca < SRR10918232.2700547/149‑5 (MQ=45)
gtcGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGTCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACACAGGCCGC > SRR10918232.4318079/4‑151 (MQ=15)
tcGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGTCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACACAGGCCGCC < SRR10918232.2146475/149‑1 (MQ=19)
GTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACCTCGGAGGTTGGACACAGCCCGCC < SRR10918232.820127/151‑1 (MQ=0)
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GTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACCTCGGAGGTTGGACACAGCCCGCCGT < SRR10918232.6526136/151‑1 (MQ=19)
aagagcgggtataccaGCGAAAG‑AGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGT < SRR10918232.2165317/135‑1 (MQ=0)
AGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGcccactgtag < SRR10918232.6268580/151‑11 (MQ=47)
agttcagacgtgtgctcttccgatctCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGT < SRR10918232.3180819/125‑1 (MQ=22)
GGCGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTA > SRR10918232.6152463/1‑151 (MQ=37)
gcctgcctgtACCCGCGAAAA‑GGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttac > SRR10918232.3921143/11‑147 (MQ=0)
gcctgcctgtACCCGCGAAAA‑GGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttac > SRR10918232.1421874/11‑147 (MQ=0)
GCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGA > SRR10918232.4326099/1‑151 (MQ=31)
tgcctgtACCCGCGAAAA‑GGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccg > SRR10918232.2631234/8‑144 (MQ=5)
CGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGTCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACCCGTCGGGGGCTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAG > SRR10918232.5500030/1‑151 (MQ=29)
GGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCAAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGC < SRR10918232.1835726/151‑1 (MQ=30)
GGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGG < SRR10918232.459398/151‑1 (MQ=38)
GGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGCTTGGTGGTGGACACACCTCGGAGGTTGGACACAGCCCGCC‑‑GTAGGCGCGGG > SRR10918232.5397969/1‑151 (MQ=0)
GTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGT < SRR10918232.5138227/151‑1 (MQ=38)
GTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGAAACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGG > SRR10918232.1738753/1‑151 (MQ=28)
tttcCCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGG < SRR10918232.559643/147‑1 (MQ=23)
tacaccggcaaaagggcccgtcctgctggccgaacTCCACCGGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGG < SRR10918232.2868019/116‑1 (MQ=6)
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CCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGagatcggaagagcaca > SRR10918232.100692/1‑135 (MQ=17)
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CGCGAAAA‑GGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaaagggcc < SRR10918232.280291/151‑18 (MQ=20)
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attccgtgactggagttcagacgtgtgctcttccgatctTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCC < SRR10918232.5214818/112‑1 (MQ=8)
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GAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTCGACACACATCGGTGGTTGGAtaccgcccactgtaggagcgggcattcccgcga > SRR10918232.1722138/1‑118 (MQ=35)
AGG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCCTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAA < SRR10918232.13956/151‑1 (MQ=23)
AAGAGGCCGGCCCTGCTGGACAATTTCCCCCCGCCCTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGGATTCGCGGGTAAACTCGCTCCTACACAGATTGGTGATGGACAAACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAA < SRR10918232.5624004/151‑1 (MQ=12)
gaGGCCGGCCCTGCTGGCTAATTTCCACCCGCTGTTCACCGTTGCCACCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACGCCTACCC‑‑‑‑CGGTGGTGGACACACATCTGGGGTTGGACACAGGCCACC‑‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAgaggcc < SRR10918232.2925979/149‑7 (MQ=0)
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A‑GGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaaagggccggccctg > SRR10918232.3499091/1‑127 (MQ=31)
A‑GGCCGGCCCTGCTGGCTAATTTCCACCCGCTGTTCACCGTTGCCACCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACGCCTACCC‑‑‑‑CGGTGGTGGACACACATCTGGGGTTGGACACAGGCCACC‑‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAgaggcca < SRR10918232.1892572/151‑8 (MQ=0)
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GGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAagggccgg > SRR10918232.5824678/1‑143 (MQ=17)
CCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAagggccggcc > SRR10918232.5802556/1‑141 (MQ=22)
CCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAagatcggaaga > SRR10918232.5919933/1‑140 (MQ=20)
CTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGA < SRR10918232.638486/151‑1 (MQ=22)
CTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAagggccggccct > SRR10918232.5696959/1‑139 (MQ=20)
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CAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAagggccggccctgctggcca > SRR10918232.487442/1‑131 (MQ=14)
ATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAgaggccggccctgctggcca > SRR10918232.2987717/1‑131 (MQ=0)
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CACCCGCCGTTCGCCGTTGCCGCCACAACCGGATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaaagggccggccctgctggccaatttccacccgccgttc < SRR10918232.2089684/151‑49 (MQ=10)
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ACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaaagggccggccctgctggccaatttccacccgccgttca > SRR10918232.2715148/1‑102 (MQ=33)
ACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGGTTACCCGCGAAagggccggccctgctggccagtttccac > SRR10918232.1248777/1‑123 (MQ=0)
CCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaaagggccggccctgctggccaatttccacccgccgttcac > SRR10918232.5690407/1‑101 (MQ=28)
CGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaaagggccggccctgctggccaatttccccccgccgctccccc > SRR10918232.5474160/1‑99 (MQ=33)
GCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGATTGGTGGTGTACACACATCGGGGGCTGGACACAGGCCGCCGccaatgagcgggcttacccgccgagaggcccgccccgctggcccagctccccca > SRR10918232.2580866/1‑97 (MQ=0)
GCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaaagggccggccctgctggccaatttccacccgccgttcaccgt < SRR10918232.4719633/151‑54 (MQ=11)
GTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGGTTACCCGCGAAgaggccggccctgctggccagtctccaccagcc > SRR10918232.4472522/1‑118 (MQ=0)
TTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATGCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAgaggccggccctgctggccaatctccaccagacg < SRR10918232.4871144/151‑35 (MQ=26)
TTCACCGTTGCCGCCACTTCCGTCTGCGCGGGTAAAACCGCTCCAAGAAAGATTGGTGGTGGAAACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGT < SRR10918232.442129/94‑1 (MQ=0)
TCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGAT > SRR10918232.120754/1‑151 (MQ=59)
ACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACGTCGGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACAgccgcagggtggtggccatatcccggccgcttgcg > SRR10918232.2683584/1‑116 (MQ=36)
CCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATGCT > SRR10918232.3435432/1‑151 (MQ=58)
TGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAACCCCGCTCCTACACAGATTGGGGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAagggccggccctgctggccaatttccacccgccgttcac < SRR10918232.4766687/151‑40 (MQ=1)
CGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAgaggccggcccggctggccaatgtccaccgcccgctcac > SRR10918232.105431/1‑112 (MQ=4)
CGTTGCCGCCGCCACCGTATCCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAgaggccggccctgctggccaatctccaccagccgttcac < SRR10918232.1503658/151‑40 (MQ=1)
GTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTC < SRR10918232.1767969/151‑1 (MQ=60)
TGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGC < SRR10918232.1128941/151‑1 (MQ=60)
TGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAggaggccggccccgctggccaatctccaccagccgctcaccgt > SRR10918232.2255807/1‑108 (MQ=8)
CCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCA < SRR10918232.3414204/151‑1 (MQ=60)
CGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTTGCCACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaacgggccggcccggctcgccaatttccacccgccggtcaccgctcccgctgctaccgc > SRR10918232.4879150/1‑83 (MQ=19)
CCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCA < SRR10918232.640136/151‑1 (MQ=60)
CGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCAT > SRR10918232.2217308/1‑151 (MQ=60)
actACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaaagggccggccctgatggccaattttcacccgccgttcaccgtggccgctgctactgtattc > SRR10918232.3037032/4‑79 (MQ=6)
CACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACCGGCTTCTTCGCCAGCATGCC > SRR10918232.5771327/1‑151 (MQ=60)
ACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCC > SRR10918232.2354689/1‑151 (MQ=60)
CGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGC > SRR10918232.1076655/1‑151 (MQ=60)
TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCC > SRR10918232.6099432/1‑151 (MQ=60)
CGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAG < SRR10918232.492799/151‑1 (MQ=60)
TAAACCCGCGCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGT < SRR10918232.3645305/62‑1 (MQ=0)
AAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGCTTCTTCCCCCGCATGCCCTCTCCTACAGGGCCC > SRR10918232.603014/1‑151 (MQ=60)
AAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAGCGCCC > SRR10918232.306725/1‑151 (MQ=60)
AAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAGCGCCC > SRR10918232.1460788/1‑151 (MQ=60)
AAACCCGCTCCTACACCGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGT < SRR10918232.6070300/61‑1 (MQ=0)
AAGCCGCTCCTACGCAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAGCGCCCC < SRR10918232.313486/151‑1 (MQ=60)
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GCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGT > SRR10918232.5881950/1‑55 (MQ=0)
TCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGT > SRR10918232.4091932/1‑53 (MQ=4)
CCTACACAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGT > SRR10918232.946909/1‑52 (MQ=11)
CTACGCAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAGCGCCCCCGGCAATTT > SRR10918232.5074653/1‑151 (MQ=60)
TACGCAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAGCGCCCCCGGCAATTTC > SRR10918232.1537423/1‑151 (MQ=60)
TACACAGAGTGGTGGTAGACACACCTGGGGGGTGGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAA < SRR10918232.4010400/73‑1 (MQ=10)
GCAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAGCGCCCCCGGCAATTTCAAG > SRR10918232.469916/1‑151 (MQ=60)
ACAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGT > SRR10918232.546512/1‑47 (MQ=24)
|
GCTGTCGAGAACTACTGGTAAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAGCGCCCCCGGCAATTTCAAG > CP009974/3105259‑3105558
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
