Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F1 I1 R1
|
404 |
265.1 |
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96.8% |
10143224 |
150.7 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 398 total aligned reads displayed.
GGCTGTCGAGAACTACTGGTAAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAGCGCCCCCGGCAATTTCAAG > CP009974/3105258‑3105558
|
GGCTGTCGAGAACTACTGGTAAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG > SRR10918231.739976/1‑151 (MQ=60)
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GTCGAGAACTACTGGTAAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGA < SRR10918231.3708947/151‑1 (MQ=60)
gcgggggctgctggtagggCAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGAT < SRR10918231.1749709/132‑1 (MQ=60)
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CGAGAACTACTGGTAAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATT < SRR10918231.3036313/151‑1 (MQ=60)
AACTACTGGTAAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTG > SRR10918231.5152850/1‑151 (MQ=60)
AACTACTGGTAAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTAACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTG > SRR10918231.3563485/1‑151 (MQ=60)
gtggacacacatcggtggttggacacagcccaCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAGTTTCCACCCGCCATGCACTGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGT > SRR10918231.5034995/33‑151 (MQ=0)
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TACTGGTAAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCCCTCCTCCG‑CAGATTGGTGATG > SRR10918231.3111931/1‑151 (MQ=60)
cacccaccggaggttggacccaggccgtcgTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGA < SRR10918231.4043081/121‑1 (MQ=0)
CTGGTAAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGA > SRR10918231.1637537/1‑151 (MQ=60)
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TGGTAAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGAC < SRR10918231.2973100/151‑1 (MQ=60)
GGTAAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACA < SRR10918231.4261677/151‑1 (MQ=60)
acacatcggtggttggacacagcccaCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAGTTTCCACCCGCCATGCACTGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACAC < SRR10918231.276654/125‑1 (MQ=0)
TAAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACA > SRR10918231.2950236/1‑151 (MQ=60)
aagacaatttgagccgttgtccaCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGACCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACAC < SRR10918231.2242202/128‑1 (MQ=19)
AAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACAC < SRR10918231.2437598/151‑1 (MQ=60)
ccggaggttggacgcaggccgtcgTGTAGGTGCGGGTTCCCCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTAGCCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACC < SRR10918231.3810223/127‑1 (MQ=10)
atcggtggttggacacagcccaCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGGAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGGGGTGGACACACAT > SRR10918231.4939871/23‑151 (MQ=0)
tcggtggttggacacagcccaCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATC < SRR10918231.1653583/130‑1 (MQ=0)
ggaggttggacgcaggccgtcgTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACCTC < SRR10918231.947269/129‑1 (MQ=1)
AATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGG < SRR10918231.4701686/151‑1 (MQ=60)
ATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGT < SRR10918231.2797778/151‑1 (MQ=60)
tggttggacacagcccaCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTG > SRR10918231.4341696/18‑151 (MQ=8)
gtgggacgcaggccgtcgTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACCTCGGAG < SRR10918231.4783225/133‑1 (MQ=1)
ttggacgcaggccgtcgTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACCTCGGAGG < SRR10918231.5093548/134‑1 (MQ=1)
ggttggacacagcccaCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGG > SRR10918231.341889/17‑151 (MQ=10)
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ggacacagcccaCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGG > SRR10918231.1672451/13‑151 (MQ=16)
GCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGG < SRR10918231.2679442/151‑1 (MQ=60)
gcggtggttgaatacacgccgccgtttACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGG < SRR10918231.327118/124‑1 (MQ=0)
cggtggttggacacaggccgccgtttACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCCGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGG > SRR10918231.3143648/27‑151 (MQ=11)
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cagcccgtcGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACACA < SRR10918231.2137652/142‑1 (MQ=1)
cagcccatTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACA < SRR10918231.415389/143‑1 (MQ=45)
TGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACA < SRR10918231.5254764/151‑1 (MQ=51)
agcccaCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAG < SRR10918231.2168167/145‑1 (MQ=16)
cgtcgTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACCTCGGAGGTTGGACACAGCC > SRR10918231.1177897/6‑151 (MQ=0)
GGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGC > SRR10918231.680288/1‑151 (MQ=45)
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CGCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCC > SRR10918231.4554501/1‑151 (MQ=47)
caCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGccca < SRR10918231.1476828/149‑5 (MQ=45)
GTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACCTCGGAGGTTGGACACAGCCCGCC > SRR10918231.459021/1‑151 (MQ=0)
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cgcctgcctgtACCCGCGAAAAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTTTA < SRR10918231.4131810/140‑1 (MQ=0)
GGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCCTTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGcccactgtagg < SRR10918231.1048112/151‑12 (MQ=48)
gcctgcctgtACCCGCGAAAAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttac > SRR10918231.2477555/11‑147 (MQ=0)
GGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACACAGGCCGCCGTGTAGG < SRR10918231.1515182/151‑1 (MQ=46)
GCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGA < SRR10918231.3667051/151‑1 (MQ=46)
CGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCG < SRR10918231.4183404/151‑1 (MQ=42)
CGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAG < SRR10918231.1887412/151‑1 (MQ=44)
CGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAG < SRR10918231.553194/151‑1 (MQ=31)
CGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAG < SRR10918231.4717724/151‑1 (MQ=31)
gcctgtACCCGCGAAAAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgc < SRR10918231.2713833/145‑9 (MQ=7)
GGGTTCACCCGCGTAAGGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGC < SRR10918231.822674/151‑1 (MQ=32)
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GGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGCGC > SRR10918231.3640129/1‑151 (MQ=42)
GGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGC > SRR10918231.4078019/1‑151 (MQ=31)
GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CACATTGCTGGCGGCCACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCGC‑‑TGTAGGAGCGGG > SRR10918231.4721358/1‑151 (MQ=21)
GGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCG < SRR10918231.1565505/151‑1 (MQ=41)
GGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCG < SRR10918231.4102550/151‑1 (MQ=41)
tttcCCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTT < SRR10918231.4309779/147‑1 (MQ=46)
TCACCCGCGAAAGGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGT > SRR10918231.4636326/1‑151 (MQ=35)
TCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGT < SRR10918231.2060848/151‑1 (MQ=24)
TACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGcccactgtaagatcggaagag > SRR10918231.854482/1‑130 (MQ=54)
TACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGAGTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTA > SRR10918231.4477141/1‑151 (MQ=36)
TACCCGCGAAAAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaaag > SRR10918231.308699/1‑138 (MQ=18)
CCCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTT < SRR10918231.209653/151‑1 (MQ=0)
ACCCGCGAAAGGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTT < SRR10918231.4991352/151‑1 (MQ=31)
ACCCGCGAAAGGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTT < SRR10918231.1419302/151‑1 (MQ=31)
ACCCGCGAAAAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaaagg < SRR10918231.131943/151‑15 (MQ=22)
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CCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTA > SRR10918231.573047/1‑151 (MQ=20)
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gaagaGGCCGGCCCTGCTGGCTAATTTCCACCCGCTGTTCACCGTTGCCACCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACGCCTACT‑C‑‑‑‑TGGTGGTGGACACTCATCTGGGGTTGGACACAGGCCTCC‑‑GTAGGTGCGGGTTTACacgcgcagag > SRR10918231.3798628/6‑141 (MQ=0)
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AAAAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGTCACACATCGGTGGTTGGAGCCAGGCCGCCGTttacccgcggaagggccggcc > SRR10918231.943289/1‑130 (MQ=0)
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CCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCCTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAagggccggccc < SRR10918231.2546364/151‑12 (MQ=6)
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CTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACCCAGGCCGCCGTGGGGGAGCGGGCTTACCCGCGAAgcccccggcc > SRR10918231.4873720/1‑141 (MQ=6)
CTGCTGGCAAATTTCCACCCGCCCTTCACCGTTGCCGCCGCAACCGTAATCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTTATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAagggccggccct < SRR10918231.2838565/151‑13 (MQ=2)
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AATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaaagggccggccctgctggccaatttccacccc > SRR10918231.1044288/1‑109 (MQ=6)
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ATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaaagggccggccctgctggccaatttccacccgc < SRR10918231.3544158/151‑44 (MQ=32)
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CAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAagggccggccctgctggccagtttccaccc > SRR10918231.4446987/1‑121 (MQ=0)
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CTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACT‑CAGATTGGTGATGGACACACAGCGGTGGTTCGACACAGCCCAC‑‑TGCAGGAGCGGATTTACCCGCGAACggcccggccctgccggccaatttacaccagaaat > SRR10918231.3871771/1‑117 (MQ=9)
gtctccgtgGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAGCCCGCTCCTACA‑CCGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAgaggccggccctgctggccaatctccaccagccg < SRR10918231.5180235/142‑35 (MQ=6)
TTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGG > SRR10918231.4095083/1‑151 (MQ=55)
TCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGAT > SRR10918231.5042011/1‑151 (MQ=59)
TCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaaagggccggccctgctgaccaatttccacccgccgttcaccgttgccg < SRR10918231.198850/151‑59 (MQ=0)
CCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAGCCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAgaggccggccctgctggccaatctccaccagccgttcaccgttg < SRR10918231.4386606/151‑45 (MQ=27)
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CCACCGTAGTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGC < SRR10918231.1240207/151‑1 (MQ=60)
CCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACGTCGGTGGTTGGACACGGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCC < SRR10918231.227763/151‑1 (MQ=60)
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GTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCT > SRR10918231.2182232/1‑151 (MQ=60)
ATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCC < SRR10918231.4532017/151‑1 (MQ=60)
CGCGGGTAACCCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTAC < SRR10918231.3511495/151‑1 (MQ=60)
GGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCCGCATGCCCGCTCCTACAGC > SRR10918231.4624003/1‑151 (MQ=60)
GGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCCCCTACAGCG > SRR10918231.5021885/1‑151 (MQ=60)
AAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAGCGCCC > SRR10918231.2034466/1‑151 (MQ=60)
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CTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAGCGCCCCCGGCAA > SRR10918231.597460/1‑151 (MQ=60)
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CTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAGCGCCCCCGGCAATTT > SRR10918231.3059171/1‑151 (MQ=60)
TACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAGCGCCCCCGGCAATTTC > SRR10918231.3445961/1‑151 (MQ=60)
TACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAGCGCCCCCGGCAATTTC < SRR10918231.4147797/151‑1 (MQ=60)
TACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGT > SRR10918231.1964492/1‑50 (MQ=13)
ACA‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAA < SRR10918231.1067738/70‑1 (MQ=1)
AA‑CAGATTGGTGATGAACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAA < SRR10918231.4653720/69‑1 (MQ=1)
G‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAGCGCCCCCGGCAATTTCAAG < SRR10918231.4140634/151‑1 (MQ=60)
G‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAGCGCCCCCGGCAATTTCAAG > SRR10918231.3380760/1‑151 (MQ=60)
A‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGT > SRR10918231.2672897/1‑47 (MQ=24)
A‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAA > SRR10918231.3436360/1‑68 (MQ=0)
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GGCTGTCGAGAACTACTGGTAAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAGCGCCCCCGGCAATTTCAAG > CP009974/3105258‑3105558
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
