Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
343 |
268.7 |
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97.0% |
10547310 |
150.6 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 437 total aligned reads displayed.
ACTACTGGTAAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAGCGCCCCCGGCAATTTCAAGGCAAGCGATTC > CP009974/3105269‑3105569
|
ACTACTGGTAAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGA < SRR10918230.3369724/151‑1 (MQ=60)
ACTACTGGTAAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGA < SRR10918230.4467925/151‑1 (MQ=60)
gtggacacacatcggtggttggacacagcccaCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAGTTTCCACCCGCCATGCACTGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGGTTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAA > SRR10918230.3568547/33‑57 (MQ=0)
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ccacccaccggaggttggacgcaggccgtcgTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGG < SRR10918230.3819094/120‑1 (MQ=0)
TGGTAAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGAC > SRR10918230.2723384/1‑151 (MQ=60)
GGTAAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACA < SRR10918230.1076489/151‑1 (MQ=60)
ccaccggaggttggacgcaggccgtcgTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACAC < SRR10918230.3203437/124‑1 (MQ=0)
AAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACAC > SRR10918230.987288/1‑151 (MQ=60)
AAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACAC > SRR10918230.1927895/1‑151 (MQ=60)
AGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACA < SRR10918230.4751918/151‑1 (MQ=60)
AGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACA < SRR10918230.1571697/151‑1 (MQ=60)
GACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAACCCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGCTGGACCCACAT > SRR10918230.2998086/1‑151 (MQ=60)
tcggtggttggacacagcccaCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCCTCGTATTCGCGGGTCAACCCGCTCCTACA‑CATATTGATGGTGGACTCACATC > SRR10918230.767213/22‑151 (MQ=0)
ggaggttggacgcaggccgtcgTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACCTC > SRR10918230.4731186/23‑151 (MQ=1)
gccggttgcttgagttcagacgtgtgctcccccgatctCCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATTGGTGGTGGACCCACAT < SRR10918230.2517146/113‑1 (MQ=0)
ggttggacgcaggccgtcgTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACCTCGGA > SRR10918230.4536621/20‑151 (MQ=1)
ATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGG > SRR10918230.2368664/1‑151 (MQ=60)
aatccgcacacagcccaCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTG < SRR10918230.2828908/134‑1 (MQ=8)
GCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGT < SRR10918230.5073955/151‑1 (MQ=60)
ttggacacagcccaCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTT < SRR10918230.1038751/137‑1 (MQ=16)
CGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTT < SRR10918230.4386785/151‑1 (MQ=60)
acgcaggccgtcgTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACCTCGGAGGTTGG > SRR10918230.1021924/14‑151 (MQ=3)
CCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGA < SRR10918230.2002684/151‑1 (MQ=59)
CCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGA < SRR10918230.4698505/151‑1 (MQ=59)
cacagcccaCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACA > SRR10918230.353167/10‑151 (MQ=16)
GTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGCCA > SRR10918230.339448/1‑151 (MQ=54)
aggcggtcgTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACCTCGGAGGTTGGACAC < SRR10918230.4783289/142‑1 (MQ=0)
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ggccgtcgTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACCTCGGAGGTTGGACACA > SRR10918230.4987894/9‑151 (MQ=6)
ggccgtcgTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACCTCGGAGGTTGGACACA > SRR10918230.3200974/9‑151 (MQ=6)
cagcccgtcGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCTCCACACGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACACA < SRR10918230.163927/142‑1 (MQ=3)
agcccactgtaggagcgggtttacccgcgaaagggccggctctgcttgctaaagcccaagagccattccgtgttgctggccccagagtattctcgggtcatcccgtTCCTACA‑CCGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAG < SRR10918230.256593/45‑1 (MQ=30)
agcccaCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAG < SRR10918230.161713/145‑1 (MQ=16)
cccaCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCACCGCATCCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGCACACACATCGGCGGGTGGACACAccc > SRR10918230.5009932/5‑148 (MQ=0)
GGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGC > SRR10918230.304799/1‑151 (MQ=45)
GCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCG < SRR10918230.2308733/151‑1 (MQ=41)
gtcGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACACAGGCCGC < SRR10918230.3450093/148‑1 (MQ=15)
CGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACCTCGGAGGTTGGACACAGCCCGC > SRR10918230.495268/1‑151 (MQ=0)
tcGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACACAGGCCGCC < SRR10918230.2696510/149‑1 (MQ=19)
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GTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGT < SRR10918230.5301446/151‑1 (MQ=41)
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ctgtACCCGCGAAAAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcga < SRR10918230.1265545/147‑11 (MQ=11)
GTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGcccactgtaggagcgggc > SRR10918230.1136702/1‑133 (MQ=45)
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TTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCTGG > SRR10918230.3034135/1‑151 (MQ=26)
TTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGG > SRR10918230.3957716/1‑151 (MQ=27)
gtACCCGCGAAAAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaaa < SRR10918230.2924145/149‑13 (MQ=18)
TTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTT < SRR10918230.3075819/151‑1 (MQ=42)
TCACCCGCGAAAGGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACACAGGCCGCCGTGGAGGAGCGGGT > SRR10918230.1722982/1‑151 (MQ=34)
TCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGT > SRR10918230.3519141/1‑151 (MQ=24)
TACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTT < SRR10918230.2976963/151‑1 (MQ=24)
TACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTT < SRR10918230.4376059/151‑1 (MQ=24)
TACCCGCGAAAAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaaag > SRR10918230.5353354/1‑138 (MQ=18)
TACCCGCGAAAAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaaag < SRR10918230.4332592/151‑14 (MQ=20)
agccgggaagGGGCCGGCCGTGCTGGCCAATTTCCACGTGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTGGCGGGTAAACCCGCTCCTAGA‑TAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTAC < SRR10918230.4314565/141‑1 (MQ=16)
ACCCGCGAAAAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaaagg > SRR10918230.2697575/1‑137 (MQ=20)
ACCCGCGAAAAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaaagg < SRR10918230.2160228/151‑15 (MQ=22)
CCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTA < SRR10918230.5317643/151‑1 (MQ=20)
CCGCGAAAGGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTCGACACAGGCCGCCGTGTATGAGCGGGcgtac > SRR10918230.5222662/1‑146 (MQ=26)
CCGCGAAAAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGGTGGACACAGGCCGCCGctgaggcgcgaaagggc > SRR10918230.2526780/1‑134 (MQ=7)
CGCGAAAAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTtgacccgcgcaaaggcc > SRR10918230.3927382/1‑134 (MQ=20)
GCGAAATGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATGCACCGTTTCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGAGGTTGACACACATCGGTTGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGATCGGGTTTACCCGC > SRR10918230.5172692/1‑151 (MQ=20)
GCGAAAGGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCC < SRR10918230.91285/151‑1 (MQ=23)
CGAAAAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaaagggccgg < SRR10918230.2495095/151‑20 (MQ=20)
GAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGA > SRR10918230.3894089/1‑151 (MQ=29)
AAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAA > SRR10918230.1833144/1‑151 (MQ=7)
AAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAca > SRR10918230.557761/1‑149 (MQ=25)
AAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAA > SRR10918230.3835619/1‑151 (MQ=25)
gaGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCCTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAag > SRR10918230.652430/3‑149 (MQ=18)
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AGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGCTGCCGCCATCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAag > SRR10918230.4350499/1‑149 (MQ=24)
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CCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCA < SRR10918230.3713617/151‑1 (MQ=60)
CGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCAT < SRR10918230.761117/151‑1 (MQ=60)
CGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCAT > SRR10918230.3063508/1‑151 (MQ=60)
CGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCAT > SRR10918230.5098398/1‑151 (MQ=60)
CCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAG > SRR10918230.2551009/1‑70 (MQ=0)
CACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCC < SRR10918230.2475392/151‑1 (MQ=60)
ACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTttacccgcgaaagggccggccctgccggccaatttccacccgccgttccccgctgccgctgctaccctatgcgcg > SRR10918230.4210747/1‑76 (MQ=6)
CCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCG > SRR10918230.449179/1‑151 (MQ=60)
CGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGC > SRR10918230.606318/1‑151 (MQ=60)
TATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTC > SRR10918230.256939/1‑151 (MQ=60)
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GCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACA > SRR10918230.323078/1‑151 (MQ=60)
TAAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAGCGCC > SRR10918230.1279646/1‑151 (MQ=60)
AAACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAGCGCCC < SRR10918230.1669763/151‑1 (MQ=60)
AAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAagggccggcgctgctggccaatttgcagccgccgttgattgttgccgccgctaccgtatttgagggc > SRR10918230.1972945/1‑84 (MQ=7)
AAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAG > SRR10918230.1115515/1‑53 (MQ=0)
AACCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAGCGCCCC > SRR10918230.888963/1‑151 (MQ=60)
AACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACCTCGAGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACggccacccccgttgccaaaacccgccccctggcgacagctgccgccgcagccggattcacgcgta > SRR10918230.2741068/1‑86 (MQ=0)
CCCGCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAGCGCCCCCG > SRR10918230.520560/1‑151 (MQ=60)
CCGCTCCTACA‑CGGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAA < SRR10918230.3947628/78‑1 (MQ=0)
GCTCCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAGCGCCCCCGGCA > SRR10918230.3024246/1‑151 (MQ=60)
CCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCAgatcggaagagcacacgtctgaactccag > SRR10918230.5129068/1‑122 (MQ=60)
CCTACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAGCGCCCCCGGCAATT > SRR10918230.2268842/1‑151 (MQ=60)
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TACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAGCGCCCCCGGCAATTTC < SRR10918230.3253175/151‑1 (MQ=60)
TACA‑CATAGTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGT < SRR10918230.3098548/50‑1 (MQ=24)
TACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGT > SRR10918230.1940407/1‑50 (MQ=13)
TACA‑CAGATTGGTGGGGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGT < SRR10918230.108057/50‑1 (MQ=24)
ACG‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAGCGCCCCCGGCAATTTCA > SRR10918230.170038/1‑151 (MQ=60)
T‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGGGGCTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAA < SRR10918230.4060399/70‑1 (MQ=0)
G‑CAGATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAGCGCCCCCGGCAATTTCAAG > SRR10918230.1966163/1‑151 (MQ=60)
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ATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTTCTACAGCGCCCCCGGCACTTTCAAGGGAA > SRR10918230.1448624/1‑151 (MQ=60)
ATTGGTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAGCGCCCCCGGCAATTTCAAGGCAA > SRR10918230.4820377/1‑151 (MQ=60)
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GTGATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAGCGCCCCCGGCAATTTCAAGGCAAGCGA < SRR10918230.4452129/151‑1 (MQ=60)
GGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGT < SRR10918230.3774002/37‑1 (MQ=3)
GGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGT > SRR10918230.3417100/1‑37 (MQ=4)
GATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAGCGCCCCCGGCAATTTCAAGGCAAGCGATT < SRR10918230.4618267/151‑1 (MQ=60)
GATGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGCCCAC‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAA < SRR10918230.613138/58‑1 (MQ=4)
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ACTACTGGTAAGACAATTGCGGCCGTTGTGGGCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑CAGATTGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCACTGGATTCTTCGCCAGCATGCCCGCTCCTACAGCGCCCCCGGCAATTTCAAGGCAAGCGATTC > CP009974/3105269‑3105569
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
