Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
336 |
367.5 |
14491858 |
96.8% |
14028118 |
150.7 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 314 total aligned reads displayed.
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|
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GGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTG > SRR10918235.6455238/1‑151 (MQ=60)
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TGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACT < SRR10918235.5509005/151‑1 (MQ=60)
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TTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACA > SRR10918235.6334888/1‑151 (MQ=60)
CACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCCACATC > SRR10918235.6683711/1‑151 (MQ=60)
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CCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCG < SRR10918235.874975/151‑1 (MQ=60)
TCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCAC < SRR10918235.5115821/151‑1 (MQ=60)
CGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGACTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGACCTTGCCGCCATCCGCACC > SRR10918235.2510654/1‑151 (MQ=60)
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GTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTT < SRR10918235.6314791/151‑1 (MQ=60)
CAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCA > SRR10918235.3761776/1‑151 (MQ=60)
CAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCA > SRR10918235.6777458/1‑151 (MQ=60)
AGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAA < SRR10918235.6603039/151‑1 (MQ=60)
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CGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCG < SRR10918235.3925269/151‑1 (MQ=60)
GTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGA > SRR10918235.5303906/1‑151 (MQ=60)
GTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGA > SRR10918235.886040/1‑151 (MQ=60)
TGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGAT < SRR10918235.4344922/151‑1 (MQ=60)
GCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATC < SRR10918235.346974/151‑1 (MQ=60)
CCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCG < SRR10918235.6092890/151‑1 (MQ=60)
CCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCG > SRR10918235.2913385/1‑151 (MQ=60)
GGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑T > SRR10918235.4032623/1‑151 (MQ=60)
TAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAttt < SRR10918235.7033148/151‑4 (MQ=60)
AATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttg > SRR10918235.6182845/1‑147 (MQ=60)
TACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgat < SRR10918235.4674191/151‑7 (MQ=60)
TACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgat < SRR10918235.4678981/151‑7 (MQ=60)
ggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACC > SRR10918235.4010592/53‑151 (MQ=4)
ggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACC < SRR10918235.3929127/99‑1 (MQ=4)
gccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCG < SRR10918235.7263490/100‑1 (MQ=8)
gccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCG < SRR10918235.2066528/100‑1 (MQ=8)
gcgggatggtgaccttgaccggatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGG < SRR10918235.6964545/101‑1 (MQ=60)
ccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGG < SRR10918235.1112905/101‑1 (MQ=13)
ccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGG < SRR10918235.6313574/101‑1 (MQ=13)
ccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGG < SRR10918235.176536/101‑1 (MQ=13)
ccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGG < SRR10918235.3055263/101‑1 (MQ=13)
cgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGG > SRR10918235.6289718/50‑151 (MQ=20)
gtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGT < SRR10918235.5323445/103‑1 (MQ=25)
GTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagagt > SRR10918235.5612964/1‑137 (MQ=60)
tgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTC < SRR10918235.6408570/104‑1 (MQ=29)
TAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagagtc < SRR10918235.2668437/151‑16 (MQ=60)
AGTGACATAACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagagtcg < SRR10918235.1163880/151‑17 (MQ=60)
atggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGT < SRR10918235.3652926/106‑1 (MQ=60)
tggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcttGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTAAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCAGCTCGTT > SRR10918235.5455618/47‑151 (MQ=54)
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TGATATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagagtcgtt < SRR10918235.2408828/151‑19 (MQ=60)
TGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagagtcgtt < SRR10918235.1448655/151‑19 (MQ=60)
gtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGC < SRR10918235.607776/109‑1 (MQ=60)
ACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagagtcgttgg > SRR10918235.1716915/1‑131 (MQ=60)
ACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagagtcgttgg > SRR10918235.1717845/1‑131 (MQ=60)
tgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCT < SRR10918235.1742049/110‑1 (MQ=60)
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gaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTA > SRR10918235.6481955/41‑151 (MQ=60)
ccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACC < SRR10918235.2136940/113‑1 (MQ=60)
ccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACC < SRR10918235.3516272/113‑1 (MQ=60)
ccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACC < SRR10918235.6949939/113‑1 (MQ=60)
CACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagagtcgttggtacc > SRR10918235.4442170/1‑127 (MQ=57)
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ttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGC > SRR10918235.3543761/37‑151 (MQ=60)
ttgaccagatcgccgtcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTAGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGA < SRR10918235.4412282/115‑1 (MQ=60)
CCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagagtcgttggtaccga > SRR10918235.3302475/1‑125 (MQ=49)
CCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagagtcgttggtaccga > SRR10918235.4817119/1‑125 (MQ=49)
tgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCTGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGAC > SRR10918235.681339/36‑151 (MQ=60)
tgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGAC > SRR10918235.1210513/36‑151 (MQ=60)
CTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagagtcgttggtaccgacg > SRR10918235.3478470/1‑123 (MQ=42)
CTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagagtcgttggtaccgacg < SRR10918235.5898380/151‑29 (MQ=42)
accagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGT > SRR10918235.4796309/34‑151 (MQ=60)
TGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagagtcgttggtaccgacgt > SRR10918235.1434118/1‑122 (MQ=38)
TGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagagtcgttggtaccgacgt > SRR10918235.5713230/1‑122 (MQ=38)
ccagatcgccttcgtggcccggagtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACACCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTA < SRR10918235.1753863/119‑1 (MQ=60)
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agatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGA > SRR10918235.218820/31‑151 (MQ=60)
agatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGA > SRR10918235.3337378/31‑151 (MQ=60)
agatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGA > SRR10918235.584115/31‑151 (MQ=60)
agatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGA > SRR10918235.2390176/31‑151 (MQ=60)
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atcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACG > SRR10918235.2150468/29‑151 (MQ=60)
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GTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacag > SRR10918235.5829197/1‑145 (MQ=5)
TACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacagt > SRR10918235.4877787/1‑144 (MQ=48)
TACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacagg > SRR10918235.2364924/1‑144 (MQ=50)
TACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGT < SRR10918235.4987696/151‑1 (MQ=60)
TACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacagt > SRR10918235.4905080/1‑144 (MQ=5)
TACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacagt < SRR10918235.5291531/151‑8 (MQ=5)
ACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacagtg < SRR10918235.4526277/151‑9 (MQ=47)
ACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacagtg < SRR10918235.5795207/151‑9 (MQ=47)
CCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGG < SRR10918235.5947349/151‑1 (MQ=60)
CCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacagtgg > SRR10918235.1931830/1‑142 (MQ=5)
CCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacagtgg < SRR10918235.4709838/151‑10 (MQ=5)
ctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacagtggc < SRR10918235.7101040/146‑11 (MQ=45)
tggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCA < SRR10918235.5420085/147‑1 (MQ=60)
tggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCA > SRR10918235.1617381/5‑151 (MQ=60)
GGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAG < SRR10918235.7153161/151‑1 (MQ=5)
GGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAG < SRR10918235.6758597/151‑1 (MQ=5)
GGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAG < SRR10918235.5985038/151‑1 (MQ=37)
GGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAG < SRR10918235.6945532/151‑1 (MQ=60)
GGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAG > SRR10918235.5442700/1‑151 (MQ=60)
GCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGCTCGA‑‑‑CCTCACGCCAGGGACGTTGCTACCGCCGTAGACGTTGTCCCGGGCAGtgcccgtggcagt > SRR10918235.6411039/1‑138 (MQ=4)
GCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGT < SRR10918235.1309709/151‑1 (MQ=3)
GCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGT > SRR10918235.1090292/1‑151 (MQ=3)
GCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGT < SRR10918235.6498126/151‑1 (MQ=3)
GCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGT < SRR10918235.3982440/151‑1 (MQ=37)
CTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTG < SRR10918235.7032830/151‑1 (MQ=60)
TCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacagtggcagtac < SRR10918235.6827233/151‑16 (MQ=41)
CGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACC < SRR10918235.5741301/151‑1 (MQ=1)
CGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACC > SRR10918235.5629411/1‑151 (MQ=1)
CGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCC > SRR10918235.6529824/1‑151 (MQ=60)
CGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCC < SRR10918235.1557409/151‑1 (MQ=60)
CGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCC < SRR10918235.2860375/151‑1 (MQ=60)
GTCGGTTACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCC < SRR10918235.2868472/151‑1 (MQ=60)
GTCGGTGACCGACGTGCTGGCCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCC > SRR10918235.540192/1‑151 (MQ=0)
GTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCC > SRR10918235.6481030/1‑151 (MQ=0)
GTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCC < SRR10918235.6648284/151‑1 (MQ=0)
GTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCC < SRR10918235.5114411/151‑1 (MQ=0)
TCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCA < SRR10918235.4487989/151‑1 (MQ=0)
CGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCAC < SRR10918235.5707361/151‑1 (MQ=0)
CGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCAC > SRR10918235.7163627/1‑151 (MQ=0)
CGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCAC > SRR10918235.1358661/1‑151 (MQ=0)
CGGTCACCGACGTGCTGACCTGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAGCTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCAC < SRR10918235.1675855/151‑1 (MQ=17)
GGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACG < SRR10918235.7175464/151‑1 (MQ=18)
GGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACG < SRR10918235.6628564/151‑1 (MQ=60)
GTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACGG > SRR10918235.840831/1‑151 (MQ=18)
TCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGT > SRR10918235.5409460/1‑151 (MQ=60)
ACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGC > SRR10918235.3685365/1‑151 (MQ=60)
ACCGACGTGCTGACCGGCGTCTCGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGC < SRR10918235.330020/151‑1 (MQ=60)
|
AGTGACTTCGGACTTGGCCGCGTTGCTCAGCGTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACCGCGGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGC > CP009974/1895584‑1895882
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
