Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F1 I1 R1
|
368 |
332.2 |
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97.0% |
12699304 |
150.6 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 263 total aligned reads displayed.
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|
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GACTTCGGACTTGGCCGCGTTGCTCAGCGTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCG > SRR10918232.1990387/1‑151 (MQ=60)
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CGCGTTGCTCAGCGTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTC < SRR10918232.3899486/151‑1 (MQ=60)
GCGTTGCTCAGCGTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCT > SRR10918232.5444513/1‑151 (MQ=60)
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tttttcaagcagaagacggcatacgagatgacattccgtgactggagttcagacgtgtgctcttccgatctTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTG < SRR10918232.1121341/80‑1 (MQ=60)
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GTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCA > SRR10918232.4480662/1‑151 (MQ=60)
CAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGC < SRR10918232.5563101/151‑1 (MQ=60)
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GGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTACTACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTG > SRR10918232.3595686/1‑151 (MQ=60)
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TTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGCACTTGCCGAC > SRR10918232.6228185/1‑151 (MQ=60)
TTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACA > SRR10918232.6296739/1‑151 (MQ=60)
CCACCCTCGGTCAGCGAAGTCGTGCCGGTAATACCGCCGGTAGTGACATCTCCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACAT < SRR10918232.2495734/151‑1 (MQ=60)
agcagaagacggcatacgagatgacattccgtgactggagttcagacgtgtgctcttccgatcttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCC < SRR10918232.199143/66‑1 (MQ=38)
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GTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTT < SRR10918232.3790777/151‑1 (MQ=60)
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GAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAAC < SRR10918232.3845448/151‑1 (MQ=60)
GAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAAC < SRR10918232.5907393/151‑1 (MQ=60)
AGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACG > SRR10918232.2984925/1‑151 (MQ=60)
AAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGT > SRR10918232.5414149/1‑151 (MQ=60)
AGTCGTGCCCGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTT > SRR10918232.2256864/1‑151 (MQ=60)
GTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTG < SRR10918232.5083991/151‑1 (MQ=60)
TCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGC < SRR10918232.6442450/151‑1 (MQ=60)
NCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATC > SRR10918232.6279192/1‑151 (MQ=60)
GCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATC < SRR10918232.566526/151‑1 (MQ=60)
CGGTAATACCGACGGTAGTGACATCCCCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGA < SRR10918232.2572896/151‑1 (MQ=60)
CGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGA < SRR10918232.4980604/151‑1 (MQ=60)
GTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtt < SRR10918232.1443050/151‑3 (MQ=60)
AATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttg < SRR10918232.2089539/151‑5 (MQ=60)
TACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgat < SRR10918232.4523107/151‑7 (MQ=60)
cggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAAC > SRR10918232.2142131/54‑151 (MQ=0)
cggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAAC > SRR10918232.3821102/54‑151 (MQ=0)
ggccgtgatggtggccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACC < SRR10918232.3214575/99‑1 (MQ=60)
ggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACC > SRR10918232.3417625/53‑151 (MQ=4)
ggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACC < SRR10918232.1444948/99‑1 (MQ=4)
ggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACC > SRR10918232.4647625/53‑151 (MQ=4)
ggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACC < SRR10918232.3874008/99‑1 (MQ=4)
ggccgggatggtgaccgtgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACAGGCGTCTTGTCCAGCGGCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACC < SRR10918232.2578404/99‑1 (MQ=50)
GACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcaca > SRR10918232.1913292/1‑141 (MQ=60)
gccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCG > SRR10918232.4812143/52‑151 (MQ=8)
ccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGG < SRR10918232.5048830/101‑1 (MQ=13)
ccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGG < SRR10918232.2183162/101‑1 (MQ=13)
CGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacaga > SRR10918232.3357971/1‑139 (MQ=60)
cgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGG > SRR10918232.5764633/50‑151 (MQ=20)
cgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGG < SRR10918232.4314660/102‑1 (MQ=20)
cgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGG > SRR10918232.1079939/50‑151 (MQ=20)
cgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGGCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGG > SRR10918232.6249282/50‑151 (MQ=19)
GGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagag > SRR10918232.291016/1‑138 (MQ=60)
gtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGT < SRR10918232.6408178/103‑1 (MQ=25)
gtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGT > SRR10918232.2624603/49‑151 (MQ=25)
gtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGT > SRR10918232.4757071/49‑151 (MQ=25)
tgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTC < SRR10918232.5157006/104‑1 (MQ=29)
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atggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGT > SRR10918232.1335814/46‑151 (MQ=60)
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tggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTT < SRR10918232.293412/107‑1 (MQ=60)
tggtgaccttgaccagagcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTT < SRR10918232.2610765/107‑1 (MQ=60)
TGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagagtcgtt < SRR10918232.5070759/151‑19 (MQ=60)
GACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagagtcgttg < SRR10918232.3933197/151‑20 (MQ=60)
tgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCT > SRR10918232.1269651/42‑151 (MQ=60)
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CATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagagtcgttggt < SRR10918232.1824843/151‑22 (MQ=60)
accttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTAC < SRR10918232.6357425/112‑1 (MQ=60)
TCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagagtcgttggtac > SRR10918232.6483/1‑128 (MQ=60)
TCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagagtcgttggtac > SRR10918232.1904032/1‑128 (MQ=60)
ccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACC > SRR10918232.418441/39‑151 (MQ=60)
CACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagagtcgttggtacc < SRR10918232.970258/151‑25 (MQ=57)
ACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagagacgttggtaccg > SRR10918232.4280572/1‑126 (MQ=60)
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ttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGA < SRR10918232.908361/115‑1 (MQ=60)
CCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagagtcgttggtaccga < SRR10918232.3804894/151‑27 (MQ=49)
CCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagaggcgttggtaccga > SRR10918232.6434791/1‑125 (MQ=59)
tgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGAC < SRR10918232.3941191/116‑1 (MQ=60)
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tgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGAC < SRR10918232.4248109/116‑1 (MQ=60)
gaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACG < SRR10918232.1252240/117‑1 (MQ=60)
gaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACG > SRR10918232.1687449/35‑151 (MQ=60)
gaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACG > SRR10918232.3743636/35‑151 (MQ=60)
TGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagagtcgttggtaccgacgt > SRR10918232.4002062/1‑122 (MQ=38)
TGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagagtcgttggtaccgacgt > SRR10918232.727165/1‑122 (MQ=38)
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atcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACG > SRR10918232.3156663/29‑151 (MQ=60)
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GCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCAC < SRR10918232.4509657/151‑1 (MQ=60)
GCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCAC < SRR10918232.2659771/151‑1 (MQ=60)
CGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgaca > SRR10918232.1896845/1‑146 (MQ=51)
CGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgaca < SRR10918232.5745285/151‑6 (MQ=51)
CGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACG > SRR10918232.2436905/1‑151 (MQ=60)
gtccctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGG < SRR10918232.3710950/142‑1 (MQ=60)
TACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacagt < SRR10918232.973175/151‑8 (MQ=48)
TACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGT < SRR10918232.4374638/151‑1 (MQ=60)
TACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacagt < SRR10918232.229620/151‑8 (MQ=5)
TACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacagt > SRR10918232.2797387/1‑144 (MQ=5)
TACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacagt < SRR10918232.292187/151‑8 (MQ=5)
ACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacagtg < SRR10918232.1035772/151‑9 (MQ=47)
CCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGG < SRR10918232.371562/151‑1 (MQ=60)
CCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacagtgg < SRR10918232.4404715/151‑10 (MQ=5)
ctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacagtggc > SRR10918232.5925809/6‑141 (MQ=45)
ctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacagtggc > SRR10918232.5926097/6‑141 (MQ=45)
ctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGC < SRR10918232.3302864/146‑1 (MQ=60)
tggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCA > SRR10918232.3642782/5‑151 (MQ=60)
GGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAG < SRR10918232.5585377/151‑1 (MQ=5)
GGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAG < SRR10918232.4041331/151‑1 (MQ=5)
GGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAG < SRR10918232.1703465/151‑1 (MQ=37)
GGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAG > SRR10918232.3681002/1‑151 (MQ=60)
GGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAG > SRR10918232.3681024/1‑151 (MQ=60)
GCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGT > SRR10918232.4576051/1‑151 (MQ=3)
GCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGT > SRR10918232.4302334/1‑151 (MQ=60)
CTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacagtggcagta > SRR10918232.5405953/1‑137 (MQ=3)
CTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacagtggcagta > SRR10918232.3188345/1‑137 (MQ=3)
CTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacagtggcagta < SRR10918232.3422918/151‑15 (MQ=41)
TCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacagtggcagtac > SRR10918232.2431973/1‑136 (MQ=4)
TCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTAGTTGATACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacagtggaagtac > SRR10918232.794553/1‑136 (MQ=5)
CGTTGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCC > SRR10918232.1452749/1‑151 (MQ=60)
CGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACC < SRR10918232.3852289/151‑1 (MQ=33)
GTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCC > SRR10918232.3746279/1‑151 (MQ=0)
GTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCC < SRR10918232.2193627/151‑1 (MQ=0)
GTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCC > SRR10918232.2410369/1‑151 (MQ=0)
GTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCC > SRR10918232.1362236/1‑151 (MQ=29)
TCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCA < SRR10918232.794555/151‑1 (MQ=0)
TCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCA < SRR10918232.4575258/151‑1 (MQ=0)
TCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCA < SRR10918232.4329167/151‑1 (MQ=25)
TCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCA > SRR10918232.6355285/1‑151 (MQ=60)
CGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCAC < SRR10918232.3847635/151‑1 (MQ=0)
CGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCAC < SRR10918232.5872366/151‑1 (MQ=0)
CGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCAC < SRR10918232.4298957/151‑1 (MQ=0)
GGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACG > SRR10918232.1808942/1‑151 (MQ=60)
GGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACG > SRR10918232.5686014/1‑151 (MQ=60)
GTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGG > SRR10918232.1083492/1‑151 (MQ=60)
ACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACGGTGC > SRR10918232.2898839/1‑151 (MQ=18)
|
AGTGACTTCGGACTTGGCCGCGTTGCTCAGCGTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACCGCGGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGC > CP009974/1895584‑1895882
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
