Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F1 I1 R1
|
404 |
265.1 |
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96.8% |
10143224 |
150.7 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 220 total aligned reads displayed.
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|
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taTCAGCGTCAGGGTATACAGGCCGGTTTCGCCCTCGTTCAATGTAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCC < SRR10918231.2311040/149‑1 (MQ=60)
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GTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtt < SRR10918231.1372159/151‑3 (MQ=60)
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GTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtt > SRR10918231.1303226/1‑149 (MQ=60)
TAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAttt < SRR10918231.1867555/151‑4 (MQ=60)
AATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttg < SRR10918231.1648879/151‑5 (MQ=60)
ACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatc > SRR10918231.3743574/1‑144 (MQ=60)
CCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatca > SRR10918231.4701643/1‑143 (MQ=60)
cggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAAC > SRR10918231.4960629/54‑151 (MQ=0)
CGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcac < SRR10918231.2733379/151‑10 (MQ=60)
CGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcac < SRR10918231.2316803/151‑10 (MQ=60)
ggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACC > SRR10918231.3642136/53‑151 (MQ=4)
ggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACC > SRR10918231.3901512/53‑151 (MQ=4)
GACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcaca < SRR10918231.809155/151‑11 (MQ=60)
GACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcaca > SRR10918231.830293/1‑141 (MQ=60)
GACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGCGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcaca > SRR10918231.3461440/1‑141 (MQ=60)
gccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCG > SRR10918231.4842730/52‑151 (MQ=8)
CGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacaga < SRR10918231.1590690/151‑13 (MQ=60)
gtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGT > SRR10918231.2725213/49‑151 (MQ=25)
gtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGT > SRR10918231.2674727/49‑151 (MQ=25)
gtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGT > SRR10918231.4616940/49‑151 (MQ=25)
GTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagagt < SRR10918231.3575556/151‑15 (MQ=60)
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cggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCC < SRR10918231.3765869/138‑1 (MQ=60)
cggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCC < SRR10918231.3117302/138‑1 (MQ=60)
ggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtga > SRR10918231.1067701/13‑148 (MQ=60)
ggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGAGCGC‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCAACCGAGGTATACGTTGTCCGGGGgagtgg > SRR10918231.4955132/13‑145 (MQ=57)
GCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgac < SRR10918231.2371650/151‑5 (MQ=53)
GCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgac < SRR10918231.5091866/151‑5 (MQ=53)
GCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCAC > SRR10918231.2617502/1‑151 (MQ=60)
GCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCAC < SRR10918231.2272643/151‑1 (MQ=60)
GCGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCAC < SRR10918231.4928453/151‑1 (MQ=60)
CGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACG > SRR10918231.3719892/1‑151 (MQ=60)
GTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacag > SRR10918231.5083959/1‑145 (MQ=50)
GTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGG > SRR10918231.2992385/1‑151 (MQ=60)
GTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacag < SRR10918231.2055592/151‑7 (MQ=5)
TACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGggacagt > SRR10918231.4701897/1‑144 (MQ=58)
TACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGT > SRR10918231.4347444/1‑151 (MQ=60)
TACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacagt < SRR10918231.4629432/151‑8 (MQ=5)
ACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacagtg > SRR10918231.1562954/1‑143 (MQ=47)
ACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacagtg < SRR10918231.3838207/151‑9 (MQ=5)
ACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacagtg < SRR10918231.1432283/151‑9 (MQ=5)
CCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacagtgg < SRR10918231.3924669/151‑10 (MQ=45)
CCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacagtgg < SRR10918231.4984238/151‑10 (MQ=45)
ctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGC < SRR10918231.2879099/146‑1 (MQ=60)
tggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCA < SRR10918231.1115383/147‑1 (MQ=60)
GGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAG > SRR10918231.4226907/1‑151 (MQ=37)
GCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGT < SRR10918231.2724774/151‑1 (MQ=3)
CTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacagtggcagta > SRR10918231.3479228/1‑137 (MQ=3)
CTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacagtggcagta > SRR10918231.3989927/1‑137 (MQ=41)
CTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTG < SRR10918231.4636114/151‑1 (MQ=60)
TCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacagtggcagtac > SRR10918231.4229121/1‑136 (MQ=4)
CGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCCATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACC < SRR10918231.2234494/151‑1 (MQ=1)
CGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACC > SRR10918231.485052/1‑151 (MQ=33)
CGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACC < SRR10918231.1367552/151‑1 (MQ=33)
GTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCC > SRR10918231.832746/1‑151 (MQ=0)
GTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCC > SRR10918231.832851/1‑151 (MQ=0)
GTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCC < SRR10918231.1171709/151‑1 (MQ=0)
GTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCC < SRR10918231.550721/151‑1 (MQ=60)
TCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGAgatcggaagagcacacgtctgaactccagtcactggtgaagatctcgtatgccgtcttctgcttg > SRR10918231.1195611/1‑86 (MQ=60)
CGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCAC > SRR10918231.2069432/1‑151 (MQ=0)
CGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCAC > SRR10918231.3469829/1‑151 (MQ=0)
CGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCAC < SRR10918231.5171035/151‑1 (MQ=21)
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GTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGG > SRR10918231.4159203/1‑151 (MQ=60)
TCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACGGT < SRR10918231.3820247/151‑1 (MQ=18)
TCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACGGT > SRR10918231.779600/1‑151 (MQ=18)
CACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTG < SRR10918231.2488268/151‑1 (MQ=60)
ACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGC < SRR10918231.3503210/151‑1 (MQ=60)
|
AGTGACTTCGGACTTGGCCGCGTTGCTCAGCGTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACCGCGGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGC > CP009974/1895584‑1895882
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
