Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
336 |
367.5 |
14491858 |
96.8% |
14028118 |
150.7 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 377 total aligned reads displayed.
GGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGT > CP009974/1896373‑1896669
|
cgtaccgggttcgtcggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACG < SRR10918235.3164896/126‑1 (MQ=22)
gtaccgggttcgtcggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGG > SRR10918235.6685867/25‑151 (MQ=24)
atgCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAG > SRR10918235.5043650/4‑151 (MQ=60)
TGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGT < SRR10918235.2118595/151‑1 (MQ=60)
TGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGT < SRR10918235.1383754/151‑1 (MQ=60)
TGCCCGGCTCGGCGGTAACCGCCGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTTACATTTGCGCAAACGTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGT < SRR10918235.4815292/151‑1 (MQ=60)
accgggttcgtcggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTG > SRR10918235.2615443/23‑151 (MQ=27)
accgggttcgtcggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTG > SRR10918235.2040527/23‑151 (MQ=27)
accgggttcgtcggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTG < SRR10918235.1364007/129‑1 (MQ=27)
ccgggttcgtcggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGG < SRR10918235.1001304/130‑1 (MQ=29)
cgggttcgtcggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGC < SRR10918235.3315629/131‑1 (MQ=31)
CCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGC < SRR10918235.4049779/151‑1 (MQ=60)
gttcgtcggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGT < SRR10918235.5628304/134‑1 (MQ=37)
GCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGT > SRR10918235.2076291/1‑151 (MQ=60)
GCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGT < SRR10918235.1801898/151‑1 (MQ=60)
GCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGT < SRR10918235.6707569/151‑1 (MQ=60)
GCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGT < SRR10918235.3268437/151‑1 (MQ=60)
CTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTG > SRR10918235.2008525/1‑151 (MQ=60)
TCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGC > SRR10918235.1657949/1‑151 (MQ=60)
CGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCC < SRR10918235.5272873/151‑1 (MQ=60)
CGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCC > SRR10918235.3517058/1‑151 (MQ=60)
tcggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCA < SRR10918235.582742/139‑1 (MQ=46)
ggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACG < SRR10918235.130895/141‑1 (MQ=50)
GGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggtt > SRR10918235.6154239/1‑147 (MQ=60)
tcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGT > SRR10918235.5051677/9‑151 (MQ=53)
acggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGC > SRR10918235.1749806/7‑151 (MQ=53)
cggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCC > SRR10918235.7115452/6‑151 (MQ=53)
CCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtacc > SRR10918235.2933519/1‑142 (MQ=60)
CGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccg > SRR10918235.6266760/1‑141 (MQ=60)
gcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCAT > SRR10918235.4699218/4‑151 (MQ=53)
cgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATT < SRR10918235.2077993/149‑1 (MQ=55)
ACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgtt < SRR10918235.4449988/151‑13 (MQ=60)
ACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggctgtaccgtt < SRR10918235.4356175/151‑13 (MQ=60)
GGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTG < SRR10918235.2070217/151‑1 (MQ=56)
CGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgtta < SRR10918235.6830379/151‑14 (MQ=60)
GTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACATTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTTGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGG < SRR10918235.214231/151‑1 (MQ=55)
GTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttag < SRR10918235.5390490/151‑15 (MQ=60)
GTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttag > SRR10918235.1822725/1‑137 (MQ=60)
TGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGC > SRR10918235.125765/1‑151 (MQ=58)
TGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagc > SRR10918235.4307262/1‑136 (MQ=60)
CTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccg < SRR10918235.3296693/151‑18 (MQ=60)
TACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGC > SRR10918235.5948975/1‑151 (MQ=60)
CCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCAC < SRR10918235.2161168/151‑1 (MQ=60)
CGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccgggatg < SRR10918235.1070861/151‑23 (MQ=60)
CGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACG > SRR10918235.4462311/1‑151 (MQ=60)
CGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACG < SRR10918235.4414155/151‑1 (MQ=60)
GGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGG > SRR10918235.5503383/1‑151 (MQ=60)
GGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCCCGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGT > SRR10918235.3362346/1‑151 (MQ=58)
GGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccgggatggtg > SRR10918235.689147/1‑126 (MQ=60)
GTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccgggatggtga < SRR10918235.5684160/151‑27 (MQ=60)
TTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccgggatggtgatg > SRR10918235.2814817/1‑123 (MQ=60)
TTGTCGAGTGTCAGTTGCTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTAGCGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACAGTGATGA > SRR10918235.1008834/1‑151 (MQ=0)
TTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccgggatggtgatgg > SRR10918235.3200280/1‑122 (MQ=60)
TGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGAC > SRR10918235.7186809/1‑151 (MQ=60)
GTCGAGTGTCAGTTGCTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCTACATCACGACAGGGTCGTTAGCGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACAGTGATGACG < SRR10918235.4292014/151‑1 (MQ=0)
GTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccgggatggtgatggtg < SRR10918235.447545/151‑32 (MQ=60)
TCGGGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGTCGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccgggatggtgatggtgg < SRR10918235.2542511/151‑33 (MQ=60)
TCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGG > SRR10918235.454424/1‑151 (MQ=60)
CCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGT > SRR10918235.3588165/1‑151 (MQ=60)
AGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccgggatggtgatggtggttt > SRR10918235.6861068/1‑116 (MQ=60)
AGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACAGCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGAGGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccgggatggtgatggtggttt < SRR10918235.1300207/151‑36 (MQ=60)
GTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTT > SRR10918235.3806718/1‑151 (MQ=60)
GTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTT > SRR10918235.226661/1‑151 (MQ=60)
TGTCATCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACCGAGTCGCTGGTACCGACGTAGACGCTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGCCGCCCTTTGCCGGCACTGTGATGACGGTTTTG > SRR10918235.2319897/1‑151 (MQ=44)
GTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccgggatggtgatggtggttttgc > SRR10918235.4155121/1‑113 (MQ=60)
TCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccgggatggtgatggtggttttgcc < SRR10918235.2855622/151‑40 (MQ=60)
TCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCC > SRR10918235.1889103/1‑151 (MQ=60)
CAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccgggatggtgatggtggttttgcca < SRR10918235.3247109/151‑41 (MQ=60)
AGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccgggatggtgatggtggttttgccat > SRR10918235.234917/1‑110 (MQ=60)
AGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGT > SRR10918235.358674/1‑151 (MQ=60)
GCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTC < SRR10918235.3341959/151‑1 (MQ=60)
CTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccgggatggtgatggagatcggaagagca > SRR10918235.95673/1‑108 (MQ=59)
CTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCG < SRR10918235.3472335/151‑1 (MQ=60)
TGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccgggatggtgatgttggttttgccatcgt > SRR10918235.2346239/1‑107 (MQ=60)
GCTCAACCGTGCCGACATGCGCTCGTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGCTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccgggatggtgatggtggttttgccatcgtc < SRR10918235.6106401/151‑46 (MQ=49)
TCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCA < SRR10918235.483314/151‑1 (MQ=60)
CAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccgggatggtgatggtggttttgccatcgtccag > SRR10918235.597737/1‑103 (MQ=60)
GAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGC < SRR10918235.231611/151‑1 (MQ=60)
GAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGC > SRR10918235.4609267/1‑151 (MQ=60)
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AACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccgggatggtgatggtggttttgccatcgtccaggg > SRR10918235.162276/1‑101 (MQ=60)
AACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCG > SRR10918235.2567114/1‑151 (MQ=60)
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cgacagggtcgttagcgCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCGACGGTGCCGTTGGCCGGCACAGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGGGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTT < SRR10918235.2596514/134‑1 (MQ=0)
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GGGTCGTTAGCGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACAGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGGGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGG < SRR10918235.2225800/151‑1 (MQ=0)
GAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGG > SRR10918235.1344260/1‑151 (MQ=8)
GGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGT < SRR10918235.128257/151‑1 (MQ=8)
AGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGT > SRR10918235.6012908/1‑151 (MQ=8)
GTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccgggatggtgatggtggttttgccatcgtccagggtaaaggtcagcgccgcatgcttgtcgatcggcaggccgtctttgttggtc < SRR10918235.3643496/151‑101 (MQ=3)
GTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTC < SRR10918235.5354830/151‑1 (MQ=8)
cgttagcgCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACAGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGGGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAG < SRR10918235.806129/143‑1 (MQ=0)
CGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGagatcggaagagcacacgtctgaactcca > SRR10918235.1859870/1‑122 (MQ=9)
TTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCG < SRR10918235.2962682/151‑1 (MQ=6)
GGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGGCAGCGTG > SRR10918235.5408024/1‑151 (MQ=1)
GTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGA > SRR10918235.6280428/1‑151 (MQ=0)
ACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATG < SRR10918235.3105216/151‑1 (MQ=0)
CGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGT > SRR10918235.5297621/1‑151 (MQ=0)
CGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGACGGT > SRR10918235.847034/1‑151 (MQ=0)
GACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACAGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGGGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGATGGTG < SRR10918235.74529/151‑1 (MQ=0)
GACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGACGGTG > SRR10918235.4186815/1‑151 (MQ=0)
GTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACAGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGGGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGATGGTGTAG < SRR10918235.1543917/151‑1 (MQ=0)
GTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACAGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGGGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGGGGGATGGTGTAG > SRR10918235.7131677/1‑151 (MQ=0)
TAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACAGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGGGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGATGGTGTAGG < SRR10918235.4868485/151‑1 (MQ=1)
TAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGACGGTGTAGG > SRR10918235.3755090/1‑151 (MQ=1)
AGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACAGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGGGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGATGGTGTAGGT > SRR10918235.665829/1‑151 (MQ=3)
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GACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGACGGTGTAGGTG > SRR10918235.3655655/1‑151 (MQ=5)
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GTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACAGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGGGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGATGGTGTAGGTGATCTCG < SRR10918235.5374908/151‑1 (MQ=6)
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TCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGACGGTGTAGGTGATCTCGC > SRR10918235.5400628/1‑151 (MQ=6)
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CGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGACGGTGTAGGTGATCTCGCCG > SRR10918235.146748/1‑151 (MQ=6)
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GGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGACGGTGTAGGTGATCTCGCCGC > SRR10918235.46019/1‑151 (MQ=4)
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GGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACAGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGGGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGACGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCT > SRR10918235.4898107/1‑151 (MQ=4)
AGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACAGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGGGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCG < SRR10918235.4426488/151‑1 (MQ=0)
AGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGACGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCG > SRR10918235.4360933/1‑151 (MQ=0)
AGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGACGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCG > SRR10918235.1929100/1‑151 (MQ=0)
GCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGACGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGG < SRR10918235.6182101/151‑1 (MQ=0)
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GGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGT > CP009974/1896373‑1896669
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
