Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F1 I1 R1
|
368 |
332.2 |
13092066 |
97.0% |
12699304 |
150.6 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 339 total aligned reads displayed.
GGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTC > CP009974/1896373‑1896666
|
cgtaccgggttcgtcggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACG < SRR10918232.5259428/126‑1 (MQ=22)
taccgggttcgtcggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGT < SRR10918232.2335361/128‑1 (MQ=26)
accgggttcgtcggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTG < SRR10918232.3379969/129‑1 (MQ=27)
GCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTG < SRR10918232.3639422/151‑1 (MQ=60)
CCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGG > SRR10918232.5722527/1‑151 (MQ=60)
cgggttcgtcggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGC > SRR10918232.6209126/21‑151 (MQ=31)
CCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGC < SRR10918232.5888127/151‑1 (MQ=60)
CCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGC < SRR10918232.2024646/151‑1 (MQ=60)
CGGCTCGTCGGTACCCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCA < SRR10918232.2397257/151‑1 (MQ=60)
ggttcgtcggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAG > SRR10918232.4888706/19‑151 (MQ=35)
ggttcgtcggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAG < SRR10918232.687785/133‑1 (MQ=35)
gttcgtcggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGT > SRR10918232.3989518/18‑151 (MQ=37)
gttcgtcggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGT < SRR10918232.3112083/134‑1 (MQ=37)
ttcgtcggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTG < SRR10918232.490000/135‑1 (MQ=39)
CTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTG > SRR10918232.980550/1‑151 (MQ=60)
tcgtcggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGC > SRR10918232.353847/16‑151 (MQ=41)
CGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCC > SRR10918232.5645378/1‑151 (MQ=60)
tcggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCA < SRR10918232.1707548/139‑1 (MQ=46)
tcggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCA < SRR10918232.1598457/139‑1 (MQ=46)
tcggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCA < SRR10918232.2670518/139‑1 (MQ=46)
TCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGagatcg > SRR10918232.4127271/1‑145 (MQ=60)
TCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCgg > SRR10918232.2640587/1‑149 (MQ=60)
CGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggt > SRR10918232.6451832/1‑148 (MQ=60)
ggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACG > SRR10918232.1728066/11‑151 (MQ=50)
GGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGCGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTACACGTTGTCCGGCGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggtg > SRR10918232.756742/1‑147 (MQ=60)
GGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggtt > SRR10918232.2503151/1‑147 (MQ=60)
GGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggtt < SRR10918232.5441921/151‑5 (MQ=60)
ctggagttcagacgtgtgctcttccgatctTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTG < SRR10918232.3489198/121‑1 (MQ=60)
acggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGC < SRR10918232.3197063/145‑1 (MQ=53)
cggcggtgcttcCCGGGGTGTTGTCCAGTGTCAGCTCCTCGAACTTGCCGACAGCCGTGCCTGCAACGGTTGCGATCGATTTGCGCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGGCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCC < SRR10918232.5207906/139‑1 (MQ=24)
CCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAACCTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtacc < SRR10918232.3373098/151‑10 (MQ=60)
ggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCCGTGCCCACGGTGCCA > SRR10918232.1349091/5‑151 (MQ=52)
ggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCCCGGTGCCA > SRR10918232.5783579/5‑151 (MQ=52)
ggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCA < SRR10918232.52443/147‑1 (MQ=53)
ggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCA < SRR10918232.97851/147‑1 (MQ=53)
ggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCA > SRR10918232.5759135/5‑151 (MQ=53)
CGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccg < SRR10918232.651079/151‑11 (MQ=60)
gcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTTCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCAT > SRR10918232.3179271/4‑151 (MQ=51)
GACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgt < SRR10918232.1708199/151‑12 (MQ=60)
ACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgtt > SRR10918232.5861657/1‑139 (MQ=60)
CGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgtta < SRR10918232.3949812/151‑14 (MQ=60)
GTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCCGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGG > SRR10918232.4136562/1‑151 (MQ=57)
GTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttag < SRR10918232.2483779/151‑15 (MQ=60)
GTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttag > SRR10918232.6132850/1‑137 (MQ=60)
TGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagc < SRR10918232.2014160/151‑16 (MQ=60)
GCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGGGCCATTGGCC > SRR10918232.316553/1‑151 (MQ=57)
CTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccg < SRR10918232.6368650/151‑18 (MQ=60)
TTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGG > SRR10918232.5102661/1‑151 (MQ=59)
TTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGG < SRR10918232.4708813/151‑1 (MQ=59)
ACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccggga > SRR10918232.2646009/1‑131 (MQ=60)
CCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCAC > SRR10918232.3087414/1‑151 (MQ=60)
CGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTagatcggaagagcacacgtctgaac > SRR10918232.6081163/1‑126 (MQ=60)
CGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACG > SRR10918232.5862062/1‑151 (MQ=60)
CGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACG < SRR10918232.6313003/151‑1 (MQ=60)
CGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACG < SRR10918232.539923/151‑1 (MQ=60)
GGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGG > SRR10918232.4694616/1‑151 (MQ=60)
GGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGG < SRR10918232.5274726/151‑1 (MQ=60)
GGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccgggatggg > SRR10918232.4468765/1‑127 (MQ=60)
GGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccgggatggtg > SRR10918232.6418726/1‑126 (MQ=60)
GGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccgggatggtg > SRR10918232.5605018/1‑126 (MQ=60)
GGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTG < SRR10918232.897941/151‑1 (MQ=60)
GTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGA > SRR10918232.1151667/1‑151 (MQ=60)
GTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGA > SRR10918232.795984/1‑151 (MQ=60)
TTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccgggatggtgat < SRR10918232.4563616/151‑28 (MQ=60)
TCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGAT > SRR10918232.6439524/1‑151 (MQ=60)
TTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccgggatggtgatg > SRR10918232.2370864/1‑123 (MQ=60)
CTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATG > SRR10918232.101711/1‑151 (MQ=60)
CTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATG > SRR10918232.86714/1‑151 (MQ=60)
TTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccgggatggtgatgg < SRR10918232.1459400/151‑30 (MQ=60)
TGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccgggatggtgatggt < SRR10918232.4953830/151‑31 (MQ=60)
GTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccgggatggtgatggtg < SRR10918232.1829091/151‑32 (MQ=60)
GTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccgggatggtgatggtg > SRR10918232.357193/1‑120 (MQ=60)
GTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACG > SRR10918232.333015/1‑151 (MQ=60)
GTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGACCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGGGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACG > SRR10918232.2029595/1‑151 (MQ=48)
GAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccgggatggtgatggtggtt < SRR10918232.2613474/151‑35 (MQ=60)
CAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTT < SRR10918232.442921/151‑1 (MQ=60)
GTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTT > SRR10918232.370788/1‑151 (MQ=60)
GTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTT < SRR10918232.4531607/151‑1 (MQ=60)
TGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccgggatggtgatggtggttttg > SRR10918232.5831444/1‑114 (MQ=60)
GTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccgggatggtgatggtggttttgc > SRR10918232.5063780/1‑113 (MQ=60)
GTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccgggatggtgatggtggttttgc > SRR10918232.3084660/1‑113 (MQ=60)
TCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCC < SRR10918232.4439951/151‑1 (MQ=60)
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ATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccgggatggtgatggtggttttgccatcgtccagggtaaaggtcagc < SRR10918232.122766/151‑62 (MQ=60)
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GAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGG > SRR10918232.2949383/1‑151 (MQ=8)
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GTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccgggatggtgatggtggttttgccatcgtccagggtaaaggtcagcgccgcatgcttgtcgatcggcaggccgtctttgttggtc < SRR10918232.189662/151‑101 (MQ=3)
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GTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGC < SRR10918232.1570718/151‑1 (MQ=8)
GTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGC > SRR10918232.107734/1‑151 (MQ=8)
TTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCG < SRR10918232.1569295/151‑1 (MQ=6)
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GGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTC > CP009974/1896373‑1896666
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |