Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
336 |
367.5 |
14491858 |
96.8% |
14028118 |
150.7 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 1346 total aligned reads displayed.
AGGGTTACGGTCAACGGACGGTCCAGCGCCTGGCTCACTTTCACAGTAAAGGAAGGTTGCTGGTCTTCGGTCACATTGCCATTGCTGACAATGCTTACGGTGACGGCATCGATGCTGTCATTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTGGGTTTTACCCGCTTCAACGGTGATGG > CP009974/1898864‑1899149
|
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gggtgacggttaccggcgtctgagcaggtgtgctcagggtcgcggtgtgggtgttcgcgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGG < SRR10918235.6753856/32‑1 (MQ=0)
gtgacggcagttagacgtggtcgcttacgatctcggtgtaagtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTG < SRR10918235.5051175/41‑1 (MQ=0)
gcggcagacgagatgtgcgaaggtgcctggtgtaaagacgtgtgctcttcccgtctacggtcgggcgggccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAA < SRR10918235.1522965/47‑1 (MQ=0)
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cgtctgagcagggttgcttagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAA < SRR10918235.1234024/48‑1 (MQ=3)
gtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAAT > SRR10918235.2133378/103‑151 (MQ=9)
CGGTCCAGCGCCTGGCTCACTTTCACAGTAAAGGAAGGTTGCTGGTCTTCGGTCACATTGCCATTGCTGACAATGCTTACGGTGACGGCATCGATGCTGTCATTGAT‑‑‑GACCGTCGAGG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAGT < SRR10918235.3886498/151‑1 (MQ=0)
tcttagtcaagcagcagacggtatacgtgttagccgaaggtgactggagttcggacgtgggctctgccgttcgggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATT < SRR10918235.1040889/50‑1 (MQ=8)
tgagcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTAC > SRR10918235.5218296/100‑151 (MQ=14)
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gagcagggttgcttagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACC > SRR10918235.448694/99‑151 (MQ=18)
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agcagggttgcttagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCG < SRR10918235.2487403/54‑1 (MQ=21)
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cagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCC > SRR10918235.3000819/96‑151 (MQ=30)
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gggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagacgttgcT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑GCGGCGTCGGGTTCGGGGGCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAG > SRR10918235.2816471/98‑151 (MQ=60)
ctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGT < SRR10918235.2417016/64‑1 (MQ=53)
ctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggacgcggtggtggcggcgaccgaggcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGCCGGGGTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGT > SRR10918235.5565094/88‑151 (MQ=47)
ctcagggtcacagtgtaagtgatcacgccgccgtcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtatcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGT < SRR10918235.6101065/64‑1 (MQ=53)
ccgaaggtgactggagttcagacgtgtgctcttccgatctcgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTT < SRR10918235.2003992/65‑1 (MQ=56)
cagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTC < SRR10918235.3920841/66‑1 (MQ=41)
atagccgaaggtgactggagttcagacgtgtgctcttccgatctcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCT < SRR10918235.4355390/67‑1 (MQ=43)
gtgctcttccgatcttgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTC < SRR10918235.2843721/68‑1 (MQ=60)
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gtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGA < SRR10918235.1701397/70‑1 (MQ=51)
cacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAT‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGTTCGAAATTAGCGCCAGTGGCGTTCTCaata > SRR10918235.1322465/80‑147 (MQ=41)
cacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATG > SRR10918235.6837412/80‑151 (MQ=60)
ggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGAG > SRR10918235.916460/77‑151 (MQ=57)
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gtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACG < SRR10918235.5813529/78‑1 (MQ=60)
ttcaagcagaagacggcataagatataaccgaaggtgactggagttcagacgtgtgctcttcggatCTGTCGTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGC < SRR10918235.228130/85‑1 (MQ=60)
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tgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGAC > SRR10918235.6440677/69‑151 (MQ=60)
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tgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTTCCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGAC < SRR10918235.128534/83‑1 (MQ=60)
ggatcacgccgccttctgttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGAC < SRR10918235.6568064/83‑1 (MQ=60)
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gatagccgggatacgggctacgctaaggggagtggagagcggccgtgtgctggtccggtctgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACG < SRR10918235.6827006/84‑1 (MQ=60)
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ataaccgaaggtgactggagttcagacgtgtgctcttccgatctggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGG < SRR10918235.3253161/85‑1 (MQ=60)
tcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGT > SRR10918235.1660314/66‑151 (MQ=60)
tcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACagatcggaa > SRR10918235.2335643/66‑142 (MQ=60)
cgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgaggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGA < SRR10918235.1359184/89‑1 (MQ=60)
gccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTGGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACCGTCGAG > SRR10918235.7030711/62‑151 (MQ=60)
gccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAG > SRR10918235.5678413/62‑151 (MQ=60)
tcgtcgccttcggttacgcttggcgcgggggtcacggtggcggttggggtgtcgacgggggcgctgcccatcGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCG < SRR10918235.6231179/79‑1 (MQ=60)
ccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGC > SRR10918235.7124090/61‑151 (MQ=60)
cgccttcggttacgcttggcgaggcggccagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAACC < SRR10918235.3516372/92‑1 (MQ=60)
agcagaagacggcatacgagataaccgaaggtgactggagttcagacgtgtgctcttccgatcT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAACC < SRR10918235.109159/88‑1 (MQ=60)
GGTCTTCGGTCACATTGCCATTGCTGACAATGCTTACGGTGACGGCATCGATGCTGTCATTGAT‑‑‑GACCGTCGAGG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCC < SRR10918235.511867/151‑1 (MQ=47)
ggcttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCG < SRR10918235.6060709/93‑1 (MQ=60)
gccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAACCG > SRR10918235.2304019/59‑151 (MQ=60)
cttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTT < SRR10918235.2722996/95‑1 (MQ=60)
cttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAagagcg > SRR10918235.6034728/57‑145 (MQ=60)
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tcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGCTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGT < SRR10918235.2776882/97‑1 (MQ=60)
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ggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAACCGTTGTTG > SRR10918235.4210620/53‑151 (MQ=60)
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gtgcccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGT < SRR10918235.1808796/100‑1 (MQ=60)
gtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTAT > SRR10918235.2572832/52‑151 (MQ=60)
gtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACagatcggaagagcacacgtctga > SRR10918235.5172573/52‑128 (MQ=60)
GTCACATTGCCATTGCTGACAATGCTTACGGTGACGGCATCGATGCTGTCATTGAT‑‑‑GACCGTCGAGG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTAT > SRR10918235.1943007/1‑151 (MQ=60)
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TTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTC < SRR10918235.3635667/44‑1 (MQ=0)
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GAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGGACTTCCTGCCAGCGGCGCTCACGTTGGTGGCGCTCACGGGCGAGCCGTTGCTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTGGGTTTTACCCGCT < SRR10918235.7153531/151‑1 (MQ=60)
GAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCTGTGGCGagctggagagggcagacgacggtcgcgcaggtgacttgggtgcagacgtgtgctcttccgatctcgacgctgccctgggttttacccgct < SRR10918235.316775/151‑91 (MQ=33)
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GAT‑‑‑CGTGGCCTGCG‑CCGGCGGCGGGGTCGGGGTCAGTTGCTCCAGATTACCGCCCGCGCCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAACCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTCAACGCTGCCCTGGGTTTTACCCGCT < SRR10918235.5461354/151‑1 (MQ=60)
AT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTGGGTTTTGCCGGCTT > SRR10918235.2592768/1‑151 (MQ=60)
AT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTGGGTTTTACCCGCTT > SRR10918235.3752362/1‑151 (MQ=60)
tgatgaccgtcgagG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGCGTCTGGAAATCGACGCTGCCCTGGGTTTTACCCGC < SRR10918235.5767107/137‑1 (MQ=60)
T‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTGGGTTTTACCCGCTTC > SRR10918235.3663924/1‑151 (MQ=60)
T‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTA > SRR10918235.6591845/1‑47 (MQ=21)
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CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTGGGTTTTACCCGCTTCA < SRR10918235.2511598/151‑1 (MQ=60)
CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGCTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATGGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTGGGTTTTGCCGGCTTCA > SRR10918235.4288573/1‑151 (MQ=60)
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GTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGCGAGTGCCGCTGCCGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTGGGTTTTACCCGCTTCAA < SRR10918235.5922727/151‑1 (MQ=60)
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TGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTGGGTTTTACCCGCTTCAAC < SRR10918235.4089010/151‑1 (MQ=60)
GGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAACCGTTGTTGTAGACGTCATTGCCCGGGGTCTGGAATTCAACGCTGCCCTGGGTTTTACCCGCTTCAACG > SRR10918235.5961572/1‑151 (MQ=60)
GGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCGCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTGGGTTTTACCCGCTTCAACG < SRR10918235.5614246/151‑1 (MQ=60)
GGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAACCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTGGGTTTTACCCGCTTCAACG > SRR10918235.4957212/1‑151 (MQ=60)
TCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTGGGTTTTgccggcttccacgca > SRR10918235.6807927/1‑136 (MQ=60)
TCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTGGGTTTTACCCGCTTCAACGGT > SRR10918235.1867235/1‑151 (MQ=60)
CTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAACCGTTGTTGTAGACGTCATTGCCCGGGGTCTGGAATTCAACGCTGCCCTGGGTTTTACCCGCTTCAACGGTG > SRR10918235.3826622/1‑151 (MQ=60)
TGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTGGGTTTTACCCGCTTCAACGGTGA < SRR10918235.2950947/151‑1 (MQ=60)
GCG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTGGGTTTTACCCGCTTCAACGGTGAT < SRR10918235.6305879/151‑1 (MQ=60)
GAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTGCCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTGGGTTTTACCCGCTTCAACGGTGAT < SRR10918235.4538343/151‑1 (MQ=60)
GAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAACCGTTGTTGTAGACGTCATTGCCCGGGGTCTGGAATTCAACGCTGCCCTGGGTTTTACCCGCTTCAACGGTGAT > SRR10918235.6719787/1‑151 (MQ=60)
AG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGAagatcgggggagcacacgtctgaactccggtcaccttcggggacctcgtatgccggctgctgctggaaaaaaaaacttcaacggggatg > SRR10918235.402812/1‑62 (MQ=60)
AG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGgatcggaggagcagtcgtcttcactggaggcgccttcggtgttgtcgtttgccgtggtttgcctgactaaaaaggtgatg > SRR10918235.3580552/1‑71 (MQ=60)
AG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAACCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAgtagatcggaagagcacacgtctgaactccagtcaccttc > SRR10918235.6641037/1‑111 (MQ=60)
AG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGCTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTGGGTTTTGCCGGCTTCAACGGTGATG > SRR10918235.418902/1‑151 (MQ=60)
G‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGCGTCTGGAAATCGACGCTGCCCTGGGTTTTACCCGCTTCAACGGTGATGG < SRR10918235.3782665/151‑1 (MQ=60)
G‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGGCGGGGacgggcagatgacggtgctctgggctcttccggcttcctcggagatgg > SRR10918235.6136119/1‑103 (MQ=60)
|
AGGGTTACGGTCAACGGACGGTCCAGCGCCTGGCTCACTTTCACAGTAAAGGAAGGTTGCTGGTCTTCGGTCACATTGCCATTGCTGACAATGCTTACGGTGACGGCATCGATGCTGTCATTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTGGGTTTTACCCGCTTCAACGGTGATGG > CP009974/1898864‑1899149
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
